HEADER transcription/dna/rna 29-SEP-15 5E18 TITLE T. thermophilus transcription initiation complex having a YYY TITLE 2 discriminator sequence and a nontemplate-strand length corresponding TITLE 3 to TSS selection at position 8 (RPo-CCC-8) COMPND MOL_ID: 3; COMPND 2 MOLECULE: DNA-directed RNA polymerase subunit beta'; COMPND 3 CHAIN: D; COMPND 4 EC: 2.7.7.6; EXPDTA X-RAY DIFFRACTION REMARK 2 RESOLUTION. 3.30 ANGSTORMS DBREF 5E18 D 1 1524 UNP Q8RQE8 RPOC_THET8 1 1524 SEQRES 1 D 91 ALA ASP CYS GLY THR THR ASN TYR ILE SER VAL PRO LEU SEQRES 2 D 91 PHE GLN PRO ASP GLU VAL THR ARG SER LEU ARG LEU ARG SEQRES 3 D 91 LYS ARG ALA ASP ILE GLU ALA GLY LEU TYR GLY ARG VAL SEQRES 4 D 91 LEU ALA ARG GLU VAL GLU VAL LEU GLY VAL ARG LEU GLU SEQRES 5 D 91 GLU GLY ARG TYR LEU SER MET ASP ASP VAL HIS LEU LEU SEQRES 6 D 91 ILE LYS ALA ALA GLU ALA GLY GLU ILE GLN GLU VAL PRO SEQRES 7 D 91 VAL ARG SER PRO LEU THR CYS GLN THR ARG TYR GLY VAL ATOM 1 N ALA D1110 -27.966 25.055 67.680 1.00 83.16 ATOM 2 CA ALA D1110 -28.968 24.763 68.694 1.00 83.20 ATOM 3 C ALA D1110 -30.024 23.779 68.203 1.00 84.77 ATOM 4 O ALA D1110 -30.330 22.797 68.877 1.00 87.84 ATOM 5 CB ALA D1110 -29.626 26.049 69.156 1.00 97.12 ATOM 6 N ASP D1111 -30.579 24.043 67.027 1.00 83.74 ATOM 7 CA ASP D1111 -31.602 23.171 66.467 1.00 85.34 ATOM 8 C ASP D1111 -31.433 23.007 64.959 1.00 96.94 ATOM 9 O ASP D1111 -31.341 23.988 64.218 1.00 99.10 ATOM 10 CB ASP D1111 -33.000 23.709 66.787 1.00 77.73 ATOM 11 CG ASP D1111 -34.081 22.647 66.661 1.00 87.44 ATOM 12 OD1 ASP D1111 -33.879 21.673 65.909 1.00 88.18 ATOM 13 OD2 ASP D1111 -35.135 22.782 67.318 1.00 86.02 ATOM 14 N CYS D1112 -31.402 21.757 64.512 1.00 95.94 ATOM 15 CA CYS D1112 -31.389 21.456 63.090 1.00 83.76 ATOM 16 C CYS D1112 -32.774 21.697 62.514 1.00 84.78 ATOM 17 O CYS D1112 -32.939 21.891 61.313 1.00 92.50 ATOM 18 CB CYS D1112 -30.958 20.015 62.851 1.00 80.75 ATOM 19 SG CYS D1112 -31.936 18.824 63.775 1.00 78.10 ATOM 20 N GLY D1113 -33.772 21.682 63.388 1.00 78.82 ATOM 21 CA GLY D1113 -35.137 21.939 62.983 1.00 85.07 ATOM 22 C GLY D1113 -35.857 20.692 62.516 1.00 84.59 ATOM 23 O GLY D1113 -36.968 20.773 61.993 1.00 88.98 ATOM 24 N THR D1114 -35.234 19.535 62.704 1.00 77.11 ATOM 25 CA THR D1114 -35.842 18.293 62.255 1.00 81.75 ATOM 26 C THR D1114 -37.155 18.012 62.982 1.00 82.56 ATOM 27 O THR D1114 -37.313 18.330 64.158 1.00 83.27 ATOM 28 CB THR D1114 -34.900 17.093 62.444 1.00 83.93 ATOM 29 OG1 THR D1114 -35.475 15.940 61.821 1.00 94.18 ATOM 30 CG2 THR D1114 -34.682 