HEADER TRANSCRIPTION/TRANSFERASE/DNA/RNA 31-DEC-69 6B6H TITLE The cryo-EM structure of a bacterial class I transcription activation TITLE 2 complex COMPND MOL_ID: 3; COMPND 2 MOLECULE: DNA-directed RNA polymerase subunit beta'; COMPND 3 CHAIN: D; COMPND 4 EC: 2.7.7.6; COMPND 5 ENGINEERED: YES; EXPDTA ELECTRON MICROSCOPY DBREF 6B6H D 1 1407 UNP P0A8T8 RPOC_ECO57 1 1407 SEQRES 1 D 37 CYS ALA HIS CYS TYR GLY ARG ASP LEU ALA ARG GLY HIS SEQRES 2 D 37 ILE ILE ASN LYS GLY GLU ALA ILE GLY VAL ILE ALA ALA SEQRES 3 D 37 GLN SER ILE GLY GLU PRO GLY THR GLN LEU THR SEQRES 1 D 163 PRO GLU ALA PRO HIS ASP ILE LEU ARG LEU ARG GLY VAL SEQRES 2 D 163 HIS ALA VAL THR ARG TYR ILE VAL ASN GLU VAL GLN ASP SEQRES 3 D 163 VAL TYR ARG LEU GLN GLY VAL LYS ILE ASN ASP LYS HIS SEQRES 4 D 163 ILE GLU VAL ILE VAL ARG GLN MET LEU ARG LYS ALA THR SEQRES 5 D 163 ILE VAL ASN ALA GLY SER SER ASP PHE LEU GLU GLY GLU SEQRES 6 D 163 GLN VAL GLU TYR SER ARG VAL LYS ILE ALA ASN ARG GLU SEQRES 7 D 163 LEU GLU ALA ASN GLY LYS VAL GLY ALA THR TYR SER ARG SEQRES 8 D 163 ASP LEU LEU GLY ILE THR LYS ALA SER LEU ALA THR GLU SEQRES 9 D 163 SER PHE ILE SER ALA ALA SER PHE GLN GLU THR THR ARG SEQRES 10 D 163 VAL LEU THR GLU ALA ALA VAL ALA GLY LYS ARG ASP GLU SEQRES 11 D 163 LEU ARG GLY LEU LYS GLU ASN VAL ILE VAL GLY ARG LEU SEQRES 12 D 163 ILE PRO ALA GLY THR GLY TYR ALA TYR HIS GLN ASP ARG SEQRES 13 D 163 MET ARG ARG ARG ALA ALA GLY ATOM 1 N CYS D 895 129.699 89.991 140.818 1.00 20.00 ATOM 2 CA CYS D 895 128.403 89.451 140.441 1.00 20.00 ATOM 3 C CYS D 895 127.297 90.377 140.922 1.00 20.00 ATOM 4 O CYS D 895 127.504 91.271 141.746 1.00 20.00 ATOM 5 CB CYS D 895 128.167 88.060 141.021 1.00 20.00 ATOM 6 SG CYS D 895 127.679 88.060 142.754 1.00 20.00 ATOM 7 H CYS D 895 129.866 89.937 141.659 1.00 20.00 ATOM 8 HA CYS D 895 128.340 89.367 139.487 1.00 20.00 ATOM 9 HB2 CYS D 895 127.463 87.651 140.499 1.00 20.00 ATOM 10 HB3 CYS D 895 128.979 87.545 140.935 1.00 20.00 ATOM 11 HG CYS D 895 127.326 86.937 142.992 1.00 20.00 ATOM 12 N ALA D 896 126.097 90.119 140.409 1.00 20.00 ATOM 13 CA ALA D 896 124.952 90.955 140.742 1.00 20.00 ATOM 14 C ALA D 896 124.542 90.768 142.192 1.00 20.00 ATOM 15 O ALA D 896 124.144 91.729 142.861 1.00 20.00 ATOM 16 CB ALA D 896 123.780 90.627 139.823 1.00 20.00 ATOM 17 H ALA D 896 125.921 89.461 139.885 1.00 20.00 ATOM 18 HA ALA D 896 125.195 91.885 140.621 1.00 20.00 ATOM 19 HB1 ALA D 896 123.017 91.160 140.091 1.00 20.00 ATOM 20 HB2 ALA D 896 124.025 90.827 138.906 1.00 20.00 ATOM 21 HB3 ALA D 896 123.569 89.684 139.914 1.00 20.00 ATOM 22 N HIS D 897 124.622 89.537 142.689 1.00 20.00 ATOM 23 CA HIS D 897 124.170 89.253 144.042 1.00 20.00 ATOM 24 C HIS D 897 124.997 90.009 145.067 1.00 20.00 ATOM 25 O HIS D 897 124.446 90.698 145.931 1.00 20.00 ATOM 26 CB HIS