HEADER TRANSFERASE/TRANSCRIPTION 31-DEC-69 3WOD TITLE RNA polymerase-gp39 complex COMPND MOL_ID: 3; COMPND 2 MOLECULE: DNA-directed RNA polymerase subunit beta'; COMPND 3 CHAIN: D; COMPND 4 EC: 2.7.7.6; EXPDTA X-RAY DIFFRACTION REMARK 2 RESOLUTION. 3.60 ANGSTORMS REMARK 465 MISSING RESIDUES REMARK 465 THE FOLLOWING RESIDUES WERE NOT LOCATED IN THE REMARK 465 EXPERIMENT. (M=MODEL NUMBER; RES=RESIDUE NAME; C=CHAIN REMARK 465 IDENTIFIER; SSSEQ=SEQUENCE NUMBER; I=INSERTION CODE.) REMARK 465 REMARK 465 M RES C SSSEQI REMARK 465 ARG D 1239 REMARK 465 THR D 1240 REMARK 465 PHE D 1241 REMARK 465 HIS D 1242 REMARK 465 THR D 1243 REMARK 465 GLY D 1244 REMARK 465 GLY D 1245 REMARK 465 VAL D 1246 REMARK 465 ALA D 1247 REMARK 465 GLY D 1248 REMARK 465 ALA D 1249 REMARK 465 ALA D 1250 REMARK 465 ASP D 1251 REMARK 465 ILE D 1252 REMARK 465 THR D 1253 REMARK 465 GLN D 1254 DBREF 3WOD D 1 1524 UNP Q8RQE8 RPOC_THET8 1 1524 SEQRES 1 D 69 CYS GLN LYS CYS TYR GLY TYR ASP LEU SER MET ALA ARG SEQRES 2 D 69 PRO VAL SER ILE GLY GLU ALA VAL GLY ILE VAL ALA ALA SEQRES 3 D 69 GLN SER ILE GLY GLU PRO GLY THR GLN LEU THR MET ARG SEQRES 4 D 69 THR PHE HIS THR GLY GLY VAL ALA GLY ALA ALA ASP ILE SEQRES 5 D 69 THR GLN GLY LEU PRO ARG VAL ILE GLU LEU PHE GLU ALA SEQRES 6 D 69 ARG ARG PRO LYS SEQRES 1 D 175 ASP PRO HIS GLN LEU LEU GLU ALA LYS GLY PRO GLU ALA SEQRES 2 D 175 VAL GLU ARG TYR LEU VAL GLU GLU ILE GLN LYS VAL TYR SEQRES 3 D 175 ARG ALA GLN GLY VAL LYS LEU HIS ASP LYS HIS ILE GLU SEQRES 4 D 175 ILE VAL VAL ARG GLN MET MET LYS TYR VAL GLU VAL THR SEQRES 5 D 175 ASP PRO GLY ASP SER ARG LEU LEU GLU GLY GLN VAL LEU SEQRES 6 D 175 GLU LYS TRP ASP VAL GLU ALA LEU ASN GLU ARG LEU ILE SEQRES 7 D 175 ALA GLU GLY LYS THR PRO VAL ALA TRP LYS PRO LEU LEU SEQRES 8 D 175 MET GLY VAL THR LYS SER ALA LEU SER THR LYS SER TRP SEQRES 9 D 175 LEU SER ALA ALA SER PHE GLN ASN THR THR HIS VAL LEU SEQRES 10 D 175 THR GLU ALA ALA ILE ALA GLY LYS LYS ASP GLU LEU ILE SEQRES 11 D 175 GLY LEU LYS GLU ASN VAL ILE LEU GLY ARG LEU ILE PRO SEQRES 12 D 175 ALA GLY THR GLY SER ASP PHE VAL ARG PHE THR GLN VAL SEQRES 13 D 175 VAL ASP GLN LYS THR LEU LYS ALA ILE GLU GLU ALA ARG SEQRES 14 D 175 LYS GLU ALA VAL GLU ALA ATOM 1 N CYS D1201 -79.900 -39.205 6.824 1.00 72.61 ATOM 2 CA CYS D1201 -79.106 -39.968 7.784 1.00 73.82 ATOM 3 C CYS D1201 -79.845 -40.277 9.091 1.00 75.30 ATOM 4 O CYS D1201 -80.682 -39.488 9.529 1.00 70.19 ATOM 5 CB CYS D1201 -77.824 -39.209 8.086 1.00 68.61 ATOM 6 SG CYS D1201 -77.945 -37.475 7.660 1.00 