HEADER transcription/dna 31-DEC-69 5D4E TITLE Crystal structure of Thermus thermophilus product complex for TITLE 2 transcription initiation with 3'-dephosphate-CoA and CTP COMPND MOL_ID: 3; COMPND 2 MOLECULE: DNA-directed RNA polymerase subunit beta'; COMPND 3 CHAIN: D, N; COMPND 4 EC: 2.7.7.6; EXPDTA X-RAY DIFFRACTION REMARK 2 RESOLUTION. 3.08 ANGSTORMS DBREF 5D4E D 1 1524 UNP Q8RQE8 RPOC_THET8 1 1524 SEQRES 1 D 61 ALA LYS ALA VAL ILE SER GLU ILE ASP GLY VAL VAL ARG SEQRES 2 D 61 ILE GLU GLU THR GLU GLU LYS LEU SER VAL PHE VAL GLU SEQRES 3 D 61 SER GLU GLY PHE SER LYS GLU TYR LYS LEU PRO LYS GLU SEQRES 4 D 61 ALA ARG LEU LEU VAL LYS ASP GLY ASP TYR VAL GLU ALA SEQRES 5 D 61 GLY GLN PRO LEU THR ARG GLY ALA ILE ATOM 1 N ALA D1270 24.496 -17.535 60.777 1.00 56.58 ATOM 2 CA ALA D1270 23.258 -18.288 60.874 1.00 53.12 ATOM 3 C ALA D1270 22.117 -17.284 60.935 1.00 62.01 ATOM 4 O ALA D1270 21.930 -16.605 61.945 1.00 66.77 ATOM 5 CB ALA D1270 23.263 -19.168 62.108 1.00 63.23 ATOM 6 N LYS D1271 21.350 -17.198 59.853 1.00 52.10 ATOM 7 CA LYS D1271 20.313 -16.181 59.746 1.00 44.59 ATOM 8 C LYS D1271 18.920 -16.789 59.796 1.00 44.55 ATOM 9 O LYS D1271 18.714 -17.941 59.414 1.00 49.79 ATOM 10 CB LYS D1271 20.474 -15.364 58.459 1.00 45.14 ATOM 11 CG LYS D1271 19.900 -16.030 57.216 1.00 42.14 ATOM 12 CD LYS D1271 19.802 -15.058 56.050 1.00 31.57 ATOM 13 CE LYS D1271 21.177 -14.589 55.601 1.00 45.62 ATOM 14 NZ LYS D1271 21.106 -13.757 54.366 1.00 47.89 ATOM 15 N ALA D1272 17.969 -16.004 60.285 1.00 43.02 ATOM 16 CA ALA D1272 16.575 -16.407 60.282 1.00 46.01 ATOM 17 C ALA D1272 16.017 -16.245 58.876 1.00 45.91 ATOM 18 O ALA D1272 16.719 -15.795 57.970 1.00 43.91 ATOM 19 CB ALA D1272 15.785 -15.568 61.266 1.00 44.04 ATOM 20 N VAL D1273 14.753 -16.611 58.697 1.00 50.58 ATOM 21 CA VAL D1273 14.082 -16.438 57.415 1.00 50.46 ATOM 22 C VAL D1273 12.808 -15.627 57.614 1.00 52.46 ATOM 23 O VAL D1273 12.011 -15.922 58.505 1.00 58.29 ATOM 24 CB VAL D1273 13.733 -17.790 56.766 1.00 49.25 ATOM 25 CG1 VAL D1273 13.112 -17.576 55.394 1.00 50.40 ATOM 26 CG2 VAL D1273 14.971 -18.665 56.660 1.00 50.93 ATOM 27 N ILE D1274 12.622 -14.601 56.790 1.00 42.40 ATOM 28 CA ILE D1274 11.450 -13.742 56.903 1.00 47.74 ATOM 29 C ILE D1274 10.596 -13.791 55.641 1.00 50.32 ATOM 30 O ILE D1274 11.088 -14.106 54.558 1.00 53.20 ATOM 31 CB ILE D1274 11.845 -12.281 57.198 1.00 49.77 ATOM 32 CG1 ILE D1274 12.707 -11.719 56.065 1.00 47.49 ATOM 33 CG2 ILE D1274 12.578 -12.187 58.527 1.00 43.18 ATOM 34 CD1 ILE D1274 13.122 -10.277 56.267 1.00 30.42 ATOM 35 N SER D1275 9.313 -13.481 55.791 1.00 51.74 ATOM 36 CA SER D1275 8.382 -13.497 54.669 1.00 56.13 ATOM 37 C SER D1275 8.518 -12.240 53.818 1.00 56.93 ATOM 38 O SER D1275 8.395 -11.122 54.321 1.00 51.06 ATOM 39 CB SER D1275 6.945 -13.629 55.172 1.00 58.22 ATOM 40 OG SER D1275 6.786 -14.791 55.965 1.00 76.65 ATOM 41 N GLU D1276 8.768 -12.428 52.525 1.00 55.84 ATOM 42 CA GLU D1276 8.906 -11.306 51.605 1.00 58.39 ATOM 43 C GLU D1276 7.579 -10.571 51.450 1.00 61.24 ATOM 44 O GLU D1276 7.549 -9.366 51.202 1.00 63.61 ATOM 45 CB GLU D1276 9.407 -11.782 50.240 1.00 54.98 ATOM 46 CG GLU D1276 10.755 -12.483 50.280 1.00 52.51 ATOM 47 CD GLU D1276 11.308 -12.760 48.896 1.00 63.55 ATOM 48 OE1 GLU D1276 10.824 -12.140 47.926 1.00 66.74 ATOM 49 OE2 GLU D1276 12.226 -13.599 48.776 1.00 69.15 ATOM 50 N ILE D1277 6.484 -11.310 51.596 1.00 66.75 ATOM 51 CA ILE D1277 5.145 -10.740 51.501 1.00 69.33 ATOM 52 C ILE D1277 4.272 -11.229 52.653 1.00 66.97 ATOM 53 O ILE D1277 4.743 -11.932 53.545 1.00 64.08 ATOM 54 CB ILE D1277 4.467 -11.110 50.168 1.00 71.93 ATOM 55 CG1 ILE D1277 4.401 -12.630 50.007 1.00 73.85 ATOM 56 CG2 ILE D1277 5.205 -10.479 48.995 1.00 69.12 ATOM 57 CD1 ILE D1277 3.752 -13.082 48.715 1.00 81.30 ATOM 58 N ASP D1278 2.999 -10.850 52.631 1.00 65.88 ATOM 59 CA ASP D1278 2.051 -11.324 53.631 1.00 70.07 ATOM 60 C ASP D1278 1.425 -12.630 53.156 1.00 80.99 ATOM 61 O ASP D1278 1.722 -13.101 52.058 1.00 85.74 ATOM 62 CB ASP D1278 0.966 -10.276 53.879 1.00 71.38 ATOM 63 CG ASP D1278 1.538 -8.916 54.228 1.00 68.19 ATOM 64 OD1 ASP D1278 1.751 -8.105 53.302 1.00 65.79 ATOM 65 OD2 ASP D1278 1.776 -8.658 55.426 1.00 66.72 ATOM 66 N GLY D1279 0.563 -13.217 53.979 1.00 82.24 ATOM 67 CA GLY D1279 -0.117 -14.442 53.598 1.00 93.02 ATOM 68 C GLY D1279 -0.457 -15.354 54.761 1.00 94.44 ATOM 69 O GLY D1279 -0.512 -14.922 55.912 1.00 91.05 ATOM 70 N VAL D1280 -0.689 -16.625 54.450 1.00 92.80 ATOM 71 CA VAL D1280 -0.987 -17.627 55.464 1.00 97.96 ATOM 72 C VAL D1280 0.050 -18.751 55.416 1.00 99.12 ATOM 73 O VAL D1280 0.530 -19.124 54.343 1.00 90.64 ATOM 74 CB VAL D1280 -2.421 -18.193 55.301 1.00102.07 ATOM 75 CG1 VAL D1280 -2.581 -18.889 53.955 1.00101.28 ATOM 76 CG2 VAL D1280 -2.772 -19.134 56.447 1.00 96.30 ATOM 77 N VAL D1281 0.406 -19.272 56.587 1.00100.95 ATOM 78 CA VAL D1281 1.418 -20.316 56.689 1.00 98.25 ATOM 79 C VAL D1281 0.867 -21.687 56.309 1.00102.75 ATOM 80 O VAL D1281 -0.146 -22.136 56.847 1.00107.06 ATOM 81 CB VAL D1281 2.015 -20.388 58.109 1.00 