D 897 124.232 87.755 144.301 1.00 20.00 ATOM 27 CG HIS D 897 123.151 86.978 143.623 1.00 20.00 ATOM 28 ND1 HIS D 897 123.245 86.556 142.316 1.00 20.00 ATOM 29 CD2 HIS D 897 121.960 86.526 144.079 1.00 20.00 ATOM 30 CE1 HIS D 897 122.151 85.892 141.991 1.00 20.00 ATOM 31 NE2 HIS D 897 121.357 85.856 143.044 1.00 20.00 ATOM 32 H HIS D 897 124.942 88.859 142.271 1.00 20.00 ATOM 33 HA HIS D 897 123.250 89.534 144.135 1.00 20.00 ATOM 34 HB2 HIS D 897 125.070 87.436 143.945 1.00 20.00 ATOM 35 HB3 HIS D 897 124.183 87.595 145.254 1.00 20.00 ATOM 36 HD1 HIS D 897 123.908 86.710 141.791 1.00 20.00 ATOM 37 HD2 HIS D 897 121.616 86.653 144.931 1.00 20.00 ATOM 38 HE1 HIS D 897 121.976 85.510 141.163 1.00 20.00 ATOM 39 N CYS D 898 126.324 89.897 144.981 1.00 20.00 ATOM 40 CA CYS D 898 127.182 90.405 146.044 1.00 20.00 ATOM 41 C CYS D 898 127.002 91.897 146.265 1.00 20.00 ATOM 42 O CYS D 898 127.122 92.374 147.399 1.00 20.00 ATOM 43 CB CYS D 898 128.641 90.109 145.733 1.00 20.00 ATOM 44 SG CYS D 898 129.108 88.383 145.865 1.00 20.00 ATOM 45 H CYS D 898 126.745 89.539 144.324 1.00 20.00 ATOM 46 HA CYS D 898 126.947 89.950 146.860 1.00 20.00 ATOM 47 HB2 CYS D 898 128.823 90.396 144.828 1.00 20.00 ATOM 48 HB3 CYS D 898 129.177 90.616 146.354 1.00 20.00 ATOM 49 N TYR D 899 126.710 92.645 145.207 1.00 20.00 ATOM 50 CA TYR D 899 126.422 94.062 145.368 1.00 20.00 ATOM 51 C TYR D 899 125.020 94.275 145.916 1.00 20.00 ATOM 52 O TYR D 899 124.804 95.159 146.746 1.00 20.00 ATOM 53 CB TYR D 899 126.591 94.780 144.036 1.00 20.00 ATOM 54 CG TYR D 899 126.406 96.270 144.119 1.00 20.00 ATOM 55 CD1 TYR D 899 127.416 97.082 144.580 1.00 20.00 ATOM 56 CD2 TYR D 899 125.219 96.862 143.741 1.00 20.00 ATOM 57 CE1 TYR D 899 127.251 98.441 144.660 1.00 20.00 ATOM 58 CE2 TYR D 899 125.048 98.224 143.819 1.00 20.00 ATOM 59 CZ TYR D 899 126.070 99.004 144.280 1.00 20.00 ATOM 60 OH TYR D 899 125.915 100.361 144.363 1.00 20.00 ATOM 61 H TYR D 899 126.675 92.357 144.399 1.00 20.00 ATOM 62 HA TYR D 899 127.044 94.445 145.998 1.00 20.00 ATOM 63 HB2 TYR D 899 127.489 94.616 143.715 1.00 20.00 ATOM 64 HB3 TYR D 899 125.939 94.429 143.415 1.00 20.00 ATOM 65 HD1 TYR D 899 128.221 96.699 144.835 1.00 20.00 ATOM 66 HD2 TYR D 899 124.528 96.329 143.429 1.00 20.00 ATOM 67 HE1 TYR D 899 127.937 98.980 144.966 1.00 20.00 ATOM 68 HE2 TYR D 899 124.247 98.613 143.562 1.00 20.00 ATOM 69 HH TYR D 899 125.102 100.550 144.299 1.00 20.00 ATOM 70 N GLY D 900 124.070 93.489 145.468 1.00 20.00 ATOM 71 CA GLY D 900 122.733 93.499 146.051 1.00 20.00 ATOM 72 C GLY D 900 121.803 94.460 145.330 1.00 20.00 ATOM 73 O GLY D 900 121.618 94.356 144.119 1.00 20.00 ATOM 74 H GLY D 900 124.170 92.929 144.825 1.00 20.00 ATOM 75 HA2 GLY D 900 122.346 92.617 145.989 1.00 20.00 ATOM 76 HA3 GLY D 900 122.777 93.760 146.983 