HEADER transcription/DNA 13-JAN-15 4XLP TITLE Crystal structure of T.aquaticus transcription initiation complex TITLE 2 containing upstream fork promoter COMPND MOL_ID: 3; COMPND 2 MOLECULE: DNA-directed RNA polymerase subunit beta'; COMPND 3 CHAIN: D, J; COMPND 4 EC: 2.7.7.6; EXPDTA X-RAY DIFFRACTION REMARK 2 RESOLUTION. 4.00 ANGSTORMS DBREF 4XLP D 1 1524 UNP Q9KWU6 RPOC_THEAQ 1 1524 SEQRES 1 D 61 ALA LYS ALA VAL ILE SER GLU ILE ASP GLY VAL VAL ARG SEQRES 2 D 61 ILE GLU GLU GLY GLU ASP ARG LEU SER VAL PHE VAL GLU SEQRES 3 D 61 SER GLU GLY PHE SER LYS GLU TYR LYS LEU PRO LYS ASP SEQRES 4 D 61 ALA ARG LEU LEU VAL LYS ASP GLY ASP TYR VAL GLU ALA SEQRES 5 D 61 GLY GLN PRO LEU THR ARG GLY ALA ILE ATOM 1 N ALA D1270 19.596 107.175 110.951 1.00132.20 ATOM 2 CA ALA D1270 20.266 108.334 111.506 1.00108.90 ATOM 3 C ALA D1270 19.503 109.558 111.052 1.00 83.51 ATOM 4 O ALA D1270 20.012 110.359 110.272 1.00 85.66 ATOM 5 CB ALA D1270 21.680 108.388 110.931 1.00127.55 ATOM 6 N LYS D1271 18.414 109.842 111.748 1.00 73.05 ATOM 7 CA LYS D1271 17.466 110.842 111.290 1.00 88.19 ATOM 8 C LYS D1271 18.031 112.217 111.575 1.00110.47 ATOM 9 O LYS D1271 18.458 112.498 112.695 1.00135.66 ATOM 10 CB LYS D1271 16.129 110.676 112.013 1.00105.24 ATOM 11 CG LYS D1271 14.973 110.194 111.145 1.00123.65 ATOM 12 CD LYS D1271 13.812 109.715 112.008 1.00142.25 ATOM 13 CE LYS D1271 13.352 110.791 112.983 1.00139.82 ATOM 14 NZ LYS D1271 12.670 111.924 112.300 1.00130.17 ATOM 15 N ALA D1272 18.056 113.066 110.557 1.00 83.76 ATOM 16 CA ALA D1272 18.418 114.456 110.756 1.00 80.07 ATOM 17 C ALA D1272 17.160 115.206 111.159 1.00 83.62 ATOM 18 O ALA D1272 16.074 114.627 111.205 1.00 88.31 ATOM 19 CB ALA D1272 19.008 115.036 109.486 1.00 84.37 ATOM 20 N VAL D1273 17.298 116.495 111.442 1.00 83.92 ATOM 21 CA VAL D1273 16.145 117.297 111.821 1.00 80.95 ATOM 22 C VAL D1273 15.981 118.486 110.884 1.00 92.31 ATOM 23 O VAL D1273 16.961 119.048 110.397 1.00106.06 ATOM 24 CB VAL D1273 16.235 117.779 113.282 1.00 84.07 ATOM 25 CG1 VAL D1273 16.272 116.589 114.225 1.00 92.37 ATOM 26 CG2 VAL D1273 17.456 118.655 113.481 1.00 94.25 ATOM 27 N ILE D1274 14.733 118.856 110.625 1.00 81.55 ATOM 28 CA ILE D1274 14.442 119.941 109.700 1.00 96.58 ATOM 29 C ILE D1274 13.518 120.973 110.332 1.00105.83 ATOM 30 O ILE D1274 12.717 120.650 111.209 1.00131.56 ATOM 31 CB ILE D1274 13.806 119.417 108.403 1.00106.12 ATOM 32 CG1 ILE D1274 12.572 118.573 108.721 1.00130.06 ATOM 33 CG2 ILE D1274 14.812 118.598 107.613 1.00110.75 ATOM 34 CD1 ILE D1274 11.897 118.005 107.498 1.00146.97 ATOM 35 N SER D1275 13.641 122.217 109.883 1.00103.33 ATOM 36 CA SER D1275 12.822 123.302 110.404 1.00103.27 ATOM 37 C SER