HEADER transcription/transcription inhibitor 25-FEB-15 4YFK TITLE Escherichia coli RNA polymerase in complex with squaramide compound COMPND MOL_ID: 3; COMPND 2 MOLECULE: DNA-directed RNA polymerase subunit beta'; COMPND 3 CHAIN: D, J; COMPND 4 EC: 2.7.7.6; COMPND 5 ENGINEERED: YES; EXPDTA X-RAY DIFFRACTION REMARK 2 RESOLUTION. 3.57 ANGSTORMS DBREF 4YFK D 1 1407 UNP A7ZUK2 RPOC_ECO24 1 1407 SEQRES 1 D 64 GLU PRO ALA ILE LEU ALA GLU ILE SER GLY ILE VAL SER SEQRES 2 D 64 PHE GLY LYS GLU THR LYS GLY LYS ARG ARG LEU VAL ILE SEQRES 3 D 64 THR PRO VAL ASP GLY SER ASP PRO TYR GLU GLU MET ILE SEQRES 4 D 64 PRO LYS TRP ARG GLN LEU ASN VAL PHE GLU GLY GLU ARG SEQRES 5 D 64 VAL GLU ARG GLY ASP VAL ILE SER ASP GLY PRO GLU ATOM 1 N GLU D1152 -107.777 -6.293 35.638 1.00147.81 ATOM 2 CA GLU D1152 -108.068 -7.494 36.403 1.00151.58 ATOM 3 C GLU D1152 -106.919 -8.498 36.191 1.00154.54 ATOM 4 O GLU D1152 -106.931 -9.331 35.268 1.00159.56 ATOM 5 CB GLU D1152 -109.454 -8.031 36.003 1.00146.69 ATOM 6 CG GLU D1152 -110.365 -8.406 37.200 1.00146.12 ATOM 7 CD GLU D1152 -111.780 -8.811 36.764 1.00148.24 ATOM 8 OE1 GLU D1152 -112.015 -8.904 35.534 1.00148.07 ATOM 9 OE2 GLU D1152 -112.647 -9.041 37.650 1.00148.82 ATOM 10 N PRO D1153 -105.889 -8.373 37.043 1.00152.46 ATOM 11 CA PRO D1153 -104.602 -9.078 37.009 1.00145.11 ATOM 12 C PRO D1153 -104.645 -10.547 37.402 1.00145.69 ATOM 13 O PRO D1153 -105.617 -11.039 37.997 1.00145.05 ATOM 14 CB PRO D1153 -103.758 -8.313 38.032 1.00144.98 ATOM 15 CG PRO D1153 -104.504 -7.049 38.271 1.00145.39 ATOM 16 CD PRO D1153 -105.930 -7.415 38.156 1.00148.71 ATOM 17 N ALA D1154 -103.604 -11.255 36.994 1.00141.86 ATOM 18 CA ALA D1154 -103.291 -12.519 37.626 1.00142.16 ATOM 19 C ALA D1154 -102.415 -12.225 38.847 1.00140.30 ATOM 20 O ALA D1154 -101.902 -11.111 39.026 1.00134.49 ATOM 21 CB ALA D1154 -102.592 -13.455 36.681 1.00140.69 ATOM 22 N ILE D1155 -102.247 -13.237 39.675 1.00146.46 ATOM 23 CA ILE D1155 -101.325 -13.166 40.776 1.00149.07 ATOM 24 C ILE D1155 -100.468 -14.422 40.724 1.00147.74 ATOM 25 O ILE D1155 -100.884 -15.490 40.273 1.00142.55 ATOM 26 CB ILE D1155 -102.030 -12.988 42.122 1.00152.66 ATOM 27 CG1 ILE D1155 -103.537 -13.190 41.949 1.00151.04 ATOM 28 CG2 ILE D1155 -101.696 -11.598 42.722 1.00148.56 ATOM 29 CD1 ILE D1155 -103.930 -14.652 42.048 1.00150.53 ATOM 30 N LEU D1156 -99.247 -14.253 41.181 1.00149.23 ATOM 31 CA LEU D1156 -98.202 -15.237 40.996 1.00146.41 ATOM 32 C LEU D1156 -97.729 -15.803 42.309 1.00145.02 ATOM 33 O LEU D1156 -97.898 -15.204 43.384 1.00140.05 ATOM 34 CB LEU D1156 -97.016 -14.597 40.257 1.00144.72 ATOM 35 CG LEU D1156 -97.299 -13.878 38.933 1.00136.43 ATOM 36 CD1 LEU D1156 -98.152 -14.720 