HEADER SPLICING 31-DEC-69 5Z57 TITLE Cryo-EM structure of the human activated spliceosome (late Bact) at TITLE 2 6.5 angstrom COMPND MOL_ID: 4; COMPND 2 MOLECULE: U5 small nuclear ribonucleoprotein 200 kDa helicase; COMPND 3 CHAIN: D; COMPND 4 EC: 3.6.4.13; EXPDTA ELECTRON MICROSCOPY DBREF 5Z57 D 1 2136 UNP O75643 U520_HUMAN 1 2136 SEQRES 1 D 55 MET CYS PRO LEU ARG GLN PHE ARG LYS LEU PRO GLU GLU SEQRES 2 D 55 VAL VAL LYS LYS ILE GLU LYS LYS ASN PHE PRO PHE GLU SEQRES 3 D 55 ARG LEU TYR ASP LEU ASN HIS ASN GLU ILE GLY GLU LEU SEQRES 4 D 55 ILE ARG MET PRO LYS MET GLY LYS THR ILE HIS LYS TYR SEQRES 5 D 55 VAL HIS LEU ATOM 1 N MET D1126 228.195 322.544 316.072 1.00146.09 ATOM 2 CA MET D1126 228.039 321.163 315.667 1.00145.54 ATOM 3 C MET D1126 226.588 320.799 315.337 1.00141.71 ATOM 4 O MET D1126 225.640 321.308 315.941 1.00138.71 ATOM 5 CB MET D1126 228.640 320.243 316.719 1.00160.55 ATOM 6 N CYS D1127 226.451 319.911 314.356 1.00150.64 ATOM 7 CA CYS D1127 225.168 319.513 313.787 1.00147.73 ATOM 8 C CYS D1127 224.165 319.040 314.824 1.00143.74 ATOM 9 O CYS D1127 224.433 318.103 315.568 1.00143.68 ATOM 10 CB CYS D1127 225.372 318.403 312.751 1.00155.30 ATOM 11 N PRO D1128 222.982 319.672 314.833 1.00145.01 ATOM 12 CA PRO D1128 221.883 319.410 315.766 1.00141.75 ATOM 13 C PRO D1128 221.486 317.941 315.792 1.00140.90 ATOM 14 O PRO D1128 220.954 317.466 316.799 1.00139.47 ATOM 15 CB PRO D1128 220.728 320.221 315.174 1.00144.35 ATOM 16 N LEU D1129 221.747 317.242 314.691 1.00127.91 ATOM 17 CA LEU D1129 221.448 315.822 314.573 1.00128.59 ATOM 18 C LEU D1129 222.157 315.024 315.668 1.00130.36 ATOM 19 O LEU D1129 221.752 313.912 315.998 1.00131.30 ATOM 20 CB LEU D1129 221.868 315.305 313.197 1.00129.09 ATOM 21 N ARG D1130 223.209 315.602 316.238 1.00149.00 ATOM 22 CA ARG D1130 223.924 314.958 317.329 1.00150.34 ATOM 23 C ARG D1130 223.104 314.800 318.605 1.00148.10 ATOM 24 O ARG D1130 223.380 313.918 319.405 1.00149.12 ATOM 25 CB ARG D1130 225.220 315.704 317.645 1.00166.31 ATOM 26 N GLN D1131 222.100 315.643 318.814 1.00131.97 ATOM 27 CA GLN D1131 221.309 315.525 320.038 1.00132.53 ATOM 28 C GLN D1131 220.428 314.284 319.998 1.00133.04 ATOM 29 O GLN D1131 219.863 313.877 321.019 1.00134.28 ATOM 30 CB GLN D1131 220.453 316.767 320.257 1.00130.91 ATOM 31 N PHE D1132 220.310 313.697 318.807 1.00144.48 ATOM 32 CA PHE D1132 219.719 312.379 318.657 1.00145.06 ATOM 33 C PHE D1132 220.894 311.432 318.740 1.00147.54 ATOM 34 O PHE D1132 221.641 311.287 317.774 1.00149.20 ATOM 35 CB PHE D1132 219.162 312.192 317.245 1.00146.74 ATOM 36 N ARG D1133 221.031 310.718 319.847 1.00166.94 ATOM 37 CA ARG D1133 222.219 309.904 320.023 