97.60 ATOM 82 CG1 VAL D1281 3.040 -21.509 58.201 1.00 96.17 ATOM 83 CG2 VAL D1281 2.640 -19.057 58.491 1.00 90.59 ATOM 84 N ARG D1282 1.544 -22.342 55.372 1.00100.31 ATOM 85 CA ARG D1282 1.214 -23.701 54.972 1.00103.01 ATOM 86 C ARG D1282 2.507 -24.508 54.979 1.00103.12 ATOM 87 O ARG D1282 3.431 -24.222 54.216 1.00100.96 ATOM 88 CB ARG D1282 0.579 -23.705 53.577 1.00102.87 ATOM 89 CG ARG D1282 -0.194 -24.972 53.218 1.00 98.01 ATOM 90 CD ARG D1282 0.705 -26.050 52.627 1.00100.06 ATOM 91 NE ARG D1282 1.457 -25.568 51.471 1.00 98.56 ATOM 92 CZ ARG D1282 1.000 -25.576 50.223 1.00 92.20 ATOM 93 NH1 ARG D1282 -0.215 -26.038 49.963 1.00 94.03 ATOM 94 NH2 ARG D1282 1.756 -25.118 49.235 1.00 88.97 ATOM 95 N ILE D1283 2.574 -25.513 55.847 1.00102.54 ATOM 96 CA ILE D1283 3.796 -26.294 56.008 1.00101.83 ATOM 97 C ILE D1283 3.783 -27.596 55.209 1.00102.88 ATOM 98 O ILE D1283 2.781 -28.311 55.177 1.00 99.40 ATOM 99 CB ILE D1283 4.093 -26.587 57.498 1.00100.82 ATOM 100 CG1 ILE D1283 2.830 -27.061 58.223 1.00 92.25 ATOM 101 CG2 ILE D1283 4.647 -25.347 58.181 1.00 91.09 ATOM 102 CD1 ILE D1283 2.700 -28.567 58.338 1.00 80.18 ATOM 103 N GLU D1284 4.902 -27.888 54.554 1.00106.36 ATOM 104 CA GLU D1284 5.056 -29.146 53.836 1.00102.41 ATOM 105 C GLU D1284 6.340 -29.818 54.298 1.00111.12 ATOM 106 O GLU D1284 7.434 -29.312 54.056 1.00116.34 ATOM 107 CB GLU D1284 5.086 -28.900 52.325 1.00 97.77 ATOM 108 CG GLU D1284 5.175 -30.163 51.478 1.00103.95 ATOM 109 CD GLU D1284 6.595 -30.492 51.054 1.00114.08 ATOM 110 OE1 GLU D1284 7.489 -29.641 51.248 1.00112.72 ATOM 111 OE2 GLU D1284 6.818 -31.600 50.523 1.00121.32 ATOM 112 N GLU D1285 6.209 -30.958 54.969 1.00112.80 ATOM 113 CA GLU D1285 7.373 -31.610 55.557 1.00118.25 ATOM 114 C GLU D1285 7.453 -33.105 55.261 1.00120.97 ATOM 115 O GLU D1285 6.589 -33.882 55.674 1.00110.22 ATOM 116 CB GLU D1285 7.412 -31.369 57.070 1.00113.90 ATOM 117 CG GLU D1285 8.668 -31.893 57.747 1.00120.38 ATOM 118 CD GLU D1285 8.776 -31.466 59.197 1.00120.54 ATOM 119 OE1 GLU D1285 9.890 -31.542 59.758 1.00109.56 ATOM 120 OE2 GLU D1285 7.749 -31.056 59.777 1.00127.42 ATOM 121 N THR D1286 8.499 -33.497 54.541 1.00122.41 ATOM 122 CA THR D1286 8.831 -34.902 54.370 1.00118.65 ATOM 123 C THR D1286 9.762 -35.264 55.520 1.00118.86 ATOM 124 O THR D1286 10.092 -34.409 56.340 1.00125.22 ATOM 125 CB THR D1286 9.538 -35.152 53.024 1.00119.16 ATOM 126 OG1 THR D1286 9.047 -34.226 52.046 1.00123.01 ATOM 127 CG2 THR D1286 9.291 -36.574 52.537 1.00117.54 ATOM 128 N GLU D1287 10.187 -36.519 