HEADER TRANSCRIPTION 31-DEC-69 6KQL TITLE Thermus thermophilus initial transcription complex comprising sigma A TITLE 2 and 5'-triphosphate RNA of 4 nt COMPND MOL_ID: 3; COMPND 2 MOLECULE: DNA-directed RNA polymerase subunit beta'; COMPND 3 CHAIN: D; COMPND 4 EC: 2.7.7.6; EXPDTA X-RAY DIFFRACTION REMARK 2 RESOLUTION. 2.89 ANGSTORMS DBREF 6KQL D 1 1524 UNP Q8RQE8 RPOC_THET8 1 1524 SEQRES 1 D 91 ALA ASP CYS GLY THR THR ASN TYR ILE SER VAL PRO LEU SEQRES 2 D 91 PHE GLN PRO ASP GLU VAL THR ARG SER LEU ARG LEU ARG SEQRES 3 D 91 LYS ARG ALA ASP ILE GLU ALA GLY LEU TYR GLY ARG VAL SEQRES 4 D 91 LEU ALA ARG GLU VAL GLU VAL LEU GLY VAL ARG LEU GLU SEQRES 5 D 91 GLU GLY ARG TYR LEU SER MET ASP ASP VAL HIS LEU LEU SEQRES 6 D 91 ILE LYS ALA ALA GLU ALA GLY GLU ILE GLN GLU VAL PRO SEQRES 7 D 91 VAL ARG SER PRO LEU THR CYS GLN THR ARG TYR GLY VAL ATOM 1 N ALA D1110 -28.228 25.707 66.300 1.00 56.94 ATOM 2 CA ALA D1110 -29.247 25.473 67.315 1.00 48.62 ATOM 3 C ALA D1110 -30.339 24.511 66.856 1.00 54.64 ATOM 4 O ALA D1110 -30.725 23.595 67.585 1.00 56.13 ATOM 5 CB ALA D1110 -29.851 26.788 67.758 1.00 50.69 ATOM 6 N ASP D1111 -30.862 24.748 65.659 1.00 52.23 ATOM 7 CA ASP D1111 -31.902 23.890 65.110 1.00 52.66 ATOM 8 C ASP D1111 -31.765 23.777 63.596 1.00 49.21 ATOM 9 O ASP D1111 -31.573 24.781 62.915 1.00 56.63 ATOM 10 CB ASP D1111 -33.281 24.436 65.494 1.00 55.10 ATOM 11 CG ASP D1111 -34.403 23.463 65.197 1.00 59.86 ATOM 12 OD1 ASP D1111 -34.146 22.241 65.167 1.00 62.97 ATOM 13 OD2 ASP D1111 -35.549 23.920 64.999 1.00 61.94 ATOM 14 N CYS D1112 -31.878 22.561 63.073 1.00 52.74 ATOM 15 CA CYS D1112 -31.855 22.341 61.630 1.00 47.98 ATOM 16 C CYS D1112 -33.270 22.448 61.085 1.00 56.43 ATOM 17 O CYS D1112 -33.482 22.469 59.872 1.00 54.27 ATOM 18 CB CYS D1112 -31.273 20.968 61.297 1.00 44.34 ATOM 19 SG CYS D1112 -32.234 19.581 61.944 1.00 48.66 ATOM 20 N GLY D1113 -34.237 22.500 61.997 1.00 50.49 ATOM 21 CA GLY D1113 -35.627 22.692 61.636 1.00 51.97 ATOM 22 C GLY D1113 -36.328 21.473 61.068 1.00 55.86 ATOM 23 O GLY D1113 -37.379 21.596 60.442 1.00 66.47 ATOM 24 N THR D1114 -35.760 20.293 61.283 1.00 55.38 ATOM 25 CA THR D1114 -36.373 19.074 60.769 1.00 58.84 ATOM 26 C THR D1114 -37.684 18.759 61.484 1.00 54.55 ATOM 27 O THR D1114 -37.838 19.024 62.674 