HEADER TRANSCRIPTION, TRANSFERASE/ANTIBIOTIC 16-SEP-13 4MQ9 TITLE Crystal structure of Thermus thermophilus RNA polymerase holoenzyme TITLE 2 in complex with GE23077 COMPND MOL_ID: 3; COMPND 2 MOLECULE: DNA-directed RNA polymerase subunit beta'; COMPND 3 CHAIN: D; COMPND 4 EC: 2.7.7.6; COMPND 5 FRAGMENT: ; EXPDTA X-RAY DIFFRACTION REMARK 2 RESOLUTION. 3.35 ANGSTORMS DBREF 4MQ9 D 1 1524 UNP Q8RQE8 RPOC_THET8 1 1524 SEQRES 1 D 91 ALA ASP CYS GLY THR THR ASN TYR ILE SER VAL PRO LEU SEQRES 2 D 91 PHE GLN PRO ASP GLU VAL THR ARG SER LEU ARG LEU ARG SEQRES 3 D 91 LYS ARG ALA ASP ILE GLU ALA GLY LEU TYR GLY ARG VAL SEQRES 4 D 91 LEU ALA ARG GLU VAL GLU VAL LEU GLY VAL ARG LEU GLU SEQRES 5 D 91 GLU GLY ARG TYR LEU SER MET ASP ASP VAL HIS LEU LEU SEQRES 6 D 91 ILE LYS ALA ALA GLU ALA GLY GLU ILE GLN GLU VAL PRO SEQRES 7 D 91 VAL ARG SER PRO LEU THR CYS GLN THR ARG TYR GLY VAL ATOM 1 N ALA D1110 50.155-124.511 16.978 1.00114.36 ATOM 2 CA ALA D1110 49.205-125.615 16.977 1.00118.38 ATOM 3 C ALA D1110 48.624-125.767 18.379 1.00115.95 ATOM 4 O ALA D1110 47.426-125.977 18.561 1.00111.50 ATOM 5 CB ALA D1110 49.883-126.897 16.534 1.00119.35 ATOM 6 N ASP D1111 49.504-125.663 19.367 1.00115.09 ATOM 7 CA ASP D1111 49.137-125.757 20.770 1.00114.90 ATOM 8 C ASP D1111 50.053-124.796 21.508 1.00117.15 ATOM 9 O ASP D1111 51.253-124.766 21.246 1.00125.88 ATOM 10 CB ASP D1111 49.363-127.190 21.261 1.00120.04 ATOM 11 CG ASP D1111 48.788-127.442 22.642 1.00120.12 ATOM 12 OD1 ASP D1111 48.927-126.570 23.528 1.00116.80 ATOM 13 OD2 ASP D1111 48.197-128.527 22.840 1.00118.94 ATOM 14 N CYS D1112 49.507-124.005 22.425 1.00107.26 ATOM 15 CA CYS D1112 50.348-123.052 23.138 1.00110.48 ATOM 16 C CYS D1112 50.900-123.665 24.416 1.00115.97 ATOM 17 O CYS D1112 51.744-123.069 25.085 1.00120.86 ATOM 18 CB CYS D1112 49.610-121.737 23.417 1.00114.73 ATOM 19 SG CYS D1112 48.549-121.709 24.874 1.00119.22 ATOM 20 N GLY D1113 50.421-124.863 24.739 1.00119.18 ATOM 21 CA GLY D1113 50.900-125.596 25.898 1.00126.99 ATOM 22 C GLY D1113 50.590-124.945 27.234 1.00121.73 ATOM 23 O GLY D1113 51.496-124.671 28.021 1.00121.85 ATOM 24 N THR D1114 49.314-124.687 27.496 1.00112.43 ATOM 25 CA THR D1114 48.933-124.069 28.758 1.00107.43 ATOM 26 C THR D1114 48.018-124.962 29.583 1.00110.41 ATOM 27 O THR D1114 47.189-125.700 29.048 1.00111.13 ATOM 28 CB THR D1114 48.284-122.689 28.556 1.00108.77 ATOM 29 OG1 THR D1114 48.240-121.994 29.807 1.00105.77 ATOM 30 CG2 THR D1114 46.879-122.819 27.993 1.00111.12 ATOM 31 N THR D1115 48.209-124.919 30.893 1.00115.71 ATOM 32 CA THR D1115 47.413-125.716 31.810 1.00112.11 ATOM 33 C THR D1115 46.065-125.068 32.087 1.00113.97 ATOM 34 O THR D1115 45.032-125.729 