HEADER TRANSFERASE 06-MAR-15 4YM7 TITLE RNA polymerase I structure with an alternative dimer hinge COMPND MOL_ID: 2; COMPND 2 MOLECULE: DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA135; COMPND 3 CHAIN: AB, BB, CB, DB, EB, FB; COMPND 4 EC: 2.7.7.6; EXPDTA X-RAY DIFFRACTION REMARK 2 RESOLUTION. 5.50 ANGSTORMS REMARK 465 MISSING RESIDUES REMARK 465 THE FOLLOWING RESIDUES WERE NOT LOCATED IN THE REMARK 465 EXPERIMENT. (M=MODEL NUMBER; RES=RESIDUE NAME; C=CHAIN REMARK 465 IDENTIFIER; SSSEQ=SEQUENCE NUMBER; I=INSERTION CODE.) REMARK 465 REMARK 465 M RES C SSSEQI REMARK 465 THR D 1143 REMARK 465 LYS D 1144 REMARK 465 SER D 1145 REMARK 465 GLU D 1146 REMARK 465 ASP D 1147 REMARK 465 GLY D 1148 REMARK 465 GLU D 1149 REMARK 465 LYS D 1150 DBREF 4YM7 D 1 1203 UNP P22138 RPA2_YEAST 1 1203 SEQRES 1 DB 163 ASN ASP LYS PHE GLN VAL ARG SER THR GLY PRO VAL ASN SEQRES 2 DB 163 SER LEU THR MET GLN PRO VAL LYS GLY ARG LYS ARG HIS SEQRES 3 DB 163 GLY GLY ILE ARG VAL GLY GLU MET GLU ARG ASP ALA LEU SEQRES 4 DB 163 ILE GLY HIS GLY THR SER PHE LEU LEU GLN ASP ARG LEU SEQRES 5 DB 163 LEU ASN SER SER ASP TYR THR GLN ALA SER VAL CYS ARG SEQRES 6 DB 163 GLU CYS GLY SER ILE LEU THR THR GLN GLN SER VAL PRO SEQRES 7 DB 163 ARG ILE GLY SER ILE SER THR VAL CYS CYS ARG ARG CYS SEQRES 8 DB 163 SER MET ARG PHE GLU ASP ALA LYS LYS LEU LEU THR LYS SEQRES 9 DB 163 SER GLU ASP GLY GLU LYS ILE PHE ILE ASP ASP SER GLN SEQRES 10 DB 163 ILE TRP GLU ASP GLY GLN GLY ASN LYS PHE VAL GLY GLY SEQRES 11 DB 163 ASN GLU THR THR THR VAL ALA ILE PRO PHE VAL LEU LYS SEQRES 12 DB 163 TYR LEU ASP SER GLU LEU SER ALA MET GLY ILE ARG LEU SEQRES 13 DB 163 ARG TYR ASN VAL GLU PRO LYS ATOM 1 N ASN D1041 81.385 149.401 161.264 1.00166.14 ATOM 2 CA ASN D1041 82.258 149.731 160.096 1.00165.27 ATOM 3 C ASN D1041 81.546 149.281 158.818 1.00164.44 ATOM 4 O ASN D1041 81.593 149.979 157.799 1.00164.00 ATOM 5 CB ASN D1041 83.680 149.081 160.175 1.00163.72 ATOM 6 CG ASN D1041 84.694 149.642 159.109 1.00163.09 ATOM 7 OD1 ASN D1041 85.143 148.919 158.206 1.00161.59 ATOM 8 ND2 ASN D1041 85.075 150.917 159.258 1.00164.37 ATOM 9 N ASP D1042 80.881 148.123 158.897 1.00164.09 ATOM 10 CA ASP D1042 80.135 147.538 157.787 1.00163.19 ATOM 11 C ASP D1042 80.956 147.585 156.500 1.00162.05 ATOM 12 O ASP D1042 81.330 146.529 155.986 1.00160.60 ATOM 13 CB ASP D1042 78.731 148.145 157.644 1.00164.78 ATOM 14 CG ASP D1042 77.771 147.653 158.723 1.00166.04 ATOM 15 OD1 ASP D1042 78.093 146.638 159.366 1.00165.23 ATOM 16 OD2 ASP D1042 76.706 148.273 158.925 1.00167.95 ATOM 17 N LYS D1043 81.240 148.814 156.030 1.00162.83 ATOM 18 CA LYS D1043 82.161 149.134 154.920 1.00162.13 ATOM 19 C LYS D1043 83.247 148.104 154.773 1.00160.14 ATOM 20 O LYS D1043 84.301 148.124 155.418 1.00159.56 ATOM 21 CB LYS D1043 82.725 150.572 154.982 1.00163.18 ATOM 22 CG LYS D1043 83.594 151.006 153.768 1.00162.49 ATOM 23 CD LYS D1043 82.912 152.057 152.870 1.00163.80 ATOM 24 CE LYS D1043 83.873 152.638 151.809 1.00163.40 ATOM 25 NZ LYS D1043 83.622 152.265 150.366 1.00163.50 ATOM 26 N PHE D1044 82.889 147.174 153.907 1.00159.22 ATOM 27 CA PHE D1044 83.706 146.078 153.516 1.00157.47 ATOM 28 C PHE D1044 85.055 146.567 153.016 1.00156.92 ATOM 29 O PHE D1044 