HEADER transcription/DNA 13-JAN-15 4XLQ TITLE Crystal structure of T.aquaticus transcription initiation complex TITLE 2 containing upstream fork (-11 base-paired) promoter COMPND MOL_ID: 3; COMPND 2 MOLECULE: DNA-directed RNA polymerase subunit beta'; COMPND 3 CHAIN: D, J; COMPND 4 EC: 2.7.7.6; EXPDTA X-RAY DIFFRACTION REMARK 2 RESOLUTION. 4.60 ANGSTORMS DBREF 4XLQ D 1 1524 UNP Q9KWU6 RPOC_THEAQ 1 1524 SEQRES 1 D 61 ALA LYS ALA VAL ILE SER GLU ILE ASP GLY VAL VAL ARG SEQRES 2 D 61 ILE GLU GLU GLY GLU ASP ARG LEU SER VAL PHE VAL GLU SEQRES 3 D 61 SER GLU GLY PHE SER LYS GLU TYR LYS LEU PRO LYS ASP SEQRES 4 D 61 ALA ARG LEU LEU VAL LYS ASP GLY ASP TYR VAL GLU ALA SEQRES 5 D 61 GLY GLN PRO LEU THR ARG GLY ALA ILE ATOM 1 N ALA D1270 19.457 106.550 110.423 1.00192.82 ATOM 2 CA ALA D1270 20.131 107.687 111.026 1.00178.63 ATOM 3 C ALA D1270 19.250 108.913 111.006 1.00142.98 ATOM 4 O ALA D1270 19.760 110.028 111.126 1.00131.99 ATOM 5 CB ALA D1270 21.454 107.959 110.318 1.00165.95 ATOM 6 N LYS D1271 17.940 108.696 110.870 1.00172.17 ATOM 7 CA LYS D1271 17.005 109.700 110.375 1.00177.74 ATOM 8 C LYS D1271 17.326 111.090 110.863 1.00155.31 ATOM 9 O LYS D1271 17.324 111.376 112.057 1.00159.76 ATOM 10 CB LYS D1271 15.582 109.338 110.833 1.00198.77 ATOM 11 CG LYS D1271 14.517 110.388 110.531 1.00186.20 ATOM 12 CD LYS D1271 13.194 110.072 111.240 1.00174.07 ATOM 13 CE LYS D1271 13.335 110.251 112.752 1.00172.01 ATOM 14 NZ LYS D1271 12.074 110.006 113.506 1.00172.01 ATOM 15 N ALA D1272 17.624 111.942 109.892 1.00122.00 ATOM 16 CA ALA D1272 18.011 113.309 110.146 1.00109.28 ATOM 17 C ALA D1272 16.785 114.097 110.534 1.00122.42 ATOM 18 O ALA D1272 15.657 113.643 110.345 1.00146.94 ATOM 19 CB ALA D1272 18.681 113.910 108.932 1.00108.28 ATOM 20 N VAL D1273 17.004 115.278 111.085 1.00 89.81 ATOM 21 CA VAL D1273 15.892 116.126 111.448 1.00106.98 ATOM 22 C VAL D1273 15.971 117.407 110.632 1.00 84.76 ATOM 23 O VAL D1273 17.041 117.815 110.181 1.00 97.33 ATOM 24 CB VAL D1273 15.870 116.409 112.964 1.00125.73 ATOM 25 CG1 VAL D1273 16.061 115.115 113.741 1.00150.70 ATOM 26 CG2 VAL D1273 16.926 117.417 113.343 1.00134.74 ATOM 27 N ILE D1274 14.811 118.006 110.408 1.00 90.13 ATOM 28 CA ILE D1274 14.692 119.189 109.576 1.00 96.20 ATOM 29 C ILE D1274 13.796 120.215 110.247 1.00106.22 ATOM 30 O ILE D1274 12.947 119.863 111.066 1.00115.73 ATOM 31 CB ILE D1274 14.130 118.829 108.180 1.00 90.69 ATOM 32 CG1 ILE D1274 12.859 117.982 108.315 1.00110.00 ATOM 33 CG2 ILE D1274 15.133 118.008 107.398 1.00 85.67 ATOM 34 CD1 ILE D1274 11.569 118.766 108.381 1.00107.29 ATOM 35 N SER D1275 13.986 121.483 109.905 1.00107.85 ATOM 36 CA SER D1275 13.133 122.525 110.449 1.00127.33 