1.00169.69 ATOM 38 C ARG D1133 222.106 308.656 319.159 1.00171.21 ATOM 39 O ARG D1133 223.058 307.890 319.010 1.00173.96 ATOM 40 CB ARG D1133 222.419 309.556 321.496 1.00171.93 ATOM 41 N LYS D1134 220.929 308.480 318.566 1.00169.70 ATOM 42 CA LYS D1134 220.615 307.295 317.783 1.00171.21 ATOM 43 C LYS D1134 221.482 307.242 316.517 1.00173.34 ATOM 44 O LYS D1134 221.612 306.195 315.876 1.00175.58 ATOM 45 CB LYS D1134 219.114 307.304 317.443 1.00181.88 ATOM 46 N LEU D1135 222.099 308.373 316.188 1.00160.34 ATOM 47 CA LEU D1135 222.823 308.533 314.929 1.00162.79 ATOM 48 C LEU D1135 224.287 308.090 314.999 1.00166.50 ATOM 49 O LEU D1135 224.953 308.276 316.023 1.00166.76 ATOM 50 CB LEU D1135 222.735 309.988 314.456 1.00163.43 ATOM 51 N PRO D1136 224.777 307.468 313.913 1.00160.13 ATOM 52 CA PRO D1136 226.189 307.130 313.683 1.00164.76 ATOM 53 C PRO D1136 227.092 308.353 313.676 1.00165.99 ATOM 54 O PRO D1136 226.717 309.376 313.108 1.00164.50 ATOM 55 CB PRO D1136 226.166 306.522 312.283 1.00166.57 ATOM 56 N GLU D1137 228.273 308.242 314.275 1.00207.54 ATOM 57 CA GLU D1137 229.199 309.370 314.371 1.00209.23 ATOM 58 C GLU D1137 229.812 309.776 313.032 1.00213.36 ATOM 59 O GLU D1137 229.978 310.969 312.754 1.00213.06 ATOM 60 CB GLU D1137 230.333 309.058 315.356 1.00217.31 ATOM 61 N GLU D1138 230.165 308.789 312.217 1.00203.52 ATOM 62 CA GLU D1138 230.846 309.074 310.961 1.00208.61 ATOM 63 C GLU D1138 229.918 309.803 309.998 1.00206.40 ATOM 64 O GLU D1138 230.361 310.643 309.216 1.00208.53 ATOM 65 CB GLU D1138 231.424 307.803 310.321 1.00224.84 ATOM 66 N VAL D1139 228.624 309.490 310.075 1.00175.88 ATOM 67 CA VAL D1139 227.637 310.134 309.217 1.00173.68 ATOM 68 C VAL D1139 227.497 311.599 309.598 1.00169.84 ATOM 69 O VAL D1139 227.523 312.480 308.737 1.00170.09 ATOM 70 CB VAL D1139 226.268 309.435 309.302 1.00180.69 ATOM 71 N VAL D1140 227.359 311.851 310.895 1.00157.94 ATOM 72 CA VAL D1140 227.303 313.211 311.413 1.00154.96 ATOM 73 C VAL D1140 228.531 314.019 310.982 1.00158.77 ATOM 74 O VAL D1140 228.401 315.098 310.388 1.00158.25 ATOM 75 CB VAL D1140 227.190 313.211 312.950 1.00149.93 ATOM 76 N LYS D1141 229.718 313.482 311.259 1.00189.24 ATOM 77 CA LYS D1141 230.961 314.142 310.864 1.00193.74 ATOM 78 C LYS D1141 230.993 314.402 309.355 1.00196.53 ATOM 79 O LYS D1141 231.527 315.418 308.898 1.00198.61 ATOM 80 CB LYS D1141 232.176 313.311 311.293 1.00206.45 ATOM 81 N LYS D1142 230.398 313.483 308.594 1.00195.99 ATOM 82 CA LYS D1142 230.342 313.585 307.135 1.00198.69 ATOM 83 C LYS D1142 229.461 314.747 306.681 1.00195.32 ATOM 84 O LYS D1142 229.823 315.477 305.756 1.00198.39 ATOM 85 CB LYS D1142 229.828 312.277 