HEADER TRANSCRIPTION/DNA/RNA 31-DEC-69 4YLN TITLE E. coli Transcription Initiation Complex - 17-bp spacer and 4-nt RNA COMPND MOL_ID: 3; COMPND 2 MOLECULE: DNA-directed RNA polymerase subunit beta'; COMPND 3 CHAIN: D, J, P; COMPND 4 EC: 2.7.7.6; COMPND 5 ENGINEERED: YES; EXPDTA X-RAY DIFFRACTION REMARK 2 RESOLUTION. 5.50 ANGSTORMS DBREF 4YLN D 1 1407 UNP A7ZUK2 RPOC_ECO24 1 1407 SEQRES 1 D 84 LYS ASP ILE THR GLY GLY LEU PRO ARG VAL ALA ASP LEU SEQRES 2 D 84 PHE GLU ALA ARG ARG PRO LYS GLU PRO ALA ILE LEU ALA SEQRES 3 D 84 GLU ILE SER GLY ILE VAL SER PHE GLY LYS GLU THR LYS SEQRES 4 D 84 GLY LYS ARG ARG LEU VAL ILE THR PRO VAL ASP GLY SER SEQRES 5 D 84 ASP PRO TYR GLU GLU MET ILE PRO LYS TRP ARG GLN LEU SEQRES 6 D 84 ASN VAL PHE GLU GLY GLU ARG VAL GLU ARG GLY ASP VAL SEQRES 7 D 84 ILE SER ASP GLY PRO GLU ATOM 1 N LYS D1132 -37.609 53.329 244.514 1.00234.28 ATOM 2 CA LYS D1132 -37.487 52.131 245.337 1.00230.20 ATOM 3 C LYS D1132 -36.648 51.158 244.524 1.00223.55 ATOM 4 O LYS D1132 -35.678 51.590 243.899 1.00221.61 ATOM 5 CB LYS D1132 -38.854 51.531 245.664 1.00233.19 ATOM 6 CG LYS D1132 -39.267 51.657 247.121 1.00236.43 ATOM 7 CD LYS D1132 -40.545 50.874 247.375 1.00238.98 ATOM 8 CE LYS D1132 -40.925 50.888 248.846 1.00242.18 ATOM 9 NZ LYS D1132 -42.295 50.348 249.076 1.00246.43 ATOM 10 N ASP D1133 -37.037 49.875 244.513 1.00220.59 ATOM 11 CA ASP D1133 -36.421 48.817 243.673 1.00214.76 ATOM 12 C ASP D1133 -34.906 48.649 243.916 1.00209.85 ATOM 13 O ASP D1133 -34.375 48.956 244.997 1.00210.00 ATOM 14 CB ASP D1133 -36.703 49.042 242.163 1.00215.62 ATOM 15 CG ASP D1133 -38.132 48.658 241.743 1.00219.00 ATOM 16 OD1 ASP D1133 -38.845 47.982 242.521 1.00219.75 ATOM 17 OD2 ASP D1133 -38.537 49.032 240.615 1.00221.26 ATOM 18 N ILE D1134 -34.192 48.157 242.920 1.00205.84 ATOM 19 CA ILE D1134 -32.763 48.258 243.061 1.00202.55 ATOM 20 C ILE D1134 -32.188 49.385 242.202 1.00204.30 ATOM 21 O ILE D1134 -30.988 49.444 242.050 1.00201.79 ATOM 22 CB ILE D1134 -32.055 46.896 242.909 1.00196.82 ATOM 23 CG1 ILE D1134 -32.520 45.960 244.028 1.00195.89 ATOM 24 CG2 ILE D1134 -30.552 47.047 243.077 1.00194.13 ATOM 25 CD1 ILE D1134 -32.209 46.548 245.450 1.00197.77 ATOM 26 N THR D1135 -33.030 50.298 241.693 1.00209.08 ATOM 27 CA THR D1135 -32.579 51.463 240.876 1.00211.66 ATOM 28 C THR D1135 -31.694 52.473 241.674 1.00213.26 ATOM 29 O THR D1135 -30.467 52.587 241.452 1.00211.00 ATOM 30 CB THR D1135 -33.786 52.190 240.173 1.00217.12 ATOM 31 OG1 THR D1135 -34.430 51.312 239.234 1.00215.77 ATOM 32 CG2 THR D1135 -33.350 53.476 239.442 1.00220.54 ATOM 33 N GLY D1136 -32.322 53.208 242.593 1.00217.59 ATOM 34 CA GLY D1136 -31.598 54.191 243.418 1.00219.80 ATOM 