ATOM 37 C SER D1275 11.763 122.369 109.802 1.00113.76 ATOM 38 O SER D1275 11.651 122.355 108.576 1.00102.63 ATOM 39 CB SER D1275 13.714 123.917 110.181 1.00117.54 ATOM 40 OG SER D1275 15.066 124.008 110.599 1.00120.22 ATOM 41 N GLU D1276 10.726 122.219 110.623 1.00123.78 ATOM 42 CA GLU D1276 9.368 122.041 110.111 1.00106.07 ATOM 43 C GLU D1276 8.861 123.278 109.378 1.00 93.42 ATOM 44 O GLU D1276 7.835 123.224 108.700 1.00119.72 ATOM 45 CB GLU D1276 8.406 121.695 111.253 1.00171.49 ATOM 46 CG GLU D1276 8.679 120.366 111.939 1.00173.12 ATOM 47 CD GLU D1276 7.809 120.155 113.164 1.00193.98 ATOM 48 OE1 GLU D1276 6.581 119.988 113.008 1.00203.42 ATOM 49 OE2 GLU D1276 8.357 120.172 114.287 1.00178.05 ATOM 50 N ILE D1277 9.580 124.387 109.514 1.00 83.38 ATOM 51 CA ILE D1277 9.205 125.626 108.850 1.00103.03 ATOM 52 C ILE D1277 10.414 126.559 108.809 1.00111.22 ATOM 53 O ILE D1277 11.470 126.236 109.356 1.00104.48 ATOM 54 CB ILE D1277 8.017 126.316 109.574 1.00131.91 ATOM 55 CG1 ILE D1277 7.216 127.199 108.611 1.00129.18 ATOM 56 CG2 ILE D1277 8.493 127.083 110.805 1.00126.69 ATOM 57 CD1 ILE D1277 6.078 127.953 109.267 1.00 88.85 ATOM 58 N ASP D1278 10.268 127.705 108.151 1.00124.21 ATOM 59 CA ASP D1278 11.323 128.702 108.124 1.00124.42 ATOM 60 C ASP D1278 11.321 129.443 109.446 1.00130.99 ATOM 61 O ASP D1278 10.308 130.015 109.848 1.00135.90 ATOM 62 CB ASP D1278 11.132 129.680 106.971 1.00159.13 ATOM 63 CG ASP D1278 9.974 129.301 106.082 1.00162.77 ATOM 64 OD1 ASP D1278 10.127 128.357 105.282 1.00156.76 ATOM 65 OD2 ASP D1278 8.898 129.918 106.222 1.00170.36 ATOM 66 N GLY D1279 12.465 129.436 110.112 1.00158.10 ATOM 67 CA GLY D1279 12.623 130.120 111.376 1.00186.42 ATOM 68 C GLY D1279 14.101 130.336 111.597 1.00210.74 ATOM 69 O GLY D1279 14.923 129.637 111.004 1.00209.84 ATOM 70 N VAL D1280 14.445 131.303 112.440 1.00221.95 ATOM 71 CA VAL D1280 15.843 131.559 112.734 1.00188.43 ATOM 72 C VAL D1280 16.362 130.356 113.491 1.00144.19 ATOM 73 O VAL D1280 15.580 129.540 113.984 1.00146.98 ATOM 74 CB VAL D1280 16.058 132.835 113.571 1.00180.22 ATOM 75 CG1 VAL D1280 15.312 134.005 112.949 1.00179.00 ATOM 76 CG2 VAL D1280 15.608 132.614 115.009 1.00171.96 ATOM 77 N VAL D1281 17.677 130.246 113.595 1.00124.87 ATOM 78 CA VAL D1281 18.242 129.114 114.289 1.00140.20 ATOM 79 C VAL D1281 18.773 129.639 115.595 1.00134.53 ATOM 80 O VAL D1281 19.228 130.773 115.683 1.00128.49 ATOM 81 CB VAL D1281 19.358 128.448 113.453 1.00142.94 ATOM 82 CG1 VAL D1281 20.213 127.512 114.300 1.00160.73 ATOM 83 CG2 VAL D1281 18.754 127.707 112.288 1.00156.84 ATOM 84 N ARG D1282 18.708 128.818 116.626 1.00143.78 ATOM 85 CA ARG D1282 19.259 129.260 117.876 1.00141.07 ATOM 86 