D1275 11.447 123.298 109.751 1.00113.60 ATOM 38 O SER D1275 11.332 123.307 108.525 1.00131.68 ATOM 39 CB SER D1275 13.508 124.650 110.181 1.00 96.21 ATOM 40 OG SER D1275 12.689 125.716 110.629 1.00 87.26 ATOM 41 N GLU D1276 10.406 123.280 110.575 1.00 75.81 ATOM 42 CA GLU D1276 9.039 123.272 110.074 1.00 84.12 ATOM 43 C GLU D1276 8.630 124.662 109.602 1.00 93.54 ATOM 44 O GLU D1276 7.638 124.818 108.891 1.00140.98 ATOM 45 CB GLU D1276 8.078 122.774 111.153 1.00121.07 ATOM 46 CG GLU D1276 8.457 121.426 111.746 1.00130.01 ATOM 47 CD GLU D1276 7.480 120.960 112.809 1.00138.30 ATOM 48 OE1 GLU D1276 6.271 121.246 112.677 1.00151.49 ATOM 49 OE2 GLU D1276 7.922 120.312 113.781 1.00120.44 ATOM 50 N ILE D1277 9.397 125.670 110.005 1.00 68.39 ATOM 51 CA ILE D1277 9.102 127.050 109.637 1.00 85.30 ATOM 52 C ILE D1277 10.345 127.798 109.168 1.00100.88 ATOM 53 O ILE D1277 11.444 127.244 109.141 1.00100.61 ATOM 54 CB ILE D1277 8.465 127.825 110.809 1.00106.70 ATOM 55 CG1 ILE D1277 9.363 127.761 112.048 1.00121.08 ATOM 56 CG2 ILE D1277 7.078 127.282 111.122 1.00116.45 ATOM 57 CD1 ILE D1277 10.116 129.047 112.330 1.00102.08 ATOM 58 N ASP D1278 10.158 129.062 108.803 1.00103.51 ATOM 59 CA ASP D1278 11.258 129.919 108.383 1.00 96.79 ATOM 60 C ASP D1278 11.580 130.910 109.493 1.00101.30 ATOM 61 O ASP D1278 10.747 131.743 109.846 1.00115.70 ATOM 62 CB ASP D1278 10.888 130.683 107.110 1.00101.95 ATOM 63 CG ASP D1278 10.336 129.780 106.024 1.00116.28 ATOM 64 OD1 ASP D1278 11.128 129.299 105.187 1.00122.62 ATOM 65 OD2 ASP D1278 9.108 129.556 106.004 1.00145.13 ATOM 66 N GLY D1279 12.786 130.821 110.042 1.00 92.84 ATOM 67 CA GLY D1279 13.187 131.717 111.111 1.00123.41 ATOM 68 C GLY D1279 14.670 131.691 111.419 1.00148.15 ATOM 69 O GLY D1279 15.442 130.992 110.766 1.00141.73 ATOM 70 N VAL D1280 15.065 132.470 112.420 1.00153.43 ATOM 71 CA VAL D1280 16.450 132.514 112.871 1.00133.12 ATOM 72 C VAL D1280 16.787 131.323 113.761 1.00107.25 ATOM 73 O VAL D1280 15.917 130.767 114.442 1.00 86.74 ATOM 74 CB VAL D1280 16.758 133.817 113.635 1.00120.45 ATOM 75 CG1 VAL D1280 16.510 135.024 112.745 1.00167.95 ATOM 76 CG2 VAL D1280 15.923 133.904 114.906 1.00100.60 ATOM 77 N VAL D1281 18.058 130.935 113.743 1.00114.99 ATOM 78 CA VAL D1281 18.543 129.842 114.573 1.00107.81 ATOM 79 C VAL D1281 19.284 130.373 115.792 1.00121.64 ATOM 80 O VAL D1281 20.296 131.065 115.671 1.00131.21 ATOM 81 CB VAL D1281 19.466 128.891 113.782 1.00120.00 ATOM 82 CG1 VAL D1281 20.248 127.988 114.727 1.00135.86 ATOM 83 CG2 VAL D1281 18.654 128.066 112.800 1.00132.64 ATOM 84 N ARG D1282 18.766 130.044 116.968 1.00123.10 ATOM 85 CA ARG D1282 19.391 130.428 118.221 1.00129.24 ATOM 86 C ARG D1282 19.819 