HEADER TRANSCRIPTION 31-DEC-69 6KQM TITLE Thermus thermophilus initial transcription complex comprising sigma A TITLE 2 and 5'-triphosphate RNA of 5 nt COMPND MOL_ID: 3; COMPND 2 MOLECULE: DNA-directed RNA polymerase subunit beta'; COMPND 3 CHAIN: D; COMPND 4 EC: 2.7.7.6; EXPDTA X-RAY DIFFRACTION REMARK 2 RESOLUTION. 3.20 ANGSTORMS DBREF 6KQM D 1 1524 UNP Q8RQE8 RPOC_THET8 1 1524 SEQRES 1 D 61 ALA LYS ALA VAL ILE SER GLU ILE ASP GLY VAL VAL ARG SEQRES 2 D 61 ILE GLU GLU THR GLU GLU LYS LEU SER VAL PHE VAL GLU SEQRES 3 D 61 SER GLU GLY PHE SER LYS GLU TYR LYS LEU PRO LYS GLU SEQRES 4 D 61 ALA ARG LEU LEU VAL LYS ASP GLY ASP TYR VAL GLU ALA SEQRES 5 D 61 GLY GLN PRO LEU THR ARG GLY ALA ILE ATOM 1 N ALA D1270 -22.999 -17.378 61.083 1.00 70.79 ATOM 2 CA ALA D1270 -24.254 -18.090 61.249 1.00 62.73 ATOM 3 C ALA D1270 -25.358 -17.067 61.059 1.00 60.51 ATOM 4 O ALA D1270 -25.605 -16.237 61.934 1.00 55.06 ATOM 5 CB ALA D1270 -24.332 -18.702 62.635 1.00 56.70 ATOM 6 N LYS D1271 -26.050 -17.157 59.929 1.00 56.78 ATOM 7 CA LYS D1271 -26.947 -16.089 59.512 1.00 48.83 ATOM 8 C LYS D1271 -28.409 -16.502 59.484 1.00 48.57 ATOM 9 O LYS D1271 -28.767 -17.545 58.938 1.00 59.41 ATOM 10 CB LYS D1271 -26.527 -15.535 58.146 1.00 47.02 ATOM 11 CG LYS D1271 -27.568 -14.628 57.502 1.00 46.16 ATOM 12 CD LYS D1271 -26.969 -13.758 56.409 1.00 35.71 ATOM 13 CE LYS D1271 -26.369 -14.584 55.290 1.00 30.84 ATOM 14 NZ LYS D1271 -25.754 -13.713 54.252 1.00 34.08 ATOM 15 N ALA D1272 -29.249 -15.669 60.084 1.00 46.87 ATOM 16 CA ALA D1272 -30.687 -15.864 60.033 1.00 55.58 ATOM 17 C ALA D1272 -31.200 -15.540 58.638 1.00 55.54 ATOM 18 O ALA D1272 -30.688 -14.639 57.973 1.00 52.33 ATOM 19 CB ALA D1272 -31.366 -14.979 61.054 1.00 55.97 ATOM 20 N VAL D1273 -32.214 -16.277 58.199 1.00 52.49 ATOM 21 CA VAL D1273 -32.843 -16.003 56.915 1.00 54.77 ATOM 22 C VAL D1273 -34.098 -15.158 57.115 1.00 56.52 ATOM 23 O VAL D1273 -34.956 -15.491 57.932 1.00 57.36 ATOM 24 CB VAL D1273 -33.205 -17.300 56.179 1.00 58.46 ATOM 25 CG1 VAL D1273 -33.582 -16.998 54.736 1.00 61.83 ATOM 26 CG2 VAL D1273 -32.041 -18.277 56.235 1.00 48.10 ATOM 27 N ILE D1274 -34.197 -14.061 56.370 1.00 58.23 ATOM 28 CA ILE D1274 -35.322 -13.139 56.506 1.00 62.48 ATOM 29 C ILE D1274 -36.155 -13.085 55.226 1.00 62.52 ATOM 30 O ILE D1274 -35.652 -13.368 54.138 1.00 64.01 ATOM 31 CB ILE D1274 -34.850 -11.715 56.887 1.00 59.96 ATOM 32 CG1 ILE D1274 -34.054 -11.080 55.743 1.00 51.93 ATOM 33 CG2 ILE D1274 -34.018 -11.753 58.160 1.00 50.71 ATOM 34 CD1 ILE D1274 -33.612 -9.657 56.018 1.00 31.89 ATOM 35 N SER D1275 -37.430 -12.731 55.361 1.00 64.37 ATOM 36 CA SER D1275 -38.342 -12.699 54.219 1.00 68.38 ATOM 37 C SER D1275 -38.146 -11.450 53.368 1.00 62.16 ATOM 38 O SER D1275 -38.008 -10.346 53.894 1.00 60.80 ATOM 39 CB SER D1275 -39.798 -12.785 54.685 1.00 71.55 ATOM 40 OG SER D1275 -40.056 -14.015 55.340 1.00 89.07 ATOM 41 N GLU D1276 -38.141 -11.633 52.051 1.00 64.74 ATOM 42 CA GLU D1276 -37.993 -10.517 51.124 1.00 66.34 ATOM 43 C GLU D1276 -39.298 -9.741 50.999 1.00 72.00 ATOM 44 O GLU D1276 -39.294 -8.521 50.834 1.00 68.20 ATOM 45 CB GLU D1276 -37.540 -11.012 49.750 1.00 66.63 ATOM 46 CG GLU D1276 -36.220 -11.763 49.769 1.00 72.03 ATOM 47 CD GLU D1276 -35.724 -12.108 48.379 1.00 77.46 ATOM 48 OE1 GLU D1276 -36.096 -11.398 47.422 1.00 76.13 ATOM 49 