55.594 1.00116.13 ATOM 129 CA GLU D1287 11.093 -36.922 56.660 1.00122.38 ATOM 130 C GLU D1287 12.522 -36.469 56.371 1.00120.93 ATOM 131 O GLU D1287 13.265 -36.113 57.286 1.00125.27 ATOM 132 CB GLU D1287 11.031 -38.434 56.891 1.00128.03 ATOM 133 CG GLU D1287 9.659 -38.930 57.324 1.00124.07 ATOM 134 CD GLU D1287 9.690 -40.345 57.869 1.00127.28 ATOM 135 OE1 GLU D1287 9.170 -41.258 57.191 1.00132.73 ATOM 136 OE2 GLU D1287 10.228 -40.544 58.979 1.00122.09 ATOM 137 N GLU D1288 12.902 -36.485 55.098 1.00118.87 ATOM 138 CA GLU D1288 14.244 -36.067 54.700 1.00128.93 ATOM 139 C GLU D1288 14.329 -34.618 54.208 1.00130.88 ATOM 140 O GLU D1288 15.420 -34.123 53.927 1.00128.20 ATOM 141 CB GLU D1288 14.803 -37.015 53.637 1.00128.44 ATOM 142 CG GLU D1288 13.906 -37.185 52.422 1.00130.31 ATOM 143 CD GLU D1288 14.474 -38.166 51.416 1.00138.30 ATOM 144 OE1 GLU D1288 15.646 -38.567 51.575 1.00147.11 ATOM 145 OE2 GLU D1288 13.749 -38.536 50.469 1.00132.19 ATOM 146 N LYS D1289 13.187 -33.941 54.114 1.00129.92 ATOM 147 CA LYS D1289 13.150 -32.566 53.606 1.00124.99 ATOM 148 C LYS D1289 12.081 -31.712 54.291 1.00119.32 ATOM 149 O LYS D1289 11.104 -32.236 54.826 1.00119.49 ATOM 150 CB LYS D1289 12.939 -32.552 52.087 1.00117.88 ATOM 151 CG LYS D1289 14.170 -32.932 51.272 1.00110.07 ATOM 152 CD LYS D1289 13.887 -32.906 49.778 1.00102.18 ATOM 153 CE LYS D1289 15.115 -33.314 48.976 1.00 94.95 ATOM 154 NZ LYS D1289 14.847 -33.333 47.511 1.00 68.63 ATOM 155 N LEU D1290 12.272 -30.395 54.265 1.00117.81 ATOM 156 CA LEU D1290 11.336 -29.466 54.895 1.00115.79 ATOM 157 C LEU D1290 11.142 -28.212 54.041 1.00100.47 ATOM 158 O LEU D1290 12.109 -27.639 53.537 1.00 89.80 ATOM 159 CB LEU D1290 11.829 -29.080 56.294 1.00112.86 ATOM 160 CG LEU D1290 10.805 -28.983 57.430 1.00108.78 ATOM 161 CD1 LEU D1290 11.500 -28.705 58.757 1.00103.69 ATOM 162 CD2 LEU D1290 9.744 -27.926 57.153 1.00 95.72 ATOM 163 N SER D1291 9.889 -27.794 53.879 1.00100.51 ATOM 164 CA SER D1291 9.571 -26.583 53.128 1.00 97.56 ATOM 165 C SER D1291 8.404 -25.809 53.744 1.00 99.43 ATOM 166 O SER D1291 7.386 -26.394 54.129 1.00 98.64 ATOM 167 CB SER D1291 9.267 -26.918 51.666 1.00 89.90 ATOM 168 OG SER D1291 10.395 -27.489 51.027 1.00 92.20 ATOM 169 N VAL D1292 8.561 -24.490 53.827 1.00103.63 ATOM 170 CA VAL D1292 7.521 -23.618 54.364 1.00 95.92 ATOM 171 C VAL D1292 6.970 -22.697 53.281 1.00 90.26 ATOM 172 O VAL D1292 7.714 -21.939 52.657 1.00 79.73 ATOM 173 CB VAL D1292 8.044 -22.762 55.533 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