HEADER TRANSCRIPTION 31-DEC-69 6ASG TITLE Crystal structure of Thermus thermophilus RNA polymerase core enzyme COMPND MOL_ID: 2; COMPND 2 MOLECULE: DNA-directed RNA polymerase subunit beta'; COMPND 3 CHAIN: D; COMPND 4 EC: 2.7.7.6; COMPND 5 ENGINEERED: YES; EXPDTA X-RAY DIFFRACTION REMARK 2 RESOLUTION. 3.80 ANGSTORMS REMARK 465 MISSING RESIDUES REMARK 465 THE FOLLOWING RESIDUES WERE NOT LOCATED IN THE REMARK 465 EXPERIMENT. (M=MODEL NUMBER; RES=RESIDUE NAME; C=CHAIN REMARK 465 IDENTIFIER; SSSEQ=SEQUENCE NUMBER; I=INSERTION CODE.) REMARK 465 REMARK 465 M RES C SSSEQI REMARK 465 THR D 1237 REMARK 465 MET D 1238 REMARK 465 ARG D 1239 REMARK 465 THR D 1240 REMARK 465 PHE D 1241 REMARK 465 HIS D 1242 REMARK 465 THR D 1243 REMARK 465 GLY D 1244 REMARK 465 GLY D 1245 REMARK 465 VAL D 1246 REMARK 465 ALA D 1247 REMARK 465 GLY D 1248 REMARK 465 ALA D 1249 REMARK 465 ALA D 1250 REMARK 465 ASP D 1251 REMARK 465 ILE D 1252 DBREF 6ASG D 1 1524 UNP Q8RQE8 RPOC_THET8 1 1524 SEQRES 1 D 69 CYS GLN LYS CYS TYR GLY TYR ASP LEU SER MET ALA ARG SEQRES 2 D 69 PRO VAL SER ILE GLY GLU ALA VAL GLY ILE VAL ALA ALA SEQRES 3 D 69 GLN SER ILE GLY GLU PRO GLY THR GLN LEU THR MET ARG SEQRES 4 D 69 THR PHE HIS THR GLY GLY VAL ALA GLY ALA ALA ASP ILE SEQRES 5 D 69 THR GLN GLY LEU PRO ARG VAL ILE GLU LEU PHE GLU ALA SEQRES 6 D 69 ARG ARG PRO LYS SEQRES 1 D 169 ASP PRO HIS GLN LEU LEU GLU ALA LYS GLY PRO GLU ALA SEQRES 2 D 169 VAL GLU ARG TYR LEU VAL GLU GLU ILE GLN LYS VAL TYR SEQRES 3 D 169 ARG ALA GLN GLY VAL LYS LEU HIS ASP LYS HIS ILE GLU SEQRES 4 D 169 ILE VAL VAL ARG GLN MET MET LYS TYR VAL GLU VAL THR SEQRES 5 D 169 ASP PRO GLY ASP SER ARG LEU LEU GLU GLY GLN VAL LEU SEQRES 6 D 169 GLU LYS TRP ASP VAL GLU ALA LEU ASN GLU ARG LEU ILE SEQRES 7 D 169 ALA GLU GLY LYS THR PRO VAL ALA TRP LYS PRO LEU LEU SEQRES 8 D 169 MET GLY VAL THR LYS SER ALA LEU SER THR LYS SER TRP SEQRES 9 D 169 LEU SER ALA ALA SER PHE GLN ASN THR THR HIS VAL LEU SEQRES 10 D 169 THR GLU ALA ALA ILE ALA GLY LYS LYS ASP GLU LEU ILE SEQRES 11 D 169 GLY LEU LYS GLU ASN VAL ILE LEU GLY ARG LEU ILE PRO SEQRES 12 D 169 ALA GLY THR GLY SER ASP PHE VAL ARG PHE THR GLN VAL SEQRES 13 D 169 VAL ASP GLN LYS THR LEU LYS ALA ILE GLU GLU ALA ARG ATOM 1 N CYS D1201 -120.021 50.090 73.509 1.00 86.00 ATOM 2 CA CYS D1201 -120.801 51.304 73.722 1.00 84.91 ATOM 3 C CYS D1201 -122.164 51.181 73.043 1.00 55.70 ATOM 4 O CYS D1201 -122.380 50.280 72.233 1.00 41.55 ATOM 5 CB CYS D1201 -120.060 52.532 73.198 1.00 80.67 ATOM 6 SG CYS D1201 -120.399 52.926 71.470 1.00 71.75 ATOM 7 N GLN D1202 -123.078 52.087 73.375 1.00 44.65 ATOM 8 CA GLN D1202 -124.428 52.052 72.819 1.00 45.97 ATOM 9 