1.00 57.52 ATOM 28 CB THR D1114 -35.427 17.858 60.868 1.00 56.05 ATOM 29 OG1 THR D1114 -36.052 16.719 60.265 1.00 58.39 ATOM 30 CG2 THR D1114 -35.101 17.535 62.318 1.00 53.40 ATOM 31 N THR D1115 -38.640 18.223 60.737 1.00 60.69 ATOM 32 CA THR D1115 -39.883 17.734 61.320 1.00 55.30 ATOM 33 C THR D1115 -39.798 16.228 61.561 1.00 55.82 ATOM 34 O THR D1115 -40.740 15.615 62.061 1.00 53.07 ATOM 35 CB THR D1115 -41.083 18.056 60.416 1.00 61.46 ATOM 36 OG1 THR D1115 -40.789 17.654 59.071 1.00 66.50 ATOM 37 CG2 THR D1115 -41.364 19.549 60.432 1.00 55.59 ATOM 38 N ASN D1116 -38.667 15.639 61.176 1.00 60.01 ATOM 39 CA ASN D1116 -38.405 14.214 61.379 1.00 52.60 ATOM 40 C ASN D1116 -37.948 13.889 62.800 1.00 52.61 ATOM 41 O ASN D1116 -37.391 14.741 63.493 1.00 53.05 ATOM 42 CB ASN D1116 -37.373 13.704 60.372 1.00 54.88 ATOM 43 CG ASN D1116 -37.801 13.922 58.930 1.00 65.06 ATOM 44 OD1 ASN D1116 -38.992 13.895 58.612 1.00 63.12 ATOM 45 ND2 ASN D1116 -36.826 14.139 58.047 1.00 57.25 ATOM 46 N TYR D1117 -38.179 12.651 63.227 1.00 46.84 ATOM 47 CA TYR D1117 -37.789 12.216 64.564 1.00 46.59 ATOM 48 C TYR D1117 -37.816 10.697 64.668 1.00 47.52 ATOM 49 O TYR D1117 -38.130 10.014 63.695 1.00 46.05 ATOM 50 CB TYR D1117 -38.722 12.822 65.614 1.00 51.79 ATOM 51 CG TYR D1117 -40.187 12.514 65.398 1.00 50.20 ATOM 52 CD1 TYR D1117 -40.796 11.449 66.048 1.00 48.15 ATOM 53 CD2 TYR D1117 -40.960 13.288 64.541 1.00 49.12 ATOM 54 CE1 TYR D1117 -42.131 11.163 65.849 1.00 51.58 ATOM 55 CE2 TYR D1117 -42.294 13.010 64.336 1.00 53.68 ATOM 56 CZ TYR D1117 -42.878 11.947 64.993 1.00 56.19 ATOM 57 OH TYR D1117 -44.212 11.669 64.792 1.00 62.99 ATOM 58 N ILE D1118 -37.488 10.168 65.845 1.00 42.06 ATOM 59 CA ILE D1118 -37.587 8.726 66.058 1.00 38.46 ATOM 60 C ILE D1118 -38.470 8.400 67.260 1.00 46.33 ATOM 61 O ILE D1118 -38.631 9.216 68.162 1.00 50.90 ATOM 62 CB ILE D1118 -36.202 8.053 66.226 1.00 41.31 ATOM 63 CG1 ILE D1118 -35.557 8.448 67.554 1.00 42.70 ATOM 64 CG2 ILE D1118 -35.289 8.392 65.056 1.00 39.95 ATOM 65 CD1 ILE D1118 -34.284 7.697 67.854 1.00 39.91 ATOM 66 N SER D1119 -39.055 7.210 67.268 1.00 45.51 ATOM 67 CA SER D1119 -39.889 6.802 68.390 1.00 44.32 ATOM 68 C SER D1119 -39.201 5.748 69.237 1.00 44.51 ATOM 69 O SER D1119 -39.039 4.607 68.810 1.00 52.37 ATOM 70 