35 C GLY D1136 -30.691 53.474 244.405 1.00215.73 ATOM 36 O GLY D1136 -29.638 53.999 244.842 1.00215.77 ATOM 37 N GLY D1137 -31.124 52.261 244.752 1.00212.61 ATOM 38 CA GLY D1137 -30.428 51.416 245.701 1.00208.94 ATOM 39 C GLY D1137 -29.056 51.012 245.209 1.00204.68 ATOM 40 O GLY D1137 -28.074 51.092 245.952 1.00203.83 ATOM 41 N LEU D1138 -28.993 50.587 243.952 1.00202.43 ATOM 42 CA LEU D1138 -27.776 49.998 243.404 1.00198.33 ATOM 43 C LEU D1138 -26.615 50.982 243.489 1.00199.92 ATOM 44 O LEU D1138 -25.571 50.669 244.084 1.00197.97 ATOM 45 CB LEU D1138 -28.012 49.526 241.951 1.00196.66 ATOM 46 CG LEU D1138 -27.361 48.262 241.350 1.00191.70 ATOM 47 CD1 LEU D1138 -27.530 47.053 242.261 1.00188.68 ATOM 48 CD2 LEU D1138 -27.920 47.957 239.960 1.00191.38 ATOM 49 N PRO D1139 -26.790 52.177 242.902 1.00203.90 ATOM 50 CA PRO D1139 -25.627 53.029 242.951 1.00205.45 ATOM 51 C PRO D1139 -25.284 53.445 244.371 1.00207.15 ATOM 52 O PRO D1139 -24.104 53.545 244.690 1.00206.57 ATOM 53 CB PRO D1139 -26.035 54.223 242.091 1.00209.91 ATOM 54 CG PRO D1139 -26.967 53.631 241.094 1.00208.77 ATOM 55 CD PRO D1139 -27.771 52.667 241.920 1.00206.66 ATOM 56 N ARG D1140 -26.285 53.651 245.224 1.00209.50 ATOM 57 CA ARG D1140 -26.000 54.072 246.599 1.00211.61 ATOM 58 C ARG D1140 -25.127 53.036 247.317 1.00207.59 ATOM 59 O ARG D1140 -24.155 53.377 248.016 1.00208.47 ATOM 60 CB ARG D1140 -27.299 54.329 247.370 1.00214.90 ATOM 61 CG ARG D1140 -27.121 54.835 248.798 1.00217.83 ATOM 62 CD ARG D1140 -27.027 56.351 248.874 1.00223.42 ATOM 63 NE ARG D1140 -27.416 56.858 250.189 1.00227.39 ATOM 64 CZ ARG D1140 -26.622 56.877 251.255 1.00227.63 ATOM 65 NH1 ARG D1140 -25.382 56.407 251.180 1.00224.18 ATOM 66 NH2 ARG D1140 -27.073 57.363 252.402 1.00231.73 ATOM 67 N VAL D1141 -25.479 51.771 247.119 1.00203.53 ATOM 68 CA VAL D1141 -24.739 50.679 247.716 1.00199.79 ATOM 69 C VAL D1141 -23.330 50.688 247.194 1.00198.21 ATOM 70 O VAL D1141 -22.370 50.693 247.958 1.00198.37 ATOM 71 CB VAL D1141 -25.355 49.328 247.350 1.00195.89 ATOM 72 CG1 VAL D1141 -24.342 48.210 247.560 1.00191.83 ATOM 73 CG2 VAL D1141 -26.612 49.094 248.169 1.00197.45 ATOM 74 N ALA D1142 -23.230 50.683 245.872 1.00197.10 ATOM 75 CA ALA D1142 -21.967 50.716 245.166 1.00196.09 ATOM 76 C ALA D1142 -21.068 51.817 245.687 1.00199.69 ATOM 77 O ALA D1142 -19.857 51.643 245.789 1.00199.05 ATOM 78 CB ALA D1142 -22.226 50.930 243.684 1.00196.10 ATOM 79 N ASP D1143 -21.667 52.953 246.010 1.00203.88 ATOM 80 CA ASP D1143 -20.897 54.124 246.371 1.00207.97 ATOM 81 C ASP D1143 -20.325 54.049 247.747 1.00208.69 ATOM 82 O ASP D1143 -19.209 54.505 247.971 1.00210.47 ATOM 83 CB ASP D1143 -21.752 55.361 246.267 1.00212.63 ATOM 