HEADER TRANSFERASE 31-DEC-69 5NWT TITLE Crystal Structure of Escherichia coli RNA polymerase - Sigma54 TITLE 2 Holoenzyme complex COMPND MOL_ID: 3; COMPND 2 MOLECULE: DNA-directed RNA polymerase subunit beta'; COMPND 3 CHAIN: D; COMPND 4 EC: 2.7.7.6; COMPND 5 ENGINEERED: YES; EXPDTA X-RAY DIFFRACTION REMARK 2 RESOLUTION. 3.76 ANGSTORMS DBREF 5NWT D 1 1407 UNP P0A8T7 RPOC_ECOLI 1 1407 SEQRES 1 D 83 ASP ILE THR GLY GLY LEU PRO ARG VAL ALA ASP LEU PHE SEQRES 2 D 83 GLU ALA ARG ARG PRO LYS GLU PRO ALA ILE LEU ALA GLU SEQRES 3 D 83 ILE SER GLY ILE VAL SER PHE GLY LYS GLU THR LYS GLY SEQRES 4 D 83 LYS ARG ARG LEU VAL ILE THR PRO VAL ASP GLY SER ASP SEQRES 5 D 83 PRO TYR GLU GLU MET ILE PRO LYS TRP ARG GLN LEU ASN SEQRES 6 D 83 VAL PHE GLU GLY GLU ARG VAL GLU ARG GLY ASP VAL ILE SEQRES 7 D 83 SER ASP GLY PRO GLU ATOM 1 N ASP D1133 284.551 27.852 77.050 1.00287.10 ATOM 2 CA ASP D1133 284.466 27.531 75.623 1.00275.90 ATOM 3 C ASP D1133 283.010 27.303 75.221 1.00273.67 ATOM 4 O ASP D1133 282.315 26.491 75.835 1.00246.84 ATOM 5 CB ASP D1133 285.286 26.278 75.312 1.00268.38 ATOM 6 N ILE D1134 282.557 28.023 74.194 1.00286.31 ATOM 7 CA ILE D1134 281.176 27.918 73.714 1.00280.01 ATOM 8 C ILE D1134 281.006 28.551 72.330 1.00277.64 ATOM 9 O ILE D1134 281.056 29.777 72.191 1.00292.52 ATOM 10 CB ILE D1134 280.195 28.596 74.690 1.00278.87 ATOM 11 N THR D1135 280.809 27.707 71.316 1.00256.20 ATOM 12 CA THR D1135 280.618 28.157 69.934 1.00232.16 ATOM 13 C THR D1135 279.174 28.595 69.676 1.00209.50 ATOM 14 O THR D1135 278.308 28.458 70.544 1.00220.52 ATOM 15 CB THR D1135 280.983 27.043 68.932 1.00238.82 ATOM 16 N GLY D1136 278.928 29.120 68.476 1.00191.86 ATOM 17 CA GLY D1136 277.599 29.592 68.078 1.00210.34 ATOM 18 C GLY D1136 276.602 28.474 67.818 1.00208.72 ATOM 19 O GLY D1136 276.973 27.301 67.731 1.00207.14 ATOM 20 N GLY D1137 275.331 28.849 67.688 1.00198.99 ATOM 21 CA GLY D1137 274.240 27.895 67.477 1.00200.14 ATOM 22 C GLY D1137 274.111 27.424 66.039 1.00210.61 ATOM 23 O GLY D1137 274.015 26.221 65.780 1.00213.61 ATOM 24 N LEU D1138 274.104 28.377 65.107 1.00214.50 ATOM 25 CA LEU D1138 273.924 28.089 63.678 1.00202.89 ATOM 26 C LEU D1138 275.105 27.346 63.024 1.00194.42 ATOM 27 O LEU D1138 274.904 26.263 62.466 1.00183.83 ATOM 28 CB LEU D1138 273.620 29.377 62.902 1.00194.77 ATOM 29 N PRO D1139 276.331 27.919 63.083 1.00194.80 ATOM 30 CA PRO D1139 277.462 27.288 62.383 1.00189.76 ATOM 31 C PRO D1139 277.988 25.984 63.009 1.00186.84 ATOM 32 O PRO D1139 278.663 25.217 62.318 1.00182.94 ATOM 33 CB PRO D1139 278.542 28.375 62.416 1.00212.19 ATOM 34 CG PRO D1139 278.243 29.161 63.641 1.00229.90 ATOM 35 CD PRO D1139 276.750 29.143 63.800 1.00213.79 