HEADER SPLICING 31-DEC-69 5Z56 TITLE cryo-EM structure of a human activated spliceosome (mature Bact) at TITLE 2 5.1 angstrom. COMPND MOL_ID: 4; COMPND 2 MOLECULE: U5 small nuclear ribonucleoprotein 200 kDa helicase; COMPND 3 CHAIN: D; COMPND 4 EC: 3.6.4.13; EXPDTA ELECTRON MICROSCOPY DBREF 5Z56 D 1 2136 UNP O75643 U520_HUMAN 1 2136 SEQRES 1 D 55 MET CYS PRO LEU ARG GLN PHE ARG LYS LEU PRO GLU GLU SEQRES 2 D 55 VAL VAL LYS LYS ILE GLU LYS LYS ASN PHE PRO PHE GLU SEQRES 3 D 55 ARG LEU TYR ASP LEU ASN HIS ASN GLU ILE GLY GLU LEU SEQRES 4 D 55 ILE ARG MET PRO LYS MET GLY LYS THR ILE HIS LYS TYR SEQRES 5 D 55 VAL HIS LEU ATOM 1 N MET D1126 228.169 318.037 318.955 1.00146.09 ATOM 2 CA MET D1126 227.955 316.640 318.642 1.00145.54 ATOM 3 C MET D1126 226.487 316.311 318.355 1.00141.71 ATOM 4 O MET D1126 225.568 316.894 318.938 1.00138.71 ATOM 5 CB MET D1126 228.538 315.767 319.744 1.00160.55 ATOM 6 N CYS D1127 226.302 315.368 317.435 1.00150.64 ATOM 7 CA CYS D1127 224.996 314.984 316.910 1.00147.73 ATOM 8 C CYS D1127 223.992 314.618 317.988 1.00143.74 ATOM 9 O CYS D1127 224.236 313.720 318.788 1.00143.68 ATOM 10 CB CYS D1127 225.142 313.804 315.945 1.00155.30 ATOM 11 N PRO D1128 222.834 315.294 317.972 1.00145.01 ATOM 12 CA PRO D1128 221.740 315.134 318.934 1.00141.75 ATOM 13 C PRO D1128 221.289 313.686 319.060 1.00140.90 ATOM 14 O PRO D1128 220.755 313.297 320.102 1.00139.47 ATOM 15 CB PRO D1128 220.607 315.949 318.306 1.00144.35 ATOM 16 N LEU D1129 221.507 312.909 318.003 1.00127.91 ATOM 17 CA LEU D1129 221.153 311.497 317.980 1.00128.59 ATOM 18 C LEU D1129 221.848 310.744 319.115 1.00130.36 ATOM 19 O LEU D1129 221.407 309.671 319.521 1.00131.30 ATOM 20 CB LEU D1129 221.532 310.877 316.635 1.00129.09 ATOM 21 N ARG D1130 222.930 311.316 319.633 1.00149.00 ATOM 22 CA ARG D1130 223.637 310.716 320.754 1.00150.34 ATOM 23 C ARG D1130 222.831 310.672 322.048 1.00148.10 ATOM 24 O ARG D1130 223.086 309.833 322.899 1.00149.12 ATOM 25 CB ARG D1130 224.965 311.431 321.004 1.00166.31 ATOM 26 N GLN D1131 221.863 311.564 322.215 1.00131.97 ATOM 27 CA GLN D1131 221.087 311.555 323.454 1.00132.53 ATOM 28 C GLN D1131 220.160 310.349 323.506 1.00133.04 ATOM 29 O GLN D1131 219.596 310.030 324.558 1.00134.28 ATOM 30 CB GLN D1131 220.282 312.840 323.604 1.00130.91 ATOM 31 N PHE D1132 220.001 309.692 322.357 1.00144.48 ATOM 32 CA PHE D1132 219.359 308.391 322.300 1.00145.06 ATOM 33 C PHE D1132 220.499 307.406 322.428 1.00147.54 ATOM 34 O PHE D1132 221.225 307.171 321.464 1.00149.20 ATOM 35 CB PHE D1132 218.774 308.135 320.910 1.00146.74 ATOM 36 N ARG D1133 220.626 306.760 323.577 1.00166.94 ATOM 37 CA ARG D1133 221.786 305.914 323.790 