129.169 118.963 1.00125.67 ATOM 87 O ARG D1282 18.983 128.396 119.426 1.00107.07 ATOM 88 CB ARG D1282 18.412 131.237 119.072 1.00111.29 ATOM 89 CG ARG D1282 19.004 131.779 120.359 1.00149.32 ATOM 90 CD ARG D1282 17.977 132.580 121.143 1.00156.85 ATOM 91 NE ARG D1282 16.870 131.749 121.610 1.00144.41 ATOM 92 CZ ARG D1282 16.852 131.118 122.780 1.00130.55 ATOM 93 NH1 ARG D1282 17.883 131.221 123.608 1.00113.60 ATOM 94 NH2 ARG D1282 15.803 130.384 123.123 1.00125.65 ATOM 95 N ILE D1283 21.127 128.966 119.072 1.00147.13 ATOM 96 CA ILE D1283 21.658 127.780 119.729 1.00121.21 ATOM 97 C ILE D1283 21.820 128.018 121.223 1.00134.32 ATOM 98 O ILE D1283 22.466 128.979 121.642 1.00146.83 ATOM 99 CB ILE D1283 23.018 127.364 119.136 1.00125.77 ATOM 100 CG1 ILE D1283 22.918 127.220 117.616 1.00139.26 ATOM 101 CG2 ILE D1283 23.503 126.067 119.768 1.00 74.09 ATOM 102 CD1 ILE D1283 24.227 126.854 116.951 1.00134.10 ATOM 103 N GLU D1284 21.224 127.143 122.024 1.00135.50 ATOM 104 CA GLU D1284 21.346 127.233 123.470 1.00135.83 ATOM 105 C GLU D1284 21.768 125.909 124.098 1.00134.36 ATOM 106 O GLU D1284 21.121 124.865 123.910 1.00123.76 ATOM 107 CB GLU D1284 20.050 127.738 124.105 1.00127.08 ATOM 108 CG GLU D1284 20.115 127.834 125.620 1.00143.69 ATOM 109 CD GLU D1284 19.016 128.700 126.202 1.00146.50 ATOM 110 OE1 GLU D1284 18.929 129.886 125.821 1.00144.54 ATOM 111 OE2 GLU D1284 18.240 128.194 127.039 1.00129.59 ATOM 112 N GLU D1285 22.885 125.963 124.817 1.00133.71 ATOM 113 CA GLU D1285 23.349 124.835 125.606 1.00130.59 ATOM 114 C GLU D1285 23.886 125.246 126.977 1.00203.21 ATOM 115 O GLU D1285 24.860 125.989 127.079 1.00250.72 ATOM 116 CB GLU D1285 24.417 124.048 124.835 1.00120.47 ATOM 117 CG GLU D1285 24.941 124.747 123.584 1.00160.31 ATOM 118 CD GLU D1285 26.108 125.677 123.860 1.00188.61 ATOM 119 OE1 GLU D1285 26.610 125.687 125.003 1.00202.08 ATOM 120 OE2 GLU D1285 26.533 126.394 122.927 1.00185.60 ATOM 121 N GLY D1286 23.233 124.765 128.028 1.00224.86 ATOM 122 CA GLY D1286 23.887 124.593 129.310 1.00216.06 ATOM 123 C GLY D1286 24.366 123.173 129.121 1.00208.46 ATOM 124 O GLY D1286 23.852 122.502 128.225 1.00191.26 ATOM 125 N GLU D1287 25.305 122.669 129.912 1.00209.80 ATOM 126 CA GLU D1287 25.785 121.356 129.529 1.00184.97 ATOM 127 C GLU D1287 24.915 120.319 130.209 1.00162.89 ATOM 128 O GLU D1287 25.124 119.946 131.363 1.00147.76 ATOM 129 CB GLU D1287 27.245 121.183 129.955 1.00166.93 ATOM 130 CG GLU D1287 27.839 119.830 129.606 1.00127.78 ATOM 131 CD GLU D1287 27.868 119.580 128.113 1.00132.21 ATOM 132 OE1 GLU D1287 28.467 120.400 127.387 1.00168.21 ATOM 133 OE2 GLU D1287 27.287 118.569 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