HEADER TRANSCRIPTION, TRANSFERASE/ANTIBIOTIC 31-DEC-69 4OIQ TITLE Crystal structure of Thermus thermophilus transcription initiation TITLE 2 complex soaked with GE23077 and rifampicin COMPND MOL_ID: 3; COMPND 2 MOLECULE: DNA-directed RNA polymerase subunit beta'; COMPND 3 CHAIN: D; COMPND 4 EC: 2.7.7.6; EXPDTA X-RAY DIFFRACTION REMARK 2 RESOLUTION. 3.62 ANGSTORMS DBREF 4OIQ D 1 1524 UNP Q8RQE8 RPOC_THET8 1 1524 SEQRES 1 D 91 ALA ASP CYS GLY THR THR ASN TYR ILE SER VAL PRO LEU SEQRES 2 D 91 PHE GLN PRO ASP GLU VAL THR ARG SER LEU ARG LEU ARG SEQRES 3 D 91 LYS ARG ALA ASP ILE GLU ALA GLY LEU TYR GLY ARG VAL SEQRES 4 D 91 LEU ALA ARG GLU VAL GLU VAL LEU GLY VAL ARG LEU GLU SEQRES 5 D 91 GLU GLY ARG TYR LEU SER MET ASP ASP VAL HIS LEU LEU SEQRES 6 D 91 ILE LYS ALA ALA GLU ALA GLY GLU ILE GLN GLU VAL PRO SEQRES 7 D 91 VAL ARG SER PRO LEU THR CYS GLN THR ARG TYR GLY VAL ATOM 1 N ALA D1110 -27.727 25.877 66.359 1.00 44.09 ATOM 2 CA ALA D1110 -28.660 25.675 67.459 1.00 35.63 ATOM 3 C ALA D1110 -29.816 24.776 67.038 1.00 37.27 ATOM 4 O ALA D1110 -30.302 23.981 67.837 1.00 39.34 ATOM 5 CB ALA D1110 -29.171 26.996 67.969 1.00 36.02 ATOM 6 N ASP D1111 -30.258 24.905 65.788 1.00 39.29 ATOM 7 CA ASP D1111 -31.314 24.036 65.257 1.00 40.98 ATOM 8 C ASP D1111 -31.283 23.911 63.720 1.00 43.28 ATOM 9 O ASP D1111 -31.183 24.905 62.995 1.00 44.31 ATOM 10 CB ASP D1111 -32.700 24.489 65.743 1.00 39.10 ATOM 11 CG ASP D1111 -33.778 23.423 65.535 1.00 42.44 ATOM 12 OD1 ASP D1111 -33.445 22.221 65.472 1.00 40.11 ATOM 13 OD2 ASP D1111 -34.969 23.792 65.442 1.00 47.25 ATOM 14 N CYS D1112 -31.360 22.673 63.242 1.00 40.15 ATOM 15 CA CYS D1112 -31.434 22.389 61.821 1.00 35.50 ATOM 16 C CYS D1112 -32.891 22.429 61.388 1.00 38.44 ATOM 17 O CYS D1112 -33.202 22.333 60.198 1.00 45.25 ATOM 18 CB CYS D1112 -30.867 21.006 61.532 1.00 33.96 ATOM 19 SG CYS D1112 -31.854 19.696 62.268 1.00 30.47 ATOM 20 N GLY D1113 -33.782 22.553 62.367 1.00 36.50 ATOM 21 CA GLY D1113 -35.204 22.675 62.107 1.00 38.98 ATOM 22 C GLY D1113 -35.792 21.478 61.389 1.00 35.62 ATOM 23 O GLY D1113 -36.759 21.594 60.637 1.00 35.58 ATOM 24 N THR D1114 -35.203 20.316 61.609 1.00 32.46 ATOM 25 CA THR D1114 -35.754 19.124 61.021 1.00 33.57 ATOM 26 C THR D1114 -37.077 18.803 61.710 1.00 35.29 ATOM 27 O THR D1114 -37.236 19.018 62.907 1.00 37.10 ATOM 28 CB THR D1114 -34.785 17.946 61.132 1.00 35.24 ATOM 29 OG1 THR D1114 -35.292 16.841 60.374 1.00 40.53 ATOM 30 CG2 THR D1114 -34.599 17.529 62.587 1.00 34.08 ATOM 31 N THR D1115 -38.040 18.321 60.940 1.00 38.18 ATOM 32 