75.74 ATOM 7 N GLN D1202 -79.557 -41.439 9.686 1.00 70.11 ATOM 8 CA GLN D1202 -80.153 -41.810 10.972 1.00 59.38 ATOM 9 C GLN D1202 -79.966 -40.719 12.008 1.00 54.28 ATOM 10 O GLN D1202 -80.915 -40.317 12.684 1.00 46.51 ATOM 11 CB GLN D1202 -79.538 -43.087 11.539 1.00 57.33 ATOM 12 CG GLN D1202 -80.139 -44.413 11.108 1.00 57.61 ATOM 13 CD GLN D1202 -79.376 -45.576 11.723 1.00 57.91 ATOM 14 OE1 GLN D1202 -78.384 -45.371 12.425 1.00 50.31 ATOM 15 NE2 GLN D1202 -79.832 -46.799 11.464 1.00 58.62 ATOM 16 N LYS D1203 -78.732 -40.240 12.125 1.00 74.76 ATOM 17 CA LYS D1203 -78.390 -39.270 13.149 1.00 81.48 ATOM 18 C LYS D1203 -79.180 -37.982 12.983 1.00 74.36 ATOM 19 O LYS D1203 -79.601 -37.366 13.962 1.00 75.07 ATOM 20 CB LYS D1203 -76.885 -38.970 13.118 1.00 92.54 ATOM 21 CG LYS D1203 -75.974 -40.180 13.329 1.00 89.73 ATOM 22 CD LYS D1203 -75.660 -40.395 14.806 1.00103.41 ATOM 23 CE LYS D1203 -74.743 -41.594 15.022 1.00104.65 ATOM 24 NZ LYS D1203 -74.466 -41.833 16.469 1.00 62.22 ATOM 25 N CYS D1204 -79.407 -37.577 11.743 1.00 92.57 ATOM 26 CA CYS D1204 -80.188 -36.373 11.512 1.00 93.84 ATOM 27 C CYS D1204 -81.657 -36.564 11.883 1.00 89.82 ATOM 28 O CYS D1204 -82.246 -35.712 12.547 1.00 87.65 ATOM 29 CB CYS D1204 -80.039 -35.906 10.067 1.00103.49 ATOM 30 SG CYS D1204 -78.715 -34.674 9.892 1.00108.05 ATOM 31 N TYR D1205 -82.232 -37.692 11.471 1.00 53.68 ATOM 32 CA TYR D1205 -83.622 -37.983 11.803 1.00 51.65 ATOM 33 C TYR D1205 -83.800 -38.109 13.306 1.00 61.16 ATOM 34 O TYR D1205 -84.239 -37.165 13.966 1.00 53.28 ATOM 35 CB TYR D1205 -84.092 -39.261 11.120 1.00 51.33 ATOM 36 CG TYR D1205 -85.592 -39.413 11.110 1.00 44.19 ATOM 37 CD1 TYR D1205 -86.397 -38.443 10.536 1.00 46.47 ATOM 38 CD2 TYR D1205 -86.204 -40.527 11.664 1.00 41.75 ATOM 39 CE1 TYR D1205 -87.767 -38.575 10.512 1.00 39.14 ATOM 40 CE2 TYR D1205 -87.577 -40.667 11.645 1.00 42.85 ATOM 41 CZ TYR D1205 -88.355 -39.686 11.071 1.00 37.28 ATOM 42 OH TYR D1205 -89.726 -39.816 11.045 1.00 33.62 ATOM 43 N GLY D1206 -83.441 -39.275 13.838 1.00 74.70 ATOM 44 CA GLY D1206 -83.685 -39.587 15.234 1.00 67.02 ATOM 45 C GLY D1206 -84.357 -40.923 15.471 1.00 54.93 ATOM 46 O GLY D1206 -84.313 -41.811 14.618 1.00 47.11 ATOM 47 N TYR D1207 -84.931 -41.076 16.660 1.00 70.62 ATOM 48 CA TYR D1207 -85.776 -42.223 16.947 1.00 70.25 ATOM 49 C TYR D1207 -86.859 -42.430 15.895 1.00 58.44 ATOM 50 O TYR D1207 -86.670 -43.112 14.888 1.00 53.09 ATOM 51 CB TYR D1207 -86.478 -42.063 18.303 1.00 80.84 ATOM 52 CG TYR D1207 -85.698 -42.434 