HEADER TRANSCRIPTION,DNA,RNA 31-DEC-69 6JNX TITLE Cryo-EM structure of a Q-engaged arrested complex COMPND MOL_ID: 3; COMPND 2 MOLECULE: DNA-directed RNA polymerase subunit beta'; COMPND 3 CHAIN: D; COMPND 4 EC: 2.7.7.6; COMPND 5 ENGINEERED: YES; EXPDTA ELECTRON MICROSCOPY REMARK 465 MISSING RESIDUES REMARK 465 THE FOLLOWING RESIDUES WERE NOT LOCATED IN THE REMARK 465 EXPERIMENT. (M=MODEL NUMBER; RES=RESIDUE NAME; C=CHAIN REMARK 465 IDENTIFIER; SSSEQ=SEQUENCE NUMBER; I=INSERTION CODE.) REMARK 465 REMARK 465 M RES C SSSEQI REMARK 465 ILE D 1134 REMARK 465 THR D 1135 DBREF 6JNX D 1 1407 UNP P0A8T7 RPOC_ECOLI 1 1407 SEQRES 1 D 82 ILE THR GLY GLY LEU PRO ARG VAL ALA ASP LEU PHE GLU SEQRES 2 D 82 ALA ARG ARG PRO LYS GLU PRO ALA ILE LEU ALA GLU ILE SEQRES 3 D 82 SER GLY ILE VAL SER PHE GLY LYS GLU THR LYS GLY LYS SEQRES 4 D 82 ARG ARG LEU VAL ILE THR PRO VAL ASP GLY SER ASP PRO SEQRES 5 D 82 TYR GLU GLU MET ILE PRO LYS TRP ARG GLN LEU ASN VAL SEQRES 6 D 82 PHE GLU GLY GLU ARG VAL GLU ARG GLY ASP VAL ILE SER SEQRES 7 D 82 ASP GLY PRO GLU ATOM 1 N GLY D1136 124.284 149.553 153.309 1.00148.95 ATOM 2 CA GLY D1136 123.255 149.027 154.182 1.00148.95 ATOM 3 C GLY D1136 122.861 147.597 153.871 1.00148.95 ATOM 4 O GLY D1136 122.145 146.970 154.642 1.00148.95 ATOM 5 N GLY D1137 123.315 147.077 152.738 1.00148.20 ATOM 6 CA GLY D1137 122.994 145.728 152.322 1.00148.20 ATOM 7 C GLY D1137 124.181 144.799 152.411 1.00148.20 ATOM 8 O GLY D1137 124.927 144.787 153.389 1.00148.20 ATOM 9 N LEU D1138 124.324 143.974 151.385 1.00138.67 ATOM 10 CA LEU D1138 125.575 143.250 151.192 1.00138.67 ATOM 11 C LEU D1138 126.822 144.130 151.120 1.00138.67 ATOM 12 O LEU D1138 127.794 143.814 151.836 1.00138.67 ATOM 13 CB LEU D1138 125.473 142.384 149.935 1.00138.67 ATOM 14 CG LEU D1138 126.771 141.672 149.584 1.00138.67 ATOM 15 CD1 LEU D1138 127.046 140.610 150.599 1.00138.67 ATOM 16 CD2 LEU D1138 126.741 141.103 148.192 1.00138.67 ATOM 17 N PRO D1139 126.886 145.219 150.332 1.00140.80 ATOM 18 CA PRO D1139 128.156 145.945 150.252 1.00140.80 ATOM 19 C PRO D1139 128.500 146.674 151.515 1.00140.80 ATOM 20 O PRO D1139 129.647 147.089 151.664 1.00140.80 ATOM 21 CB PRO D1139 127.934 146.928 149.102 1.00140.80 ATOM 22 CG PRO D1139 126.798 146.436 148.395 1.00140.80 ATOM 23 CD PRO D1139 125.927 145.871 149.424 1.00140.80 ATOM 24 N ARG D1140 127.536 146.869 152.409 1.00145.82 ATOM 25 CA ARG D1140 127.859 147.211 153.783 1.00145.82 ATOM 26 C ARG D1140 128.818 146.201 154.382 1.00145.82 ATOM 27 O ARG D1140 129.868 146.579 154.911 1.00145.82 ATOM 28 CB ARG D1140 126.574 147.281 154.597 1.00145.82 ATOM 29 CG ARG D1140 126.776 147.312 156.075 1.00145.82 ATOM 30 CD ARG D1140 127.356 148.594 156.515 1.00145.82 ATOM 31 NE ARG D1140 127.580 148.588 157.946 1.00145.82 ATOM 32 CZ ARG D1140 128.203 149.564 158.577 1.00145.82 ATOM 33 NH1 ARG D1140 128.637 150.608 157.896 1.00145.82 ATOM 34 NH2 ARG D1140 128.385 149.509 159.876 1.00145.82 ATOM 35 N VAL D1141 128.500 144.916 154.248 1.00138.36 ATOM 36 CA VAL D1141 129.319 143.874 154.844 1.00138.36 ATOM 37 C VAL D1141 130.665 143.809 154.165 1.00138.36 ATOM 38 O VAL D1141 131.711 143.707 154.825 1.00138.36 ATOM 39 CB VAL D1141 