HEADER SPLICING 31-DEC-69 6AH0 TITLE The Cryo-EM Structure of the Precusor of Human Pre-catalytic TITLE 2 Spliceosome (pre-B complex) COMPND MOL_ID: 2; COMPND 2 MOLECULE: U5 small nuclear ribonucleoprotein 200 kDa helicase; COMPND 3 CHAIN: D; COMPND 4 EC: 3.6.4.13; EXPDTA ELECTRON MICROSCOPY DBREF 6AH0 D 1 2136 UNP O75643 U520_HUMAN 1 2136 SEQRES 1 D 59 LYS ASP SER TYR LEU LYS GLN LEU PRO HIS PHE THR SER SEQRES 2 D 59 GLU HIS ILE LYS ARG CYS THR ASP LYS GLY VAL GLU SER SEQRES 3 D 59 VAL PHE ASP ILE MET GLU MET GLU ASP GLU GLU ARG ASN SEQRES 4 D 59 ALA LEU LEU GLN LEU THR ASP SER GLN ILE ALA ASP VAL SEQRES 5 D 59 ALA ARG PHE CYS ASN ARG TYR ATOM 1 N LYS D1956 155.650 255.305 332.860 1.00199.62 ATOM 2 CA LYS D1956 154.776 255.530 334.003 1.00203.19 ATOM 3 C LYS D1956 155.220 256.822 334.674 1.00204.30 ATOM 4 O LYS D1956 156.245 256.870 335.358 1.00205.27 ATOM 5 N ASP D1957 154.425 257.865 334.469 1.00178.91 ATOM 6 CA ASP D1957 154.757 259.203 334.936 1.00179.79 ATOM 7 C ASP D1957 153.526 260.093 334.942 1.00180.95 ATOM 8 O ASP D1957 152.509 259.763 334.333 1.00180.32 ATOM 9 N SER D1958 153.619 261.221 335.630 1.00154.88 ATOM 10 CA SER D1958 152.539 262.198 335.612 1.00155.43 ATOM 11 C SER D1958 152.387 262.806 334.225 1.00153.08 ATOM 12 O SER D1958 153.365 263.215 333.606 1.00152.47 ATOM 13 N TYR D1959 151.150 262.869 333.749 1.00172.21 ATOM 14 CA TYR D1959 150.860 263.453 332.445 1.00172.24 ATOM 15 C TYR D1959 150.878 264.979 332.504 1.00175.31 ATOM 16 O TYR D1959 150.838 265.642 331.472 1.00175.86 ATOM 17 N LEU D1960 150.916 265.536 333.712 1.00159.69 ATOM 18 CA LEU D1960 150.895 266.989 333.871 1.00162.73 ATOM 19 C LEU D1960 152.261 267.630 333.657 1.00163.37 ATOM 20 O LEU D1960 152.354 268.795 333.267 1.00165.34 ATOM 21 N LYS D1961 153.319 266.861 333.890 1.00184.97 ATOM 22 CA LYS D1961 154.673 267.408 333.862 1.00186.46 ATOM 23 C LYS D1961 155.068 267.923 332.480 1.00186.08 ATOM 24 O LYS D1961 156.113 268.559 332.322 1.00187.92 ATOM 25 N GLN D1962 154.230 267.647 331.485 1.00201.65 ATOM 26 CA GLN D1962 154.405 268.208 330.151 1.00201.73 ATOM 27 C GLN D1962 154.299 269.733 330.178 1.00205.12 ATOM 28 O GLN D1962 154.941 270.420 329.379 1.00206.23 ATOM 29 N LEU D1963 153.493 270.252 331.104 1.00197.27 ATOM 30 CA LEU D1963 153.306 271.696 331.243 1.00200.48 ATOM 31 C LEU D1963 154.576 272.406 331.716 1.00202.69 ATOM 32 O LEU D1963 155.317 271.876 332.545 1.00202.70 ATOM 33 N PRO D1964 154.832 273.612 331.176 1.00210.59 ATOM 34 CA PRO D1964 156.000 274.411 331.565 1.00213.40 ATOM 35 C PRO D1964 155.866 274.991 332.973 1.00215.82 ATOM 36 O PRO D1964 154.751 275.172 333.463 1.00215.83 ATOM 37 N HIS D1965 157.010 275.268 333.602 1.00237.68 ATOM 38 CA HIS D1965 157.084 275.798 334.966 1.00240.44 ATOM 39 C HIS D1965 156.419 