HEADER TRANSCRIPTION, TRANSFERASE/DNA 20-JUL-12 4G7O TITLE Crystal structure of Thermus thermophilus transcription initiation TITLE 2 complex containing 2 nt of RNA COMPND MOL_ID: 3; COMPND 2 MOLECULE: DNA-directed RNA polymerase subunit beta'; COMPND 3 CHAIN: D, N; COMPND 4 EC: 2.7.7.6; EXPDTA X-RAY DIFFRACTION REMARK 2 RESOLUTION. 2.99 ANGSTORMS DBREF 4G7O D 1 1524 UNP Q8RQE8 RPOC_THET8 1 1524 SEQRES 1 D 61 ALA LYS ALA VAL ILE SER GLU ILE ASP GLY VAL VAL ARG SEQRES 2 D 61 ILE GLU GLU THR GLU GLU LYS LEU SER VAL PHE VAL GLU SEQRES 3 D 61 SER GLU GLY PHE SER LYS GLU TYR LYS LEU PRO LYS GLU SEQRES 4 D 61 ALA ARG LEU LEU VAL LYS ASP GLY ASP TYR VAL GLU ALA SEQRES 5 D 61 GLY GLN PRO LEU THR ARG GLY ALA ILE ATOM 1 N ALA D1270 23.118 -17.534 61.502 1.00 91.28 ATOM 2 CA ALA D1270 21.778 -18.091 61.540 1.00 87.91 ATOM 3 C ALA D1270 20.787 -16.943 61.559 1.00 84.19 ATOM 4 O ALA D1270 20.567 -16.320 62.598 1.00 86.69 ATOM 5 CB ALA D1270 21.599 -18.962 62.767 1.00 88.24 ATOM 6 N LYS D1271 20.198 -16.656 60.403 1.00 75.83 ATOM 7 CA LYS D1271 19.244 -15.565 60.301 1.00 74.79 ATOM 8 C LYS D1271 17.821 -16.099 60.279 1.00 84.78 ATOM 9 O LYS D1271 17.520 -17.070 59.587 1.00 94.88 ATOM 10 CB LYS D1271 19.507 -14.715 59.052 1.00 72.29 ATOM 11 CG LYS D1271 18.957 -15.305 57.755 1.00 76.45 ATOM 12 CD LYS D1271 19.248 -14.420 56.549 1.00 71.79 ATOM 13 CE LYS D1271 20.749 -14.330 56.279 1.00 82.65 ATOM 14 NZ LYS D1271 21.076 -13.530 55.059 1.00 78.41 ATOM 15 N ALA D1272 16.947 -15.469 61.052 1.00 82.82 ATOM 16 CA ALA D1272 15.531 -15.774 60.969 1.00 90.84 ATOM 17 C ALA D1272 15.025 -15.371 59.589 1.00 87.80 ATOM 18 O ALA D1272 15.593 -14.490 58.939 1.00 81.02 ATOM 19 CB ALA D1272 14.764 -15.041 62.058 1.00 95.17 ATOM 20 N VAL D1273 13.960 -16.023 59.141 1.00 92.44 ATOM 21 CA VAL D1273 13.382 -15.718 57.841 1.00 92.99 ATOM 22 C VAL D1273 12.109 -14.891 57.999 1.00 96.03 ATOM 23 O VAL D1273 11.250 -15.208 58.818 1.00101.87 ATOM 24 CB VAL D1273 13.080 -17.002 57.054 1.00 91.51 ATOM 25 CG1 VAL D1273 12.528 -16.663 55.679 1.00 95.18 ATOM 26 CG2 VAL D1273 14.337 -17.859 56.940 1.00 82.35 ATOM 27 N ILE D1274 11.996 -13.826 57.215 1.00 94.32 ATOM 28 CA ILE D1274 10.855 -12.928 57.318 1.00 93.44 ATOM 29 C ILE D1274 10.036 -12.930 56.033 1.00 96.31 ATOM 30 O ILE D1274 10.568 -13.173 54.950 1.00100.80 ATOM 31 CB ILE D1274 11.312 -11.492 57.621 1.00 95.76 ATOM 32 CG1 ILE D1274 12.229 -10.983 56.509 1.00 84.88 ATOM 33 CG2 ILE D1274 12.036 -11.438 58.954 1.00 92.74 ATOM 34 CD1 ILE D1274 12.737 -9.582 56.735 1.00 72.04 ATOM 35 N SER D1275 8.741 -12.661 56.157 1.00 95.28 ATOM 36 CA SER D1275 7.865 -12.588 54.995 1.00 93.45 ATOM 37 C SER D1275 8.083 -11.269 54.285 1.00 91.59 ATOM 38 O SER D1275 8.301 -10.241 54.923 1.00 90.03 ATOM 39 CB SER D1275 6.399 -12.706 55.408 1.00106.35 ATOM 40 OG SER D1275 6.157 -13.914 56.107 1.00117.86 ATOM 41 N GLU D1276 8.024 -11.303 52.960 1.00 93.26 ATOM 42 CA GLU D1276 8.236 -10.107 52.160 1.00 94.76 ATOM 43 C GLU D1276 6.972 -9.264 52.093 1.00103.32 ATOM 44 O GLU D1276 7.043 -8.036 