19.544 1.00 72.12 ATOM 53 CD1 TYR D1207 -86.212 -42.152 20.807 1.00 62.99 ATOM 54 CD2 TYR D1207 -84.471 -43.067 19.466 1.00 72.01 ATOM 55 CE1 TYR D1207 -85.525 -42.475 21.950 1.00 71.43 ATOM 56 CE2 TYR D1207 -83.770 -43.403 20.615 1.00 80.03 ATOM 57 CZ TYR D1207 -84.305 -43.102 21.853 1.00 75.45 ATOM 58 OH TYR D1207 -83.623 -43.426 23.004 1.00 59.86 ATOM 59 N ASP D1208 -87.976 -41.755 16.147 1.00 45.42 ATOM 60 CA ASP D1208 -89.274 -42.401 16.078 1.00 43.98 ATOM 61 C ASP D1208 -89.512 -43.349 14.903 1.00 55.43 ATOM 62 O ASP D1208 -89.959 -42.932 13.836 1.00 97.19 ATOM 63 CB ASP D1208 -90.369 -41.328 16.080 1.00 34.86 ATOM 64 CG ASP D1208 -91.603 -41.750 16.866 1.00 36.75 ATOM 65 OD1 ASP D1208 -91.543 -42.773 17.581 1.00 36.31 ATOM 66 OD2 ASP D1208 -92.623 -41.032 16.797 1.00 38.39 ATOM 67 N LEU D1209 -89.188 -44.624 15.110 1.00 57.22 ATOM 68 CA LEU D1209 -89.832 -45.740 14.427 1.00 76.89 ATOM 69 C LEU D1209 -91.142 -45.807 15.190 1.00 84.14 ATOM 70 O LEU D1209 -91.264 -45.090 16.177 1.00 62.41 ATOM 71 CB LEU D1209 -89.030 -47.039 14.519 1.00 80.88 ATOM 72 CG LEU D1209 -88.501 -47.668 13.229 1.00 78.07 ATOM 73 CD1 LEU D1209 -87.976 -46.600 12.302 1.00 75.64 ATOM 74 CD2 LEU D1209 -87.403 -48.672 13.547 1.00 70.75 ATOM 75 N SER D1210 -92.168 -46.510 14.724 1.00118.96 ATOM 76 CA SER D1210 -93.354 -46.603 15.575 1.00128.32 ATOM 77 C SER D1210 -92.910 -46.980 17.014 1.00105.63 ATOM 78 O SER D1210 -93.522 -46.561 17.990 1.00 92.18 ATOM 79 CB SER D1210 -94.366 -47.608 15.023 1.00155.93 ATOM 80 OG SER D1210 -95.479 -46.950 14.435 1.00120.39 ATOM 81 N MET D1211 -91.825 -47.761 17.101 1.00 80.54 ATOM 82 CA MET D1211 -91.002 -48.022 18.301 1.00 81.01 ATOM 83 C MET D1211 -90.347 -46.783 18.929 1.00 76.88 ATOM 84 O MET D1211 -90.593 -45.660 18.506 1.00 74.31 ATOM 85 CB MET D1211 -89.919 -49.053 17.958 1.00 73.80 ATOM 86 CG MET D1211 -90.460 -50.284 17.243 1.00 92.41 ATOM 87 SD MET D1211 -90.079 -50.319 15.478 1.00 75.16 ATOM 88 CE MET D1211 -88.689 -51.445 15.463 1.00 59.52 ATOM 89 N ALA D1212 -89.534 -46.982 19.965 1.00 45.93 ATOM 90 CA ALA D1212 -88.793 -45.859 20.533 1.00 40.65 ATOM 91 C ALA D1212 -87.282 -46.040 20.387 1.00 37.92 ATOM 92 O ALA D1212 -86.510 -45.254 20.929 1.00 43.53 ATOM 93 CB ALA D1212 -89.166 -45.668 22.004 1.00 46.25 ATOM 94 N ARG D1213 -86.860 -47.054 19.633 1.00 32.41 ATOM 95 CA ARG D1213 -85.454 -47.193 19.227 1.00 48.95 ATOM 96 C ARG D1213 -85.157 -46.309 18.005 1.00 54.67 ATOM 97 O ARG D1213 -86.085 -45.771 17.410 1.00 61.62 ATOM 98 CB ARG