306.524 1.00217.90 ATOM 86 N ILE D1143 228.305 314.914 307.315 1.00169.99 ATOM 87 CA ILE D1143 227.440 316.039 306.969 1.00167.32 ATOM 88 C ILE D1143 228.039 317.357 307.464 1.00167.85 ATOM 89 O ILE D1143 227.716 318.423 306.942 1.00168.12 ATOM 90 CB ILE D1143 225.961 315.868 307.455 1.00152.94 ATOM 91 N GLU D1144 228.904 317.287 308.474 1.00169.21 ATOM 92 CA GLU D1144 229.595 318.483 308.952 1.00170.43 ATOM 93 C GLU D1144 230.723 318.875 308.000 1.00176.75 ATOM 94 O GLU D1144 231.071 320.052 307.884 1.00178.62 ATOM 95 CB GLU D1144 230.149 318.262 310.360 1.00177.96 ATOM 96 N LYS D1145 231.282 317.874 307.321 1.00209.51 ATOM 97 CA LYS D1145 232.362 318.067 306.351 1.00216.30 ATOM 98 C LYS D1145 231.974 319.071 305.262 1.00217.93 ATOM 99 O LYS D1145 232.623 320.107 305.100 1.00221.54 ATOM 100 CB LYS D1145 232.749 316.711 305.736 1.00217.53 ATOM 101 N LYS D1146 230.905 318.764 304.533 1.00203.52 ATOM 102 CA LYS D1146 230.326 319.703 303.582 1.00204.83 ATOM 103 C LYS D1146 229.466 320.666 304.377 1.00200.10 ATOM 104 O LYS D1146 228.705 320.242 305.239 1.00194.56 ATOM 105 CB LYS D1146 229.450 318.969 302.565 1.00205.80 ATOM 106 N ASN D1147 229.563 321.960 304.096 1.00207.90 ATOM 107 CA ASN D1147 228.723 322.900 304.823 1.00204.06 ATOM 108 C ASN D1147 227.417 323.136 304.073 1.00202.81 ATOM 109 O ASN D1147 227.379 323.801 303.038 1.00207.34 ATOM 110 CB ASN D1147 229.471 324.212 305.074 1.00201.92 ATOM 111 N PHE D1148 226.346 322.575 304.624 1.00207.52 ATOM 112 CA PHE D1148 225.011 322.638 304.039 1.00205.57 ATOM 113 C PHE D1148 223.995 322.956 305.128 1.00199.80 ATOM 114 O PHE D1148 223.524 322.042 305.807 1.00195.40 ATOM 115 CB PHE D1148 224.641 321.329 303.341 1.00216.44 ATOM 116 N PRO D1149 223.662 324.246 305.301 1.00165.12 ATOM 117 CA PRO D1149 222.919 324.745 306.463 1.00159.88 ATOM 118 C PRO D1149 221.694 323.890 306.794 1.00154.30 ATOM 119 O PRO D1149 220.927 323.511 305.908 1.00154.11 ATOM 120 CB PRO D1149 222.505 326.161 306.038 1.00157.72 ATOM 121 N PHE D1150 221.545 323.592 308.082 1.00178.90 ATOM 122 CA PHE D1150 220.644 322.549 308.573 1.00174.66 ATOM 123 C PHE D1150 219.183 322.719 308.163 1.00172.29 ATOM 124 O PHE D1150 218.526 321.751 307.771 1.00171.28 ATOM 125 CB PHE D1150 220.772 322.425 310.099 1.00171.46 ATOM 126 N GLU D1151 218.679 323.945 308.242 1.00179.93 ATOM 127 CA GLU D1151 217.291 324.216 307.895 1.00178.21 ATOM 128 C GLU D1151 217.027 323.984 306.407 1.00180.76 ATOM 129 O GLU D1151 215.888 324.079 305.949 1.00180.00 ATOM 130 CB GLU D1151 216.874 325.630 308.317 1.00192.87 ATOM 131 N ARG D1152 218.085 323.702 305.651 1.00173.28 ATOM 132 CA ARG D1152 217.942 323.392 304.234 1.00176.39 