HEADER TRANSLATION 31-DEC-69 6KQE TITLE Thermus thermophilus initial transcription complex comprising sigma A TITLE 2 and 5'-OH RNA of 4 nt COMPND MOL_ID: 3; COMPND 2 MOLECULE: DNA-directed RNA polymerase subunit beta'; COMPND 3 CHAIN: D; COMPND 4 EC: 2.7.7.6; EXPDTA X-RAY DIFFRACTION REMARK 2 RESOLUTION. 3.30 ANGSTORMS DBREF 6KQE D 1 1524 UNP Q8RQE8 RPOC_THET8 1 1524 SEQRES 1 D 91 ALA ASP CYS GLY THR THR ASN TYR ILE SER VAL PRO LEU SEQRES 2 D 91 PHE GLN PRO ASP GLU VAL THR ARG SER LEU ARG LEU ARG SEQRES 3 D 91 LYS ARG ALA ASP ILE GLU ALA GLY LEU TYR GLY ARG VAL SEQRES 4 D 91 LEU ALA ARG GLU VAL GLU VAL LEU GLY VAL ARG LEU GLU SEQRES 5 D 91 GLU GLY ARG TYR LEU SER MET ASP ASP VAL HIS LEU LEU SEQRES 6 D 91 ILE LYS ALA ALA GLU ALA GLY GLU ILE GLN GLU VAL PRO SEQRES 7 D 91 VAL ARG SER PRO LEU THR CYS GLN THR ARG TYR GLY VAL ATOM 1 N ALA D1110 -27.796 26.057 66.494 1.00 81.31 ATOM 2 CA ALA D1110 -28.791 25.807 67.534 1.00 75.01 ATOM 3 C ALA D1110 -29.938 24.910 67.077 1.00 74.89 ATOM 4 O ALA D1110 -30.349 24.001 67.799 1.00 75.60 ATOM 5 CB ALA D1110 -29.321 27.115 68.090 1.00 72.94 ATOM 6 N ASP D1111 -30.463 25.173 65.884 1.00 74.50 ATOM 7 CA ASP D1111 -31.536 24.347 65.338 1.00 76.19 ATOM 8 C ASP D1111 -31.413 24.158 63.831 1.00 78.52 ATOM 9 O ASP D1111 -31.203 25.118 63.091 1.00 77.75 ATOM 10 CB ASP D1111 -32.912 24.922 65.691 1.00 70.74 ATOM 11 CG ASP D1111 -34.050 23.993 65.302 1.00 76.46 ATOM 12 OD1 ASP D1111 -33.804 22.776 65.165 1.00 76.10 ATOM 13 OD2 ASP D1111 -35.189 24.478 65.131 1.00 83.68 ATOM 14 N CYS D1112 -31.549 22.914 63.383 1.00 79.85 ATOM 15 CA CYS D1112 -31.579 22.616 61.957 1.00 74.90 ATOM 16 C CYS D1112 -33.010 22.740 61.442 1.00 72.55 ATOM 17 O CYS D1112 -33.254 22.756 60.235 1.00 72.16 ATOM 18 CB CYS D1112 -31.030 21.215 61.688 1.00 66.52 ATOM 19 SG CYS D1112 -32.037 19.882 62.370 1.00 67.22 ATOM 20 N GLY D1113 -33.953 22.825 62.374 1.00 66.74 ATOM 21 CA GLY D1113 -35.349 23.034 62.041 1.00 73.45 ATOM 22 C GLY D1113 -36.057 21.836 61.441 1.00 76.33 ATOM 23 O GLY D1113 -37.130 21.977 60.853 1.00 81.53 ATOM 24 N THR D1114 -35.470 20.654 61.588 1.00 73.46 ATOM 25 CA THR D1114 -36.091 19.446 61.060 1.00 72.05 ATOM 26 C THR D1114 -37.386 19.102 61.799 1.00 72.76 ATOM 27 O THR D1114 -37.519 19.327 63.003 1.00 68.87 ATOM 