CA THR D1115 -39.306 17.892 61.508 1.00 38.25 ATOM 33 C THR D1115 -39.271 16.389 61.745 1.00 38.68 ATOM 34 O THR D1115 -40.277 15.792 62.126 1.00 38.43 ATOM 35 CB THR D1115 -40.472 18.232 60.573 1.00 46.10 ATOM 36 OG1 THR D1115 -40.125 17.864 59.228 1.00 50.16 ATOM 37 CG2 THR D1115 -40.772 19.719 60.619 1.00 43.76 ATOM 38 N ASN D1116 -38.109 15.785 61.502 1.00 38.41 ATOM 39 CA ASN D1116 -37.928 14.347 61.659 1.00 35.72 ATOM 40 C ASN D1116 -37.457 14.044 63.058 1.00 33.77 ATOM 41 O ASN D1116 -36.852 14.896 63.710 1.00 32.26 ATOM 42 CB ASN D1116 -36.884 13.811 60.675 1.00 39.72 ATOM 43 CG ASN D1116 -37.218 14.120 59.225 1.00 50.71 ATOM 44 OD1 ASN D1116 -38.383 14.326 58.869 1.00 56.29 ATOM 45 ND2 ASN D1116 -36.189 14.143 58.372 1.00 47.81 ATOM 46 N TYR D1117 -37.724 12.821 63.508 1.00 34.77 ATOM 47 CA TYR D1117 -37.312 12.362 64.838 1.00 33.33 ATOM 48 C TYR D1117 -37.276 10.838 64.876 1.00 29.83 ATOM 49 O TYR D1117 -37.656 10.178 63.904 1.00 30.40 ATOM 50 CB TYR D1117 -38.264 12.898 65.914 1.00 31.42 ATOM 51 CG TYR D1117 -39.721 12.557 65.682 1.00 31.80 ATOM 52 CD1 TYR D1117 -40.278 11.402 66.218 1.00 34.77 ATOM 53 CD2 TYR D1117 -40.539 13.383 64.921 1.00 33.70 ATOM 54 CE1 TYR D1117 -41.612 11.077 65.998 1.00 37.25 ATOM 55 CE2 TYR D1117 -41.874 13.067 64.698 1.00 36.66 ATOM 56 CZ TYR D1117 -42.403 11.911 65.236 1.00 40.00 ATOM 57 OH TYR D1117 -43.726 11.586 65.014 1.00 45.39 ATOM 58 N ILE D1118 -36.822 10.276 65.989 1.00 25.93 ATOM 59 CA ILE D1118 -36.880 8.831 66.151 1.00 26.06 ATOM 60 C ILE D1118 -37.801 8.473 67.312 1.00 31.91 ATOM 61 O ILE D1118 -38.116 9.328 68.141 1.00 32.43 ATOM 62 CB ILE D1118 -35.480 8.227 66.336 1.00 23.71 ATOM 63 CG1 ILE D1118 -34.917 8.507 67.720 1.00 24.40 ATOM 64 CG2 ILE D1118 -34.539 8.818 65.333 1.00 26.20 ATOM 65 CD1 ILE D1118 -33.611 7.781 67.960 1.00 21.70 ATOM 66 N SER D1119 -38.256 7.223 67.363 1.00 34.39 ATOM 67 CA SER D1119 -39.132 6.781 68.455 1.00 37.68 ATOM 68 C SER D1119 -38.487 5.750 69.367 1.00 36.77 ATOM 69 O SER D1119 -38.420 4.571 69.024 1.00 44.56 ATOM 70 CB SER D1119 -40.426 6.193 67.904 1.00 42.32 ATOM 71 OG SER D1119 -41.288 7.210 67.441 1.00 49.89 ATOM 72 N VAL D1120 -38.033 6.180 70.537 1.00 30.47 ATOM 73 CA VAL D1120 -37.402 5.243 71.452 1.00 33.23 ATOM 74 C VAL D1120 -38.459 4.352 72.103 1.00 37.61 ATOM 75 O VAL D1120 -39.348 4.848 72.791 1.00 38.33 ATOM 76 CB VAL D1120 -36.614 5.965 72.543 1.00 30.98 ATOM 77 CG1 VAL D1120 -35.869 4.956 73.394 1.00 31.89 ATOM 78 CG2 VAL D1120 -35.660 6.965 71.925 1.00 27.02 ATOM 79 N PRO D1121 -38.371 3.030 