32.037 1.00118.05 ATOM 35 CB THR D1115 48.151-125.917 33.134 1.00115.81 ATOM 36 OG1 THR D1115 48.268-124.655 33.805 1.00123.25 ATOM 37 CG2 THR D1115 49.540-126.488 32.884 1.00112.32 ATOM 38 N ASN D1116 46.080-123.767 32.365 1.00114.10 ATOM 39 CA ASN D1116 44.870-123.060 32.784 1.00109.18 ATOM 40 C ASN D1116 43.793-122.993 31.703 1.00102.82 ATOM 41 O ASN D1116 44.081-123.127 30.513 1.00104.57 ATOM 42 CB ASN D1116 45.205-121.664 33.311 1.00 98.37 ATOM 43 CG ASN D1116 46.351-121.025 32.562 1.00118.66 ATOM 44 OD1 ASN D1116 46.750-121.498 31.496 1.00120.60 ATOM 45 ND2 ASN D1116 46.892-119.947 33.116 1.00130.80 ATOM 46 N TYR D1117 42.549-122.797 32.134 1.00100.57 ATOM 47 CA TYR D1117 41.396-122.866 31.244 1.00 93.51 ATOM 48 C TYR D1117 40.206-122.089 31.802 1.00 88.12 ATOM 49 O TYR D1117 40.341-121.361 32.784 1.00 92.72 ATOM 50 CB TYR D1117 41.002-124.323 31.029 1.00 89.00 ATOM 51 CG TYR D1117 40.709-125.082 32.307 1.00101.24 ATOM 52 CD1 TYR D1117 39.410-125.199 32.789 1.00105.92 ATOM 53 CD2 TYR D1117 41.729-125.691 33.027 1.00108.27 ATOM 54 CE1 TYR D1117 39.138-125.898 33.956 1.00105.24 ATOM 55 CE2 TYR D1117 41.467-126.389 34.194 1.00106.28 ATOM 56 CZ TYR D1117 40.171-126.490 34.652 1.00109.03 ATOM 57 OH TYR D1117 39.906-127.184 35.810 1.00116.64 ATOM 58 N ILE D1118 39.044-122.231 31.169 1.00 80.59 ATOM 59 CA ILE D1118 37.826-121.643 31.718 1.00 85.43 ATOM 60 C ILE D1118 36.780-122.717 31.979 1.00 91.70 ATOM 61 O ILE D1118 36.760-123.745 31.307 1.00 90.26 ATOM 62 CB ILE D1118 37.212-120.562 30.800 1.00 84.40 ATOM 63 CG1 ILE D1118 36.644-121.187 29.527 1.00 86.67 ATOM 64 CG2 ILE D1118 38.226-119.486 30.473 1.00 86.49 ATOM 65 CD1 ILE D1118 35.744-120.252 28.754 1.00 87.04 ATOM 66 N SER D1119 35.916-122.481 32.960 1.00 86.27 ATOM 67 CA SER D1119 34.838-123.418 33.243 1.00 87.76 ATOM 68 C SER D1119 33.498-122.841 32.821 1.00 91.70 ATOM 69 O SER D1119 33.038-121.844 33.372 1.00101.58 ATOM 70 CB SER D1119 34.817-123.805 34.723 1.00109.52 ATOM 71 OG SER D1119 35.733-124.856 34.989 1.00113.53 ATOM 72 N VAL D1120 32.884-123.475 31.829 1.00 87.08 ATOM 73 CA VAL D1120 31.612-123.020 31.295 1.00 85.08 ATOM 74 C VAL D1120 30.485-123.570 32.148 1.00 79.41 ATOM 75 O VAL D1120 30.316-124.784 32.248 1.00 87.02 ATOM 76 CB VAL D1120 31.413-123.499 29.847 1.00 89.89 ATOM 77 CG1 VAL D1120 30.141-122.909 29.265 1.00 88.81 ATOM 78 CG2 VAL D1120 32.620-123.137 28.988 1.00 86.33 ATOM 79 N PRO D1121 29.709-122.674 32.769 1.00 74.65 ATOM 80 CA PRO D1121 28.611-123.048 33.663 1.00 84.19 ATOM 81 C PRO D1121 27.418-123.599 32.898 1.00 85.64 ATOM 82 O PRO D1121 27.094-123.098 31.823 1.00 89.26 ATOM 83 CB PRO D1121 28.235-121.719 34.316 1.00 82.94 ATOM 84 CG PRO