274.871 335.981 1.00239.05 ATOM 40 O HIS D1965 155.985 275.314 337.047 1.00240.94 ATOM 41 N PHE D1966 156.353 273.587 335.653 1.00204.98 ATOM 42 CA PHE D1966 155.682 272.621 336.513 1.00203.47 ATOM 43 C PHE D1966 156.709 271.770 337.242 1.00203.97 ATOM 44 O PHE D1966 157.387 270.940 336.632 1.00202.15 ATOM 45 N THR D1967 156.818 271.973 338.550 1.00210.91 ATOM 46 CA THR D1967 157.806 271.255 339.347 1.00212.40 ATOM 47 C THR D1967 157.303 269.873 339.751 1.00209.68 ATOM 48 O THR D1967 156.159 269.511 339.470 1.00206.87 ATOM 49 N SER D1968 158.162 269.110 340.421 1.00233.90 ATOM 50 CA SER D1968 157.800 267.778 340.889 1.00231.71 ATOM 51 C SER D1968 156.925 267.919 342.126 1.00233.32 ATOM 52 O SER D1968 155.994 267.140 342.342 1.00231.00 ATOM 53 N GLU D1969 157.235 268.928 342.933 1.00268.08 ATOM 54 CA GLU D1969 156.484 269.197 344.149 1.00270.25 ATOM 55 C GLU D1969 155.106 269.785 343.851 1.00268.74 ATOM 56 O GLU D1969 154.256 269.873 344.740 1.00270.08 ATOM 57 N HIS D1970 154.897 270.192 342.602 1.00189.68 ATOM 58 CA HIS D1970 153.578 270.609 342.143 1.00188.25 ATOM 59 C HIS D1970 152.683 269.380 342.065 1.00185.24 ATOM 60 O HIS D1970 151.510 269.413 342.447 1.00185.55 ATOM 61 N ILE D1971 153.264 268.289 341.576 1.00218.25 ATOM 62 CA ILE D1971 152.535 267.049 341.331 1.00215.04 ATOM 63 C ILE D1971 151.953 266.442 342.613 1.00216.32 ATOM 64 O ILE D1971 150.909 265.785 342.578 1.00214.75 ATOM 65 N LYS D1972 152.621 266.679 343.741 1.00229.89 ATOM 66 CA LYS D1972 152.115 266.231 345.033 1.00231.81 ATOM 67 C LYS D1972 150.711 266.784 345.258 1.00232.62 ATOM 68 O LYS D1972 149.754 266.025 345.436 1.00231.45 ATOM 69 N ARG D1973 150.594 268.107 345.212 1.00224.86 ATOM 70 CA ARG D1973 149.330 268.780 345.499 1.00226.45 ATOM 71 C ARG D1973 148.323 268.652 344.362 1.00223.89 ATOM 72 O ARG D1973 147.111 268.719 344.586 1.00224.96 ATOM 73 N CYS D1974 148.826 268.455 343.150 1.00179.18 ATOM 74 CA CYS D1974 147.952 268.247 342.002 1.00177.01 ATOM 75 C CYS D1974 147.254 266.890 342.076 1.00175.13 ATOM 76 O CYS D1974 146.057 266.781 341.799 1.00175.44 ATOM 77 N THR D1975 148.008 265.861 342.458 1.00217.14 ATOM 78 CA THR D1975 147.465 264.509 342.578 1.00215.33 ATOM 79 C THR D1975 146.673 264.298 343.871 1.00217.94 ATOM 80 O THR D1975 145.745 263.486 343.911 1.00217.34 ATOM 81 N ASP D1976 147.047 265.023 344.924 1.00224.24 ATOM 82 CA ASP D1976 146.280 265.006 346.170 1.00227.30 ATOM 83 C ASP D1976 144.945 265.732 345.994 1.00229.07 ATOM 84 O ASP D1976 143.934 265.339 346.580 1.00230.55 ATOM 85 N LYS D1977 144.955 266.791 345.186 1.00212.07 ATOM 86 CA LYS D1977 143.724 267.466 344.776 1.00213.71 ATOM 87 C LYS D1977 142.788 266.506 344.038 1.00212.03 ATOM 88 O LYS D1977 141.563 266.594 344.166 1.00214.17 ATOM 89 N GLY D1978 143.373 