85.993 146.666 153.796 1.00156.82 ATOM 30 CB PHE D1044 83.011 145.231 152.438 1.00156.93 ATOM 31 CG PHE D1044 81.669 145.796 151.924 1.00158.26 ATOM 32 CD1 PHE D1044 81.625 146.684 150.841 1.00158.92 ATOM 33 CD2 PHE D1044 80.446 145.383 152.470 1.00158.94 ATOM 34 CE1 PHE D1044 80.379 147.189 150.328 1.00160.22 ATOM 35 CE2 PHE D1044 79.199 145.883 151.962 1.00160.26 ATOM 36 CZ PHE D1044 79.173 146.786 150.892 1.00160.90 ATOM 37 N GLN D1045 85.106 146.878 151.723 1.00156.68 ATOM 38 CA GLN D1045 86.289 147.314 150.982 1.00156.35 ATOM 39 C GLN D1045 87.038 146.141 150.368 1.00154.82 ATOM 40 O GLN D1045 87.546 145.278 151.064 1.00153.93 ATOM 41 CB GLN D1045 87.190 148.260 151.787 1.00156.82 ATOM 42 CG GLN D1045 88.686 147.994 151.697 1.00155.77 ATOM 43 CD GLN D1045 89.329 148.020 153.077 1.00155.86 ATOM 44 OE1 GLN D1045 88.627 148.008 154.099 1.00156.43 ATOM 45 NE2 GLN D1045 90.664 148.062 153.118 1.00155.39 ATOM 46 N VAL D1046 87.027 146.095 149.046 1.00154.64 ATOM 47 CA VAL D1046 87.689 145.061 148.299 1.00153.41 ATOM 48 C VAL D1046 88.937 145.702 147.724 1.00153.32 ATOM 49 O VAL D1046 89.233 146.873 147.970 1.00154.19 ATOM 50 CB VAL D1046 86.761 144.541 147.179 1.00153.33 ATOM 51 CG1 VAL D1046 86.589 145.585 146.097 1.00154.47 ATOM 52 CG2 VAL D1046 87.262 143.241 146.585 1.00152.23 ATOM 53 N ARG D1047 89.684 144.933 146.963 1.00155.38 ATOM 54 CA ARG D1047 90.917 145.440 146.443 1.00155.35 ATOM 55 C ARG D1047 91.393 144.596 145.262 1.00154.67 ATOM 56 O ARG D1047 92.278 143.765 145.428 1.00153.75 ATOM 57 CB ARG D1047 91.955 145.434 147.565 1.00154.98 ATOM 58 CG ARG D1047 92.644 146.760 147.800 1.00155.95 ATOM 59 CD ARG D1047 93.954 146.841 147.022 1.00155.59 ATOM 60 NE ARG D1047 94.582 148.146 147.183 1.00156.67 ATOM 61 CZ ARG D1047 95.580 148.611 146.430 1.00156.89 ATOM 62 NH1 ARG D1047 96.088 147.871 145.457 1.00156.12 ATOM 63 NH2 ARG D1047 96.082 149.826 146.657 1.00158.02 ATOM 64 N SER D1048 90.826 144.811 144.070 1.00154.86 ATOM 65 CA SER D1048 91.353 144.176 142.851 1.00154.51 ATOM 66 C SER D1048 92.791 144.654 142.699 1.00154.54 ATOM 67 O SER D1048 93.747 143.876 142.860 1.00153.80 ATOM 68 CB SER D1048 90.513 144.525 141.602 1.00155.30 ATOM 69 OG SER D1048 90.841 145.799 141.069 1.00156.14 ATOM 70 N THR D1049 92.918 145.950 142.403 1.00157.74 ATOM 71 CA THR D1049 94.180 146.700 142.479 1.00158.01 ATOM 72 C THR D1049 93.975 148.243 142.359 1.00159.31 ATOM 73 O THR D1049 93.097 148.702 141.602 1.00160.07 ATOM 74 CB THR D1049 95.190 146.238 141.410 1.00157.87 ATOM 75 OG1 THR D1049 95.209 144.801 141.326 1.00156.98 ATOM 76 CG2 THR D1049 96.584 146.763 141.753 1.00157.81 ATOM 77 N GLY D1050 94.796 149.011 143.096 1.00159.35 ATOM 78 CA GLY D1050 94.778 150.471 143.123 1.00160.73 ATOM 79 C GLY D1050 96.005 151.015 143.852 1.00161.21 ATOM 80 O GLY D1050 97.063 150.389 143.847 1.00160.77 ATOM 81 N PRO D1051 95.844 152.141 144.557 1.00159.27 ATOM 82 CA PRO D1051 96.933 152.948 145.119 1.00160.04 ATOM 83 C PRO D1051 98.000 152.220 145.931 1.00159.06 ATOM 84 O PRO D1051 97.713 151.475 146.858 1.00158.20 ATOM 85 CB PRO D1051 96.199 153.937 146.030 1.00161.28 ATOM 86 CG PRO D1051 94.878 153.344 146.297 1.00160.73 ATOM 87 CD PRO D1051 94.531 152.587 145.048 