1.00169.69 ATOM 38 C ARG D1133 221.613 304.618 323.010 1.00171.21 ATOM 39 O ARG D1133 222.533 303.808 322.898 1.00173.96 ATOM 40 CB ARG D1133 221.995 305.653 325.280 1.00171.93 ATOM 41 N LYS D1134 220.421 304.450 322.445 1.00169.70 ATOM 42 CA LYS D1134 220.051 303.230 321.744 1.00171.21 ATOM 43 C LYS D1134 220.896 303.063 320.473 1.00173.34 ATOM 44 O LYS D1134 220.976 301.973 319.899 1.00175.58 ATOM 45 CB LYS D1134 218.546 303.275 321.423 1.00181.88 ATOM 46 N LEU D1135 221.549 304.147 320.063 1.00160.34 ATOM 47 CA LEU D1135 222.259 304.198 318.787 1.00162.79 ATOM 48 C LEU D1135 223.707 303.704 318.867 1.00166.50 ATOM 49 O LEU D1135 224.395 303.930 319.868 1.00166.76 ATOM 50 CB LEU D1135 222.219 305.622 318.223 1.00163.43 ATOM 51 N PRO D1136 224.156 302.996 317.817 1.00160.13 ATOM 52 CA PRO D1136 225.551 302.590 317.591 1.00164.76 ATOM 53 C PRO D1136 226.499 303.775 317.493 1.00165.99 ATOM 54 O PRO D1136 226.154 304.773 316.866 1.00164.50 ATOM 55 CB PRO D1136 225.484 301.895 316.233 1.00166.57 ATOM 56 N GLU D1137 227.684 303.657 318.083 1.00207.54 ATOM 57 CA GLU D1137 228.653 304.752 318.094 1.00209.23 ATOM 58 C GLU D1137 229.260 305.048 316.724 1.00213.36 ATOM 59 O GLU D1137 229.466 306.214 316.367 1.00213.06 ATOM 60 CB GLU D1137 229.789 304.461 319.082 1.00217.31 ATOM 61 N GLU D1138 229.563 303.998 315.970 1.00203.52 ATOM 62 CA GLU D1138 230.235 304.176 314.689 1.00208.61 ATOM 63 C GLU D1138 229.320 304.877 313.693 1.00206.40 ATOM 64 O GLU D1138 229.782 305.648 312.853 1.00208.53 ATOM 65 CB GLU D1138 230.755 302.846 314.125 1.00224.84 ATOM 66 N VAL D1139 228.017 304.620 313.807 1.00175.88 ATOM 67 CA VAL D1139 227.042 305.245 312.922 1.00173.68 ATOM 68 C VAL D1139 226.962 306.736 313.210 1.00169.84 ATOM 69 O VAL D1139 227.008 307.558 312.294 1.00170.09 ATOM 70 CB VAL D1139 225.649 304.606 313.070 1.00180.69 ATOM 71 N VAL D1140 226.854 307.075 314.490 1.00157.94 ATOM 72 CA VAL D1140 226.857 308.466 314.920 1.00154.96 ATOM 73 C VAL D1140 228.107 309.198 314.421 1.00158.77 ATOM 74 O VAL D1140 228.009 310.241 313.761 1.00158.25 ATOM 75 CB VAL D1140 226.768 308.569 316.455 1.00149.93 ATOM 76 N LYS D1141 229.278 308.634 314.717 1.00189.24 ATOM 77 CA LYS D1141 230.538 309.219 314.264 1.00193.74 ATOM 78 C LYS D1141 230.557 309.381 312.741 1.00196.53 ATOM 79 O LYS D1141 231.121 310.345 312.213 1.00198.61 ATOM 80 CB LYS D1141 231.728 308.372 314.730 1.00206.45 ATOM 81 N LYS D1142 229.916 308.439 312.049 1.00195.99 ATOM 82 CA LYS D1142 229.841 308.449 310.587 1.00198.69 ATOM 83 C LYS D1142 228.998 309.613 310.071 1.00195.32 ATOM 84 O LYS D1142 229.372 310.268 309.096 1.00198.39 ATOM 85 CB LYS D1142 229.270 307.126 