ATOM 36 N ARG D1140 277.692 25.742 64.288 1.00193.80 ATOM 37 CA ARG D1140 278.064 24.486 64.954 1.00189.98 ATOM 38 C ARG D1140 277.286 23.286 64.405 1.00164.74 ATOM 39 O ARG D1140 277.842 22.192 64.275 1.00144.66 ATOM 40 CB ARG D1140 277.844 24.588 66.465 1.00195.10 ATOM 41 N VAL D1141 276.005 23.496 64.100 1.00148.59 ATOM 42 CA VAL D1141 275.168 22.478 63.453 1.00148.45 ATOM 43 C VAL D1141 275.648 22.158 62.036 1.00152.83 ATOM 44 O VAL D1141 275.605 21.001 61.611 1.00175.40 ATOM 45 CB VAL D1141 273.692 22.919 63.384 1.00128.78 ATOM 46 N ALA D1142 276.094 23.187 61.313 1.00151.51 ATOM 47 CA ALA D1142 276.710 23.016 59.992 1.00160.92 ATOM 48 C ALA D1142 278.065 22.310 60.086 1.00158.62 ATOM 49 O ALA D1142 278.383 21.463 59.250 1.00173.70 ATOM 50 CB ALA D1142 276.867 24.364 59.302 1.00168.51 ATOM 51 N ASP D1143 278.855 22.669 61.100 1.00150.71 ATOM 52 CA ASP D1143 280.140 22.012 61.371 1.00157.15 ATOM 53 C ASP D1143 279.975 20.547 61.789 1.00142.71 ATOM 54 O ASP D1143 280.804 19.704 61.437 1.00133.73 ATOM 55 CB ASP D1143 280.911 22.771 62.456 1.00162.06 ATOM 56 N LEU D1144 278.912 20.256 62.541 1.00123.11 ATOM 57 CA LEU D1144 278.571 18.882 62.931 1.00119.48 ATOM 58 C LEU D1144 278.125 18.034 61.735 1.00129.69 ATOM 59 O LEU D1144 278.467 16.853 61.649 1.00137.43 ATOM 60 CB LEU D1144 277.474 18.885 63.998 1.00105.30 ATOM 61 N PHE D1145 277.356 18.641 60.827 1.00147.93 ATOM 62 CA PHE D1145 276.921 17.978 59.591 1.00154.29 ATOM 63 C PHE D1145 278.082 17.771 58.618 1.00155.82 ATOM 64 O PHE D1145 278.235 16.686 58.052 1.00138.64 ATOM 65 CB PHE D1145 275.814 18.789 58.909 1.00134.71 ATOM 66 N GLU D1146 278.890 18.815 58.428 1.00150.62 ATOM 67 CA GLU D1146 280.101 18.740 57.595 1.00162.41 ATOM 68 C GLU D1146 281.205 17.858 58.199 1.00172.32 ATOM 69 O GLU D1146 282.055 17.350 57.463 1.00168.18 ATOM 70 CB GLU D1146 280.654 20.143 57.311 1.00179.28 ATOM 71 CG GLU D1146 279.782 20.971 56.377 1.00204.42 ATOM 72 CD GLU D1146 280.212 22.426 56.294 1.00215.20 ATOM 73 OE1 GLU D1146 281.426 22.707 56.391 1.00214.40 ATOM 74 OE2 GLU D1146 279.329 23.294 56.120 1.00199.38 ATOM 75 N ALA D1147 281.194 17.702 59.527 1.00176.46 ATOM 76 CA ALA D1147 282.121 16.827 60.262 1.00191.35 ATOM 77 C ALA D1147 283.581 17.299 60.197 1.00198.86 ATOM 78 O ALA D1147 284.499 16.500 59.984 1.00240.39 ATOM 79 CB ALA D1147 281.984 15.376 59.799 1.00206.29 ATOM 80 N ARG D1148 283.778 18.601 60.400 1.00191.06 ATOM 81 CA ARG D1148 285.112 19.205 60.442 1.00203.30 ATOM 82 C ARG D1148 285.681 19.120 61.856 1.00196.31 ATOM 83 O ARG D1148 284.938 19.224 62.836 1.00177.15 ATOM 84 CB ARG D1148 285.051 20.667 59.995 1.00194.04 ATOM 85 N ARG D1149 286.997 18.938 61.954 1.00206.50 ATOM 86 