128.594 142.532 154.747 1.00138.36 ATOM 40 CG1 VAL D1141 129.414 141.448 155.383 1.00138.36 ATOM 41 CG2 VAL D1141 127.275 142.650 155.397 1.00138.36 ATOM 42 N ALA D1142 130.660 143.922 152.839 1.00145.70 ATOM 43 CA ALA D1142 131.912 143.914 152.099 1.00145.70 ATOM 44 C ALA D1142 132.765 145.119 152.454 1.00145.70 ATOM 45 O ALA D1142 133.995 145.047 152.447 1.00145.70 ATOM 46 CB ALA D1142 131.632 143.881 150.605 1.00145.70 ATOM 47 N ASP D1143 132.130 146.229 152.803 1.00161.83 ATOM 48 CA ASP D1143 132.921 147.362 153.237 1.00161.83 ATOM 49 C ASP D1143 133.364 147.236 154.677 1.00161.83 ATOM 50 O ASP D1143 134.275 147.957 155.091 1.00161.83 ATOM 51 CB ASP D1143 132.149 148.650 153.025 1.00161.83 ATOM 52 CG ASP D1143 132.000 148.980 151.563 1.00161.83 ATOM 53 OD1 ASP D1143 132.870 148.551 150.777 1.00161.83 ATOM 54 OD2 ASP D1143 131.013 149.644 151.191 1.00161.83 ATOM 55 N LEU D1144 132.753 146.347 155.450 1.00148.44 ATOM 56 CA LEU D1144 133.263 146.114 156.791 1.00148.44 ATOM 57 C LEU D1144 134.499 145.242 156.760 1.00148.44 ATOM 58 O LEU D1144 135.481 145.528 157.449 1.00148.44 ATOM 59 CB LEU D1144 132.186 145.504 157.663 1.00148.44 ATOM 60 CG LEU D1144 131.190 146.628 157.882 1.00148.44 ATOM 61 CD1 LEU D1144 129.936 146.094 158.479 1.00148.44 ATOM 62 CD2 LEU D1144 131.789 147.708 158.761 1.00148.44 ATOM 63 N PHE D1145 134.493 144.181 155.960 1.00149.41 ATOM 64 CA PHE D1145 135.751 143.456 155.871 1.00149.41 ATOM 65 C PHE D1145 136.747 144.168 154.990 1.00149.41 ATOM 66 O PHE D1145 137.946 143.901 155.078 1.00149.41 ATOM 67 CB PHE D1145 135.532 142.051 155.360 1.00149.41 ATOM 68 CG PHE D1145 134.610 141.280 156.198 1.00149.41 ATOM 69 CD1 PHE D1145 134.938 141.011 157.499 1.00149.41 ATOM 70 CD2 PHE D1145 133.432 140.806 155.691 1.00149.41 ATOM 71 CE1 PHE D1145 134.100 140.291 158.290 1.00149.41 ATOM 72 CE2 PHE D1145 132.587 140.076 156.481 1.00149.41 ATOM 73 CZ PHE D1145 132.922 139.821 157.782 1.00149.41 ATOM 74 N GLU D1146 136.275 145.082 154.165 1.00160.67 ATOM 75 CA GLU D1146 137.183 145.973 153.480 1.00160.67 ATOM 76 C GLU D1146 137.777 146.979 154.447 1.00160.67 ATOM 77 O GLU D1146 138.898 147.450 154.230 1.00160.67 ATOM 78 CB GLU D1146 136.431 146.660 152.349 1.00160.67 ATOM 79 CG GLU D1146 137.246 147.572 151.483 1.00160.67 ATOM 80 CD GLU D1146 138.268 146.841 150.667 1.00160.67 ATOM 81 OE1 GLU D1146 138.050 145.650 150.361 1.00160.67 ATOM 82 OE2 GLU D1146 139.288 147.466 150.320 1.00160.67 ATOM 83 N ALA D1147 137.051 147.275 155.531 1.00156.53 ATOM 84 CA ALA D1147 137.441 148.228 156.569 1.00156.53 ATOM 85 C ALA D1147 137.737 149.596 155.964 1.00156.53 ATOM 86 O ALA D1147 138.877 150.041 155.884 1.00156.53 ATOM 87 CB ALA D1147 138.625 147.716 157.391 1.00156.53 ATOM 88 N ARG D1148 136.685 150.236 155.492 1.00157.17 ATOM 89 CA ARG D1148 136.852 151.506 154.823 1.00157.17 ATOM 90 C ARG D1148 136.768 152.657 155.795 1.00157.17 ATOM 91 O ARG D1148 136.113 152.582 156.834 1.00157.17 ATOM 92 CB ARG D1148 135.779 151.697 153.778 1.00157.17 ATOM 93 CG ARG D1148 135.884 150.716 152.716 1.00157.17 ATOM 94 CD ARG D1148 134.848 150.970 151.688 1.00157.17 ATOM 95 NE ARG D1148 134.981 149.984 150.633 1.00157.17 ATOM 96 CZ ARG