71.882 1.00 39.25 ATOM 80 CA PRO D1121 -39.369 2.104 72.422 1.00 37.80 ATOM 81 C PRO D1121 -39.085 1.795 73.867 1.00 39.10 ATOM 82 O PRO D1121 -37.950 1.482 74.209 1.00 36.42 ATOM 83 CB PRO D1121 -39.164 0.846 71.592 1.00 41.44 ATOM 84 CG PRO D1121 -37.710 0.868 71.269 1.00 49.38 ATOM 85 CD PRO D1121 -37.344 2.328 71.094 1.00 44.87 ATOM 86 N LEU D1122 -40.112 1.891 74.704 1.00 47.24 ATOM 87 CA LEU D1122 -39.989 1.609 76.132 1.00 47.92 ATOM 88 C LEU D1122 -40.352 0.149 76.375 1.00 52.11 ATOM 89 O LEU D1122 -40.104 -0.398 77.452 1.00 53.35 ATOM 90 CB LEU D1122 -40.909 2.530 76.936 1.00 36.69 ATOM 91 CG LEU D1122 -40.744 4.043 76.763 1.00 29.93 ATOM 92 CD1 LEU D1122 -42.029 4.769 77.094 1.00 36.75 ATOM 93 CD2 LEU D1122 -39.618 4.565 77.618 1.00 21.17 ATOM 94 N PHE D1123 -40.949 -0.471 75.360 1.00 52.77 ATOM 95 CA PHE D1123 -41.348 -1.869 75.446 1.00 60.25 ATOM 96 C PHE D1123 -40.704 -2.682 74.334 1.00 65.02 ATOM 97 O PHE D1123 -40.640 -2.230 73.188 1.00 66.15 ATOM 98 CB PHE D1123 -42.873 -2.000 75.378 1.00 63.82 ATOM 99 CG PHE D1123 -43.582 -1.420 76.562 1.00 53.18 ATOM 100 CD1 PHE D1123 -43.734 -2.159 77.720 1.00 52.62 ATOM 101 CD2 PHE D1123 -44.090 -0.134 76.517 1.00 51.36 ATOM 102 CE1 PHE D1123 -44.378 -1.629 78.815 1.00 53.67 ATOM 103 CE2 PHE D1123 -44.736 0.404 77.614 1.00 55.56 ATOM 104 CZ PHE D1123 -44.880 -0.345 78.765 1.00 54.11 ATOM 105 N GLN D1124 -40.224 -3.876 74.682 1.00 71.91 ATOM 106 CA GLN D1124 -39.606 -4.782 73.714 1.00 79.58 ATOM 107 C GLN D1124 -40.297 -6.139 73.730 1.00 86.24 ATOM 108 O GLN D1124 -40.820 -6.560 74.771 1.00 89.43 ATOM 109 CB GLN D1124 -38.112 -4.952 74.000 1.00 77.87 ATOM 110 CG GLN D1124 -37.798 -5.534 75.372 1.00 80.79 ATOM 111 CD GLN D1124 -36.312 -5.495 75.689 1.00 87.35 ATOM 112 OE1 GLN D1124 -35.886 -5.835 76.801 1.00 81.85 ATOM 113 NE2 GLN D1124 -35.511 -5.075 74.708 1.00 83.16 ATOM 114 N PRO D1125 -40.320 -6.818 72.569 1.00 88.85 ATOM 115 CA PRO D1125 -40.909 -8.158 72.470 1.00 98.30 ATOM 116 C PRO D1125 -40.197 -9.167 73.373 1.00108.65 ATOM 117 O PRO D1125 -38.975 -9.293 73.296 1.00112.23 ATOM 118 CB PRO D1125 -40.711 -8.513 70.993 1.00 89.81 ATOM 119 CG PRO D1125 -40.691 -7.191 70.301 1.00 79.73 ATOM 120 CD PRO D1125 -39.954 -6.286 71.246 1.00 83.13 ATOM 121 N ASP D1126 -40.959 -9.854 74.224 1.00112.18 ATOM 122 CA ASP D1126 -40.423 -10.888 75.109 1.00119.98 ATOM 123 C ASP D1126 -39.925 -12.054 74.249 1.00133.34 ATOM 124 O ASP D1126 -40.400 -12.246 73.126 1.00136.10 ATOM 125 CB ASP D1126 -41.516 -11.352 76.088 1.00121.35 ATOM 126 CG ASP D1126 -40.959 -12.044 77.329 1.00123.73 ATOM 127 OD1 ASP D1126 -40.561 -11.344 78.286 1.00121.93 ATOM 128 OD2 ASP D1126 -40.945 -13.290 77.362 1.00125.26 ATOM 129 N GLU D1127 -38.961 -12.818 74.758 1.00133.36 ATOM 130 CA GLU D1127 -38.449 -13.973 74.017 1.00136.97 ATOM 131 C GLU D1127 -39.473 -15.114 73.977 1.00140.97 ATOM 132 O GLU D1127 -39.467 -15.933 73.053 1.00140.00 ATOM 133 CB GLU D1127 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THR D1129 -43.427 -13.634 69.830 1.00113.29 ATOM 152 N ARG D1130 -44.870 -13.911 74.149 1.00129.55 ATOM 153 CA ARG D1130 -46.202 -13.934 74.732 1.00127.50 ATOM 154 C ARG D1130 -46.835 -12.555 74.647 1.00135.16 ATOM 155 O ARG D1130 -48.022 -12.422 74.342 1.00140.71 ATOM 156 CB ARG D1130 -46.153 -14.389 76.187 1.00119.99 ATOM 157 CG ARG D1130 -47.498 -14.849 76.710 1.00111.54 ATOM 158 CD ARG D1130 -47.505 -14.897 78.211 1.00107.45 ATOM 159 NE ARG D1130 -47.511 -13.558 78.785 1.00114.04 ATOM 160 CZ ARG D1130 -47.439 -13.308 80.088 1.00117.66 ATOM 161 NH1 ARG D1130 -47.453 -12.057 80.530 1.00119.38 ATOM 162 NH2 ARG D1130 -47.348 -14.311 80.950 1.00115.83 ATOM 163 N SER D1131 -46.034 -11.533 74.932 1.00132.92 ATOM 164 CA SER D1131 -46.463 -10.143 74.794 1.00127.35 ATOM 165 C SER D1131 -45.249 -9.223 74.651 1.00115.71 ATOM 166 O SER D1131 -44.152 -9.677 74.313 1.00113.22 ATOM 167 CB SER D1131 -47.353 -9.714 75.977 1.00116.22 ATOM 168 OG SER D1131 -46.686 -9.827 77.223 1.00105.77 ATOM 169 N 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224 CZ ARG D1137 -37.026 3.446 87.585 1.00 64.44 ATOM 225 NH1 ARG D1137 -38.330 3.400 87.342 1.00 61.75 ATOM 226 NH2 ARG D1137 -36.581 3.954 88.731 1.00 62.00 ATOM 227 N ALA D1138 -31.927 0.931 83.156 1.00 44.88 ATOM 228 CA ALA D1138 -30.640 1.416 82.678 1.00 44.28 ATOM 229 C ALA D1138 -30.693 1.643 81.174 1.00 36.47 ATOM 230 O ALA D1138 -30.165 2.627 80.663 1.00 37.35 ATOM 231 CB ALA D1138 -29.543 0.422 83.025 1.00 52.31 ATOM 232 N ASP D1139 -31.353 0.734 80.472 1.00 31.94 ATOM 233 CA ASP D1139 -31.382 0.792 79.027 1.00 33.98 ATOM 234 C ASP D1139 -32.175 1.999 78.550 1.00 35.22 ATOM 235 O ASP D1139 -31.727 2.777 77.671 1.00 39.73 ATOM 236 CB ASP D1139 -31.958 -0.502 78.464 1.00 37.57 ATOM 237 CG ASP D1139 -31.119 -1.718 78.835 1.00 38.42 ATOM 238 OD1 ASP D1139 -29.986 -1.529 79.349 1.00 34.79 ATOM 239 OD2 ASP D1139 -31.588 -2.859 78.608 1.00 37.82 ATOM 240 N ILE D1140 -33.346 2.172 79.149 1.00 29.16 ATOM 241 CA ILE D1140 -34.209 3.280 78.783 1.00 26.85 ATOM 242 C ILE D1140 -33.553 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