CA ARG D1149 287.679 18.823 63.246 1.00196.47 ATOM 87 C ARG D1149 287.800 20.193 63.929 1.00185.68 ATOM 88 O ARG D1149 287.857 21.218 63.245 1.00164.89 ATOM 89 CB ARG D1149 289.070 18.209 63.062 1.00198.31 ATOM 90 N PRO D1150 287.847 20.215 65.279 1.00187.53 ATOM 91 CA PRO D1150 287.957 21.482 66.010 1.00199.05 ATOM 92 C PRO D1150 289.376 22.063 66.002 1.00211.21 ATOM 93 O PRO D1150 290.298 21.454 65.451 1.00220.00 ATOM 94 CB PRO D1150 287.537 21.094 67.430 1.00194.41 ATOM 95 CG PRO D1150 287.970 19.677 67.562 1.00181.53 ATOM 96 CD PRO D1150 287.809 19.061 66.199 1.00177.52 ATOM 97 N LYS D1151 289.532 23.236 66.614 1.00203.66 ATOM 98 CA LYS D1151 290.829 23.918 66.696 1.00197.48 ATOM 99 C LYS D1151 291.801 23.192 67.628 1.00208.41 ATOM 100 O LYS D1151 292.962 22.976 67.270 1.00211.71 ATOM 101 CB LYS D1151 290.647 25.363 67.168 1.00190.12 ATOM 102 N GLU D1152 291.314 22.825 68.815 1.00217.22 ATOM 103 CA GLU D1152 292.099 22.098 69.818 1.00214.81 ATOM 104 C GLU D1152 291.466 20.726 70.094 1.00201.88 ATOM 105 O GLU D1152 290.707 20.579 71.056 1.00185.16 ATOM 106 CB GLU D1152 292.177 22.914 71.110 1.00225.43 ATOM 107 N PRO D1153 291.771 19.716 69.249 1.00204.63 ATOM 108 CA PRO D1153 291.187 18.384 69.432 1.00230.78 ATOM 109 C PRO D1153 291.851 17.598 70.567 1.00254.31 ATOM 110 O PRO D1153 293.080 17.601 70.681 1.00297.28 ATOM 111 CB PRO D1153 291.442 17.705 68.084 1.00216.68 ATOM 112 CG PRO D1153 292.691 18.338 67.585 1.00204.16 ATOM 113 CD PRO D1153 292.671 19.759 68.078 1.00197.99 ATOM 114 N ALA D1154 291.037 16.933 71.385 1.00249.97 ATOM 115 CA ALA D1154 291.529 16.158 72.527 1.00241.60 ATOM 116 C ALA D1154 292.102 14.818 72.067 1.00245.37 ATOM 117 O ALA D1154 291.475 14.111 71.275 1.00230.88 ATOM 118 CB ALA D1154 290.412 15.934 73.535 1.00222.38 ATOM 119 N ILE D1155 293.287 14.475 72.574 1.00245.55 ATOM 120 CA ILE D1155 293.964 13.226 72.215 1.00234.19 ATOM 121 C ILE D1155 293.366 12.043 72.976 1.00214.05 ATOM 122 O ILE D1155 293.673 11.834 74.152 1.00178.82 ATOM 123 CB ILE D1155 295.476 13.302 72.509 1.00250.54 ATOM 124 N LEU D1156 292.509 11.279 72.299 1.00211.57 ATOM 125 CA LEU D1156 291.865 10.102 72.891 1.00224.64 ATOM 126 C LEU D1156 292.819 8.909 72.931 1.00216.96 ATOM 127 O LEU D1156 293.701 8.781 72.077 1.00201.32 ATOM 128 CB LEU D1156 290.607 9.728 72.105 1.00245.57 ATOM 129 N ALA D1157 292.628 8.039 73.922 1.00209.60 ATOM 130 CA ALA D1157 293.460 6.846 74.095 1.00215.34 ATOM 131 C ALA D1157 293.052 5.761 73.099 1.00197.60 ATOM 132 O ALA D1157 291.877 5.392 73.029 1.00185.19 ATOM 133 CB ALA D1157 293.349 6.322 75.519 1.00253.73 ATOM 134 N GLU D1158 294.024 5.253 72.340 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