ATOM 133 C ARG D1152 217.760 321.889 303.999 1.00175.84 ATOM 134 O ARG D1152 217.719 321.431 302.858 1.00178.66 ATOM 135 CB ARG D1152 219.129 323.941 303.430 1.00194.71 ATOM 136 N LEU D1153 217.656 321.119 305.077 1.00147.78 ATOM 137 CA LEU D1153 217.395 319.687 304.956 1.00147.35 ATOM 138 C LEU D1153 215.904 319.371 304.765 1.00145.41 ATOM 139 O LEU D1153 215.553 318.288 304.303 1.00145.97 ATOM 140 CB LEU D1153 217.973 318.913 306.156 1.00138.81 ATOM 141 N TYR D1154 215.024 320.309 305.109 1.00166.14 ATOM 142 CA TYR D1154 213.589 320.051 305.004 1.00164.98 ATOM 143 C TYR D1154 213.112 320.038 303.554 1.00167.58 ATOM 144 O TYR D1154 212.127 319.375 303.218 1.00167.63 ATOM 145 CB TYR D1154 212.781 321.064 305.813 1.00164.51 ATOM 146 N ASP D1155 213.818 320.760 302.692 1.00199.48 ATOM 147 CA ASP D1155 213.426 320.859 301.292 1.00202.54 ATOM 148 C ASP D1155 213.657 319.535 300.559 1.00204.50 ATOM 149 O ASP D1155 212.984 319.223 299.569 1.00206.43 ATOM 150 CB ASP D1155 214.210 321.988 300.614 1.00195.21 ATOM 151 N LEU D1156 214.604 318.755 301.078 1.00183.40 ATOM 152 CA LEU D1156 215.077 317.545 300.414 1.00185.80 ATOM 153 C LEU D1156 214.303 316.293 300.828 1.00183.92 ATOM 154 O LEU D1156 213.959 316.123 301.999 1.00180.81 ATOM 155 CB LEU D1156 216.569 317.353 300.704 1.00183.77 ATOM 156 N ASN D1157 214.029 315.426 299.855 1.00206.90 ATOM 157 CA ASN D1157 213.400 314.137 300.136 1.00206.01 ATOM 158 C ASN D1157 214.432 313.110 300.577 1.00206.52 ATOM 159 O ASN D1157 215.606 313.443 300.749 1.00207.44 ATOM 160 CB ASN D1157 212.599 313.626 298.931 1.00206.13 ATOM 161 N HIS D1158 213.999 311.863 300.744 1.00197.36 ATOM 162 CA HIS D1158 214.864 310.834 301.317 1.00197.73 ATOM 163 C HIS D1158 216.102 310.575 300.456 1.00201.42 ATOM 164 O HIS D1158 217.175 310.244 300.967 1.00202.05 ATOM 165 CB HIS D1158 214.080 309.535 301.551 1.00202.66 ATOM 166 N ASN D1159 215.943 310.735 299.146 1.00188.39 ATOM 167 CA ASN D1159 217.032 310.497 298.205 1.00192.68 ATOM 168 C ASN D1159 217.995 311.680 298.121 1.00193.93 ATOM 169 O ASN D1159 219.220 311.504 298.126 1.00196.43 ATOM 170 CB ASN D1159 216.454 310.173 296.821 1.00212.90 ATOM 171 N GLU D1160 217.429 312.882 298.062 1.00194.06 ATOM 172 CA GLU D1160 218.205 314.109 297.914 1.00195.67 ATOM 173 C GLU D1160 219.134 314.332 299.099 1.00194.02 ATOM 174 O GLU D1160 220.173 314.980 298.973 1.00196.62 ATOM 175 CB GLU D1160 217.278 315.317 297.726 1.00190.74 ATOM 176 N ILE D1161 218.749 313.793 300.249 1.00180.66 ATOM 177 CA ILE D1161 219.566 313.888 301.447 1.00179.07 ATOM 178 C ILE D1161 220.856 313.093 301.304 1.00182.49 ATOM 179 O ILE D1161 221.953 313.617 301.525 1.00184.30 