16.798 63.918 1.00 77.77 ATOM 31 N THR D1115 -38.112 17.451 62.256 1.00 89.70 ATOM 32 CA THR D1115 -39.342 16.967 62.861 1.00 90.12 ATOM 33 C THR D1115 -39.177 15.504 63.229 1.00 86.14 ATOM 34 O THR D1115 -40.032 14.915 63.887 1.00 91.76 ATOM 35 CB THR D1115 -40.546 17.130 61.918 1.00101.83 ATOM 36 OG1 THR D1115 -40.203 16.646 60.613 1.00 89.68 ATOM 37 CG2 THR D1115 -40.942 18.591 61.815 1.00117.83 ATOM 38 N ASN D1116 -38.067 14.923 62.792 1.00 82.85 ATOM 39 CA ASN D1116 -37.813 13.505 62.993 1.00 82.95 ATOM 40 C ASN D1116 -37.369 13.191 64.412 1.00 84.56 ATOM 41 O ASN D1116 -36.845 14.054 65.114 1.00 89.69 ATOM 42 CB ASN D1116 -36.763 13.011 62.001 1.00 83.72 ATOM 43 CG ASN D1116 -37.086 13.400 60.576 1.00 93.81 ATOM 44 OD1 ASN D1116 -38.235 13.701 60.250 1.00 94.57 ATOM 45 ND2 ASN D1116 -36.073 13.395 59.714 1.00 93.94 ATOM 46 N TYR D1117 -37.582 11.947 64.824 1.00 80.57 ATOM 47 CA TYR D1117 -37.187 11.498 66.150 1.00 71.26 ATOM 48 C TYR D1117 -37.117 9.980 66.213 1.00 74.59 ATOM 49 O TYR D1117 -37.395 9.297 65.228 1.00 81.18 ATOM 50 CB TYR D1117 -38.166 12.015 67.196 1.00 75.13 ATOM 51 CG TYR D1117 -39.610 11.643 66.925 1.00 82.54 ATOM 52 CD1 TYR D1117 -40.444 12.490 66.204 1.00 85.00 ATOM 53 CD2 TYR D1117 -40.141 10.447 67.395 1.00 82.28 ATOM 54 CE1 TYR D1117 -41.767 12.154 65.957 1.00 85.60 ATOM 55 CE2 TYR D1117 -41.460 10.103 67.153 1.00 82.27 ATOM 56 CZ TYR D1117 -42.268 10.959 66.434 1.00 87.24 ATOM 57 OH TYR D1117 -43.580 10.617 66.193 1.00 89.57 ATOM 58 N ILE D1118 -36.752 9.453 67.375 1.00 76.17 ATOM 59 CA ILE D1118 -36.784 8.013 67.587 1.00 73.30 ATOM 60 C ILE D1118 -37.639 7.696 68.808 1.00 79.73 ATOM 61 O ILE D1118 -37.783 8.520 69.714 1.00 72.97 ATOM 62 CB ILE D1118 -35.369 7.414 67.767 1.00 68.59 ATOM 63 CG1 ILE D1118 -34.818 7.710 69.162 1.00 76.25 ATOM 64 CG2 ILE D1118 -34.423 7.933 66.696 1.00 66.15 ATOM 65 CD1 ILE D1118 -33.499 7.019 69.452 1.00 79.89 ATOM 66 N SER D1119 -38.223 6.504 68.816 1.00 80.31 ATOM 67 CA SER D1119 -39.110 6.096 69.894 1.00 72.91 ATOM 68 C SER D1119 -38.461 5.023 70.744 1.00 74.79 ATOM 69 O SER D1119 -38.314 3.885 70.307 1.00 81.67 ATOM 70 CB SER D1119 -40.432 5.581 69.328 1.00 84.67 ATOM 71 OG SER D1119 -40.913 6.441 68.311 1.00 97.82 ATOM 72 N VAL D1120 -38.095 5.376 71.968 1.00 67.45 ATOM 73 CA VAL D1120 -37.406 4.438 72.838 1.00 71.55 ATOM 74 C VAL D1120 -38.388 3.519 73.548 1.00 72.29 ATOM 75 O VAL D1120 -39.157 3.966 74.393 1.00 78.88 ATOM 76 CB VAL D1120 -36.558 5.171 73.879 1.00 69.88 ATOM 77 CG1 VAL D1120 -35.863 4.174 74.781 1.00 71.27 ATOM 78 CG2 VAL D1120 -35.546 6.068 73.188 1.00 78.63 ATOM 79 N PRO D1121 -38.361 2.223 73.208 1.00 71.82 ATOM 80 CA PRO D1121 -39.272 1.248 73.810 1.00 80.90 ATOM 81 C PRO D1121 -38.965 0.998 75.278 1.00 85.40 ATOM 82 O PRO D1121 -37.798 0.845 75.637 1.00 81.69 ATOM 83 CB PRO D1121 -39.026 -0.013 72.982 1.00 78.66 ATOM 84 CG PRO D1121 -37.634 0.126 72.513 1.00 80.97 ATOM 85 CD PRO D1121 -37.437 1.591 72.254 1.00 79.59 ATOM 86 N LEU D1122 -40.001 0.975 76.112 1.00 86.93 ATOM 87 CA LEU D1122 -39.850 0.645 77.525 1.00 82.86 ATOM 88 C LEU D1122 -40.070 -0.841 77.777 1.00 86.16 ATOM 89 O LEU D1122 -39.816 -1.338 78.871 1.00 91.60 ATOM 90 CB LEU D1122 -40.819 1.473 78.364 1.00 77.35 ATOM 91 CG LEU D1122 -40.683 2.985 78.189 1.00 77.43 ATOM 92 CD1 LEU D1122 -41.953 3.687 78.612 1.00 92.47 ATOM 93 CD2 LEU D1122 -39.509 3.505 78.987 1.00 70.83 ATOM 94 N PHE D1123 -40.537 -1.549 76.755 1.00 92.21 ATOM 95 CA PHE D1123 -40.822 -2.973 76.881 1.00102.91 ATOM 96 C PHE D1123 -40.114 -3.784 75.805 1.00112.61 ATOM 97 O PHE D1123 -39.978 -3.338 74.666 1.00103.57 ATOM 98 CB PHE D1123 -42.327 -3.238 76.803 1.00113.25 ATOM 99 CG PHE D1123 -43.122 -2.572 77.886 1.00101.73 ATOM 100 CD1 PHE D1123 -43.198 -3.131 79.148 1.00 99.20 ATOM 101 CD2 PHE D1123 -43.807 -1.394 77.636 1.00 95.54 ATOM 102 CE1 PHE D1123 -43.928 -2.522 80.141 1.00 96.99 ATOM 103 CE2 PHE D1123 -44.541 -0.782 78.625 1.00 94.60 ATOM 104 CZ PHE D1123 -44.602 -1.345 79.879 1.00 95.09 ATOM 105 N GLN D1124 -39.678 -4.983 76.173 1.00120.03 ATOM 106 CA GLN D1124 -39.055 -5.896 75.225 1.00122.68 ATOM 107 C GLN D1124 -39.761 -7.244 75.256 1.00126.97 ATOM 108 O GLN D1124 -40.193 -7.697 76.316 1.00133.19 ATOM 109 CB GLN D1124 -37.565 -6.065 75.534 1.00126.62 ATOM 110 CG GLN D1124 -37.265 -6.587 76.935 1.00129.74 ATOM 111 CD GLN D1124 -35.775 -6.665 77.223 1.00126.27 ATOM 112 OE1 GLN D1124 -35.359 -7.119 78.291 1.00123.31 ATOM 113 NE2 GLN D1124 -34.964 -6.220 76.269 1.00124.35 ATOM 114 N PRO D1125 -39.891 -7.885 74.086 1.00129.64 ATOM 115 CA PRO D1125 -40.523 -9.203 73.982 1.00144.77 ATOM 116 C PRO D1125 -39.815 -10.238 74.842 1.00152.93 ATOM 117 O PRO D1125 -38.590 -10.335 74.803 1.00151.63 ATOM 118 CB PRO D1125 -40.386 -9.541 72.496 1.00140.64 ATOM 119 CG PRO D1125 -40.293 -8.219 71.821 1.00135.97 ATOM 120 CD PRO D1125 -39.527 -7.343 72.766 1.00132.85 ATOM 121 N ASP D1126 -40.585 -10.998 75.613 1.00161.03 ATOM 122 CA ASP D1126 -40.018 -12.002 76.501 1.00170.77 ATOM 123 C ASP D1126 -39.401 -13.134 75.686 