265.571 343.295 1.00207.31 ATOM 90 CA GLY D1978 142.602 264.642 342.486 1.00205.65 ATOM 91 C GLY D1978 142.695 264.903 340.994 1.00204.00 ATOM 92 O GLY D1978 142.037 264.230 340.198 1.00203.14 ATOM 93 N VAL D1979 143.516 265.874 340.607 1.00214.72 ATOM 94 CA VAL D1979 143.700 266.172 339.194 1.00213.36 ATOM 95 C VAL D1979 144.895 265.382 338.655 1.00209.58 ATOM 96 O VAL D1979 146.044 265.673 338.987 1.00209.02 ATOM 97 N GLU D1980 144.612 264.367 337.843 1.00201.76 ATOM 98 CA GLU D1980 145.664 263.517 337.279 1.00198.11 ATOM 99 C GLU D1980 146.086 263.768 335.822 1.00196.60 ATOM 100 O GLU D1980 147.008 263.109 335.329 1.00193.68 ATOM 101 N SER D1981 145.434 264.703 335.134 1.00182.92 ATOM 102 CA SER D1981 145.766 264.953 333.730 1.00181.97 ATOM 103 C SER D1981 145.390 266.351 333.229 1.00184.95 ATOM 104 O SER D1981 144.881 267.185 333.982 1.00187.73 ATOM 105 N VAL D1982 145.656 266.582 331.945 1.00173.50 ATOM 106 CA VAL D1982 145.430 267.875 331.310 1.00176.20 ATOM 107 C VAL D1982 143.957 268.071 330.968 1.00179.64 ATOM 108 O VAL D1982 143.464 269.193 330.944 1.00182.81 ATOM 109 N PHE D1983 143.260 266.971 330.713 1.00236.48 ATOM 110 CA PHE D1983 141.819 267.024 330.505 1.00240.49 ATOM 111 C PHE D1983 141.110 267.448 331.794 1.00242.95 ATOM 112 O PHE D1983 139.973 267.925 331.761 1.00247.15 ATOM 113 N ASP D1984 141.788 267.269 332.927 1.00207.11 ATOM 114 CA ASP D1984 141.223 267.638 334.223 1.00209.28 ATOM 115 C ASP D1984 141.316 269.143 334.501 1.00211.78 ATOM 116 O ASP D1984 140.417 269.724 335.107 1.00215.15 ATOM 117 N ILE D1985 142.398 269.774 334.051 1.00183.30 ATOM 118 CA ILE D1985 142.592 271.212 334.256 1.00185.57 ATOM 119 C ILE D1985 142.019 272.071 333.119 1.00188.32 ATOM 120 O ILE D1985 142.218 273.286 333.087 1.00190.10 ATOM 121 N MET D1986 141.331 271.429 332.177 1.00226.60 ATOM 122 CA MET D1986 140.645 272.140 331.101 1.00230.06 ATOM 123 C MET D1986 139.456 272.920 331.654 1.00234.80 ATOM 124 O MET D1986 139.222 274.071 331.281 1.00237.83 ATOM 125 N GLU D1987 138.711 272.276 332.546 1.00239.69 ATOM 126 CA GLU D1987 137.485 272.839 333.108 1.00244.35 ATOM 127 C GLU D1987 137.719 274.005 334.067 1.00245.32 ATOM 128 O GLU D1987 136.789 274.750 334.383 1.00249.45 ATOM 129 N MET D1988 138.954 274.151 334.538 1.00233.40 ATOM 130 CA MET D1988 139.274 275.163 335.540 1.00234.35 ATOM 131 C MET D1988 138.985 276.577 335.046 1.00237.72 ATOM 132 O MET D1988 139.453 276.986 333.981 1.00237.34 ATOM 133 N GLU D1989 138.202 277.319 335.825 1.00247.19 ATOM 134 CA GLU D1989 137.978 278.733 335.556 1.00250.46 ATOM 135 C GLU D1989 139.136 279.523 336.156 1.00248.94 ATOM 136 O GLU D1989 140.076 278.938 336.692 1.00245.70 ATOM 137 N ASP D1990 139.057 280.846 336.102 1.00223.29 ATOM 138 CA ASP D1990 140.172 281.690 336.524 