HEADER transcription/dna/rna 29-SEP-15 5E18 TITLE T. thermophilus transcription initiation complex having a YYY TITLE 2 discriminator sequence and a nontemplate-strand length corresponding TITLE 3 to TSS selection at position 8 (RPo-CCC-8) COMPND MOL_ID: 3; COMPND 2 MOLECULE: DNA-directed RNA polymerase subunit beta'; COMPND 3 CHAIN: D; COMPND 4 EC: 2.7.7.6; EXPDTA X-RAY DIFFRACTION REMARK 2 RESOLUTION. 3.30 ANGSTORMS DBREF 5E18 D 1 1524 UNP Q8RQE8 RPOC_THET8 1 1524 SEQRES 1 D 61 ALA LYS ALA VAL ILE SER GLU ILE ASP GLY VAL VAL ARG SEQRES 2 D 61 ILE GLU GLU THR GLU GLU LYS LEU SER VAL PHE VAL GLU SEQRES 3 D 61 SER GLU GLY PHE SER LYS GLU TYR LYS LEU PRO LYS GLU SEQRES 4 D 61 ALA ARG LEU LEU VAL LYS ASP GLY ASP TYR VAL GLU ALA SEQRES 5 D 61 GLY GLN PRO LEU THR ARG GLY ALA ILE ATOM 1 N ALA D1270 -21.671 -17.818 62.218 1.00120.34 ATOM 2 CA ALA D1270 -22.939 -18.496 62.387 1.00120.58 ATOM 3 C ALA D1270 -24.010 -17.427 62.344 1.00116.77 ATOM 4 O ALA D1270 -24.171 -16.654 63.289 1.00119.09 ATOM 5 CB ALA D1270 -22.982 -19.265 63.698 1.00117.92 ATOM 6 N LYS D1271 -24.758 -17.397 61.249 1.00112.61 ATOM 7 CA LYS D1271 -25.724 -16.332 61.050 1.00115.05 ATOM 8 C LYS D1271 -27.122 -16.903 60.961 1.00113.00 ATOM 9 O LYS D1271 -27.314 -18.065 60.600 1.00110.93 ATOM 10 CB LYS D1271 -25.403 -15.522 59.791 1.00103.30 ATOM 11 CG LYS D1271 -26.126 -16.003 58.548 1.00106.16 ATOM 12 CD LYS D1271 -26.306 -14.887 57.529 1.00103.34 ATOM 13 CE LYS D1271 -24.987 -14.500 56.883 1.00 93.15 ATOM 14 NZ LYS D1271 -25.190 -13.559 55.748 1.00 89.50 ATOM 15 N ALA D1272 -28.098 -16.075 61.303 1.00110.92 ATOM 16 CA ALA D1272 -29.485 -16.477 61.210 1.00119.36 ATOM 17 C ALA D1272 -29.979 -16.299 59.785 1.00113.69 ATOM 18 O ALA D1272 -29.253 -15.818 58.917 1.00112.23 ATOM 19 CB ALA D1272 -30.334 -15.668 62.171 1.00122.17 ATOM 20 N VAL D1273 -31.227 -16.677 59.556 1.00111.86 ATOM 21 CA VAL D1273 -31.847 -16.496 58.258 1.00121.07 ATOM 22 C VAL D1273 -33.084 -15.632 58.420 1.00120.17 ATOM 23 O VAL D1273 -33.937 -15.916 59.258 1.00126.27 ATOM 24 CB VAL D1273 -32.228 -17.839 57.620 1.00122.57 ATOM 25 CG1 VAL D1273 -32.886 -17.614 56.269 1.00130.27 ATOM 26 CG2 VAL D1273 -31.001 -18.723 57.481 1.00126.41 ATOM 27 N ILE D1274 -33.181 -14.568 57.634 1.00111.74 ATOM 28 CA ILE D1274 -34.330 -13.683 57.745 1.00120.58 ATOM 29 C ILE D1274 -35.182 -13.708 56.480 1.00124.88 ATOM 30 O ILE D1274 -34.665 -13.822 55.370 1.00127.20 ATOM 31 CB ILE D1274 -33.898 -12.239 58.057 1.00115.93 ATOM 32 CG1 ILE D1274 -32.948 -11.706 56.987 1.00107.01 ATOM 33 CG2 ILE D1274 -33.222 -12.175 59.413 1.00114.37 ATOM 34 CD1 ILE D1274 -32.513 -10.281 57.238 1.00 94.69 ATOM 35 N SER