38.017 1.00134.64 ATOM 37 CD2 LEU D1156 -97.964 -12.510 39.159 1.00133.99 ATOM 38 N ALA D1157 -97.107 -16.957 42.218 1.00140.39 ATOM 39 CA ALA D1157 -96.511 -17.529 43.395 1.00145.28 ATOM 40 C ALA D1157 -95.437 -16.611 43.918 1.00146.35 ATOM 41 O ALA D1157 -94.401 -16.459 43.284 1.00150.24 ATOM 42 CB ALA D1157 -95.934 -18.878 43.090 1.00145.01 ATOM 43 N GLU D1158 -95.692 -15.969 45.052 1.00143.49 ATOM 44 CA GLU D1158 -94.706 -15.083 45.638 1.00141.63 ATOM 45 C GLU D1158 -93.414 -15.778 46.014 1.00142.53 ATOM 46 O GLU D1158 -92.359 -15.162 46.008 1.00141.54 ATOM 47 CB GLU D1158 -95.272 -14.428 46.863 1.00144.35 ATOM 48 CG GLU D1158 -96.013 -13.189 46.545 1.00147.42 ATOM 49 CD GLU D1158 -95.088 -12.118 45.981 1.00151.45 ATOM 50 OE1 GLU D1158 -93.874 -12.124 46.300 1.00153.61 ATOM 51 OE2 GLU D1158 -95.589 -11.243 45.247 1.00151.23 ATOM 52 N ILE D1159 -93.503 -17.054 46.372 1.00149.63 ATOM 53 CA ILE D1159 -92.298 -17.863 46.595 1.00154.18 ATOM 54 C ILE D1159 -92.630 -19.334 46.335 1.00159.30 ATOM 55 O ILE D1159 -93.808 -19.762 46.402 1.00160.58 ATOM 56 CB ILE D1159 -91.680 -17.676 48.037 1.00153.24 ATOM 57 CG1 ILE D1159 -90.287 -18.320 48.141 1.00151.92 ATOM 58 CG2 ILE D1159 -92.598 -18.214 49.139 1.00155.78 ATOM 59 CD1 ILE D1159 -89.289 -17.827 47.099 1.00146.94 ATOM 60 N SER D1160 -91.598 -20.082 45.951 1.00158.49 ATOM 61 CA SER D1160 -91.708 -21.504 45.683 1.00158.94 ATOM 62 C SER D1160 -92.145 -22.259 46.982 1.00159.87 ATOM 63 O SER D1160 -92.089 -21.665 48.089 1.00159.81 ATOM 64 CB SER D1160 -90.381 -22.001 45.115 1.00156.54 ATOM 65 OG SER D1160 -90.456 -23.303 44.569 1.00157.08 ATOM 66 N GLY D1161 -92.631 -23.507 46.862 1.00162.06 ATOM 67 CA GLY D1161 -93.049 -24.279 48.026 1.00166.52 ATOM 68 C GLY D1161 -94.559 -24.523 48.055 1.00171.30 ATOM 69 O GLY D1161 -95.280 -23.960 47.208 1.00169.65 ATOM 70 N ILE D1162 -95.037 -25.341 49.010 1.00175.79 ATOM 71 CA ILE D1162 -96.478 -25.715 49.118 1.00178.81 ATOM 72 C ILE D1162 -97.423 -24.705 49.849 1.00170.36 ATOM 73 O ILE D1162 -97.091 -24.114 50.891 1.00169.85 ATOM 74 CB ILE D1162 -96.623 -27.105 49.806 1.00165.89 ATOM 75 CG1 ILE D1162 -98.081 -27.415 50.184 1.00168.13 ATOM 76 CG2 ILE D1162 -95.685 -27.194 51.029 1.00166.21 ATOM 77 CD1 ILE D1162 -99.004 -27.671 49.017 1.00167.54 ATOM 78 N VAL D1163 -98.618 -24.563 49.284 1.00169.56 ATOM 79 CA VAL D1163 -99.574 -23.561 49.714 1.00169.04 ATOM 80 C VAL D1163 -100.833 -24.184 50.290 1.00170.75 ATOM 81 O VAL D1163 -101.061 -25.392 50.172 1.00170.58 ATOM 82 CB VAL D1163 -99.949 -22.630 48.521 1.00165.71 ATOM 83 CG1 VAL D1163 -101.197 -23.170 47.730 1.00160.10 ATOM 84 CG2 VAL D1163 -100.131 -21.184 48.998 1.00163.87 ATOM 85 N SER D1164 -101.666 -23.319 50.858 1.00174.19 ATOM 86 CA SER D1164 -102.954 -23.675 51.454 1.00180.36 ATOM 87 C SER D1164 -103.675 -22.393 51.928 1.00183.94 ATOM 88 O SER D1164 -103.045 -21.323 52.033 1.00183.78 ATOM 89 CB SER D1164 -102.759 -24.663 52.623 1.00178.71 ATOM 90 OG SER D1164 -101.830 -24.162 53.582 1.00176.60 ATOM 91 N PHE D1165 -104.982 -22.516 52.196 1.00187.14 ATOM 92 CA PHE D1165 -105.852 -21.383 52.552 1.00183.09 ATOM 93 C PHE D1165 -106.086 -21.377 54.057 1.00185.94 ATOM 94 O PHE D1165 -106.248 -22.449 54.658 1.00186.39 ATOM 95 CB PHE D1165 -107.168 -21.479 51.776 1.00178.47 ATOM 96 CG PHE D1165 -106.962 -21.577 50.313 1.00172.68 ATOM 97 CD1 PHE D1165 -106.361 -22.706 49.757 1.00173.59 ATOM 98 CD2 PHE D1165 -107.300 -20.537 49.486 1.00168.18 ATOM 99 CE1 PHE D1165 -106.125 -22.792 48.419 1.00172.92 ATOM 100 CE2 PHE D1165 -107.089 -20.615 48.142 1.00167.81 ATOM 101 CZ PHE D1165 -106.493 -21.745 47.599 1.00170.22 ATOM 102 N GLY D1166 -106.076 -20.189 54.662 1.00186.23 ATOM 103 CA GLY D1166 -106.237 -20.065 56.103 1.00188.06 ATOM 104 C GLY D1166 -107.095 -18.846 56.352 1.00186.47 ATOM 105 O GLY D1166 -107.182 -17.978 55.473 1.00183.00 ATOM 106 N LYS D1167 -107.737 -18.781 57.524 1.00185.84 ATOM 107 CA LYS D1167 -108.808 -17.808 57.734 1.00183.37 ATOM 108 C LYS D1167 -109.902 -17.978 56.645 1.00189.78 ATOM 109 O LYS D1167 -109.889 -18.977 55.899 1.00191.77 ATOM 110 CB LYS D1167 -108.257 -16.396 57.721 1.00178.98 ATOM 111 CG LYS D1167 -108.935 -15.435 58.637 1.00177.48 ATOM 112 CD LYS D1167 -108.598 -14.003 58.232 1.00173.40 ATOM 113 CE LYS D1167 -109.083 -13.706 56.803 1.00168.87 ATOM 114 NZ LYS D1167 -110.571 -13.762 56.682 1.00169.03 ATOM 115 N GLU D1168 -110.816 -17.003 56.526 1.00186.72 ATOM 116 CA GLU D1168 -111.973 -17.145 55.609 1.00184.06 ATOM 117 C GLU D1168 -112.591 -15.791 55.197 1.00180.91 ATOM 118 O GLU D1168 -112.543 -14.810 55.957 1.00179.95 ATOM 119 CB GLU D1168 -113.104 -18.002 56.248 1.00192.33 ATOM 120 CG GLU D1168 -112.922 -19.563 56.333 1.00195.89 ATOM 121 CD GLU D1168 -113.224 -20.326 55.028 1.00193.90 ATOM 122 OE1 GLU D1168 -112.406 -21.189 54.646 1.00195.16 ATOM 123 OE2 GLU D1168 -114.296 -20.106 54.410 1.00191.33 ATOM 124 N THR D1169 -113.131 -15.802 53.969 1.00180.10 ATOM 125 CA THR D1169 -114.071 -14.817 53.357 1.00179.22 ATOM 126 C THR D1169 -114.430 -13.486 54.100 1.00187.64 ATOM 127 O THR D1169 -115.622 -13.142 54.236 1.00191.75 ATOM 128 CB THR D1169 -115.417 -15.579 53.042 1.00177.03 ATOM 129 OG1 THR D1169 -115.127 -16.929 52.640 1.00178.94 ATOM 130 CG2 THR D1169 -116.235 -14.892 51.951 1.00173.12 ATOM 131 N LYS D1170 -113.413 -12.743 54.560 1.00181.29 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