C GLN D1202 -124.417 52.292 71.314 1.00 41.95 ATOM 10 O GLN D1202 -125.147 51.639 70.567 1.00 24.89 ATOM 11 CB GLN D1202 -125.321 53.088 73.506 1.00 54.24 ATOM 12 CG GLN D1202 -126.779 53.034 73.081 1.00 39.30 ATOM 13 CD GLN D1202 -127.575 54.238 73.550 1.00 53.28 ATOM 14 OE1 GLN D1202 -127.014 55.292 73.850 1.00 68.40 ATOM 15 NE2 GLN D1202 -128.893 54.085 73.616 1.00 42.93 ATOM 16 N LYS D1203 -123.584 53.230 70.874 1.00 75.46 ATOM 17 CA LYS D1203 -123.480 53.548 69.455 1.00 74.82 ATOM 18 C LYS D1203 -122.888 52.392 68.655 1.00 61.12 ATOM 19 O LYS D1203 -123.395 52.049 67.588 1.00 37.70 ATOM 20 CB LYS D1203 -122.640 54.811 69.245 1.00 93.94 ATOM 21 CG LYS D1203 -123.456 56.094 69.174 1.00 96.59 ATOM 22 CD LYS D1203 -122.601 57.270 68.725 1.00105.97 ATOM 23 CE LYS D1203 -123.450 58.499 68.429 1.00100.37 ATOM 24 NZ LYS D1203 -124.233 58.938 69.617 1.00 49.07 ATOM 25 N CYS D1204 -121.822 51.787 69.172 1.00 82.00 ATOM 26 CA CYS D1204 -121.134 50.728 68.440 1.00 72.85 ATOM 27 C CYS D1204 -122.032 49.521 68.206 1.00 52.39 ATOM 28 O CYS D1204 -121.994 48.913 67.139 1.00 37.46 ATOM 29 CB CYS D1204 -119.854 50.309 69.165 1.00 64.70 ATOM 30 SG CYS D1204 -118.451 51.400 68.834 1.00101.78 ATOM 31 N TYR D1205 -122.853 49.180 69.190 1.00 40.99 ATOM 32 CA TYR D1205 -123.766 48.063 69.014 1.00 48.21 ATOM 33 C TYR D1205 -124.888 48.428 68.041 1.00 54.39 ATOM 34 O TYR D1205 -124.998 47.837 66.971 1.00 69.24 ATOM 35 CB TYR D1205 -124.344 47.613 70.355 1.00 39.46 ATOM 36 CG TYR D1205 -125.226 46.396 70.236 1.00 38.27 ATOM 37 CD1 TYR D1205 -124.758 45.236 69.636 1.00 65.72 ATOM 38 CD2 TYR D1205 -126.524 46.404 70.723 1.00 39.95 ATOM 39 CE1 TYR D1205 -125.559 44.119 69.520 1.00 53.03 ATOM 40 CE2 TYR D1205 -127.333 45.291 70.615 1.00 77.44 ATOM 41 CZ TYR D1205 -126.846 44.151 70.015 1.00 60.22 ATOM 42 OH TYR D1205 -127.653 43.042 69.908 1.00 36.49 ATOM 43 N GLY D1206 -125.707 49.410 68.402 1.00 52.87 ATOM 44 CA GLY D1206 -126.824 49.807 67.560 1.00 66.69 ATOM 45 C GLY D1206 -128.156 49.461 68.199 1.00 54.87 ATOM 46 O GLY D1206 -128.242 49.359 69.418 1.00 33.00 ATOM 47 N TYR D1207 -129.190 49.279 67.380 1.00 70.82 ATOM 48 CA TYR D1207 -130.534 48.975 67.877 1.00 47.74 ATOM 49 C TYR D1207 -130.573 47.739 68.767 1.00 43.83 ATOM 50 O TYR D1207 -129.876 46.757 68.509 1.00 40.33 ATOM 51 CB TYR D1207 -131.504 48.760 66.710 1.00 37.76 ATOM 52 CG TYR D1207 -132.359 49.950 66.319 1.00 35.94 ATOM 53 CD1 TYR D1207 -133.721 49.956 66.579 1.00 52.18 ATOM 54 CD2 TYR D1207 -131.813 51.054 65.676 1.00 70.91 ATOM 55 CE1 TYR D1207 -134.516 51.031 66.219 1.00 84.24 ATOM 56 CE2 TYR D1207 -132.603 52.132 65.311 1.00 80.37 ATOM 57 CZ TYR D1207 -133.951 52.117 65.587 1.00 69.59 ATOM 58 OH TYR D1207 -134.733 53.191 65.227 1.00 81.60 ATOM 59 N ASP D1208 -131.384 47.787 69.820 1.00 53.31 ATOM 60 CA ASP D1208 -131.779 46.554 70.487 1.00 60.18 ATOM 61 C ASP D1208 -132.944 45.986 69.700 1.00 55.00 ATOM 62 O ASP D1208 -133.996 46.617 69.583 1.00 57.06 ATOM 63 CB ASP D1208 -132.172 46.768 71.949 1.00 82.71 ATOM 64 CG ASP D1208 -132.626 45.478 72.625 1.00 84.67 ATOM 65 OD1 ASP D1208 -133.364 45.550 73.631 1.00 60.59 ATOM 66 OD2 ASP D1208 -132.250 44.388 72.143 1.00 99.07 ATOM 67 N LEU D1209 -132.740 44.795 69.155 1.00 44.28 ATOM 68 CA LEU D1209 -133.697 44.184 68.246 1.00 31.09 ATOM 69 C LEU D1209 -134.993 43.797 68.951 1.00 25.28 ATOM 70 O LEU D1209 -136.064 43.823 68.348 1.00 30.08 ATOM 71 CB LEU D1209 -133.066 42.960 67.580 1.00 20.39 ATOM 72 CG LEU D1209 -131.702 43.213 66.928 1.00 15.69 ATOM 73 CD1 LEU D1209 -131.208 41.972 66.197 1.00 22.99 ATOM 74 CD2 LEU D1209 -131.748 44.413 65.990 1.00 23.64 ATOM 75 N SER D1210 -134.889 43.461 70.233 1.00 31.55 ATOM 76 CA SER D1210 -136.032 42.995 71.013 1.00 48.58 ATOM 77 C SER D1210 -137.126 44.050 71.153 1.00 50.85 ATOM 78 O SER D1210 -138.306 43.720 71.275 1.00 65.22 ATOM 79 CB SER D1210 -135.573 42.550 72.403 1.00 67.42 ATOM 80 OG SER D1210 -135.054 43.646 73.138 1.00 95.96 ATOM 81 N MET D1211 -136.730 45.317 71.140 1.00 41.18 ATOM 82 CA MET D1211 -137.678 46.408 71.336 1.00 55.10 ATOM 83 C MET D1211 -137.589 47.467 70.239 1.00 75.86 ATOM 84 O MET D1211 -138.297 48.473 70.288 1.00 98.65 ATOM 85 CB MET D1211 -137.457 47.053 72.703 1.00 45.14 ATOM 86 CG MET D1211 -136.015 47.434 72.963 1.00 56.83 ATOM 87 SD MET D1211 -135.772 48.292 74.529 1.00116.41 ATOM 88 CE MET D1211 -134.051 48.752 74.382 1.00 68.42 ATOM 89 N ALA D1212 -136.723 47.229 69.257 1.00 40.41 ATOM 90 CA ALA D1212 -136.587 48.099 68.088 1.00 18.86 ATOM 91 C ALA D1212 -136.397 49.572 68.450 1.00 34.23 ATOM 92 O ALA D1212 -137.077 50.446 67.914 1.00 68.73 ATOM 93 CB ALA D1212 -137.793 47.939 67.171 1.00 59.16 ATOM 94 N ARG D1213 -135.467 49.830 69.363 1.00 37.34 ATOM 95 CA ARG D1213 -135.027 51.184 69.687 1.00 42.49 ATOM 96 C ARG D1213 -133.526 51.093 69.974 1.00 35.23 ATOM 97 O ARG D1213 -132.986 49.989 69.989 1.00 36.67 ATOM 98 CB ARG D1213 -135.823 51.759 70.868 1.00 47.36 ATOM 99 CG ARG D1213 -135.983 50.835 72.059 1.00 52.77 ATOM 100 CD ARG D1213 -137.360 51.012 72.688 1.00 53.37 ATOM 101 NE ARG D1213 -138.429 50.646 71.763 1.00 66.99 ATOM 102 CZ ARG D1213 -139.649 51.175 71.774 1.00 65.08 ATOM 103 NH1 ARG D1213 -139.965 52.111 72.658 1.00 85.16 ATOM 104 NH2 ARG D1213 -140.552 50.771 70.890 1.00 31.21 ATOM 105 N PRO D1214 -132.834 