D1275 -36.496 -13.615 56.665 1.00131.99 ATOM 36 CA SER D1275 -37.438 -13.637 55.553 1.00131.76 ATOM 37 C SER D1275 -37.334 -12.363 54.734 1.00131.65 ATOM 38 O SER D1275 -37.422 -11.260 55.275 1.00131.93 ATOM 39 CB SER D1275 -38.869 -13.812 56.061 1.00140.77 ATOM 40 OG SER D1275 -38.989 -14.973 56.864 1.00147.83 ATOM 41 N GLU D1276 -37.149 -12.516 53.428 1.00133.79 ATOM 42 CA GLU D1276 -37.011 -11.364 52.549 1.00135.40 ATOM 43 C GLU D1276 -38.318 -10.579 52.472 1.00136.67 ATOM 44 O GLU D1276 -38.307 -9.363 52.285 1.00137.62 ATOM 45 CB GLU D1276 -36.560 -11.802 51.154 1.00137.41 ATOM 46 CG GLU D1276 -35.196 -12.480 51.134 1.00135.17 ATOM 47 CD GLU D1276 -34.674 -12.710 49.729 1.00138.46 ATOM 48 OE1 GLU D1276 -35.165 -12.043 48.795 1.00140.09 ATOM 49 OE2 GLU D1276 -33.772 -13.557 49.557 1.00136.80 ATOM 50 N ILE D1277 -39.441 -11.275 52.623 1.00141.54 ATOM 51 CA ILE D1277 -40.745 -10.617 52.639 1.00144.75 ATOM 52 C ILE D1277 -41.618 -11.072 53.806 1.00150.39 ATOM 53 O ILE D1277 -41.219 -11.919 54.608 1.00147.09 ATOM 54 CB ILE D1277 -41.521 -10.866 51.331 1.00141.26 ATOM 55 CG1 ILE D1277 -41.668 -12.368 51.078 1.00145.07 ATOM 56 CG2 ILE D1277 -40.830 -10.189 50.160 1.00149.30 ATOM 57 CD1 ILE D1277 -42.471 -12.701 49.842 1.00155.79 ATOM 58 N ASP D1278 -42.809 -10.488 53.896 1.00151.18 ATOM 59 CA ASP D1278 -43.823 -10.921 54.850 1.00148.20 ATOM 60 C ASP D1278 -44.549 -12.153 54.323 1.00150.02 ATOM 61 O ASP D1278 -44.617 -12.366 53.114 1.00159.41 ATOM 62 CB ASP D1278 -44.821 -9.796 55.124 1.00143.73 ATOM 63 CG ASP D1278 -44.143 -8.466 55.377 1.00144.25 ATOM 64 OD1 ASP D1278 -43.582 -8.285 56.477 1.00148.06 ATOM 65 OD2 ASP D1278 -44.176 -7.599 54.478 1.00143.18 ATOM 66 N GLY D1279 -45.092 -12.963 55.225 1.00151.71 ATOM 67 CA GLY D1279 -45.858 -14.128 54.819 1.00161.95 ATOM 68 C GLY D1279 -46.180 -15.074 55.959 1.00166.88 ATOM 69 O GLY D1279 -45.948 -14.759 57.125 1.00166.16 ATOM 70 N VAL D1280 -46.717 -16.241 55.618 1.00168.37 ATOM 71 CA VAL D1280 -47.068 -17.237 56.622 1.00171.27 ATOM 72 C VAL D1280 -46.052 -18.377 56.599 1.00171.19 ATOM 73 O VAL D1280 -45.516 -18.726 55.546 1.00170.72 ATOM 74 CB VAL D1280 -48.501 -17.786 56.403 1.00177.81 ATOM 75 CG1 VAL D1280 -48.591 -18.579 55.106 1.00181.16 ATOM 76 CG2 VAL D1280 -48.945 -18.635 57.590 1.00178.20 ATOM 77 N VAL D1281 -45.773 -18.940 57.769 1.00172.82 ATOM 78 CA VAL D1281 -44.784 -20.002 57.881 1.00170.71 ATOM 79 C VAL D1281 -45.365 -21.365 57.527 1.00171.28 ATOM 80 O VAL D1281 -46.329 -21.825 58.138 1.00171.30 ATOM 81 CB VAL D1281 -44.189 -20.068 59.300 1.00173.42 ATOM 82 CG1 VAL D1281 -43.301 -21.294 59.447 1.00172.77 ATOM 83 CG2 VAL D1281 -43.412 -18.799 