84 CG ASP D1143 -21.926 55.791 244.854 1.00213.45 ATOM 85 OD1 ASP D1143 -21.615 54.963 243.965 1.00209.85 ATOM 86 OD2 ASP D1143 -22.356 56.947 244.637 1.00217.96 ATOM 87 N LEU D1144 -21.108 53.504 248.670 1.00207.81 ATOM 88 CA LEU D1144 -20.635 53.277 250.018 1.00208.36 ATOM 89 C LEU D1144 -19.490 52.271 249.982 1.00204.88 ATOM 90 O LEU D1144 -18.515 52.384 250.737 1.00206.26 ATOM 91 CB LEU D1144 -21.767 52.736 250.887 1.00207.94 ATOM 92 CG LEU D1144 -22.913 53.685 251.215 1.00212.19 ATOM 93 CD1 LEU D1144 -24.142 52.880 251.590 1.00210.88 ATOM 94 CD2 LEU D1144 -22.513 54.624 252.339 1.00216.75 ATOM 95 N PHE D1145 -19.605 51.278 249.105 1.00200.71 ATOM 96 CA PHE D1145 -18.555 50.265 249.020 1.00197.61 ATOM 97 C PHE D1145 -17.326 50.797 248.302 1.00198.97 ATOM 98 O PHE D1145 -16.218 50.290 248.504 1.00198.25 ATOM 99 CB PHE D1145 -19.050 48.957 248.389 1.00192.98 ATOM 100 CG PHE D1145 -19.830 48.093 249.337 1.00191.44 ATOM 101 CD1 PHE D1145 -19.287 47.711 250.557 1.00191.87 ATOM 102 CD2 PHE D1145 -21.106 47.668 249.011 1.00190.03 ATOM 103 CE1 PHE D1145 -20.005 46.924 251.436 1.00190.88 ATOM 104 CE2 PHE D1145 -21.829 46.878 249.882 1.00189.10 ATOM 105 CZ PHE D1145 -21.278 46.506 251.096 1.00189.50 ATOM 106 N GLU D1146 -17.521 51.833 247.486 1.00201.44 ATOM 107 CA GLU D1146 -16.409 52.441 246.758 1.00203.45 ATOM 108 C GLU D1146 -15.857 53.625 247.534 1.00208.41 ATOM 109 O GLU D1146 -14.983 54.347 247.047 1.00211.25 ATOM 110 CB GLU D1146 -16.824 52.863 245.344 1.00203.69 ATOM 111 CG GLU D1146 -16.980 51.713 244.349 1.00199.28 ATOM 112 CD GLU D1146 -15.683 51.299 243.654 1.00198.56 ATOM 113 OE1 GLU D1146 -14.636 51.938 243.878 1.00201.67 ATOM 114 OE2 GLU D1146 -15.704 50.325 242.867 1.00195.21 ATOM 115 N ALA D1147 -16.378 53.817 248.747 1.00209.78 ATOM 116 CA ALA D1147 -15.885 54.840 249.670 1.00214.60 ATOM 117 C ALA D1147 -15.894 56.218 249.014 1.00218.92 ATOM 118 O ALA D1147 -14.931 56.976 249.114 1.00222.60 ATOM 119 CB ALA D1147 -14.490 54.483 250.170 1.00215.06 ATOM 120 N ARG D1148 -16.985 56.520 248.323 1.00218.76 ATOM 121 CA ARG D1148 -17.070 57.752 247.564 1.00222.80 ATOM 122 C ARG D1148 -17.731 58.861 248.371 1.00227.58 ATOM 123 O ARG D1148 -18.904 58.765 248.751 1.00227.29 ATOM 124 CB ARG D1148 -17.779 57.492 246.242 1.00220.57 ATOM 125 CG ARG D1148 -17.008 56.495 245.410 1.00216.59 ATOM 126 CD ARG D1148 -17.869 55.880 244.343 1.00213.41 ATOM 127 NE ARG D1148 -17.028 55.393 243.264 1.00211.59 ATOM 128 CZ ARG D1148 -17.473 54.670 242.246 1.00208.50 ATOM 129 NH1 ARG D1148 -18.758 54.344 242.174 1.00206.87 ATOM 130 NH2 ARG D1148 -16.632 54.269 241.301 1.00207.40 ATOM 131 N ARG 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