310.069 1.00217.90 ATOM 86 N ILE D1143 227.859 309.864 310.708 1.00169.99 ATOM 87 CA ILE D1143 227.031 310.997 310.301 1.00167.32 ATOM 88 C ILE D1143 227.687 312.320 310.702 1.00167.85 ATOM 89 O ILE D1143 227.396 313.362 310.117 1.00168.12 ATOM 90 CB ILE D1143 225.554 310.915 310.816 1.00152.94 ATOM 91 N GLU D1144 228.564 312.282 311.703 1.00169.21 ATOM 92 CA GLU D1144 229.306 313.479 312.094 1.00170.43 ATOM 93 C GLU D1144 230.433 313.765 311.105 1.00176.75 ATOM 94 O GLU D1144 230.823 314.918 310.909 1.00178.62 ATOM 95 CB GLU D1144 229.873 313.327 313.506 1.00177.96 ATOM 96 N LYS D1145 230.944 312.702 310.484 1.00209.51 ATOM 97 CA LYS D1145 232.016 312.791 309.490 1.00216.30 ATOM 98 C LYS D1145 231.649 313.738 308.344 1.00217.93 ATOM 99 O LYS D1145 232.333 314.736 308.107 1.00221.54 ATOM 100 CB LYS D1145 232.342 311.385 308.959 1.00217.53 ATOM 101 N LYS D1146 230.558 313.426 307.650 1.00203.52 ATOM 102 CA LYS D1146 230.000 314.324 306.648 1.00204.83 ATOM 103 C LYS D1146 229.189 315.368 307.390 1.00200.10 ATOM 104 O LYS D1146 228.426 315.030 308.288 1.00194.56 ATOM 105 CB LYS D1146 229.081 313.561 305.692 1.00205.80 ATOM 106 N ASN D1147 229.330 316.637 307.025 1.00207.90 ATOM 107 CA ASN D1147 228.537 317.653 307.701 1.00204.06 ATOM 108 C ASN D1147 227.229 317.890 306.954 1.00202.81 ATOM 109 O ASN D1147 227.200 318.489 305.879 1.00207.34 ATOM 110 CB ASN D1147 229.337 318.949 307.857 1.00201.92 ATOM 111 N PHE D1148 226.147 317.407 307.554 1.00207.52 ATOM 112 CA PHE D1148 224.806 317.484 306.984 1.00205.57 ATOM 113 C PHE D1148 223.820 317.910 308.063 1.00199.80 ATOM 114 O PHE D1148 223.325 317.060 308.805 1.00195.40 ATOM 115 CB PHE D1148 224.377 316.148 306.376 1.00216.44 ATOM 116 N PRO D1149 223.538 319.220 308.157 1.00165.12 ATOM 117 CA PRO D1149 222.832 319.820 309.294 1.00159.88 ATOM 118 C PRO D1149 221.581 319.036 309.695 1.00154.30 ATOM 119 O PRO D1149 220.787 318.630 308.845 1.00154.11 ATOM 120 CB PRO D1149 222.465 321.221 308.784 1.00157.72 ATOM 121 N PHE D1150 221.441 318.826 311.001 1.00178.90 ATOM 122 CA PHE D1150 220.509 317.852 311.570 1.00174.66 ATOM 123 C PHE D1150 219.049 318.052 311.169 1.00172.29 ATOM 124 O PHE D1150 218.351 317.087 310.849 1.00171.28 ATOM 125 CB PHE D1150 220.656 317.821 313.099 1.00171.46 ATOM 126 N GLU D1151 218.593 319.299 311.175 1.00179.93 ATOM 127 CA GLU D1151 217.211 319.600 310.830 1.00178.21 ATOM 128 C GLU D1151 216.915 319.284 309.363 1.00180.76 ATOM 129 O GLU D1151 215.774 319.393 308.915 1.00180.00 ATOM 130 CB GLU D1151 216.854 321.053 311.165 1.00192.87 ATOM 131 N ARG D1152 217.950 318.914 308.613 1.00173.28 ATOM 132 CA ARG D1152 217.774 318.519 307.221 1.00176.39 