1.00222.36 ATOM 139 C ASP D1990 140.191 281.899 338.037 1.00223.27 ATOM 140 O ASP D1990 141.014 282.653 338.559 1.00223.31 ATOM 141 N GLU D1991 139.275 281.229 338.731 1.00269.32 ATOM 142 CA GLU D1991 139.213 281.291 340.187 1.00270.37 ATOM 143 C GLU D1991 140.351 280.492 340.829 1.00267.10 ATOM 144 O GLU D1991 141.243 281.067 341.454 1.00267.14 ATOM 145 N GLU D1992 140.309 279.170 340.690 1.00247.84 ATOM 146 CA GLU D1992 141.307 278.300 341.314 1.00245.00 ATOM 147 C GLU D1992 142.437 277.821 340.391 1.00241.36 ATOM 148 O GLU D1992 143.346 277.124 340.844 1.00239.19 ATOM 149 N ARG D1993 142.389 278.185 339.112 1.00245.12 ATOM 150 CA ARG D1993 143.397 277.709 338.153 1.00241.84 ATOM 151 C ARG D1993 144.810 278.140 338.544 1.00241.01 ATOM 152 O ARG D1993 145.703 277.304 338.700 1.00238.51 ATOM 153 N ASN D1994 145.004 279.445 338.707 1.00240.08 ATOM 154 CA ASN D1994 146.281 279.975 339.160 1.00240.20 ATOM 155 C ASN D1994 146.363 279.979 340.684 1.00241.83 ATOM 156 O ASN D1994 147.434 280.183 341.254 1.00242.20 ATOM 157 N ALA D1995 145.225 279.737 341.331 1.00275.16 ATOM 158 CA ALA D1995 145.122 279.756 342.792 1.00277.23 ATOM 159 C ALA D1995 145.401 278.385 343.401 1.00275.34 ATOM 160 O ALA D1995 145.223 278.182 344.605 1.00277.03 ATOM 161 N LEU D1996 145.825 277.444 342.562 1.00253.66 ATOM 162 CA LEU D1996 146.123 276.092 343.015 1.00251.64 ATOM 163 C LEU D1996 147.415 276.090 343.830 1.00252.20 ATOM 164 O LEU D1996 147.394 275.874 345.043 1.00254.02 ATOM 165 N LEU D1997 148.534 276.342 343.159 1.00273.01 ATOM 166 CA LEU D1997 149.832 276.391 343.826 1.00274.12 ATOM 167 C LEU D1997 150.472 277.770 343.701 1.00276.43 ATOM 168 O LEU D1997 150.520 278.533 344.672 1.00279.63 ATOM 169 N GLN D1998 150.960 278.087 342.505 1.00249.13 ATOM 170 CA GLN D1998 151.616 279.369 342.271 1.00251.23 ATOM 171 C GLN D1998 150.925 280.203 341.190 1.00250.87 ATOM 172 O GLN D1998 150.531 279.689 340.135 1.00248.34 ATOM 173 N LEU D1999 150.784 281.498 341.466 1.00311.07 ATOM 174 CA LEU D1999 150.171 282.422 340.516 1.00311.41 ATOM 175 C LEU D1999 151.204 283.373 339.897 1.00312.37 ATOM 176 O LEU D1999 151.675 284.308 340.544 1.00315.08 ATOM 177 N THR D2000 151.552 283.125 338.636 1.00236.84 ATOM 178 CA THR D2000 152.432 284.020 337.886 1.00237.81 ATOM 179 C THR D2000 151.941 284.182 336.442 1.00236.55 ATOM 180 O THR D2000 151.938 283.220 335.676 1.00233.97 ATOM 181 N ASP D2001 151.570 285.408 336.069 1.00224.19 ATOM 182 CA ASP D2001 150.874 285.667 334.803 1.00223.77 ATOM 183 C ASP D2001 151.630 285.205 333.552 1.00221.91 ATOM 184 O ASP D2001 151.027 284.660 332.626 1.00220.40 ATOM 185 N SER D2002 152.945 285.420 333.532 1.00242.85 ATOM 186 CA SER D2002 153.775 285.005 332.403 1.00241.54 ATOM 187 C SER D2002 153.790 283.487 332.252 1.00238.37 