D1213 -85.126 -48.672 18.959 1.00 50.13 ATOM 99 CG ARG D1213 -85.713 -49.254 17.690 1.00 69.50 ATOM 100 CD ARG D1213 -85.659 -50.782 17.748 1.00 78.16 ATOM 101 NE ARG D1213 -86.574 -51.296 18.761 1.00 65.79 ATOM 102 CZ ARG D1213 -86.360 -52.384 19.494 1.00 73.53 ATOM 103 NH1 ARG D1213 -85.246 -53.091 19.338 1.00 74.76 ATOM 104 NH2 ARG D1213 -87.264 -52.760 20.393 1.00 78.79 ATOM 105 N PRO D1214 -83.864 -46.112 17.656 1.00 49.92 ATOM 106 CA PRO D1214 -83.550 -45.239 16.512 1.00 47.66 ATOM 107 C PRO D1214 -84.134 -45.708 15.184 1.00 52.96 ATOM 108 O PRO D1214 -84.487 -46.879 15.050 1.00 56.28 ATOM 109 CB PRO D1214 -82.022 -45.289 16.441 1.00 48.96 ATOM 110 CG PRO D1214 -81.597 -45.583 17.813 1.00 52.58 ATOM 111 CD PRO D1214 -82.640 -46.497 18.386 1.00 57.08 ATOM 112 N VAL D1215 -84.194 -44.806 14.207 1.00 50.54 ATOM 113 CA VAL D1215 -84.837 -45.123 12.941 1.00 50.63 ATOM 114 C VAL D1215 -84.024 -46.147 12.159 1.00 43.95 ATOM 115 O VAL D1215 -82.797 -46.061 12.071 1.00 46.64 ATOM 116 CB VAL D1215 -85.045 -43.850 12.078 1.00 48.57 ATOM 117 CG1 VAL D1215 -83.708 -43.171 11.771 1.00 55.26 ATOM 118 CG2 VAL D1215 -85.784 -44.179 10.795 1.00 39.65 ATOM 119 N SER D1216 -84.718 -47.129 11.599 1.00 38.03 ATOM 120 CA SER D1216 -84.067 -48.193 10.851 1.00 42.59 ATOM 121 C SER D1216 -83.914 -47.834 9.391 1.00 53.77 ATOM 122 O SER D1216 -84.871 -47.392 8.759 1.00 64.36 ATOM 123 CB SER D1216 -84.848 -49.492 10.986 1.00 42.77 ATOM 124 OG SER D1216 -84.282 -50.321 11.989 1.00 56.33 ATOM 125 N ILE D1217 -82.705 -48.005 8.869 1.00 56.62 ATOM 126 CA ILE D1217 -82.393 -47.609 7.501 1.00 58.17 ATOM 127 C ILE D1217 -83.373 -48.248 6.517 1.00 56.56 ATOM 128 O ILE D1217 -83.683 -49.438 6.616 1.00 50.80 ATOM 129 CB ILE D1217 -80.956 -47.996 7.104 1.00 55.00 ATOM 130 CG1 ILE D1217 -79.962 -46.998 7.696 1.00 69.86 ATOM 131 CG2 ILE D1217 -80.794 -48.025 5.589 1.00 52.85 ATOM 132 CD1 ILE D1217 -78.558 -47.169 7.178 1.00 67.31 ATOM 133 N GLY D1218 -83.845 -47.446 5.570 1.00 82.14 ATOM 134 CA GLY D1218 -84.794 -47.887 4.569 1.00 77.32 ATOM 135 C GLY D1218 -86.244 -47.704 4.969 1.00 77.77 ATOM 136 O GLY D1218 -87.142 -48.246 4.327 1.00 78.82 ATOM 137 N GLU D1219 -86.475 -46.929 6.025 1.00 57.17 ATOM 138 CA GLU D1219 -87.831 -46.564 6.423 1.00 53.54 ATOM 139 C GLU D1219 -88.213 -45.341 5.612 1.00 45.28 ATOM 140 O GLU D1219 -87.430 -44.395 5.508 1.00 39.18 ATOM 141 CB GLU D1219 -87.944 -46.278 7.922 1.00 53.79 ATOM 142 CG GLU D1219 -89.323 -45.759 8.346 1.00 55.40 ATOM 143 CD GLU D1219 -89.895 -46.505 9.540 1.00 67.02 ATOM 144 OE1 GLU D1219 -89.601 -47.713 9.682 1.00 73.68 ATOM 145 OE2 GLU D1219 -90.634 -45.886 10.340 1.00 57.79 ATOM 146 N ALA D1220 -89.418 -45.350 5.059 1.00 44.06 ATOM 147 CA ALA D1220 -89.824 -44.314 4.130 1.00 49.48 ATOM 148 C ALA D1220 -90.365 -43.141 4.924 1.00 45.07 ATOM 149 O ALA D1220 -91.572 -42.902 4.968 1.00 43.82 ATOM 150 CB ALA D1220 -90.868 -44.840 3.166 1.00 47.38 ATOM 151 N VAL D1221 -89.444 -42.408 5.542 1.00 40.50 ATOM 152 CA VAL D1221 -89.799 -41.322 6.432 1.00 44.84 ATOM 153 C VAL D1221 -90.620 -40.244 5.736 1.00 50.60 ATOM 154 O VAL D1221 -91.500 -39.638 6.349 1.00 43.63 ATOM 155 CB VAL D1221 -88.522 -40.707 7.028 1.00 45.25 ATOM 156 CG1 VAL D1221 -88.739 -39.248 7.410 1.00 51.23 ATOM 157 CG2 VAL D1221 -88.040 -41.542 8.203 1.00 53.76 ATOM 158 N GLY D1222 -90.339 -40.022 4.454 1.00 93.21 ATOM 159 CA GLY D1222 -91.114 -39.095 3.641 1.00 91.28 ATOM 160 C GLY D1222 -92.605 -39.309 3.813 1.00 80.75 ATOM 161 O GLY D1222 -93.320 -38.464 4.364 1.00 82.27 ATOM 162 N ILE D1223 -93.062 -40.463 3.335 1.00 43.39 ATOM 163 CA ILE D1223 -94.469 -40.828 3.385 1.00 43.55 ATOM 164 C ILE D1223 -95.008 -40.755 4.807 1.00 44.25 ATOM 165 O ILE D1223 -96.097 -40.230 5.028 1.00 35.96 ATOM 166 CB ILE D1223 -94.695 -42.226 2.775 1.00 40.48 ATOM 167 CG1 ILE D1223 -95.013 -42.073 1.294 1.00 45.19 ATOM 168 CG2 ILE D1223 -95.856 -42.943 3.444 1.00 45.09 ATOM 169 CD1 ILE D1223 -94.251 -43.001 0.387 1.00 61.62 ATOM 170 N VAL D1224 -94.261 -41.304 5.760 1.00 61.63 ATOM 171 CA VAL D1224 -94.710 -41.319 7.141 1.00 61.35 ATOM 172 C VAL D1224 -95.004 -39.900 7.605 1.00 65.05 ATOM 173 O VAL D1224 -96.031 -39.644 8.234 1.00 71.31 ATOM 174 CB VAL D1224 -93.660 -41.965 8.066 1.00 68.08 ATOM 175 CG1 VAL D1224 -93.837 -41.507 9.517 1.00 83.84 ATOM 176 CG2 VAL D1224 -93.722 -43.479 7.955 1.00 67.60 ATOM 177 N ALA D1225 -94.119 -38.973 7.251 1.00 45.51 ATOM 178 CA ALA D1225 -94.261 -37.589 7.672 1.00 48.04 ATOM 179 C ALA D1225 -95.464 -36.944 6.996 1.00 40.41 ATOM 180 O ALA D1225 -96.254 -36.225 7.635 1.00 38.57 ATOM 181 CB ALA D1225 -92.989 -36.815 7.357 1.00 42.28 ATOM 182 N ALA D1226 -95.651 -37.302 5.726 1.00 24.78 ATOM 183 CA ALA D1226 -96.798 -36.837 4.959 1.00 24.01 ATOM 184 C ALA D1226 -98.053 -37.231 5.704 1.00 27.84 ATOM 185 O ALA D1226 -98.841 -36.380 6.092 1.00 28.76 ATOM 186 CB ALA D1226 -96.785 -37.427 3.574 1.00 26.99 ATOM 187 N GLN D1227 -98.233 -38.535 5.862 1.00 36.28 ATOM 188 CA GLN 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