ATOM 133 C ARG D1152 217.532 317.012 307.086 1.00175.84 ATOM 134 O ARG D1152 217.457 316.484 305.977 1.00178.66 ATOM 135 CB ARG D1152 218.968 318.970 306.368 1.00194.71 ATOM 136 N LEU D1153 217.416 316.318 308.213 1.00147.78 ATOM 137 CA LEU D1153 217.100 314.892 308.187 1.00147.35 ATOM 138 C LEU D1153 215.595 314.622 308.037 1.00145.41 ATOM 139 O LEU D1153 215.197 313.526 307.650 1.00145.97 ATOM 140 CB LEU D1153 217.667 314.174 309.427 1.00138.81 ATOM 141 N TYR D1154 214.757 315.613 308.331 1.00166.14 ATOM 142 CA TYR D1154 213.311 315.404 308.261 1.00164.98 ATOM 143 C TYR D1154 212.812 315.316 306.821 1.00167.58 ATOM 144 O TYR D1154 211.798 314.672 306.542 1.00167.63 ATOM 145 CB TYR D1154 212.555 316.497 309.014 1.00164.51 ATOM 146 N ASP D1155 213.531 315.954 305.906 1.00199.48 ATOM 147 CA ASP D1155 213.122 315.979 304.507 1.00202.54 ATOM 148 C ASP D1155 213.292 314.603 303.858 1.00204.50 ATOM 149 O ASP D1155 212.592 314.254 302.899 1.00206.43 ATOM 150 CB ASP D1155 213.937 317.031 303.748 1.00195.21 ATOM 151 N LEU D1156 214.217 313.822 304.414 1.00183.40 ATOM 152 CA LEU D1156 214.634 312.554 303.823 1.00185.80 ATOM 153 C LEU D1156 213.820 311.362 304.327 1.00183.92 ATOM 154 O LEU D1156 213.488 311.280 305.511 1.00180.81 ATOM 155 CB LEU D1156 216.122 312.324 304.106 1.00183.77 ATOM 156 N ASN D1157 213.499 310.446 303.416 1.00206.90 ATOM 157 CA ASN D1157 212.826 309.202 303.787 1.00206.01 ATOM 158 C ASN D1157 213.826 308.167 304.280 1.00206.52 ATOM 159 O ASN D1157 215.014 308.465 304.415 1.00207.44 ATOM 160 CB ASN D1157 211.988 308.647 302.628 1.00206.13 ATOM 161 N HIS D1158 213.349 306.951 304.533 1.00197.36 ATOM 162 CA HIS D1158 214.184 305.928 305.160 1.00197.73 ATOM 163 C HIS D1158 215.398 305.567 304.301 1.00201.42 ATOM 164 O HIS D1158 216.465 305.229 304.818 1.00202.05 ATOM 165 CB HIS D1158 213.355 304.678 305.487 1.00202.66 ATOM 166 N ASN D1159 215.225 305.649 302.986 1.00188.39 ATOM 167 CA ASN D1159 216.289 305.310 302.048 1.00192.68 ATOM 168 C ASN D1159 217.295 306.447 301.876 1.00193.93 ATOM 169 O ASN D1159 218.512 306.225 301.876 1.00196.43 ATOM 170 CB ASN D1159 215.678 304.920 300.695 1.00212.90 ATOM 171 N GLU D1160 216.773 307.664 301.746 1.00194.06 ATOM 172 CA GLU D1160 217.592 308.848 301.510 1.00195.67 ATOM 173 C GLU D1160 218.547 309.111 302.666 1.00194.02 ATOM 174 O GLU D1160 219.607 309.709 302.485 1.00196.62 ATOM 175 CB GLU D1160 216.708 310.076 301.256 1.00190.74 ATOM 176 N ILE D1161 218.160 308.661 303.853 1.00180.66 ATOM 177 CA ILE D1161 218.998 308.801 305.032 1.00179.07 ATOM 178 C ILE D1161 220.255 307.950 304.924 1.00182.49 ATOM 179 O ILE D1161 221.374 308.445 305.096 1.00184.30 