C ARG D1282 19.923 128.041 118.458 1.00148.42 ATOM 87 O ARG D1282 19.249 127.053 118.737 1.00136.53 ATOM 88 CB ARG D1282 18.154 129.794 118.779 1.00158.13 ATOM 89 CG ARG D1282 18.554 130.950 119.662 1.00158.13 ATOM 90 CD ARG D1282 17.348 131.462 120.431 1.00175.39 ATOM 91 NE ARG D1282 16.763 130.398 121.238 1.00167.70 ATOM 92 CZ ARG D1282 17.296 129.982 122.382 1.00170.76 ATOM 93 NH1 ARG D1282 18.398 130.561 122.842 1.00173.11 ATOM 94 NH2 ARG D1282 16.728 129.003 123.074 1.00160.79 ATOM 95 N ILE D1283 21.232 128.071 118.647 1.00168.50 ATOM 96 CA ILE D1283 21.842 126.899 119.235 1.00151.56 ATOM 97 C ILE D1283 22.024 127.179 120.710 1.00174.39 ATOM 98 O ILE D1283 22.865 127.986 121.106 1.00207.89 ATOM 99 CB ILE D1283 23.185 126.532 118.579 1.00162.92 ATOM 100 CG1 ILE D1283 23.056 126.536 117.054 1.00172.37 ATOM 101 CG2 ILE D1283 23.627 125.157 119.037 1.00158.67 ATOM 102 CD1 ILE D1283 24.369 126.301 116.327 1.00150.62 ATOM 103 N GLU D1284 21.205 126.519 121.517 1.00164.43 ATOM 104 CA GLU D1284 21.323 126.635 122.952 1.00169.58 ATOM 105 C GLU D1284 21.402 125.249 123.559 1.00184.98 ATOM 106 O GLU D1284 20.409 124.523 123.622 1.00187.34 ATOM 107 CB GLU D1284 20.127 127.401 123.515 1.00203.86 ATOM 108 CG GLU D1284 20.297 127.894 124.930 1.00203.86 ATOM 109 CD GLU D1284 18.970 128.262 125.556 1.00203.86 ATOM 110 OE1 GLU D1284 18.491 129.385 125.302 1.00203.86 ATOM 111 OE2 GLU D1284 18.398 127.426 126.290 1.00203.86 ATOM 112 N GLU D1285 22.593 124.896 124.020 1.00195.39 ATOM 113 CA GLU D1285 22.800 123.640 124.711 1.00209.12 ATOM 114 C GLU D1285 23.834 123.816 125.809 1.00227.81 ATOM 115 O GLU D1285 25.009 124.039 125.523 1.00232.94 ATOM 116 CB GLU D1285 23.224 122.540 123.735 1.00231.35 ATOM 117 CG GLU D1285 23.648 123.038 122.360 1.00231.35 ATOM 118 CD GLU D1285 25.073 123.558 122.333 1.00250.81 ATOM 119 OE1 GLU D1285 25.301 124.707 122.767 1.00257.08 ATOM 120 OE2 GLU D1285 25.967 122.814 121.877 1.00251.35 ATOM 121 N GLY D1286 23.407 123.727 127.063 1.00241.79 ATOM 122 CA GLY D1286 24.348 123.650 128.166 1.00247.36 ATOM 123 C GLY D1286 24.884 122.235 128.146 1.00240.99 ATOM 124 O GLY D1286 24.653 121.503 127.183 1.00231.26 ATOM 125 N GLU D1287 25.584 121.805 129.187 1.00237.73 ATOM 126 CA GLU D1287 25.938 120.401 129.173 1.00228.27 ATOM 127 C GLU D1287 24.819 119.636 129.866 1.00218.85 ATOM 128 O GLU D1287 24.830 119.446 131.083 1.00195.15 ATOM 129 CB GLU D1287 27.280 120.187 129.882 1.00219.20 ATOM 130 CG GLU D1287 27.818 118.765 129.876 1.00215.95 ATOM 131 CD GLU D1287 27.874 118.152 128.494 1.00201.96 ATOM 132 OE1 GLU D1287 28.579 118.708 127.624 1.00208.83 ATOM 133 OE2 GLU D1287 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