1.00159.90 ATOM 88 N VAL D1052 99.253 152.500 145.616 1.00160.70 ATOM 89 CA VAL D1052 100.342 151.831 146.294 1.00159.99 ATOM 90 C VAL D1052 101.228 152.811 147.039 1.00161.16 ATOM 91 O VAL D1052 100.719 153.661 147.754 1.00162.33 ATOM 92 CB VAL D1052 101.123 150.977 145.312 1.00159.32 ATOM 93 CG1 VAL D1052 100.249 149.833 144.827 1.00158.10 ATOM 94 CG2 VAL D1052 101.587 151.807 144.150 1.00160.47 ATOM 95 N ASN D1053 102.541 152.698 146.895 1.00158.08 ATOM 96 CA ASN D1053 103.433 153.601 147.598 1.00159.23 ATOM 97 C ASN D1053 104.731 153.699 146.875 1.00159.66 ATOM 98 O ASN D1053 105.195 152.756 146.264 1.00158.73 ATOM 99 CB ASN D1053 103.697 153.134 149.022 1.00158.72 ATOM 100 CG ASN D1053 104.505 154.133 149.833 1.00159.98 ATOM 101 OD1 ASN D1053 105.146 153.766 150.811 1.00159.74 ATOM 102 ND2 ASN D1053 104.477 155.390 149.435 1.00161.44 ATOM 103 N SER D1054 105.316 154.867 146.984 1.00161.21 ATOM 104 CA SER D1054 106.495 155.213 146.263 1.00161.97 ATOM 105 C SER D1054 107.655 154.383 146.719 1.00161.36 ATOM 106 O SER D1054 108.555 154.076 145.955 1.00161.37 ATOM 107 CB SER D1054 106.809 156.660 146.576 1.00163.96 ATOM 108 OG SER D1054 106.728 156.840 147.985 1.00164.49 ATOM 109 N LEU D1055 107.670 154.035 147.981 1.00160.93 ATOM 110 CA LEU D1055 108.916 153.550 148.466 1.00160.58 ATOM 111 C LEU D1055 108.863 152.064 148.650 1.00158.80 ATOM 112 O LEU D1055 109.867 151.434 148.926 1.00158.41 ATOM 113 CB LEU D1055 109.289 154.258 149.755 1.00161.46 ATOM 114 CG LEU D1055 109.046 155.770 149.831 1.00163.18 ATOM 115 CD1 LEU D1055 109.605 156.311 151.126 1.00164.23 ATOM 116 CD2 LEU D1055 109.653 156.533 148.678 1.00164.35 ATOM 117 N THR D1056 107.697 151.478 148.474 1.00158.94 ATOM 118 CA THR D1056 107.560 150.084 148.861 1.00157.37 ATOM 119 C THR D1056 106.835 149.259 147.848 1.00156.48 ATOM 120 O THR D1056 106.997 148.039 147.804 1.00155.37 ATOM 121 CB THR D1056 106.708 149.984 150.078 1.00156.96 ATOM 122 OG1 THR D1056 105.771 151.058 150.045 1.00158.00 ATOM 123 CG2 THR D1056 107.539 150.123 151.306 1.00157.04 ATOM 124 N MET D1057 105.987 149.935 147.081 1.00161.22 ATOM 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148.471 1.00159.03 ATOM 143 C PRO D1059 99.408 149.659 149.935 1.00159.44 ATOM 144 O PRO D1059 99.862 148.909 150.795 1.00158.70 ATOM 145 CB PRO D1059 98.317 148.244 148.191 1.00158.30 ATOM 146 CG PRO D1059 98.845 147.376 147.072 1.00157.56 ATOM 147 CD PRO D1059 100.318 147.218 147.333 1.00157.21 ATOM 148 N VAL D1060 98.871 150.848 150.213 1.00159.09 ATOM 149 CA VAL D1060 98.814 151.401 151.580 1.00159.82 ATOM 150 C VAL D1060 97.402 151.209 152.129 1.00159.71 ATOM 151 O VAL D1060 96.534 150.747 151.389 1.00159.06 ATOM 152 CB VAL D1060 99.152 152.901 151.554 1.00161.55 ATOM 153 CG1 VAL D1060 98.154 153.608 150.687 1.00162.46 ATOM 154 CG2 VAL D1060 99.233 153.515 152.955 1.00162.37 ATOM 155 N LYS D1061 97.166 151.544 153.406 1.00161.60 ATOM 156 CA LYS D1061 95.819 151.500 154.013 1.00161.86 ATOM 157 C LYS D1061 94.836 152.371 153.205 1.00163.02 ATOM 158 O LYS D1061 95.262 153.079 152.271 1.00163.80 ATOM 159 CB LYS D1061 95.844 151.914 155.520 1.00162.61 ATOM 160 CG LYS D1061 94.855 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