ATOM 180 CB ILE D1161 218.816 313.348 302.664 1.00162.37 ATOM 181 N GLY D1162 220.716 311.823 300.937 1.00215.31 ATOM 182 CA GLY D1162 221.851 310.926 300.838 1.00218.79 ATOM 183 C GLY D1162 222.832 311.340 299.759 1.00223.93 ATOM 184 O GLY D1162 224.007 310.958 299.795 1.00227.27 ATOM 185 N GLU D1163 222.350 312.130 298.803 1.00187.09 ATOM 186 CA GLU D1163 223.166 312.569 297.676 1.00192.63 ATOM 187 C GLU D1163 224.211 313.617 298.051 1.00194.39 ATOM 188 O GLU D1163 225.184 313.813 297.323 1.00199.78 ATOM 189 CB GLU D1163 222.275 313.082 296.546 1.00201.70 ATOM 190 N LEU D1164 224.012 314.284 299.182 1.00187.60 ATOM 191 CA LEU D1164 224.950 315.303 299.632 1.00189.10 ATOM 192 C LEU D1164 226.247 314.686 300.127 1.00191.55 ATOM 193 O LEU D1164 227.337 315.085 299.718 1.00196.53 ATOM 194 CB LEU D1164 224.336 316.130 300.755 1.00189.40 ATOM 195 N ILE D1165 226.115 313.712 301.018 1.00220.68 ATOM 196 CA ILE D1165 227.264 313.064 301.642 1.00222.93 ATOM 197 C ILE D1165 227.699 311.798 300.895 1.00227.13 ATOM 198 O ILE D1165 228.569 311.060 301.364 1.00229.50 ATOM 199 CB ILE D1165 226.996 312.742 303.134 1.00194.72 ATOM 200 N ARG D1166 227.063 311.554 299.746 1.00233.92 ATOM 201 CA ARG D1166 227.267 310.362 298.912 1.00237.79 ATOM 202 C ARG D1166 227.149 309.041 299.682 1.00236.15 ATOM 203 O ARG D1166 227.756 308.029 299.321 1.00240.24 ATOM 204 CB ARG D1166 228.550 310.442 298.054 1.00246.55 ATOM 205 N MET D1167 226.326 309.058 300.728 1.00197.64 ATOM 206 CA MET D1167 226.015 307.862 301.498 1.00195.88 ATOM 207 C MET D1167 224.510 307.624 301.435 1.00191.62 ATOM 208 O MET D1167 223.796 307.882 302.404 1.00187.07 ATOM 209 CB MET D1167 226.469 308.026 302.950 1.00221.94 ATOM 210 N PRO D1168 224.023 307.126 300.284 1.00184.63 ATOM 211 CA PRO D1168 222.586 307.015 300.006 1.00181.51 ATOM 212 C PRO D1168 221.884 305.967 300.867 1.00178.82 ATOM 213 O PRO D1168 220.678 306.071 301.088 1.00175.39 ATOM 214 CB PRO D1168 222.548 306.609 298.531 1.00192.12 ATOM 215 N LYS D1169 222.627 304.976 301.346 1.00186.92 ATOM 216 CA LYS D1169 222.050 303.931 302.188 1.00185.00 ATOM 217 C LYS D1169 221.483 304.540 303.475 1.00180.16 ATOM 218 O LYS D1169 220.557 304.002 304.081 1.00177.68 ATOM 219 CB LYS D1169 223.100 302.853 302.503 1.00186.32 ATOM 220 N MET D1170 222.039 305.677 303.872 1.00197.18 ATOM 221 CA MET D1170 221.599 306.379 305.072 1.00192.97 ATOM 222 C MET D1170 220.390 307.278 304.819 1.00189.75 ATOM 223 O MET D1170 219.709 307.702 305.764 1.00186.32 ATOM 224 CB MET D1170 222.752 307.215 305.618 1.00197.92 ATOM 225 N GLY D1171 220.116 307.532 303.541 1.00195.97 ATOM 226 CA GLY D1171 219.168 308.551 303.118 1.00193.90 