1.00 20.00 ATOM 77 N ARG D 901 121.220 95.384 146.083 1.00 20.00 ATOM 78 CA ARG D 901 120.148 96.224 145.577 1.00 20.00 ATOM 79 C ARG D 901 120.702 97.448 144.861 1.00 20.00 ATOM 80 O ARG D 901 121.568 98.150 145.391 1.00 20.00 ATOM 81 CB ARG D 901 119.226 96.667 146.713 1.00 20.00 ATOM 82 CG ARG D 901 118.059 97.522 146.236 1.00 20.00 ATOM 83 CD ARG D 901 117.100 97.955 147.330 1.00 20.00 ATOM 84 NE ARG D 901 116.266 96.877 147.847 1.00 20.00 ATOM 85 CZ ARG D 901 115.339 97.045 148.785 1.00 20.00 ATOM 86 NH1 ARG D 901 115.103 98.245 149.297 1.00 20.00 ATOM 87 NH2 ARG D 901 114.624 96.013 149.203 1.00 20.00 ATOM 88 H ARG D 901 121.429 95.543 146.900 1.00 20.00 ATOM 89 HA ARG D 901 119.624 95.709 144.951 1.00 20.00 ATOM 90 HB2 ARG D 901 118.867 95.879 147.148 1.00 20.00 ATOM 91 HB3 ARG D 901 119.747 97.188 147.341 1.00 20.00 ATOM 92 HG2 ARG D 901 118.387 98.341 145.846 1.00 20.00 ATOM 93 HG3 ARG D 901 117.557 97.019 145.577 1.00 20.00 ATOM 94 HD2 ARG D 901 117.605 98.319 148.075 1.00 20.00 ATOM 95 HD3 ARG D 901 116.507 98.637 146.980 1.00 20.00 ATOM 96 HE ARG D 901 116.519 96.071 147.683 1.00 20.00 ATOM 97 HH11 ARG D 901 115.546 98.937 149.047 1.00 20.00 ATOM 98 HH12 ARG D 901 114.497 98.328 149.896 1.00 20.00 ATOM 99 HH21 ARG D 901 114.766 95.234 148.876 1.00 20.00 ATOM 100 HH22 ARG D 901 114.020 96.126 149.805 1.00 20.00 ATOM 101 N ASP D 902 120.188 97.701 143.663 1.00 20.00 ATOM 102 CA ASP D 902 120.258 99.020 143.044 1.00 20.00 ATOM 103 C ASP D 902 119.200 99.881 143.713 1.00 20.00 ATOM 104 O ASP D 902 118.002 99.712 143.474 1.00 20.00 ATOM 105 CB ASP D 902 120.033 98.926 141.542 1.00 20.00 ATOM 106 CG ASP D 902 120.203 100.255 140.838 1.00 20.00 ATOM 107 OD1 ASP D 902 120.518 101.261 141.508 1.00 20.00 ATOM 108 OD2 ASP D 902 119.999 100.299 139.608 1.00 20.00 ATOM 109 H ASP D 902 119.798 97.111 143.178 1.00 20.00 ATOM 110 HA ASP D 902 121.125 99.414 143.208 1.00 20.00 ATOM 111 HB2 ASP D 902 120.683 98.309 141.178 1.00 20.00 ATOM 112 HB3 ASP D 902 119.134 98.612 141.375 1.00 20.00 ATOM 113 N LEU D 903 119.651 100.809 144.555 1.00 20.00 ATOM 114 CA LEU D 903 118.747 101.512 145.458 1.00 20.00 ATOM 115 C LEU D 903 117.704 102.308 144.692 1.00 20.00 ATOM 116 O LEU D 903 116.511 102.262 145.011 1.00 20.00 ATOM 117 CB LEU D 903 119.539 102.437 146.371 1.00 20.00 ATOM 118 CG LEU D 903 120.290 101.820 147.538 1.00 20.00 ATOM 119 CD1 LEU D 903 121.525 101.092 147.073 1.00 20.00 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118.933 103.048 143.365 1.00 20.00 ATOM 138 HA ALA D 904 116.695 104.388 143.641 1.00 20.00 ATOM 139 HB1 ALA D 904 117.288 105.423 141.598 1.00 20.00 ATOM 140 HB2 ALA D 904 118.457 105.501 142.675 1.00 20.00 ATOM 141 HB3 ALA D 904 118.519 104.425 141.501 1.00 20.00 ATOM 142 N ARG D 905 116.497 101.859 141.844 1.00 