HEADER TRANSCRIPTION 31-DEC-69 6KQL TITLE Thermus thermophilus initial transcription complex comprising sigma A TITLE 2 and 5'-triphosphate RNA of 4 nt COMPND MOL_ID: 3; COMPND 2 MOLECULE: DNA-directed RNA polymerase subunit beta'; COMPND 3 CHAIN: D; COMPND 4 EC: 2.7.7.6; EXPDTA X-RAY DIFFRACTION REMARK 2 RESOLUTION. 2.89 ANGSTORMS DBREF 6KQL D 1 1524 UNP Q8RQE8 RPOC_THET8 1 1524 SEQRES 1 D 61 ALA LYS ALA VAL ILE SER GLU ILE ASP GLY VAL VAL ARG SEQRES 2 D 61 ILE GLU GLU THR GLU GLU LYS LEU SER VAL PHE VAL GLU SEQRES 3 D 61 SER GLU GLY PHE SER LYS GLU TYR LYS LEU PRO LYS GLU SEQRES 4 D 61 ALA ARG LEU LEU VAL LYS ASP GLY ASP TYR VAL GLU ALA SEQRES 5 D 61 GLY GLN PRO LEU THR ARG GLY ALA ILE ATOM 1 N ALA D1270 -23.000 -17.238 60.768 1.00107.36 ATOM 2 CA ALA D1270 -24.281 -17.904 60.931 1.00106.28 ATOM 3 C ALA D1270 -25.350 -16.824 60.929 1.00104.69 ATOM 4 O ALA D1270 -25.470 -16.059 61.887 1.00 99.36 ATOM 5 CB ALA D1270 -24.312 -18.681 62.232 1.00103.39 ATOM 6 N LYS D1271 -26.132 -16.772 59.855 1.00 99.97 ATOM 7 CA LYS D1271 -27.094 -15.692 59.679 1.00 93.80 ATOM 8 C LYS D1271 -28.532 -16.191 59.663 1.00 99.76 ATOM 9 O LYS D1271 -28.810 -17.333 59.295 1.00103.19 ATOM 10 CB LYS D1271 -26.804 -14.899 58.399 1.00 81.02 ATOM 11 CG LYS D1271 -27.638 -15.326 57.200 1.00 88.96 ATOM 12 CD LYS D1271 -27.602 -14.296 56.080 1.00 80.33 ATOM 13 CE LYS D1271 -26.223 -14.194 55.453 1.00 80.26 ATOM 14 NZ LYS D1271 -26.239 -13.347 54.226 1.00 82.23 ATOM 15 N ALA D1272 -29.439 -15.319 60.084 1.00 98.40 ATOM 16 CA ALA D1272 -30.862 -15.592 60.008 1.00 97.44 ATOM 17 C ALA D1272 -31.345 -15.366 58.582 1.00 97.98 ATOM 18 O ALA D1272 -30.800 -14.531 57.859 1.00 92.30 ATOM 19 CB ALA D1272 -31.616 -14.695 60.970 1.00 92.63 ATOM 20 N VAL D1273 -32.364 -16.117 58.178 1.00 98.04 ATOM 21 CA VAL D1273 -32.984 -15.919 56.876 1.00 97.75 ATOM 22 C VAL D1273 -34.227 -15.050 57.035 1.00 96.03 ATOM 23 O VAL D1273 -35.076 -15.322 57.883 1.00102.25 ATOM 24 CB VAL D1273 -33.370 -17.258 56.223 1.00 95.09 ATOM 25 CG1 VAL D1273 -33.902 -17.027 54.818 1.00100.64 ATOM 26 CG2 VAL D1273 -32.174 -18.195 56.195 1.00 93.50 ATOM 27 N ILE D1274 -34.328 -14.002 56.224 1.00 93.20 ATOM 28 CA ILE D1274 -35.446 -13.070 56.331 1.00 98.86 ATOM 29 C ILE D1274 -36.295 -13.048 55.064 1.00 99.72 ATOM 30 O ILE D1274 -35.822 -13.388 53.981 1.00101.06 ATOM 31 CB ILE D1274 -34.967 -11.637 56.650 1.00 99.15 ATOM 32 CG1 ILE D1274 -34.101 -11.092 55.512 1.00 85.13 ATOM 33 CG2 ILE D1274 -34.208 -11.608 57.971 1.00 90.54 ATOM 34 CD1 ILE D1274 -33.683 -9.651 55.704 1.00 74.75 ATOM 35 N SER D1275 -37.555 -12.651 55.212 1.00100.08 ATOM 36 CA SER D1275 -38.481 -12.592 54.087 1.00106.96 ATOM 37 C SER D1275 -38.292 -11.315 53.278 1.00106.40 ATOM 38 O SER D1275 -38.181 -10.224 53.838 1.00104.36 ATOM 39 CB SER D1275 -39.928 -12.686 54.576 1.00113.28 ATOM 40 OG SER D1275 -40.163 -13.912 55.245 1.00115.06 ATOM 41 N GLU D1276 -38.259 -11.459 51.957 1.00108.22 ATOM 42 CA GLU D1276 -38.107 -10.314 51.068 1.00111.66 ATOM 43 C GLU D1276 -39.424 -9.560 50.914 1.00115.28 ATOM 44 O GLU D1276 -39.435 -8.352 50.677 1.00112.36 ATOM 45 CB GLU D1276 -37.592 -10.764 49.699 1.00107.68 ATOM 46 CG GLU D1276 -36.257 -11.491 49.748 1.00107.80 ATOM 47 CD GLU D1276 -35.800 -11.970 48.383 1.00108.68 ATOM 48 OE1 GLU D1276 -36.189 -11.352 47.371 1.00110.81 ATOM 49 OE2 GLU D1276 -35.054 -12.970 48.324 1.00102.25 ATOM 50 N ILE D1277 -40.533 -10.282 51.048 1.00121.95 ATOM 51 CA ILE D1277 -41.861 -9.698 50.887 1.00122.72 ATOM 52 C ILE D1277 -42.798 -10.105 52.017 1.00124.97 ATOM 53 O ILE D1277 -42.500 -11.014 52.792 1.00121.33 ATOM 54 CB ILE D1277 -42.516 -10.125 49.558 1.00123.68 ATOM 55 CG1 ILE D1277 -42.755 -11.637 49.547 1.00129.18 ATOM 56 CG2 ILE D1277 -41.666 -9.695 48.370 1.00125.20 ATOM 57 CD1 ILE D1277 -43.542 -12.123 48.351 1.00139.98 ATOM 58 N ASP D1278 -43.933 -9.417 52.102 1.00130.16 ATOM 59 CA ASP D1278 -44.984 -9.776 53.045 1.00133.18 ATOM 60 C ASP D1278 -45.722 -11.008 52.532 1.00137.30 ATOM 61 O ASP D1278 -45.715 -11.287 51.333 1.00137.82 ATOM 62 CB ASP D1278 -45.965 -8.616 53.214 1.00131.91 ATOM 63 CG ASP D1278 -45.267 -7.293 53.454 1.00130.58 ATOM 64 OD1 ASP D1278 -44.933 -6.998 54.621 1.00135.14 ATOM 65 OD2 ASP D1278 -45.053 -6.547 52.476 1.00130.16 ATOM 66 N GLY D1279 -46.355 -11.747 53.438 1.00136.36 ATOM 67 CA GLY D1279 -47.105 -12.927 53.050 1.00141.46 ATOM 68 C GLY D1279 -47.389 -13.877 54.196 1.00146.38 ATOM 69 O GLY D1279 -47.152 -13.553 55.359 1.00147.78 ATOM 70 N VAL D1280 -47.905 -15.057 53.862 1.00149.24 ATOM 71 CA VAL D1280 -48.232 -16.065 54.864 1.00151.76 ATOM 72 C VAL D1280 -47.257 -17.243 54.783 1.00148.84 ATOM 73 O VAL D1280 -46.814 -17.624 53.697 1.00145.93 ATOM 74 CB VAL D1280 -49.701 -16.546 54.731 1.00153.97 ATOM 75 CG1 VAL D1280 -49.919 -17.269 53.407 1.00154.88 ATOM 76 CG2 VAL D1280 -50.096 -17.428 55.911 1.00146.97 ATOM 77 N VAL D1281 -46.914 -17.803 55.939 1.00150.20 ATOM 78 CA VAL D1281 -45.927 -18.875 56.011 1.00150.42 ATOM 79 C VAL D1281 -46.536 -20.262 55.814 1.00152.16 ATOM 80 O VAL D1281 -47.466 -20.655 56.517 1.00152.40 ATOM 81 CB VAL D1281 -45.170 -18.850 57.354 1.00150.34 ATOM 82 CG1 VAL D1281 -44.171 -19.997 57.426 1.00149.43 ATOM 83 CG2 VAL D1281 -44.469 -17.513 57.543 1.00147.63 ATOM 84 N ARG D1282 -45.997 -20.997 54.849 1.00152.11 ATOM 85 CA ARG D1282 -46.374 -22.382 54.619 1.00151.32 ATOM 86 C ARG D1282 -45.106 -23.223 54.675 1.00152.24 ATOM 87 O ARG D1282 -44.206 -23.062 53.847 1.00152.06 ATOM 88 CB ARG D1282 -47.062 -22.528 53.258 1.00153.88 ATOM 89 CG ARG D1282 -47.682 -23.897 52.991 1.00154.84 ATOM 90 CD ARG D1282 -46.722 -24.828 52.258 1.00152.95 ATOM 91 NE ARG D1282 -46.212 -24.232 51.026 1.00146.02 ATOM 92 CZ ARG D1282 -46.783 -24.373 49.834 1.00142.31 ATOM 93 NH1 ARG D1282 -47.887 -25.094 49.707 1.00144.20 ATOM 94 NH2 ARG D1282 -46.249 -23.793 48.769 1.00140.07 ATOM 95 N ILE D1283 -45.032 -24.112 55.659 1.00150.96 ATOM 96 CA ILE D1283 -43.850 -24.944 55.846 1.00153.78 ATOM 97 C ILE D1283 -43.932 -26.243 55.051 1.00154.50 ATOM 98 O ILE D1283 -44.986 -26.878 54.985 1.00157.07 ATOM 99 CB ILE D1283 -43.598 -25.257 57.342 1.00153.20 ATOM 100 CG1 ILE D1283 -44.891 -25.698 58.034 1.00155.23 ATOM 101 CG2 ILE D1283 -43.017 -24.044 58.050 1.00147.16 ATOM 102 CD1 ILE D1283 -45.062 -27.201 58.152 1.00150.66 ATOM 103 N GLU D1284 -42.820 -26.624 54.431 1.00152.03 ATOM 104 CA GLU D1284 -42.738 -27.912 53.758 1.00154.10 ATOM 105 C GLU D1284 -41.508 -28.646 54.267 1.00157.62 ATOM 106 O GLU D1284 -40.379 -28.215 54.029 1.00154.18 ATOM 107 CB GLU D1284 -42.666 -27.720 52.240 1.00154.90 ATOM 108 CG GLU D1284 -42.743 -29.008 51.427 1.00151.91 ATOM 109 CD GLU D1284 -41.377 -29.559 51.060 1.00152.30 ATOM 110 OE1 GLU D1284 -40.369 -28.853 51.272 1.00151.64 ATOM 111 OE2 GLU D1284 -41.312 -30.700 50.555 1.00149.68 ATOM 112 N GLU D1285 -41.721 -29.751 54.974 1.00161.03 ATOM 113 CA GLU D1285 -40.599 -30.479 55.552 1.00160.00 ATOM 114 C GLU D1285 -40.601 -31.965 55.210 1.00159.09 ATOM 115 O GLU D1285 -41.462 -32.722 55.661 1.00157.58 ATOM 116 CB GLU D1285 -40.587 -30.295 57.072 1.00153.82 ATOM 117 CG GLU D1285 -39.370 -30.883 57.766 1.00154.84 ATOM 118 CD GLU D1285 -39.295 -30.500 59.232 1.00155.81 ATOM 119 OE1 GLU D1285 -38.325 -30.905 59.906 1.00155.94 ATOM 120 OE2 GLU D1285 -40.207 -29.792 59.709 1.00150.52 ATOM 121 N THR D1286 -39.623 -32.371 54.409 1.00157.75 ATOM 122 CA THR D1286 -39.291 -33.775 54.231 1.00157.21 ATOM 123 C THR D1286 -38.417 -34.183 55.412 1.00157.57 ATOM 124 O THR D1286 -37.767 -33.332 56.021 1.00157.70 ATOM 125 CB THR D1286 -38.534 -34.012 52.906 1.00154.99 ATOM 126 OG1 THR D1286 -39.177 -33.288 51.850 1.00154.42 ATOM 127 CG2 THR D1286 -38.501 -35.493 52.551 1.00150.92 ATOM 128 N GLU D1287 -38.409 -35.468 55.750 1.00156.63 ATOM 129 CA GLU D1287 -37.472 -35.979 56.746 1.00156.38 ATOM 130 C GLU D1287 -36.034 -35.731 56.290 1.00157.94 ATOM 131 O GLU D1287 -35.114 -35.653 57.105 1.00159.48 ATOM 132 CB GLU D1287 -37.696 -37.472 56.985 1.00155.62 ATOM 133 CG GLU D1287 -39.090 -37.824 57.475 1.00147.97 ATOM 134 CD GLU D1287 -39.249 -39.305 57.757 1.00140.05 ATOM 135 OE1 GLU D1287 -39.828 -40.015 56.908 1.00139.39 ATOM 136 OE2 GLU D1287 -38.796 -39.760 58.828 1.00133.37 ATOM 137 N GLU D1288 -35.854 -35.613 54.978 1.00154.70 ATOM 138 CA GLU D1288 -34.558 -35.309 54.386 1.00154.29 ATOM 139 C GLU D1288 -34.297 -33.804 54.336 1.00156.81 ATOM 140 O GLU D1288 -33.380 -33.302 54.986 1.00153.05 ATOM 141 CB GLU D1288 -34.473 -35.897 52.977 1.00155.93 ATOM 142 CG GLU D1288 -33.158 -35.627 52.269 1.00154.05 ATOM 143 CD GLU D1288 -33.235 -35.909 50.783 1.00156.46 ATOM 144 OE1 GLU D1288 -32.171 -35.977 50.132 1.00156.27 ATOM 145 OE2 GLU D1288 -34.362 -36.056 50.263 1.00156.79 ATOM 146 N LYS D1289 -35.110 -33.091 53.560 1.00159.92 ATOM 147 CA LYS D1289 -34.896 -31.666 53.309 1.00155.52 ATOM 148 C LYS D1289 -36.018 -30.794 53.877 1.00154.74 ATOM 149 O LYS D1289 -37.149 -31.249 54.043 1.00154.05 ATOM 150 CB LYS D1289 -34.753 -31.410 51.806 1.00148.70 ATOM 151 CG LYS D1289 -33.629 -32.193 51.146 1.00145.74 ATOM 152 CD LYS D1289 -33.674 -32.057 49.632 1.00150.83 ATOM 153 CE LYS D1289 -32.574 -32.874 48.970 1.00146.73 ATOM 154 NZ LYS D1289 -32.660 -32.829 47.484 1.00134.24 ATOM 155 N LEU D1290 -35.691 -29.539 54.170 1.00152.25 ATOM 156 CA LEU D1290 -36.653 -28.596 54.735 1.00150.61 ATOM 157 C LEU D1290 -36.695 -27.293 53.936 1.00148.71 ATOM 158 O LEU D1290 -35.662 -26.794 53.489 1.00145.24 ATOM 159 CB LEU D1290 -36.316 -28.314 56.203 1.00150.77 ATOM 160 CG LEU D1290 -37.032 -27.173 56.934 1.00148.02 ATOM 161 CD1 LEU D1290 -38.540 -27.354 56.916 1.00146.69 ATOM 162 CD2 LEU D1290 -36.526 -27.065 58.364 1.00147.45 ATOM 163 N SER D1291 -37.897 -26.750 53.758 1.00148.33 ATOM 164 CA SER D1291 -38.079 -25.499 53.029 1.00146.62 ATOM 165 C SER D1291 -39.264 -24.702 53.573 1.00145.69 ATOM 166 O SER D1291 -40.251 -25.275 54.044 1.00146.30 ATOM 167 CB SER D1291 -38.273 -25.769 51.534 1.00145.23 ATOM 168 OG SER D1291 -37.149 -26.435 50.984 1.00140.60 ATOM 169 N VAL D1292 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VAL D1294 -43.011 -18.279 51.729 1.00144.31 ATOM 188 CA VAL D1294 -43.755 -17.073 52.084 1.00148.64 ATOM 189 C VAL D1294 -44.624 -16.641 50.908 1.00151.82 ATOM 190 O VAL D1294 -44.114 -16.187 49.885 1.00149.10 ATOM 191 CB VAL D1294 -42.821 -15.919 52.488 1.00141.78 ATOM 192 CG1 VAL D1294 -43.632 -14.673 52.817 1.00138.52 ATOM 193 CG2 VAL D1294 -41.959 -16.328 53.673 1.00136.49 ATOM 194 N GLU D1295 -45.938 -16.771 51.063 1.00154.42 ATOM 195 CA GLU D1295 -46.853 -16.598 49.938 1.00152.95 ATOM 196 C GLU D1295 -47.828 -15.435 50.105 1.00152.53 ATOM 197 O GLU D1295 -48.592 -15.381 51.068 1.00150.15 ATOM 198 CB GLU D1295 -47.626 -17.896 49.691 1.00155.90 ATOM 199 CG GLU D1295 -46.742 -19.077 49.322 1.00156.01 ATOM 200 CD GLU D1295 -47.442 -20.410 49.499 1.00156.71 ATOM 201 OE1 GLU D1295 -48.463 -20.455 50.219 1.00157.70 ATOM 202 OE2 GLU D1295 -46.972 -21.412 48.919 1.00151.66 ATOM 203 N SER D1296 -47.790 -14.508 49.152 1.00155.27 ATOM 204 CA SER D1296 -48.747 -13.410 49.095 1.00154.81 ATOM 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ATOM 474 CD1 ILE D1330 -33.114 -9.258 61.716 1.00 59.94 TER