ATOM 180 CB ILE D1161 218.247 308.369 306.291 1.00162.37 ATOM 181 N GLY D1162 220.062 306.665 304.641 1.00215.31 ATOM 182 CA GLY D1162 221.161 305.721 304.585 1.00218.79 ATOM 183 C GLY D1162 222.140 306.027 303.469 1.00223.93 ATOM 184 O GLY D1162 223.300 305.604 303.515 1.00227.27 ATOM 185 N GLU D1163 221.673 306.773 302.471 1.00187.09 ATOM 186 CA GLU D1163 222.488 307.107 301.307 1.00192.63 ATOM 187 C GLU D1163 223.577 308.136 301.600 1.00194.39 ATOM 188 O GLU D1163 224.545 308.248 300.849 1.00199.78 ATOM 189 CB GLU D1163 221.599 307.581 300.158 1.00201.70 ATOM 190 N LEU D1164 223.420 308.881 302.688 1.00187.60 ATOM 191 CA LEU D1164 224.403 309.890 303.060 1.00189.10 ATOM 192 C LEU D1164 225.683 309.257 303.577 1.00191.55 ATOM 193 O LEU D1164 226.781 309.587 303.129 1.00196.53 ATOM 194 CB LEU D1164 223.837 310.810 304.135 1.00189.40 ATOM 195 N ILE D1165 225.529 308.347 304.530 1.00220.68 ATOM 196 CA ILE D1165 226.662 307.697 305.180 1.00222.93 ATOM 197 C ILE D1165 227.038 306.370 304.510 1.00227.13 ATOM 198 O ILE D1165 227.887 305.631 305.014 1.00229.50 ATOM 199 CB ILE D1165 226.405 307.481 306.693 1.00194.72 ATOM 200 N ARG D1166 226.375 306.078 303.388 1.00233.92 ATOM 201 CA ARG D1166 226.522 304.828 302.630 1.00237.79 ATOM 202 C ARG D1166 226.366 303.564 303.485 1.00236.15 ATOM 203 O ARG D1166 226.929 302.509 303.182 1.00240.24 ATOM 204 CB ARG D1166 227.794 304.804 301.752 1.00246.55 ATOM 205 N MET D1167 225.561 303.680 304.538 1.00197.64 ATOM 206 CA MET D1167 225.217 302.548 305.387 1.00195.88 ATOM 207 C MET D1167 223.703 302.364 305.359 1.00191.62 ATOM 208 O MET D1167 223.015 302.711 306.319 1.00187.07 ATOM 209 CB MET D1167 225.699 302.787 306.820 1.00221.94 ATOM 210 N PRO D1168 223.180 301.813 304.249 1.00184.63 ATOM 211 CA PRO D1168 221.736 301.740 303.998 1.00181.51 ATOM 212 C PRO D1168 221.009 300.776 304.933 1.00178.82 ATOM 213 O PRO D1168 219.811 300.941 305.163 1.00175.39 ATOM 214 CB PRO D1168 221.660 301.242 302.552 1.00192.12 ATOM 215 N LYS D1169 221.721 299.790 305.466 1.00186.92 ATOM 216 CA LYS D1169 221.119 298.824 306.381 1.00185.00 ATOM 217 C LYS D1169 220.595 299.535 307.633 1.00180.16 ATOM 218 O LYS D1169 219.659 299.073 308.284 1.00177.68 ATOM 219 CB LYS D1169 222.132 297.729 306.751 1.00186.32 ATOM 220 N MET D1170 221.199 300.673 307.949 1.00197.18 ATOM 221 CA MET D1170 220.804 301.467 309.106 1.00192.97 ATOM 222 C MET D1170 219.626 302.394 308.812 1.00189.75 ATOM 223 O MET D1170 218.976 302.903 309.736 1.00186.32 ATOM 224 CB MET D1170 221.996 302.291 309.582 1.00197.92 ATOM 225 N GLY D1171 219.342 302.576 307.524 1.00195.97 ATOM 226 CA GLY D1171 218.426 303.601 307.048 1.00193.90 