HEADER TRANSCRIPTION, TRANSFERASE/DNA 20-JUL-12 4G7H TITLE Crystal structure of Thermus thermophilus transcription initiation TITLE 2 complex COMPND MOL_ID: 3; COMPND 2 MOLECULE: DNA-directed RNA polymerase subunit beta'; COMPND 3 CHAIN: D, N; COMPND 4 EC: 2.7.7.6; EXPDTA X-RAY DIFFRACTION REMARK 2 RESOLUTION. 2.90 ANGSTORMS DBREF 4G7H D 1 1524 UNP Q8RQE8 RPOC_THET8 1 1524 SEQRES 1 D 61 ALA LYS ALA VAL ILE SER GLU ILE ASP GLY VAL VAL ARG SEQRES 2 D 61 ILE GLU GLU THR GLU GLU LYS LEU SER VAL PHE VAL GLU SEQRES 3 D 61 SER GLU GLY PHE SER LYS GLU TYR LYS LEU PRO LYS GLU SEQRES 4 D 61 ALA ARG LEU LEU VAL LYS ASP GLY ASP TYR VAL GLU ALA SEQRES 5 D 61 GLY GLN PRO LEU THR ARG GLY ALA ILE ATOM 1 N ALA D1270 23.310 -17.868 61.327 1.00 95.46 ATOM 2 CA ALA D1270 22.014 -18.505 61.472 1.00 93.97 ATOM 3 C ALA D1270 21.000 -17.384 61.538 1.00 89.03 ATOM 4 O ALA D1270 20.877 -16.701 62.556 1.00 91.97 ATOM 5 CB ALA D1270 21.968 -19.333 62.739 1.00 96.99 ATOM 6 N LYS D1271 20.260 -17.211 60.450 1.00 81.57 ATOM 7 CA LYS D1271 19.369 -16.074 60.326 1.00 76.81 ATOM 8 C LYS D1271 17.929 -16.539 60.307 1.00 81.06 ATOM 9 O LYS D1271 17.611 -17.606 59.782 1.00 87.61 ATOM 10 CB LYS D1271 19.693 -15.243 59.072 1.00 72.18 ATOM 11 CG LYS D1271 19.019 -15.715 57.788 1.00 71.45 ATOM 12 CD LYS D1271 19.125 -14.685 56.662 1.00 69.22 ATOM 13 CE LYS D1271 20.523 -14.644 56.046 1.00 84.15 ATOM 14 NZ LYS D1271 20.574 -13.860 54.769 1.00 71.88 ATOM 15 N ALA D1272 17.059 -15.743 60.908 1.00 85.34 ATOM 16 CA ALA D1272 15.638 -16.008 60.833 1.00 87.88 ATOM 17 C ALA D1272 15.143 -15.648 59.437 1.00 83.26 ATOM 18 O ALA D1272 15.714 -14.785 58.759 1.00 72.42 ATOM 19 CB ALA D1272 14.890 -15.217 61.895 1.00 87.31 ATOM 20 N VAL D1273 14.087 -16.331 59.011 1.00 89.40 ATOM 21 CA VAL D1273 13.444 -16.051 57.738 1.00 86.66 ATOM 22 C VAL D1273 12.208 -15.184 57.970 1.00 89.87 ATOM 23 O VAL D1273 11.393 -15.475 58.846 1.00 90.71 ATOM 24 CB VAL D1273 13.028 -17.354 57.039 1.00 81.34 ATOM 25 CG1 VAL D1273 12.452 -17.059 55.662 1.00 89.90 ATOM 26 CG2 VAL D1273 14.218 -18.306 56.944 1.00 72.64 ATOM 27 N ILE D1274 12.069 -14.119 57.189 1.00 84.68 ATOM 28 CA ILE D1274 10.936 -13.213 57.348 1.00 89.40 ATOM 29 C ILE D1274 10.018 -13.255 56.127 1.00 95.22 ATOM 30 O ILE D1274 10.458 -13.579 55.024 1.00 99.03 ATOM 31 CB ILE D1274 11.399 -11.760 57.599 1.00 86.15 ATOM 32 CG1 ILE D1274 12.284 -11.270 56.452 1.00 77.45 ATOM 33 CG2 ILE D1274 12.153 -11.660 58.912 1.00 86.02 ATOM 34 CD1 ILE D1274 12.652 -9.810 56.552 1.00 68.17 ATOM 35 N SER D1275 8.741 -12.945 56.330 1.00 94.73 ATOM 36 CA SER D1275 7.790 -12.891 55.224 1.00 95.61 ATOM 37 C SER D1275 8.027 -11.632 54.411 1.00 94.36 ATOM 38 O SER D1275 8.245 -10.556 54.970 1.00 89.62 ATOM 39 CB SER D1275 6.348 -12.913 55.734 1.00107.07 ATOM 40 OG SER D1275 6.044 -14.143 56.365 1.00117.09 ATOM 41 N GLU D1276 7.987 -11.771 53.090 1.00 93.87 ATOM 42 CA GLU D1276 8.216 -10.641 52.200 1.00 87.61 ATOM 43 C GLU D1276 6.976 -9.758 52.123 1.00 95.70 ATOM 44 O GLU D1276 7.082 -8.531 52.113 1.00 93.97 