D1148 135.784 150.159 149.599 1.00157.17 ATOM 97 NH1 ARG D1148 136.474 151.275 149.523 1.00157.17 ATOM 98 NH2 ARG D1148 135.898 149.235 148.662 1.00157.17 ATOM 99 N ARG D1149 137.402 153.732 155.431 1.00171.76 ATOM 100 CA ARG D1149 137.105 154.965 156.093 1.00171.76 ATOM 101 C ARG D1149 135.758 155.434 155.585 1.00171.76 ATOM 102 O ARG D1149 135.587 155.591 154.373 1.00171.76 ATOM 103 CB ARG D1149 138.174 155.984 155.810 1.00171.76 ATOM 104 CG ARG D1149 139.491 155.556 156.366 1.00171.76 ATOM 105 CD ARG D1149 140.467 156.678 156.266 1.00171.76 ATOM 106 NE ARG D1149 139.977 157.823 157.025 1.00171.76 ATOM 107 CZ ARG D1149 140.148 157.993 158.333 1.00171.76 ATOM 108 NH1 ARG D1149 140.801 157.088 159.052 1.00171.76 ATOM 109 NH2 ARG D1149 139.664 159.075 158.924 1.00171.76 ATOM 110 N PRO D1150 134.793 155.656 156.443 1.00174.58 ATOM 111 CA PRO D1150 133.469 156.072 155.973 1.00174.58 ATOM 112 C PRO D1150 133.440 157.524 155.532 1.00174.58 ATOM 113 O PRO D1150 134.482 158.185 155.504 1.00174.58 ATOM 114 CB PRO D1150 132.582 155.831 157.193 1.00174.58 ATOM 115 CG PRO D1150 133.508 155.969 158.331 1.00174.58 ATOM 116 CD PRO D1150 134.825 155.446 157.894 1.00174.58 ATOM 117 N LYS D1151 132.242 158.017 155.202 1.00180.57 ATOM 118 CA LYS D1151 132.094 159.264 154.451 1.00180.57 ATOM 119 C LYS D1151 132.591 160.464 155.242 1.00180.57 ATOM 120 O LYS D1151 133.335 161.301 154.721 1.00180.57 ATOM 121 CB LYS D1151 130.639 159.459 154.055 1.00180.57 ATOM 122 CG LYS D1151 130.430 160.713 153.266 1.00180.57 ATOM 123 CD LYS D1151 131.150 160.612 151.943 1.00180.57 ATOM 124 CE LYS D1151 130.870 161.819 151.075 1.00180.57 ATOM 125 NZ LYS D1151 131.448 163.056 151.667 1.00180.57 ATOM 126 N GLU D1152 132.187 160.568 156.502 1.00185.86 ATOM 127 CA GLU D1152 132.878 161.417 157.467 1.00185.86 ATOM 128 C GLU D1152 133.021 160.608 158.747 1.00185.86 ATOM 129 O GLU D1152 132.064 159.969 159.203 1.00185.86 ATOM 130 CB GLU D1152 132.159 162.749 157.678 1.00185.86 ATOM 131 CG GLU D1152 130.736 162.704 158.190 1.00185.86 ATOM 132 CD GLU D1152 130.682 162.665 159.697 1.00185.86 ATOM 133 OE1 GLU D1152 131.715 162.968 160.326 1.00185.86 ATOM 134 OE2 GLU D1152 129.625 162.309 160.251 1.00185.86 ATOM 135 N PRO D1153 134.212 160.538 159.318 1.00181.37 ATOM 136 CA PRO D1153 134.376 159.764 160.548 1.00181.37 ATOM 137 C PRO D1153 133.869 160.555 161.736 1.00181.37 ATOM 138 O PRO D1153 133.957 161.779 161.764 1.00181.37 ATOM 139 CB PRO D1153 135.886 159.541 160.627 1.00181.37 ATOM 140 CG PRO D1153 136.360 159.718 159.229 1.00181.37 ATOM 141 CD PRO D1153 135.496 160.790 158.659 1.00181.37 ATOM 142 N ALA D1154 133.329 159.848 162.711 1.00183.04 ATOM 143 CA ALA D1154 133.076 160.462 164.004 1.00183.04 ATOM 144 C ALA D1154 134.426 160.736 164.644 1.00183.04 ATOM 145 O ALA D1154 135.276 159.852 164.734 1.00183.04 ATOM 146 CB ALA D1154 132.210 159.560 164.871 1.00183.04 ATOM 147 N ILE D1155 134.654 161.981 165.038 1.00191.46 ATOM 148 CA ILE D1155 135.932 162.337 165.625 1.00191.46 ATOM 149 C ILE D1155 135.967 161.932 167.091 1.00191.46 ATOM 150 O ILE D1155 134.984 162.069 167.833 1.00191.46 ATOM 151 CB ILE D1155 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