52.237 70.149 1.00 34.78 ATOM 106 CA PRO D1214 -131.415 52.139 70.517 1.00 28.59 ATOM 107 C PRO D1214 -131.183 51.200 71.697 1.00 42.19 ATOM 108 O PRO D1214 -131.993 51.199 72.625 1.00 53.11 ATOM 109 CB PRO D1214 -131.058 53.576 70.888 1.00 32.71 ATOM 110 CG PRO D1214 -131.925 54.396 70.010 1.00 38.53 ATOM 111 CD PRO D1214 -133.220 53.628 69.847 1.00 68.71 ATOM 112 N VAL D1215 -130.115 50.406 71.654 1.00 42.17 ATOM 113 CA VAL D1215 -129.886 49.411 72.696 1.00 39.80 ATOM 114 C VAL D1215 -129.859 50.067 74.068 1.00 41.64 ATOM 115 O VAL D1215 -129.192 51.084 74.277 1.00 61.56 ATOM 116 CB VAL D1215 -128.571 48.613 72.477 1.00 34.28 ATOM 117 CG1 VAL D1215 -127.352 49.529 72.429 1.00 57.95 ATOM 118 CG2 VAL D1215 -128.403 47.553 73.559 1.00 52.82 ATOM 119 N SER D1216 -130.631 49.504 74.989 1.00 29.16 ATOM 120 CA SER D1216 -130.612 49.969 76.360 1.00 47.24 ATOM 121 C SER D1216 -129.224 49.752 76.930 1.00 46.74 ATOM 122 O SER D1216 -128.735 48.623 76.997 1.00 45.20 ATOM 123 CB SER D1216 -131.662 49.252 77.197 1.00 57.19 ATOM 124 OG SER D1216 -132.901 49.928 77.099 1.00 44.30 ATOM 125 N ILE D1217 -128.580 50.850 77.304 1.00 44.19 ATOM 126 CA ILE D1217 -127.249 50.796 77.883 1.00 34.55 ATOM 127 C ILE D1217 -127.286 49.948 79.144 1.00 39.72 ATOM 128 O ILE D1217 -128.040 50.224 80.081 1.00 66.28 ATOM 129 CB ILE D1217 -126.700 52.198 78.203 1.00 49.49 ATOM 130 CG1 ILE D1217 -126.862 53.120 76.995 1.00 67.78 ATOM 131 CG2 ILE D1217 -125.238 52.121 78.624 1.00 47.67 ATOM 132 CD1 ILE D1217 -128.099 53.986 77.058 1.00 52.34 ATOM 133 N GLY D1218 -126.483 48.894 79.144 1.00 49.59 ATOM 134 CA GLY D1218 -126.454 47.959 80.249 1.00 47.91 ATOM 135 C GLY D1218 -126.923 46.576 79.851 1.00 44.67 ATOM 136 O GLY D1218 -126.817 45.631 80.626 1.00 56.12 ATOM 137 N GLU D1219 -127.440 46.457 78.634 1.00 40.51 ATOM 138 CA GLU D1219 -127.945 45.178 78.156 1.00 38.59 ATOM 139 C GLU D1219 -126.833 44.143 78.035 1.00 44.28 ATOM 140 O GLU D1219 -125.725 44.452 77.596 1.00 47.60 ATOM 141 CB GLU D1219 -128.646 45.339 76.806 1.00 41.32 ATOM 142 CG GLU D1219 -129.384 44.081 76.361 1.00 28.41 ATOM 143 CD GLU D1219 -130.282 44.319 75.165 1.00 68.14 ATOM 144 OE1 GLU D1219 -129.747 44.650 74.088 1.00118.76 ATOM 145 OE2 GLU D1219 -131.518 44.180 75.300 1.00 61.40 ATOM 146 N ALA D1220 -127.140 42.914 78.438 1.00 54.87 ATOM 147 CA ALA D1220 -126.225 41.794 78.266 1.00 55.17 ATOM 148 C ALA D1220 -126.143 41.398 76.802 1.00 41.59 ATOM 149 O ALA D1220 -126.553 40.303 76.421 1.00 52.59 ATOM 150 CB ALA D1220 -126.665 40.617 79.099 1.00 70.29 ATOM 151 N VAL D1221 -125.610 42.303 75.992 1.00 40.07 ATOM 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