59.607 1.00167.03 ATOM 84 N ARG D1282 -44.768 -22.003 56.527 1.00171.27 ATOM 85 CA ARG D1282 -45.095 -23.376 56.185 1.00172.64 ATOM 86 C ARG D1282 -43.803 -24.177 56.214 1.00172.49 ATOM 87 O ARG D1282 -42.909 -23.952 55.400 1.00173.57 ATOM 88 CB ARG D1282 -45.768 -23.452 54.811 1.00171.51 ATOM 89 CG ARG D1282 -46.382 -24.804 54.459 1.00173.16 ATOM 90 CD ARG D1282 -45.390 -25.723 53.756 1.00173.90 ATOM 91 NE ARG D1282 -44.772 -25.085 52.596 1.00175.87 ATOM 92 CZ ARG D1282 -45.248 -25.157 51.357 1.00174.07 ATOM 93 NH1 ARG D1282 -46.355 -25.842 51.109 1.00174.42 ATOM 94 NH2 ARG D1282 -44.617 -24.544 50.365 1.00174.18 ATOM 95 N ILE D1283 -43.702 -25.110 57.152 1.00173.95 ATOM 96 CA ILE D1283 -42.476 -25.879 57.306 1.00174.02 ATOM 97 C ILE D1283 -42.537 -27.185 56.526 1.00177.44 ATOM 98 O ILE D1283 -43.542 -27.894 56.549 1.00182.07 ATOM 99 CB ILE D1283 -42.176 -26.172 58.791 1.00171.02 ATOM 100 CG1 ILE D1283 -43.430 -26.671 59.511 1.00170.28 ATOM 101 CG2 ILE D1283 -41.648 -24.925 59.478 1.00170.30 ATOM 102 CD1 ILE D1283 -43.485 -28.173 59.699 1.00169.78 ATOM 103 N GLU D1284 -41.454 -27.487 55.820 1.00181.44 ATOM 104 CA GLU D1284 -41.344 -28.739 55.087 1.00186.66 ATOM 105 C GLU D1284 -40.115 -29.486 55.583 1.00191.88 ATOM 106 O GLU D1284 -38.987 -29.023 55.409 1.00191.49 ATOM 107 CB GLU D1284 -41.260 -28.482 53.578 1.00183.88 ATOM 108 CG GLU D1284 -41.317 -29.736 52.715 1.00183.80 ATOM 109 CD GLU D1284 -39.976 -30.434 52.597 1.00187.53 ATOM 110 OE1 GLU D1284 -38.936 -29.743 52.652 1.00185.89 ATOM 111 OE2 GLU D1284 -39.961 -31.675 52.457 1.00189.78 ATOM 112 N GLU D1285 -40.332 -30.642 56.202 1.00194.71 ATOM 113 CA GLU D1285 -39.227 -31.380 56.794 1.00195.79 ATOM 114 C GLU D1285 -39.222 -32.859 56.420 1.00195.52 ATOM 115 O GLU D1285 -40.133 -33.608 56.775 1.00195.04 ATOM 116 CB GLU D1285 -39.261 -31.231 58.319 1.00192.54 ATOM 117 CG GLU D1285 -38.037 -31.784 59.028 1.00190.44 ATOM 118 CD GLU D1285 -38.038 -31.482 60.513 1.00182.97 ATOM 119 OE1 GLU D1285 -37.066 -31.862 61.198 1.00180.45 ATOM 120 OE2 GLU D1285 -39.010 -30.864 60.993 1.00180.46 ATOM 121 N THR D1286 -38.179 -33.269 55.703 1.00197.75 ATOM 122 CA THR D1286 -37.886 -34.680 55.504 1.00196.84 ATOM 123 C THR D1286 -37.055 -35.119 56.701 1.00198.04 ATOM 124 O THR D1286 -36.753 -34.307 57.573 1.00199.91 ATOM 125 CB THR D1286 -37.116 -34.937 54.189 1.00195.61 ATOM 126 OG1 THR D1286 -37.494 -33.962 53.209 1.00196.47 ATOM 127 CG2 THR D1286 -37.404 -36.334 53.650 1.00195.66 ATOM 128 N GLU D1287 -36.677 -36.389 56.753 1.00199.50 ATOM 129 CA GLU D1287 -35.799 -36.843 57.821 1.00198.15 ATOM 130 C GLU D1287 -34.360 -36.433 57.520 1.00202.35 ATOM 131 O GLU D1287 -33.602 -36.084 58.425 1.00205.02 ATOM 132 CB GLU D1287 -35.906 -38.356 58.007 1.00193.54 ATOM 133 CG GLU D1287 -37.298 -38.822 58.399 1.00187.85 ATOM 134 CD GLU D1287 -37.323 -40.266 58.853 1.00180.27 ATOM 135 OE1 GLU D1287 -37.872 -41.113 58.118 1.00175.93 ATOM 136 OE2 GLU D1287 -36.795 -40.553 59.947 1.00182.34 ATOM 137 N GLU D1288 -33.989 -36.482 56.244 1.00202.12 ATOM 138 CA GLU D1288 -32.643 -36.109 55.823 1.00200.19 ATOM 139 C GLU D1288 -32.523 -34.666 55.327 1.00199.30 ATOM 140 O GLU D1288 -31.419 -34.205 55.032 1.00199.36 ATOM 141 CB GLU D1288 -32.166 -37.056 54.722 1.00200.22 ATOM 142 CG GLU D1288 -33.039 -37.031 53.479 1.00199.09 ATOM 143 CD GLU D1288 -32.513 -37.924 52.375 1.00201.09 ATOM 144 OE1 GLU D1288 -31.428 -38.517 52.556 1.00204.12 ATOM 145 OE2 GLU D1288 -33.183 -38.033 51.327 1.00197.06 ATOM 146 N LYS D1289 -33.642 -33.950 55.247 1.00201.49 ATOM 147 CA LYS D1289 -33.634 -32.595 54.690 1.00199.22 ATOM 148 C LYS D1289 -34.675 -31.680 55.330 1.00196.98 ATOM 149 O LYS D1289 -35.705 -32.139 55.821 1.00195.19 ATOM 150 CB LYS D1289 -33.855 -32.640 53.175 1.00196.46 ATOM 151 CG LYS D1289 -32.622 -33.038 52.381 1.00194.99 ATOM 152 CD LYS D1289 -32.937 -33.253 50.914 1.00193.82 ATOM 153 CE LYS D1289 -31.707 -33.744 50.168 1.00190.53 ATOM 154 NZ LYS D1289 -31.989 -34.015 48.732 1.00188.21 ATOM 155 N LEU D1290 -34.393 -30.381 55.313 1.00193.15 ATOM 156 CA LEU D1290 -35.270 -29.387 55.921 1.00188.08 ATOM 157 C LEU D1290 -35.387 -28.147 55.036 1.00187.07 ATOM 158 O LEU D1290 -34.381 -27.596 54.586 1.00185.81 ATOM 159 CB LEU D1290 -34.749 -29.004 57.310 1.00188.35 ATOM 160 CG LEU D1290 -35.741 -28.617 58.412 1.00187.79 ATOM 161 CD1 LEU D1290 -35.015 -28.501 59.744 1.00187.04 ATOM 162 CD2 LEU D1290 -36.475 -27.322 58.094 1.00184.58 ATOM 163 N SER D1291 -36.619 -27.715 54.785 1.00185.04 ATOM 164 CA SER D1291 -36.861 -26.494 54.024 1.00179.75 ATOM 165 C SER D1291 -38.023 -25.702 54.612 1.00177.23 ATOM 166 O SER D1291 -39.091 -26.252 54.875 1.00185.19 ATOM 167 CB SER D1291 -37.137 -26.819 52.556 1.00177.71 ATOM 168 OG SER D1291 -36.009 -27.424 51.950 1.00179.48 ATOM 169 N VAL D1292 -37.810 -24.406 54.810 1.00180.15 ATOM 170 CA VAL D1292 -38.845 -23.540 55.361 1.00175.17 ATOM 171 C VAL D1292 -39.415 -22.635 54.275 1.00173.54 ATOM 172 O VAL D1292 -38.670 -22.017 53.514 1.00170.88 ATOM 173 CB VAL D1292 -38.306 -22.682 56.524 1.00175.35 ATOM 174 CG1 VAL D1292 -39.380 -21.732 57.035 1.00172.13 ATOM 175 CG2 VAL D1292 -37.801 -23.574 57.648 1.00176.74 ATOM 176 N PHE D1293 -40.740 -22.566 54.207 1.00172.11 ATOM 177 CA PHE D1293 -41.413 -21.775 53.188 1.00173.59 ATOM 178 C PHE D1293 -42.181 -20.603 53.785 1.00168.49 