52.004 1.00101.44 ATOM 45 CB GLU D1276 8.717 -10.479 50.758 1.00 96.20 ATOM 46 CG GLU D1276 10.181 -10.879 50.703 1.00 95.74 ATOM 47 CD GLU D1276 10.504 -11.763 49.518 1.00 95.84 ATOM 48 OE1 GLU D1276 11.439 -11.428 48.757 1.00 93.36 ATOM 49 OE2 GLU D1276 9.828 -12.800 49.357 1.00 95.21 ATOM 50 N ILE D1277 5.819 -9.930 52.142 1.00111.86 ATOM 51 CA ILE D1277 4.526 -9.247 52.115 1.00116.27 ATOM 52 C ILE D1277 3.609 -9.758 53.230 1.00111.64 ATOM 53 O ILE D1277 4.005 -10.600 54.037 1.00106.50 ATOM 54 CB ILE D1277 3.809 -9.417 50.750 1.00116.03 ATOM 55 CG1 ILE D1277 4.820 -9.496 49.598 1.00107.18 ATOM 56 CG2 ILE D1277 2.806 -8.285 50.517 1.00114.24 ATOM 57 CD1 ILE D1277 5.459 -8.166 49.232 1.00100.82 ATOM 58 N ASP D1278 2.387 -9.234 53.268 1.00118.99 ATOM 59 CA ASP D1278 1.379 -9.664 54.232 1.00124.84 ATOM 60 C ASP D1278 0.724 -10.957 53.752 1.00127.98 ATOM 61 O ASP D1278 0.691 -11.228 52.552 1.00124.54 ATOM 62 CB ASP D1278 0.312 -8.580 54.401 1.00122.72 ATOM 63 CG ASP D1278 0.903 -7.217 54.722 1.00118.40 ATOM 64 OD1 ASP D1278 1.763 -7.136 55.624 1.00121.35 ATOM 65 OD2 ASP D1278 0.508 -6.226 54.069 1.00111.72 ATOM 66 N GLY D1279 0.202 -11.752 54.683 1.00131.85 ATOM 67 CA GLY D1279 -0.472 -12.987 54.318 1.00140.93 ATOM 68 C GLY D1279 -0.928 -13.848 55.483 1.00144.62 ATOM 69 O GLY D1279 -0.983 -13.396 56.627 1.00143.65 ATOM 70 N VAL D1280 -1.266 -15.098 55.178 1.00150.93 ATOM 71 CA VAL D1280 -1.669 -16.067 56.193 1.00154.26 ATOM 72 C VAL D1280 -0.795 -17.319 56.098 1.00154.11 ATOM 73 O VAL D1280 -0.355 -17.703 55.014 1.00148.34 ATOM 74 CB VAL D1280 -3.162 -16.446 56.066 1.00153.96 ATOM 75 CG1 VAL D1280 -3.402 -17.272 54.810 1.00150.74 ATOM 76 CG2 VAL D1280 -3.630 -17.200 57.302 1.00156.03 ATOM 77 N VAL D1281 -0.546 -17.953 57.239 1.00154.98 ATOM 78 CA VAL D1281 0.403 -19.059 57.307 1.00155.53 ATOM 79 C VAL D1281 -0.192 -20.415 56.936 1.00156.53 ATOM 80 O VAL D1281 -1.147 -20.881 57.557 1.00160.31 ATOM 81 CB VAL D1281 1.027 -19.171 58.711 1.00160.78 ATOM 82 CG1 VAL D1281 1.940 -20.386 58.792 1.00160.58 ATOM 83 CG2 VAL D1281 1.784 -17.899 59.058 1.00159.16 ATOM 84 N ARG D1282 0.402 -21.048 55.933 1.00151.70 ATOM 85 CA ARG D1282 0.060 -22.414 55.588 1.00157.47 ATOM 86 C ARG D1282 1.238 -23.259 56.036 1.00159.95 ATOM 87 O ARG D1282 2.381 -22.976 55.679 1.00154.39 ATOM 88 CB ARG D1282 -0.157 -22.556 54.082 1.00153.06 ATOM 89 CG ARG D1282 -1.093 -23.690 53.694 1.00147.58 ATOM 90 CD ARG D1282 -0.474 -24.575 52.625 1.00143.66 ATOM 91 NE ARG D1282 -0.542 -23.962 51.301 1.00142.00 ATOM 92 CZ ARG D1282 0.041 -24.462 50.216 1.00146.09 ATOM 93 NH1 ARG D1282 0.738 -25.587 50.293 1.00149.43 ATOM 94 NH2 ARG D1282 -0.073 -23.836 49.052 1.00143.97 ATOM 95 N ILE D1283 0.965 -24.289 56.827 1.00166.92 ATOM 96 CA ILE D1283 2.041 -25.078 57.403 1.00167.11 ATOM 97 C ILE D1283 2.311 -26.309 56.557 1.00167.62 ATOM 98 O ILE D1283 1.424 -27.131 56.327 1.00173.23 ATOM 99 CB ILE D1283 1.710 -25.518 58.842 1.00169.64 ATOM 100 CG1 ILE D1283 0.211 -25.378 59.110 1.00170.40 ATOM 101 CG2 ILE D1283 2.515 -24.706 59.845 