ATOM 227 C GLY D1171 217.091 303.711 307.761 1.00190.21 ATOM 228 O GLY D1171 216.608 304.817 308.008 1.00187.79 ATOM 229 N LYS D1172 216.493 302.573 308.092 1.00174.68 ATOM 230 CA LYS D1172 215.221 302.566 308.803 1.00171.90 ATOM 231 C LYS D1172 215.396 303.054 310.239 1.00169.16 ATOM 232 O LYS D1172 214.716 303.992 310.674 1.00166.70 ATOM 233 CB LYS D1172 214.615 301.163 308.801 1.00174.92 ATOM 234 N THR D1173 216.330 302.430 310.961 1.00174.63 ATOM 235 CA THR D1173 216.502 302.681 312.392 1.00172.47 ATOM 236 C THR D1173 216.824 304.140 312.692 1.00170.67 ATOM 237 O THR D1173 216.198 304.751 313.569 1.00168.04 ATOM 238 CB THR D1173 217.585 301.777 313.012 1.00168.30 ATOM 239 N ILE D1174 217.784 304.691 311.949 1.00157.71 ATOM 240 CA ILE D1174 218.112 306.110 312.047 1.00156.41 ATOM 241 C ILE D1174 216.835 306.923 311.970 1.00153.94 ATOM 242 O ILE D1174 216.564 307.754 312.844 1.00151.54 ATOM 243 CB ILE D1174 219.035 306.579 310.907 1.00152.16 ATOM 244 N HIS D1175 216.033 306.636 310.947 1.00154.02 ATOM 245 CA HIS D1175 214.813 307.383 310.708 1.00152.30 ATOM 246 C HIS D1175 213.953 307.417 311.958 1.00149.86 ATOM 247 O HIS D1175 213.467 308.486 312.340 1.00148.04 ATOM 248 CB HIS D1175 214.037 306.794 309.536 1.00157.61 ATOM 249 N LYS D1176 213.817 306.268 312.620 1.00162.01 ATOM 250 CA LYS D1176 213.000 306.181 313.829 1.00160.20 ATOM 251 C LYS D1176 213.442 307.263 314.798 1.00158.15 ATOM 252 O LYS D1176 212.643 308.120 315.200 1.00156.65 ATOM 253 CB LYS D1176 213.141 304.810 314.489 1.00174.32 ATOM 254 N TYR D1177 214.737 307.263 315.112 1.00165.81 ATOM 255 CA TYR D1177 215.284 308.238 316.049 1.00164.18 ATOM 256 C TYR D1177 215.067 309.672 315.603 1.00163.17 ATOM 257 O TYR D1177 214.764 310.530 316.432 1.00161.39 ATOM 258 CB TYR D1177 216.773 308.013 316.281 1.00165.76 ATOM 259 N VAL D1178 215.209 309.935 314.305 1.00127.70 ATOM 260 CA VAL D1178 215.114 311.307 313.848 1.00126.88 ATOM 261 C VAL D1178 213.710 311.807 314.130 1.00126.87 ATOM 262 O VAL D1178 213.511 312.984 314.442 1.00126.30 ATOM 263 CB VAL D1178 215.487 311.467 312.366 1.00127.49 ATOM 264 N HIS D1179 212.737 310.902 314.076 1.00135.81 ATOM 265 CA HIS D1179 211.362 311.309 314.335 1.00135.28 ATOM 266 C HIS D1179 210.967 311.127 315.796 1.00134.44 ATOM 267 O HIS D1179 209.887 311.540 316.215 1.00134.48 ATOM 268 CB HIS D1179 210.393 310.615 313.381 1.00137.21 ATOM 269 N LEU D1180 211.852 310.502 316.566 1.00135.66 ATOM 270 CA LEU D1180 211.675 310.404 318.009 1.00134.48 ATOM 271 C LEU D1180 212.146 311.672 318.704 1.00133.25 ATOM 272 O LEU D1180 211.706 311.994 319.809 1.00132.45 ATOM 273 CB LEU D1180 212.438 309.207 318.564 1.00138.48 TER