1.00180.15 ATOM 124 O ASP D1126 -39.770 -13.346 74.531 1.00177.81 ATOM 125 CB ASP D1126 -41.090 -12.544 77.449 1.00171.97 ATOM 126 CG ASP D1126 -40.503 -13.183 78.687 1.00174.28 ATOM 127 OD1 ASP D1126 -40.180 -12.444 79.640 1.00168.41 ATOM 128 OD2 ASP D1126 -40.367 -14.422 78.710 1.00175.88 ATOM 129 N GLU D1127 -38.454 -13.849 76.284 1.00185.50 ATOM 130 CA GLU D1127 -37.813 -14.973 75.610 1.00189.05 ATOM 131 C GLU D1127 -38.785 -16.139 75.482 1.00190.42 ATOM 132 O GLU D1127 -38.712 -16.923 74.535 1.00190.93 ATOM 133 CB GLU D1127 -36.549 -15.406 76.355 1.00189.40 ATOM 134 CG GLU D1127 -35.434 -14.376 76.314 1.00188.60 ATOM 135 CD GLU D1127 -35.010 -14.032 74.899 1.00190.05 ATOM 136 OE1 GLU D1127 -34.992 -14.941 74.041 1.00192.38 ATOM 137 OE2 GLU D1127 -34.700 -12.850 74.641 1.00190.54 ATOM 138 N VAL D1128 -39.699 -16.243 76.441 1.00190.07 ATOM 139 CA VAL D1128 -40.780 -17.216 76.370 1.00188.45 ATOM 140 C VAL D1128 -41.764 -16.772 75.286 1.00189.94 ATOM 141 O VAL D1128 -42.580 -17.562 74.806 1.00198.30 ATOM 142 CB VAL D1128 -41.498 -17.365 77.735 1.00183.51 ATOM 143 CG1 VAL D1128 -42.505 -18.506 77.708 1.00182.45 ATOM 144 CG2 VAL D1128 -40.481 -17.597 78.840 1.00181.99 ATOM 145 N THR D1129 -41.659 -15.500 74.903 1.00188.31 ATOM 146 CA THR D1129 -42.541 -14.871 73.920 1.00186.32 ATOM 147 C THR D1129 -43.979 -14.930 74.421 1.00186.37 ATOM 148 O THR D1129 -44.930 -14.893 73.640 1.00189.68 ATOM 149 CB THR D1129 -42.433 -15.536 72.525 1.00186.65 ATOM 150 OG1 THR D1129 -41.100 -16.022 72.324 1.00191.76 ATOM 151 CG2 THR D1129 -42.778 -14.543 71.422 1.00183.77 ATOM 152 N ARG D1130 -44.126 -15.015 75.738 1.00182.25 ATOM 153 CA ARG D1130 -45.439 -15.076 76.353 1.00182.73 ATOM 154 C ARG D1130 -46.099 -13.716 76.239 1.00179.42 ATOM 155 O ARG D1130 -47.260 -13.603 75.849 1.00184.03 ATOM 156 CB ARG D1130 -45.336 -15.502 77.817 1.00182.11 ATOM 157 CG ARG D1130 -46.634 -16.034 78.394 1.00182.14 ATOM 158 CD ARG D1130 -46.558 -16.146 79.903 1.00182.84 ATOM 159 NE ARG D1130 -46.548 -14.834 80.540 1.00185.44 ATOM 160 CZ ARG D1130 -46.456 -14.639 81.851 1.00190.28 ATOM 161 NH1 ARG D1130 -46.457 -13.407 82.342 1.00192.94 ATOM 162 NH2 ARG D1130 -46.361 -15.676 82.673 1.00189.42 ATOM 163 N SER D1131 -45.339 -12.682 76.577 1.00175.91 ATOM 164 CA SER D1131 -45.821 -11.312 76.498 1.00172.75 ATOM 165 C SER D1131 -44.653 -10.338 76.512 1.00164.38 ATOM 166 O SER D1131 -43.493 -10.743 76.457 1.00165.40 ATOM 167 CB SER D1131 -46.776 -11.005 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