1.00166.29 ATOM 102 CD1 ILE D1283 -0.649 -25.547 57.877 1.00164.78 ATOM 103 N GLU D1284 3.550 -26.426 56.095 1.00161.36 ATOM 104 CA GLU D1284 3.949 -27.557 55.277 1.00164.21 ATOM 105 C GLU D1284 5.059 -28.344 55.955 1.00168.03 ATOM 106 O GLU D1284 6.080 -27.787 56.357 1.00170.95 ATOM 107 CB GLU D1284 4.408 -27.086 53.896 1.00160.30 ATOM 108 CG GLU D1284 5.615 -27.834 53.354 1.00158.86 ATOM 109 CD GLU D1284 5.227 -29.015 52.485 1.00155.30 ATOM 110 OE1 GLU D1284 5.895 -30.066 52.576 1.00152.43 ATOM 111 OE2 GLU D1284 4.255 -28.891 51.711 1.00150.42 ATOM 112 N GLU D1285 4.848 -29.648 56.071 1.00168.06 ATOM 113 CA GLU D1285 5.857 -30.552 56.608 1.00168.34 ATOM 114 C GLU D1285 5.908 -31.898 55.876 1.00167.83 ATOM 115 O GLU D1285 4.914 -32.622 55.792 1.00168.65 ATOM 116 CB GLU D1285 5.677 -30.757 58.117 1.00169.12 ATOM 117 CG GLU D1285 6.651 -31.769 58.710 1.00172.92 ATOM 118 CD GLU D1285 7.570 -31.170 59.759 1.00172.71 ATOM 119 OE1 GLU D1285 8.772 -31.514 59.759 1.00174.10 ATOM 120 OE2 GLU D1285 7.092 -30.357 60.578 1.00163.23 ATOM 121 N THR D1286 7.080 -32.205 55.330 1.00167.24 ATOM 122 CA THR D1286 7.380 -33.515 54.758 1.00167.81 ATOM 123 C THR D1286 8.398 -34.126 55.709 1.00169.57 ATOM 124 O THR D1286 9.160 -33.392 56.335 1.00171.85 ATOM 125 CB THR D1286 7.936 -33.386 53.307 1.00166.05 ATOM 126 OG1 THR D1286 6.847 -33.203 52.393 1.00159.13 ATOM 127 CG2 THR D1286 8.731 -34.624 52.881 1.00159.92 ATOM 128 N GLU D1287 8.396 -35.445 55.872 1.00168.36 ATOM 129 CA GLU D1287 9.284 -36.038 56.868 1.00168.18 ATOM 130 C GLU D1287 10.741 -35.624 56.672 1.00170.55 ATOM 131 O GLU D1287 11.414 -35.266 57.631 1.00170.86 ATOM 132 CB GLU D1287 9.164 -37.560 56.925 1.00163.03 ATOM 133 CG GLU D1287 9.222 -38.144 58.354 1.00156.81 ATOM 134 CD GLU D1287 10.130 -37.370 59.322 1.00163.52 ATOM 135 OE1 GLU D1287 11.293 -37.792 59.524 1.00161.15 ATOM 136 OE2 GLU D1287 9.672 -36.359 59.905 1.00165.56 ATOM 137 N GLU D1288 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54.504 1.00162.17 ATOM 156 CA LEU D1290 10.092 -28.495 55.155 1.00158.99 ATOM 157 C LEU D1290 9.811 -27.291 54.267 1.00155.06 ATOM 158 O LEU D1290 10.638 -26.917 53.431 1.00148.31 ATOM 159 CB LEU D1290 10.738 -28.038 56.465 1.00156.25 ATOM 160 CG LEU D1290 9.890 -28.050 57.735 1.00156.36 ATOM 161 CD1 LEU D1290 9.172 -26.734 57.963 1.00145.68 ATOM 162 CD2 LEU D1290 8.902 -29.155 57.595 1.00163.73 ATOM 163 N SER D1291 8.632 -26.694 54.449 1.00151.14 ATOM 164 CA SER D1291 8.312 -25.444 53.765 1.00146.80 ATOM 165 C SER D1291 7.212 -24.645 54.460 1.00144.03 ATOM 166 O SER D1291 6.436 -25.177 55.255 1.00150.52 ATOM 167 CB SER D1291 7.952 -25.694 52.296 1.00142.06 ATOM 168 OG SER D1291 7.622 -24.487 51.633 1.00134.18 ATOM 169 N VAL D1292 7.211 -23.340 54.215 1.00139.84 ATOM 170 CA VAL D1292 6.199 -22.457 54.773 1.00134.98 ATOM 171 C VAL D1292 5.585 -21.615 53.666 1.00134.03 ATOM 172 O VAL D1292 6.304 -21.043 52.846 1.00131.64 ATOM 173 CB VAL D1292 6.791 -21.526 55.847 1.00127.25 ATOM 174 CG1 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