ATOM 188 O SER D2002 153.549 282.951 331.165 1.00236.64 ATOM 189 N GLN D2003 154.066 282.796 333.355 1.00255.48 ATOM 190 CA GLN D2003 154.130 281.339 333.365 1.00252.56 ATOM 191 C GLN D2003 152.750 280.705 333.170 1.00250.69 ATOM 192 O GLN D2003 152.622 279.674 332.504 1.00248.12 ATOM 193 N ILE D2004 151.726 281.329 333.754 1.00237.62 ATOM 194 CA ILE D2004 150.347 280.859 333.604 1.00236.83 ATOM 195 C ILE D2004 149.871 281.013 332.152 1.00236.59 ATOM 196 O ILE D2004 149.127 280.174 331.642 1.00235.18 ATOM 197 N ALA D2005 150.316 282.078 331.486 1.00218.78 ATOM 198 CA ALA D2005 150.036 282.256 330.064 1.00218.86 ATOM 199 C ALA D2005 150.782 281.210 329.235 1.00216.06 ATOM 200 O ALA D2005 150.219 280.610 328.308 1.00214.97 ATOM 201 N ASP D2006 152.049 280.993 329.581 1.00246.93 ATOM 202 CA ASP D2006 152.871 279.983 328.919 1.00244.48 ATOM 203 C ASP D2006 152.272 278.583 329.051 1.00241.52 ATOM 204 O ASP D2006 152.450 277.737 328.174 1.00239.45 ATOM 205 N VAL D2007 151.574 278.341 330.154 1.00213.37 ATOM 206 CA VAL D2007 150.878 277.075 330.357 1.00211.00 ATOM 207 C VAL D2007 149.557 277.062 329.579 1.00211.58 ATOM 208 O VAL D2007 149.151 276.032 329.030 1.00209.68 ATOM 209 N ALA D2008 148.904 278.220 329.525 1.00219.07 ATOM 210 CA ALA D2008 147.635 278.372 328.818 1.00220.72 ATOM 211 C ALA D2008 147.770 278.072 327.325 1.00219.93 ATOM 212 O ALA D2008 146.887 277.447 326.723 1.00219.98 ATOM 213 N ARG D2009 148.873 278.517 326.728 1.00229.49 ATOM 214 CA ARG D2009 149.102 278.246 325.310 1.00228.83 ATOM 215 C ARG D2009 149.292 276.747 325.051 1.00225.43 ATOM 216 O ARG D2009 148.817 276.226 324.043 1.00225.14 ATOM 217 N PHE D2010 149.968 276.063 325.972 1.00173.13 ATOM 218 CA PHE D2010 150.143 274.617 325.887 1.00169.82 ATOM 219 C PHE D2010 148.782 273.941 325.955 1.00169.93 ATOM 220 O PHE D2010 148.487 273.026 325.181 1.00168.55 ATOM 221 N CYS D2011 147.965 274.387 326.906 1.00246.47 ATOM 222 CA CYS D2011 146.637 273.822 327.105 1.00247.47 ATOM 223 C CYS D2011 145.764 273.994 325.872 1.00249.80 ATOM 224 O CYS D2011 145.002 273.096 325.515 1.00249.92 ATOM 225 N ASN D2012 145.875 275.146 325.217 1.00198.67 ATOM 226 CA ASN D2012 145.161 275.337 323.965 1.00201.08 ATOM 227 C ASN D2012 145.697 274.401 322.883 1.00198.56 ATOM 228 O ASN D2012 144.922 273.776 322.153 1.00199.67 ATOM 229 N ARG D2013 147.024 274.294 322.803 1.00255.45 ATOM 230 CA ARG D2013 147.688 273.485 321.778 1.00253.01 ATOM 231 C ARG D2013 147.516 271.983 321.987 1.00250.22 ATOM 232 O ARG D2013 147.672 271.201 321.049 1.00248.90 ATOM 233 N TYR D2014 147.215 271.584 323.220 1.00184.31 ATOM 234 CA TYR D2014 147.013 270.174 323.529 1.00181.76 ATOM 235 C TYR D2014 145.771 269.663 322.792 1.00184.02 ATOM 236 O TYR D2014 144.743 270.342 322.759 1.00188.00 TER