28 CB THR D1114 -35.137 18.238 61.100 1.00 67.81 ATOM 29 OG1 THR D1114 -35.721 17.146 60.381 1.00 68.32 ATOM 30 CG2 THR D1114 -34.868 17.805 62.536 1.00 69.45 ATOM 31 N THR D1115 -38.351 18.578 61.058 1.00 73.22 ATOM 32 CA THR D1115 -39.592 18.109 61.649 1.00 73.76 ATOM 33 C THR D1115 -39.503 16.605 61.904 1.00 76.89 ATOM 34 O THR D1115 -40.438 15.996 62.425 1.00 78.07 ATOM 35 CB THR D1115 -40.786 18.417 60.735 1.00 82.13 ATOM 36 OG1 THR D1115 -40.563 17.832 59.447 1.00 79.09 ATOM 37 CG2 THR D1115 -40.949 19.922 60.571 1.00 85.77 ATOM 38 N ASN D1116 -38.372 16.017 61.522 1.00 75.15 ATOM 39 CA ASN D1116 -38.129 14.585 61.685 1.00 70.09 ATOM 40 C ASN D1116 -37.633 14.228 63.082 1.00 71.01 ATOM 41 O ASN D1116 -36.923 15.013 63.714 1.00 72.33 ATOM 42 CB ASN D1116 -37.127 14.092 60.643 1.00 73.11 ATOM 43 CG ASN D1116 -37.548 14.422 59.226 1.00 84.47 ATOM 44 OD1 ASN D1116 -38.739 14.490 58.918 1.00 83.64 ATOM 45 ND2 ASN D1116 -36.567 14.625 58.351 1.00 88.40 ATOM 46 N TYR D1117 -37.996 13.041 63.556 1.00 62.11 ATOM 47 CA TYR D1117 -37.577 12.593 64.881 1.00 61.73 ATOM 48 C TYR D1117 -37.590 11.074 64.992 1.00 63.13 ATOM 49 O TYR D1117 -37.956 10.382 64.041 1.00 64.77 ATOM 50 CB TYR D1117 -38.492 13.191 65.949 1.00 69.22 ATOM 51 CG TYR D1117 -39.964 12.905 65.727 1.00 70.04 ATOM 52 CD1 TYR D1117 -40.739 13.738 64.929 1.00 71.11 ATOM 53 CD2 TYR D1117 -40.577 11.802 66.311 1.00 66.70 ATOM 54 CE1 TYR D1117 -42.084 13.479 64.717 1.00 75.60 ATOM 55 CE2 TYR D1117 -41.923 11.536 66.104 1.00 68.68 ATOM 56 CZ TYR D1117 -42.671 12.379 65.306 1.00 72.57 ATOM 57 OH TYR D1117 -44.009 12.124 65.092 1.00 71.39 ATOM 58 N ILE D1118 -37.196 10.558 66.156 1.00 60.98 ATOM 59 CA ILE D1118 -37.242 9.113 66.390 1.00 61.98 ATOM 60 C ILE D1118 -38.070 8.782 67.630 1.00 65.91 ATOM 61 O ILE D1118 -38.132 9.567 68.572 1.00 64.58 ATOM 62 CB ILE D1118 -35.831 8.494 66.530 1.00 57.14 ATOM 63 CG1 ILE D1118 -35.176 8.914 67.846 1.00 58.99 ATOM 64 CG2 ILE D1118 -34.955 8.889 65.358 1.00 59.49 ATOM 65 CD1 ILE D1118 -33.946 8.115 68.189 1.00 59.10 ATOM 66 N SER D1119 -38.710 7.619 67.634 1.00 66.63 ATOM 67 CA SER D1119 -39.541 7.235 68.769 1.00 65.17 ATOM 68 C SER D1119 -38.871 6.179 69.636 1.00 59.94 ATOM 69 O SER D1119 -38.733 5.029 69.229 1.00 70.79 ATOM 70 CB SER D1119 -40.893 6.720 68.278 1.00 73.11 ATOM 71 OG SER D1119 -41.478 7.629 67.364 1.00 84.14 ATOM 72 N VAL D1120 -38.469 6.562 70.840 1.00 53.71 ATOM 73 CA VAL D1120 -37.848 5.609 71.749 1.00 58.57 ATOM 74 C VAL D1120 -38.912 4.709 72.377 1.00 64.93 ATOM 75 O VAL D1120 -39.771 5.188 73.118 1.00 67.32 ATOM 76 CB VAL D1120 -37.075 6.328 72.867 1.00 57.90 ATOM 77 CG1 VAL D1120 -36.228 5.338 73.645 1.00 49.53 ATOM 78 CG2 VAL D1120 -36.205 7.430 72.285 1.00 63.75 ATOM 79 N PRO D1121 -38.865 3.401 72.076 1.00 64.40 ATOM 80 CA PRO D1121 -39.835 2.477 72.668 1.00 66.64 ATOM 81 C PRO D1121 -39.564 2.279 74.152 1.00 70.41 ATOM 82 O PRO D1121 -38.404 2.164 74.548 1.00 68.70 ATOM 83 CB PRO D1121 -39.571 1.175 71.912 1.00 66.82 ATOM 84 CG PRO D1121 -38.143 1.247 71.547 1.00 63.48 ATOM 85 CD PRO D1121 -37.879 2.698 71.238 1.00 66.96 ATOM 86 N LEU D1122 -40.619 2.259 74.960 1.00 76.08 ATOM 87 CA LEU D1122 -40.486 1.949 76.379 1.00 76.74 ATOM 88 C LEU D1122 -40.798 0.479 76.645 1.00 75.79 ATOM 89 O LEU D1122 -40.666 -0.006 77.768 1.00 76.17 ATOM 90 CB LEU D1122 -41.408 2.845 77.204 1.00 70.41 ATOM 91 CG LEU D1122 -41.214 4.344 76.976 1.00 65.84 ATOM 92 CD1 LEU D1122 -42.303 5.143 77.658 1.00 68.48 ATOM 93 CD2 LEU D1122 -39.845 4.783 77.465 1.00 62.81 ATOM 94 N PHE D1123 -41.196 -0.230 75.595 1.00 73.48 ATOM 95 CA PHE D1123 -41.605 -1.619 75.728 1.00 83.53 ATOM 96 C PHE D1123 -40.938 -2.484 74.670 1.00 92.09 ATOM 97 O PHE D1123 -40.783 -2.066 73.523 1.00 90.93 ATOM 98 CB PHE D1123 -43.128 -1.744 75.622 1.00 90.90 ATOM 99 CG PHE D1123 -43.870 -1.123 76.772 1.00 89.79 ATOM 100 CD1 PHE D1123 -43.969 -1.785 77.986 1.00 90.15 ATOM 101 CD2 PHE D1123 -44.469 0.119 76.640 1.00 82.65 ATOM 102 CE1 PHE D1123 -44.646 -1.218 79.049 1.00 82.36 ATOM 103 CE2 PHE D1123 -45.149 0.691 77.701 1.00 85.27 ATOM 104 CZ PHE D1123 -45.237 0.020 78.907 1.00 83.44 ATOM 105 N GLN D1124 -40.545 -3.691 75.062 1.00100.01 ATOM 106 CA GLN D1124 -39.929 -4.632 74.135 1.00105.46 ATOM 107 C GLN D1124 -40.633 -5.984 74.169 1.00108.87 ATOM 108 O GLN D1124 -41.145 -6.398 75.215 1.00110.82 ATOM 109 CB GLN D1124 -38.439 -4.797 74.442 1.00108.03 ATOM 110 CG GLN D1124 -38.138 -5.310 75.840 1.00113.49 ATOM 111 CD GLN D1124 -36.649 -5.369 76.125 1.00120.07 ATOM 112 OE1 GLN D1124 -36.228 -5.751 77.218 1.00121.75 