CB SER D1119 -41.231 6.265 67.896 1.00 48.23 ATOM 71 OG SER D1119 -42.005 7.300 67.320 1.00 57.50 ATOM 72 N VAL D1120 -38.810 6.125 70.447 1.00 39.59 ATOM 73 CA VAL D1120 -38.197 5.168 71.352 1.00 39.07 ATOM 74 C VAL D1120 -39.282 4.330 72.014 1.00 50.34 ATOM 75 O VAL D1120 -40.139 4.864 72.724 1.00 52.34 ATOM 76 CB VAL D1120 -37.353 5.866 72.425 1.00 41.65 ATOM 77 CG1 VAL D1120 -36.640 4.835 73.288 1.00 41.42 ATOM 78 CG2 VAL D1120 -36.353 6.810 71.775 1.00 40.56 ATOM 79 N PRO D1121 -39.267 3.011 71.764 1.00 53.33 ATOM 80 CA PRO D1121 -40.262 2.123 72.368 1.00 50.87 ATOM 81 C PRO D1121 -40.017 1.960 73.861 1.00 52.23 ATOM 82 O PRO D1121 -38.868 1.835 74.281 1.00 54.13 ATOM 83 CB PRO D1121 -40.018 0.796 71.649 1.00 50.07 ATOM 84 CG PRO D1121 -38.586 0.836 71.280 1.00 48.12 ATOM 85 CD PRO D1121 -38.298 2.271 70.939 1.00 50.07 ATOM 86 N LEU D1122 -41.084 1.982 74.650 1.00 51.90 ATOM 87 CA LEU D1122 -40.985 1.688 76.073 1.00 55.22 ATOM 88 C LEU D1122 -41.256 0.209 76.327 1.00 59.17 ATOM 89 O LEU D1122 -41.051 -0.295 77.433 1.00 57.73 ATOM 90 CB LEU D1122 -41.957 2.563 76.867 1.00 55.72 ATOM 91 CG LEU D1122 -41.711 4.069 76.746 1.00 53.64 ATOM 92 CD1 LEU D1122 -42.879 4.868 77.296 1.00 51.03 ATOM 93 CD2 LEU D1122 -40.424 4.449 77.454 1.00 45.41 ATOM 94 N PHE D1123 -41.707 -0.483 75.286 1.00 57.29 ATOM 95 CA PHE D1123 -42.094 -1.882 75.401 1.00 61.59 ATOM 96 C PHE D1123 -41.409 -2.728 74.338 1.00 64.01 ATOM 97 O PHE D1123 -41.174 -2.268 73.221 1.00 63.05 ATOM 98 CB PHE D1123 -43.615 -2.034 75.272 1.00 67.09 ATOM 99 CG PHE D1123 -44.383 -1.500 76.447 1.00 60.82 ATOM 100 CD1 PHE D1123 -44.585 -2.282 77.573 1.00 65.30 ATOM 101 CD2 PHE D1123 -44.912 -0.220 76.423 1.00 60.73 ATOM 102 CE1 PHE D1123 -45.292 -1.795 78.660 1.00 61.75 ATOM 103 CE2 PHE D1123 -45.619 0.274 77.508 1.00 63.17 ATOM 104 CZ PHE D1123 -45.810 -0.517 78.627 1.00 58.06 ATOM 105 N GLN D1124 -41.094 -3.969 74.691 1.00 73.88 ATOM 106 CA GLN D1124 -40.519 -4.907 73.737 1.00 83.24 ATOM 107 C GLN D1124 -41.223 -6.258 73.805 1.00 90.25 ATOM 108 O GLN D1124 -41.690 -6.668 74.874 1.00 91.37 ATOM 109 CB GLN D1124 -39.012 -5.066 73.961 1.00 85.79 ATOM 110 CG GLN D1124 -38.619 -5.594 75.329 1.00 87.58 ATOM 111 CD GLN D1124 -37.112 -5.634 75.520 1.00 92.86 ATOM 112 OE1 GLN D1124 -36.619 -5.923 76.612 1.00 93.35 ATOM 113 NE2 GLN D1124 -36.373 -5.342 74.452 1.00 86.44 ATOM 114 N PRO D1125 -41.324 -6.942 72.652 1.00 97.46 ATOM 115 CA PRO D1125 -41.927 -8.276 72.581 1.00103.11 ATOM 116 C PRO D1125 -41.159 -9.272 73.440 1.00110.57 ATOM 117 O PRO D1125 -39.932 -9.331 73.365 1.00111.51 ATOM 118 CB PRO D1125 -41.781 -8.643 71.101 1.00 99.49 ATOM 119 CG PRO D1125 -41.695 -7.341 70.394 1.00 89.42 ATOM 120 CD PRO D1125 -40.942 -6.441 71.320 1.00 90.52 ATOM 121 N ASP D1126 -41.880 -10.039 74.250 1.00122.60 ATOM 122 CA ASP D1126 -41.261 -11.051 75.095 1.00135.69 ATOM 123 C ASP D1126 -40.747 -12.190 74.219 1.00149.21 ATOM 124 O ASP D1126 -41.243 -12.396 73.110 1.00150.03 ATOM 125 CB ASP D1126 -42.275 -11.575 76.114 1.00138.16 ATOM 126 CG ASP D1126 -41.618 -12.118 77.367 1.00141.86 ATOM 127 OD1 ASP D1126 -41.387 -11.329 78.307 1.00135.58 ATOM 128 OD2 ASP D1126 -41.335 -13.332 77.414 1.00149.73 ATOM 129 N GLU D1127 -39.748 -12.922 74.705 1.00152.52 ATOM 130 CA GLU D1127 -39.200 -14.044 73.947 1.00157.92 ATOM 131 C GLU D1127 -40.208 -15.183 73.825 1.00160.39 ATOM 132 O GLU D1127 -40.120 -16.010 72.917 1.00161.64 ATOM 133 CB GLU D1127 -37.889 -14.541 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-13.678 69.550 1.00148.89 ATOM 152 N ARG D1130 -45.565 -13.874 73.856 1.00150.22 ATOM 153 CA ARG D1130 -46.891 -13.877 74.454 1.00149.13 ATOM 154 C ARG D1130 -47.514 -12.488 74.374 1.00149.36 ATOM 155 O ARG D1130 -48.681 -12.340 74.008 1.00148.91 ATOM 156 CB ARG D1130 -46.816 -14.331 75.912 1.00144.43 ATOM 157 CG ARG D1130 -48.110 -14.919 76.445 1.00142.45 ATOM 158 CD ARG D1130 -48.133 -14.910 77.962 1.00141.60 ATOM 159 NE ARG D1130 -48.313 -13.561 78.491 1.00137.72 ATOM 160 CZ ARG D1130 -48.334 -13.261 79.785 1.00141.12 ATOM 161 NH1 ARG D1130 -48.506 -12.005 80.173 1.00140.02 ATOM 162 NH2 ARG D1130 -48.180 -14.216 80.692 1.00143.05 ATOM 163 N SER D1131 -46.721 -11.476 74.713 1.00144.08 ATOM 164 CA SER D1131 -47.190 -10.095 74.726 1.00135.63 ATOM 165 C SER D1131 -46.019 -9.121 74.762 1.00123.08 ATOM 166 O SER D1131 -44.858 -9.525 74.684 1.00126.63 ATOM 167 CB SER D1131 -48.103 -9.847 75.931 1.00127.27 ATOM 168 OG SER D1131 -47.393 -9.985 77.149 1.00117.00 ATOM 169 N LEU D1132 -46.335 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