ATOM 179 O PHE D1293 -42.966 -20.769 54.719 1.00173.87 ATOM 180 CB PHE D1293 -42.370 -22.653 52.377 1.00176.09 ATOM 181 CG PHE D1293 -41.678 -23.638 51.479 1.00177.43 ATOM 182 CD1 PHE D1293 -41.188 -24.832 51.983 1.00179.05 ATOM 183 CD2 PHE D1293 -41.525 -23.373 50.128 1.00178.28 ATOM 184 CE1 PHE D1293 -40.553 -25.741 51.157 1.00183.93 ATOM 185 CE2 PHE D1293 -40.892 -24.277 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-47.696 -14.752 44.335 1.00182.40 ATOM 222 N PHE D1299 -47.219 -14.479 46.517 1.00184.45 ATOM 223 CA PHE D1299 -45.824 -14.896 46.372 1.00181.71 ATOM 224 C PHE D1299 -45.446 -16.114 47.207 1.00180.08 ATOM 225 O PHE D1299 -46.145 -16.483 48.152 1.00181.63 ATOM 226 CB PHE D1299 -44.889 -13.739 46.732 1.00178.44 ATOM 227 CG PHE D1299 -44.743 -12.718 45.646 1.00181.97 ATOM 228 CD1 PHE D1299 -45.075 -13.028 44.338 1.00182.53 ATOM 229 CD2 PHE D1299 -44.267 -11.450 45.930 1.00182.55 ATOM 230 CE1 PHE D1299 -44.940 -12.090 43.334 1.00182.90 ATOM 231 CE2 PHE D1299 -44.130 -10.507 44.930 1.00184.80 ATOM 232 CZ PHE D1299 -44.466 -10.827 43.630 1.00183.04 ATOM 233 N SER D1300 -44.327 -16.732 46.841 1.00174.55 ATOM 234 CA SER D1300 -43.794 -17.872 47.575 1.00172.37 ATOM 235 C SER D1300 -42.277 -17.774 47.701 1.00169.19 ATOM 236 O SER D1300 -41.575 -17.574 46.711 1.00165.68 ATOM 237 CB SER D1300 -44.181 -19.181 46.888 1.00168.40 ATOM 238 OG SER D1300 -43.602 -19.264 45.599 1.00161.93 ATOM 239 N LYS D1301 -41.777 -17.916 48.924 1.00168.38 ATOM 240 CA LYS D1301 -40.341 -17.886 49.176 1.00166.20 ATOM 241 C LYS D1301 -39.873 -19.183 49.822 1.00164.51 ATOM 242 O LYS D1301 -40.562 -19.749 50.669 1.00166.98 ATOM 243 CB LYS D1301 -39.976 -16.697 50.066 1.00165.55 ATOM 244 CG LYS D1301 -40.014 -15.356 49.359 1.00164.36 ATOM 245 CD LYS D1301 -38.928 -15.263 48.302 1.00159.07 ATOM 246 CE LYS D1301 -38.866 -13.872 47.697 1.00153.92 ATOM 247 NZ LYS D1301 -37.733 -13.735 46.742 1.00154.36 ATOM 248 N GLU D1302 -38.696 -19.650 49.420 1.00166.91 ATOM 249 CA GLU D1302 -38.162 -20.903 49.937 1.00166.02 ATOM 250 C GLU D1302 -36.766 -20.730 50.524 1.00163.52 ATOM 251 O GLU D1302 -35.839 -20.306 49.833 1.00161.00 ATOM 252 CB GLU D1302 -38.136 -21.962 48.835 1.00169.59 ATOM 253 CG GLU D1302 -37.421 -23.244 49.222 1.00170.24 ATOM 254 CD GLU D1302 -37.421 -24.266 48.106 1.00172.63 ATOM 255 OE1 GLU D1302 -36.427 -25.009 47.980 1.00173.17 ATOM 256 OE2 GLU D1302 -38.417 -24.327 47.355 1.00173.46 ATOM 257 N 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CG1 ILE D1330 -30.815 -10.983 63.036 1.00 93.12 ATOM 473 CG2 ILE D1330 -30.404 -9.951 60.781 1.00 88.32 ATOM 474 CD1 ILE D1330 -32.026 -10.113 63.277 1.00 88.86 TER