ATOM 113 NE2 GLN D1124 -35.841 -4.987 75.138 1.00103.91 ATOM 114 N PRO D1125 -40.676 -6.666 73.012 1.00113.06 ATOM 115 CA PRO D1125 -41.266 -8.003 72.908 1.00123.58 ATOM 116 C PRO D1125 -40.551 -9.001 73.808 1.00132.10 ATOM 117 O PRO D1125 -39.321 -9.040 73.836 1.00133.40 ATOM 118 CB PRO D1125 -41.042 -8.366 71.437 1.00116.90 ATOM 119 CG PRO D1125 -40.972 -7.059 70.738 1.00108.89 ATOM 120 CD PRO D1125 -40.269 -6.144 71.696 1.00113.19 ATOM 121 N ASP D1126 -41.327 -9.790 74.544 1.00141.71 ATOM 122 CA ASP D1126 -40.779 -10.812 75.424 1.00149.01 ATOM 123 C ASP D1126 -40.299 -12.001 74.594 1.00160.87 ATOM 124 O ASP D1126 -40.767 -12.212 73.475 1.00160.06 ATOM 125 CB ASP D1126 -41.840 -11.253 76.434 1.00147.41 ATOM 126 CG ASP D1126 -41.244 -11.920 77.652 1.00147.63 ATOM 127 OD1 ASP D1126 -40.672 -11.204 78.501 1.00145.94 ATOM 128 OD2 ASP D1126 -41.355 -13.156 77.768 1.00151.04 ATOM 129 N GLU D1127 -39.359 -12.769 75.138 1.00167.90 ATOM 130 CA GLU D1127 -38.823 -13.930 74.431 1.00169.12 ATOM 131 C GLU D1127 -39.867 -15.037 74.320 1.00172.71 ATOM 132 O GLU D1127 -39.840 -15.840 73.385 1.00173.64 ATOM 133 CB GLU D1127 -37.559 -14.450 75.119 1.00165.16 ATOM 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1.00149.76 ATOM 152 N ARG D1130 -45.169 -13.689 74.342 1.00163.88 ATOM 153 CA ARG D1130 -46.500 -13.663 74.929 1.00163.02 ATOM 154 C ARG D1130 -47.106 -12.270 74.813 1.00166.76 ATOM 155 O ARG D1130 -48.248 -12.111 74.385 1.00168.16 ATOM 156 CB ARG D1130 -46.439 -14.088 76.397 1.00155.44 ATOM 157 CG ARG D1130 -47.731 -14.685 76.927 1.00152.72 ATOM 158 CD ARG D1130 -47.720 -14.749 78.441 1.00151.18 ATOM 159 NE ARG D1130 -47.815 -13.417 79.028 1.00151.23 ATOM 160 CZ ARG D1130 -47.713 -13.163 80.328 1.00155.71 ATOM 161 NH1 ARG D1130 -47.815 -11.917 80.772 1.00155.45 ATOM 162 NH2 ARG D1130 -47.505 -14.153 81.185 1.00154.93 ATOM 163 N SER D1131 -46.327 -11.263 75.195 1.00162.66 ATOM 164 CA SER D1131 -46.771 -9.874 75.150 1.00153.70 ATOM 165 C SER D1131 -45.582 -8.919 75.081 1.00139.62 ATOM 166 O SER D1131 -44.442 -9.339 74.878 1.00137.42 ATOM 167 CB SER D1131 -47.629 -9.547 76.374 1.00147.72 ATOM 168 OG SER D1131 -46.870 -9.661 77.567 1.00141.29 ATOM 169 N LEU D1132 -45.861 -7.629 75.241 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