ATOM 45 CB GLU D1276 8.640 -11.125 50.811 1.00 87.91 ATOM 46 CG GLU D1276 9.920 -11.953 50.824 1.00 92.93 ATOM 47 CD GLU D1276 10.354 -12.410 49.442 1.00 95.16 ATOM 48 OE1 GLU D1276 10.720 -11.550 48.611 1.00 90.37 ATOM 49 OE2 GLU D1276 10.337 -13.634 49.191 1.00 94.23 ATOM 50 N ILE D1277 5.803 -10.388 52.072 1.00106.48 ATOM 51 CA ILE D1277 4.530 -9.666 52.080 1.00111.21 ATOM 52 C ILE D1277 3.625 -10.224 53.182 1.00108.77 ATOM 53 O ILE D1277 4.006 -11.152 53.899 1.00107.45 ATOM 54 CB ILE D1277 3.794 -9.751 50.711 1.00110.78 ATOM 55 CG1 ILE D1277 4.784 -9.953 49.556 1.00110.98 ATOM 56 CG2 ILE D1277 2.939 -8.504 50.468 1.00103.32 ATOM 57 CD1 ILE D1277 5.556 -8.699 49.158 1.00 95.44 ATOM 58 N ASP D1278 2.437 -9.644 53.321 1.00115.22 ATOM 59 CA ASP D1278 1.434 -10.132 54.262 1.00120.04 ATOM 60 C ASP D1278 0.770 -11.396 53.718 1.00121.64 ATOM 61 O ASP D1278 0.802 -11.651 52.512 1.00113.97 ATOM 62 CB ASP D1278 0.372 -9.057 54.511 1.00117.96 ATOM 63 CG ASP D1278 0.960 -7.659 54.596 1.00114.87 ATOM 64 OD1 ASP D1278 1.417 -7.269 55.691 1.00112.89 ATOM 65 OD2 ASP D1278 0.959 -6.949 53.567 1.00113.47 ATOM 66 N GLY D1279 0.172 -12.186 54.607 1.00123.08 ATOM 67 CA GLY D1279 -0.562 -13.370 54.191 1.00129.35 ATOM 68 C GLY D1279 -0.983 -14.282 55.329 1.00132.95 ATOM 69 O GLY D1279 -0.822 -13.948 56.504 1.00131.87 ATOM 70 N VAL D1280 -1.535 -15.441 54.980 1.00139.33 ATOM 71 CA VAL D1280 -1.910 -16.432 55.982 1.00140.11 ATOM 72 C VAL D1280 -0.957 -17.626 55.924 1.00136.39 ATOM 73 O VAL D1280 -0.508 -18.033 54.846 1.00128.63 ATOM 74 CB VAL D1280 -3.392 -16.884 55.839 1.00142.86 ATOM 75 CG1 VAL D1280 -3.589 -17.746 54.598 1.00139.18 ATOM 76 CG2 VAL D1280 -3.853 -17.625 57.088 1.00139.26 ATOM 77 N VAL D1281 -0.637 -18.167 57.094 1.00138.76 ATOM 78 CA VAL D1281 0.328 -19.253 57.204 1.00139.02 ATOM 79 C VAL D1281 -0.272 -20.600 56.828 1.00143.34 ATOM 80 O VAL D1281 -1.295 -21.011 57.373 1.00147.39 ATOM 81 CB VAL D1281 0.893 -19.356 58.631 1.00140.53 ATOM 82 CG1 VAL D1281 1.813 -20.563 58.751 1.00136.13 ATOM 83 CG2 VAL D1281 1.623 -18.077 59.005 1.00139.64 ATOM 84 N ARG D1282 0.371 -21.280 55.886 1.00138.84 ATOM 85 CA ARG D1282 -0.008 -22.634 55.520 1.00144.62 ATOM 86 C ARG D1282 1.245 -23.501 55.585 1.00147.56 ATOM 87 O ARG D1282 2.158 -23.347 54.771 1.00144.99 ATOM 88 CB ARG D1282 -0.604 -22.645 54.109 1.00144.43 ATOM 89 CG ARG D1282 -1.511 -23.829 53.794 1.00143.33 ATOM 90 CD ARG D1282 -0.729 -25.046 53.319 1.00140.88 ATOM 91 NE ARG D1282 0.075 -24.766 52.130 1.00137.64 ATOM 92 CZ ARG D1282 -0.384 -24.825 50.883 1.00131.28 ATOM 93 NH1 ARG D1282 -1.649 -25.146 50.655 1.00146.55 ATOM 94 NH2 ARG D1282 0.420 -24.558 49.862 1.00122.28 ATOM 95 N ILE D1283 1.286 -24.415 56.549 1.00148.92 ATOM 96 CA ILE D1283 2.459 -25.268 56.740 1.00148.67 ATOM 97 C ILE D1283 2.475 -26.511 55.853 1.00152.75 ATOM 98 O ILE D1283 1.429 -27.066 55.518 1.00159.69 ATOM 99 CB ILE D1283 2.654 -25.681 58.218 1.00139.36 ATOM 100 CG1 ILE D1283 1.308 -25.799 58.939 1.00143.71 ATOM 101 CG2 ILE D1283 3.536 -24.674 58.933 1.00118.69 