D1121 28.571-120.709 33.296 1.00 92.18 ATOM 85 CD PRO D1121 29.805-121.217 32.598 1.00 91.19 ATOM 86 N LEU D1122 26.790-124.638 33.437 1.00 87.39 ATOM 87 CA LEU D1122 25.568-125.172 32.849 1.00 82.58 ATOM 88 C LEU D1122 24.297-124.698 33.560 1.00 89.18 ATOM 89 O LEU D1122 23.191-125.035 33.141 1.00 87.76 ATOM 90 CB LEU D1122 25.626-126.698 32.772 1.00 74.97 ATOM 91 CG LEU D1122 26.876-127.226 32.059 1.00 80.43 ATOM 92 CD1 LEU D1122 26.764-128.714 31.771 1.00 80.01 ATOM 93 CD2 LEU D1122 27.140-126.450 30.776 1.00 85.18 ATOM 94 N PHE D1123 24.457-123.912 34.626 1.00 91.40 ATOM 95 CA PHE D1123 23.312-123.419 35.399 1.00 90.58 ATOM 96 C PHE D1123 23.401-121.921 35.689 1.00 89.83 ATOM 97 O PHE D1123 24.492-121.371 35.830 1.00 89.94 ATOM 98 CB PHE D1123 23.159-124.204 36.708 1.00 87.23 ATOM 99 CG PHE D1123 22.949-125.676 36.509 1.00 84.69 ATOM 100 CD1 PHE D1123 21.674-126.194 36.369 1.00 84.88 ATOM 101 CD2 PHE D1123 24.030-126.543 36.451 1.00 92.26 ATOM 102 CE1 PHE D1123 21.478-127.553 36.174 1.00 84.21 ATOM 103 CE2 PHE D1123 23.841-127.904 36.257 1.00 94.03 ATOM 104 CZ PHE D1123 22.562-128.409 36.118 1.00 84.30 ATOM 105 N GLN D1124 22.246-121.266 35.761 1.00 90.54 ATOM 106 CA GLN D1124 22.191-119.826 36.011 1.00102.72 ATOM 107 C GLN D1124 21.477-119.463 37.315 1.00103.94 ATOM 108 O GLN D1124 20.290-119.749 37.484 1.00103.93 ATOM 109 CB GLN D1124 21.568-119.088 34.820 1.00121.49 ATOM 110 CG GLN D1124 20.235-119.656 34.347 1.00129.26 ATOM 111 CD GLN D1124 19.746-119.007 33.065 1.00131.53 ATOM 112 OE1 GLN D1124 20.358-118.064 32.561 1.00133.43 ATOM 113 NE2 GLN D1124 18.639-119.513 32.529 1.00129.75 ATOM 114 N PRO D1125 22.204-118.827 38.243 1.00108.46 ATOM 115 CA PRO D1125 21.645-118.483 39.551 1.00111.60 ATOM 116 C PRO D1125 20.818-117.198 39.542 1.00120.28 ATOM 117 O PRO D1125 20.734-116.522 38.519 1.00125.82 ATOM 118 CB PRO D1125 22.895-118.290 40.410 1.00106.95 ATOM 119 CG PRO D1125 23.912-117.794 39.462 1.00103.84 ATOM 120 CD PRO D1125 23.635-118.489 38.152 1.00118.79 ATOM 121 N ASP D1126 20.224-116.885 40.693 1.00135.39 ATOM 122 CA ASP D1126 19.427-115.672 40.915 1.00140.98 ATOM 123 C ASP D1126 18.217-115.536 39.987 1.00151.49 ATOM 124 O ASP D1126 17.717-114.432 39.764 1.00158.24 ATOM 125 CB ASP D1126 20.307-114.414 40.848 1.00144.02 ATOM 126 CG ASP D1126 19.620-113.184 41.424 1.00139.56 ATOM 127 OD1 ASP D1126 18.951-113.307 42.472 1.00137.98 ATOM 128 OD2 ASP D1126 19.735-112.100 40.814 1.00136.71 ATOM 129 N GLU D1127 17.735-116.656 39.457 1.00157.12 ATOM 130 CA GLU D1127 16.523-116.634 38.642 1.00171.04 ATOM 131 C GLU D1127 15.381-116.224 39.552 1.00171.18 ATOM 132 O GLU D1127 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