20.00 ATOM 143 CA ARG D 905 115.513 100.985 141.222 1.00 20.00 ATOM 144 C ARG D 905 114.609 100.353 142.270 1.00 20.00 ATOM 145 O ARG D 905 113.395 100.247 142.066 1.00 20.00 ATOM 146 CB ARG D 905 116.214 99.893 140.414 1.00 20.00 ATOM 147 CG ARG D 905 115.257 98.958 139.685 1.00 20.00 ATOM 148 CD ARG D 905 115.966 97.831 138.997 1.00 20.00 ATOM 149 NE ARG D 905 115.000 96.832 138.554 1.00 20.00 ATOM 150 CZ ARG D 905 115.306 95.687 137.954 1.00 20.00 ATOM 151 NH1 ARG D 905 116.565 95.361 137.699 1.00 20.00 ATOM 152 NH2 ARG D 905 114.335 94.856 137.609 1.00 20.00 ATOM 153 H ARG D 905 117.254 101.480 141.999 1.00 20.00 ATOM 154 HA ARG D 905 114.961 101.497 140.613 1.00 20.00 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144.902 107.416 165.803 1.00 20.00 ATOM 11 HG2 PRO D1214 147.633 107.909 165.577 1.00 20.00 ATOM 12 HG3 PRO D1214 146.481 108.980 165.839 1.00 20.00 ATOM 13 HD2 PRO D1214 147.908 108.098 167.770 1.00 20.00 ATOM 14 HD3 PRO D1214 146.375 108.490 168.008 1.00 20.00 ATOM 15 N GLU D1215 146.666 104.320 164.800 1.00 20.00 ATOM 16 CA GLU D1215 147.474 103.307 164.129 1.00 20.00 ATOM 17 C GLU D1215 147.437 103.520 162.623 1.00 20.00 ATOM 18 O GLU D1215 146.744 104.402 162.109 1.00 20.00 ATOM 19 CB GLU D1215 147.008 101.888 164.492 1.00 20.00 ATOM 20 CG GLU D1215 145.623 101.491 164.017 1.00 20.00 ATOM 21 CD GLU D1215 144.526 102.018 164.911 1.00 20.00 ATOM 22 OE1 GLU D1215 144.789 102.957 165.691 1.00 20.00 ATOM 23 OE2 GLU D1215 143.400 101.486 164.837 1.00 20.00 ATOM 24 H GLU D1215 145.920 104.488 164.407 1.00 20.00 ATOM 25 HA GLU D1215 148.399 103.383 164.399 1.00 20.00 ATOM 26 HB2 GLU D1215 147.628 101.255 164.100 1.00 20.00 ATOM 27 HB3 GLU D1215 147.018 101.796 165.455 1.00 20.00 ATOM 28 HG2 GLU D1215 145.450 101.790 163.116 1.00 20.00 ATOM 29 HG3 GLU D1215 145.577 100.528 164.046 1.00 20.00 ATOM 30 N ALA D1216 148.205 102.682 161.924 1.00 20.00 ATOM 31 CA ALA D1216 148.276 102.660 160.476 1.00 20.00 ATOM 32 C ALA D1216 147.530 101.442 159.955 1.00 20.00 ATOM 33 O ALA D1216 147.744 100.341 160.481 1.00 20.00 ATOM 34 CB ALA D1216 149.725 102.615 160.005 1.00 20.00 ATOM 35 H ALA D1216 148.704 102.089 162.289 1.00 20.00 ATOM 36 HA ALA D1216 147.909 103.483 160.148 1.00 20.00 ATOM 37 HB1 ALA D1216 149.727 102.683 159.038 1.00 20.00 ATOM 38 HB2 ALA D1216 150.212 103.356 160.399 1.00 20.00 ATOM 39 HB3 ALA D1216 150.119 101.777 160.284 1.00 20.00 ATOM 40 N PRO D1217 146.661 101.562 158.944 1.00 20.00 ATOM 41 CA PRO D1217 145.904 100.384 158.509 1.00 20.00 ATOM 42 C PRO D1217 146.766 99.313 157.887 1.00 20.00 ATOM 43 O PRO D1217 146.350 98.146 157.857 1.00 20.00 ATOM 44 CB PRO D1217 144.921 100.958 157.486 1.00 20.00 ATOM 45 CG PRO D1217 144.885 102.390 157.750 1.00 20.00 ATOM 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