ATOM 102 CD1 ILE D1283 0.480 -27.014 58.563 1.00132.15 ATOM 103 N GLU D1284 3.674 -26.930 55.465 1.00146.07 ATOM 104 CA GLU D1284 3.849 -28.188 54.749 1.00155.15 ATOM 105 C GLU D1284 5.045 -28.948 55.323 1.00156.45 ATOM 106 O GLU D1284 6.163 -28.427 55.376 1.00156.59 ATOM 107 CB GLU D1284 3.987 -27.933 53.237 1.00151.60 ATOM 108 CG GLU D1284 5.139 -28.650 52.532 1.00150.69 ATOM 109 CD GLU D1284 4.954 -30.153 52.443 1.00152.62 ATOM 110 OE1 GLU D1284 5.974 -30.875 52.444 1.00150.76 ATOM 111 OE2 GLU D1284 3.794 -30.611 52.369 1.00153.80 ATOM 112 N GLU D1285 4.802 -30.172 55.784 1.00156.65 ATOM 113 CA GLU D1285 5.884 -30.996 56.309 1.00154.69 ATOM 114 C GLU D1285 5.931 -32.407 55.727 1.00156.33 ATOM 115 O GLU D1285 5.063 -33.236 55.999 1.00154.55 ATOM 116 CB GLU D1285 5.811 -31.064 57.838 1.00156.61 ATOM 117 CG GLU D1285 6.808 -32.029 58.458 1.00159.58 ATOM 118 CD GLU D1285 7.268 -31.590 59.833 1.00155.81 ATOM 119 OE1 GLU D1285 8.360 -32.024 60.260 1.00151.01 ATOM 120 OE2 GLU D1285 6.543 -30.810 60.486 1.00148.72 ATOM 121 N THR D1286 6.960 -32.664 54.927 1.00162.88 ATOM 122 CA THR D1286 7.341 -34.018 54.548 1.00164.93 ATOM 123 C THR D1286 8.165 -34.561 55.710 1.00166.81 ATOM 124 O THR D1286 8.700 -33.784 56.500 1.00169.04 ATOM 125 CB THR D1286 8.167 -34.030 53.238 1.00160.97 ATOM 126 OG1 THR D1286 7.473 -33.291 52.225 1.00152.49 ATOM 127 CG2 THR D1286 8.396 -35.452 52.738 1.00153.30 ATOM 128 N GLU D1287 8.240 -35.879 55.852 1.00167.48 ATOM 129 CA GLU D1287 9.103 -36.463 56.871 1.00168.93 ATOM 130 C GLU D1287 10.549 -36.008 56.667 1.00168.41 ATOM 131 O GLU D1287 11.220 -35.594 57.614 1.00161.58 ATOM 132 CB GLU D1287 9.019 -37.990 56.846 1.00158.12 ATOM 133 CG GLU D1287 8.869 -38.625 58.221 1.00155.81 ATOM 134 CD GLU D1287 9.958 -38.203 59.192 1.00159.98 ATOM 135 OE1 GLU D1287 11.132 -38.570 58.973 1.00161.91 ATOM 136 OE2 GLU D1287 9.637 -37.502 60.176 1.00159.35 ATOM 137 N GLU D1288 11.022 -36.083 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1.00152.78 ATOM 156 CA LEU D1290 9.998 -28.936 54.990 1.00148.73 ATOM 157 C LEU D1290 9.722 -27.747 54.076 1.00145.10 ATOM 158 O LEU D1290 10.577 -27.355 53.279 1.00138.83 ATOM 159 CB LEU D1290 10.713 -28.461 56.259 1.00144.15 ATOM 160 CG LEU D1290 9.891 -28.130 57.510 1.00136.87 ATOM 161 CD1 LEU D1290 9.059 -26.867 57.344 1.00131.84 ATOM 162 CD2 LEU D1290 9.011 -29.304 57.882 1.00144.88 ATOM 163 N SER D1291 8.521 -27.184 54.186 1.00142.73 ATOM 164 CA SER D1291 8.193 -25.955 53.472 1.00135.08 ATOM 165 C SER D1291 7.108 -25.144 54.184 1.00130.75 ATOM 166 O SER D1291 6.261 -25.696 54.889 1.00138.19 ATOM 167 CB SER D1291 7.775 -26.263 52.033 1.00131.55 ATOM 168 OG SER D1291 7.686 -25.077 51.265 1.00125.77 ATOM 169 N VAL D1292 7.139 -23.830 53.987 1.00124.61 ATOM 170 CA VAL D1292 6.155 -22.935 54.583 1.00121.97 ATOM 171 C VAL D1292 5.615 -21.959 53.547 1.00122.50 ATOM 172 O VAL D1292 6.377 -21.269 52.869 1.00117.70 ATOM 173 CB VAL D1292 6.743 -22.144 55.769 1.00109.25 ATOM 174 CG1 VAL 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