ATOM 227 C GLY D1171 217.820 308.564 303.816 1.00190.21 ATOM 228 O GLY D1171 217.292 309.633 304.125 1.00187.79 ATOM 229 N LYS D1172 217.262 307.386 304.064 1.00174.68 ATOM 230 CA LYS D1172 215.982 307.286 304.754 1.00171.90 ATOM 231 C LYS D1172 216.120 307.686 306.220 1.00169.16 ATOM 232 O LYS D1172 215.399 308.568 306.704 1.00166.70 ATOM 233 CB LYS D1172 215.431 305.864 304.653 1.00174.92 ATOM 234 N THR D1173 217.068 307.052 306.915 1.00174.63 ATOM 235 CA THR D1173 217.211 307.217 308.362 1.00172.47 ATOM 236 C THR D1173 217.473 308.665 308.759 1.00170.67 ATOM 237 O THR D1173 216.813 309.194 309.664 1.00168.04 ATOM 238 CB THR D1173 218.320 306.316 308.939 1.00168.30 ATOM 239 N ILE D1174 218.421 309.298 308.068 1.00157.71 ATOM 240 CA ILE D1174 218.693 310.719 308.262 1.00156.41 ATOM 241 C ILE D1174 217.387 311.487 308.217 1.00153.94 ATOM 242 O ILE D1174 217.073 312.249 309.138 1.00151.54 ATOM 243 CB ILE D1174 219.612 311.295 307.168 1.00152.16 ATOM 244 N HIS D1175 216.610 311.236 307.166 1.00154.02 ATOM 245 CA HIS D1175 215.365 311.951 306.956 1.00152.30 ATOM 246 C HIS D1175 214.488 311.872 308.192 1.00149.86 ATOM 247 O HIS D1175 213.957 312.895 308.634 1.00148.04 ATOM 248 CB HIS D1175 214.628 311.410 305.737 1.00157.61 ATOM 249 N LYS D1176 214.388 310.679 308.777 1.00162.01 ATOM 250 CA LYS D1176 213.559 310.483 309.966 1.00160.20 ATOM 251 C LYS D1176 213.947 311.517 311.008 1.00158.15 ATOM 252 O LYS D1176 213.111 312.315 311.452 1.00156.65 ATOM 253 CB LYS D1176 213.744 309.079 310.539 1.00174.32 ATOM 254 N TYR D1177 215.237 311.545 311.342 1.00165.81 ATOM 255 CA TYR D1177 215.734 312.477 312.347 1.00164.18 ATOM 256 C TYR D1177 215.468 313.928 311.991 1.00163.17 ATOM 257 O TYR D1177 215.121 314.719 312.868 1.00161.39 ATOM 258 CB TYR D1177 217.227 312.294 312.587 1.00165.76 ATOM 259 N VAL D1178 215.616 314.279 310.714 1.00127.70 ATOM 260 CA VAL D1178 215.475 315.673 310.345 1.00126.88 ATOM 261 C VAL D1178 214.049 316.101 310.636 1.00126.87 ATOM 262 O VAL D1178 213.801 317.247 311.020 1.00126.30 ATOM 263 CB VAL D1178 215.861 315.942 308.882 1.00127.49 ATOM 264 N HIS D1179 213.112 315.166 310.510 1.00135.81 ATOM 265 CA HIS D1179 211.719 315.503 310.773 1.00135.28 ATOM 266 C HIS D1179 211.313 315.213 312.213 1.00134.44 ATOM 267 O HIS D1179 210.212 315.557 312.641 1.00134.48 ATOM 268 CB HIS D1179 210.790 314.836 309.762 1.00137.21 ATOM 269 N LEU D1180 212.211 314.573 312.955 1.00135.66 ATOM 270 CA LEU D1180 212.019 314.376 314.386 1.00134.48 ATOM 271 C LEU D1180 212.432 315.613 315.168 1.00133.25 ATOM 272 O LEU D1180 211.966 315.846 316.284 1.00132.45 ATOM 273 CB LEU D1180 212.820 313.175 314.875 1.00138.48 TER