OE2 GLU D1276 -34.964 -13.089 48.245 1.00 85.00 ATOM 50 N ILE D1277 -40.413 -10.461 51.078 1.00 81.33 ATOM 51 CA ILE D1277 -41.734 -9.848 51.010 1.00 82.17 ATOM 52 C ILE D1277 -42.613 -10.311 52.167 1.00 83.23 ATOM 53 O ILE D1277 -42.165 -11.049 53.046 1.00 82.79 ATOM 54 CB ILE D1277 -42.445 -10.181 49.686 1.00 83.92 ATOM 55 CG1 ILE D1277 -42.554 -11.697 49.509 1.00 94.36 ATOM 56 CG2 ILE D1277 -41.707 -9.556 48.512 1.00 86.20 ATOM 57 CD1 ILE D1277 -43.258 -12.117 48.236 1.00102.84 ATOM 58 N ASP D1278 -43.868 -9.872 52.158 1.00 84.70 ATOM 59 CA ASP D1278 -44.830 -10.292 53.167 1.00 94.66 ATOM 60 C ASP D1278 -45.481 -11.598 52.724 1.00100.66 ATOM 61 O ASP D1278 -45.176 -12.113 51.648 1.00100.16 ATOM 62 CB ASP D1278 -45.896 -9.213 53.364 1.00 96.99 ATOM 63 CG ASP D1278 -45.301 -7.824 53.511 1.00 94.46 ATOM 64 OD1 ASP D1278 -44.963 -7.437 54.650 1.00 96.67 ATOM 65 OD2 ASP D1278 -45.173 -7.119 52.487 1.00 80.00 ATOM 66 N GLY D1279 -46.375 -12.136 53.548 1.00 95.06 ATOM 67 CA GLY D1279 -47.074 -13.357 53.190 1.00 99.60 ATOM 68 C GLY D1279 -47.442 -14.234 54.370 1.00102.68 ATOM 69 O GLY D1279 -47.425 -13.794 55.518 1.00100.33 ATOM 70 N VAL D1280 -47.778 -15.486 54.078 1.00105.71 ATOM 71 CA VAL D1280 -48.132 -16.450 55.112 1.00108.51 ATOM 72 C VAL D1280 -47.144 -17.620 55.101 1.00109.53 ATOM 73 O VAL D1280 -46.625 -17.999 54.047 1.00103.90 ATOM 74 CB VAL D1280 -49.590 -16.948 54.942 1.00113.69 ATOM 75 CG1 VAL D1280 -49.740 -17.764 53.663 1.00106.26 ATOM 76 CG2 VAL D1280 -50.039 -17.747 56.160 1.00114.30 ATOM 77 N VAL D1281 -46.875 -18.175 56.280 1.00109.48 ATOM 78 CA VAL D1281 -45.886 -19.238 56.425 1.00111.20 ATOM 79 C VAL D1281 -46.451 -20.627 56.135 1.00113.73 ATOM 80 O VAL D1281 -47.408 -21.068 56.770 1.00109.59 ATOM 81 CB VAL D1281 -45.263 -19.237 57.836 1.00112.82 ATOM 82 CG1 VAL D1281 -44.361 -20.450 58.022 1.00118.12 ATOM 83 CG2 VAL D1281 -44.491 -17.950 58.075 1.00107.62 ATOM 84 N ARG D1282 -45.846 -21.308 55.169 1.00107.83 ATOM 85 CA ARG D1282 -46.180 -22.692 54.871 1.00103.03 ATOM 86 C ARG D1282 -44.889 -23.499 54.899 1.00108.97 ATOM 87 O ARG D1282 -44.004 -23.294 54.068 1.00112.00 ATOM 88 CB ARG D1282 -46.852 -22.795 53.498 1.00108.22 ATOM 89 CG ARG D1282 -47.424 -24.169 53.154 1.00108.90 ATOM 90 CD ARG D1282 -46.425 -25.037 52.393 1.00105.58 ATOM 91 NE ARG D1282 -45.934 -24.387 51.181 1.00 97.78 ATOM 92 CZ ARG D1282 -46.473 -24.541 49.975 1.00 94.15 ATOM 93 NH1 ARG D1282 -47.528 -25.327 49.813 1.00 96.23 ATOM 94 NH2 ARG D1282 -45.956 -23.909 48.930 1.00 91.65 ATOM 95 N ILE D1283 -44.780 -24.414 55.855 1.00110.38 ATOM 96 CA ILE D1283 -43.570 -25.216 55.994 1.00113.42 ATOM 97 C ILE D1283 -43.627 -26.490 55.158 1.00119.58 ATOM 98 O ILE D1283 -44.668 -27.142 55.070 1.00120.92 ATOM 99 CB ILE D1283 -43.270 -25.559 57.473 1.00104.71 ATOM 100 CG1 ILE D1283 -44.567 -25.754 58.263 1.00108.37 ATOM 101 CG2 ILE D1283 -42.449 -24.456 58.115 1.00 93.32 ATOM 102 CD1 ILE D1283 -45.150 -27.151 58.192 1.00101.94 ATOM 103 N GLU D1284 -42.506 -26.832 54.531 1.00117.79 ATOM 104 CA GLU D1284 -42.410 -28.086 53.795 1.00123.71 ATOM 105 C GLU D1284 -41.190 -28.846 54.296 1.00127.15 ATOM 106 O GLU D1284 -40.055 -28.416 54.097 1.00124.10 ATOM 107 CB GLU D1284 -42.305 -27.817 52.290 1.00118.48 ATOM 108 CG GLU D1284 -42.433 -29.054 51.408 1.00113.87 ATOM 109 CD GLU D1284 -41.098 -29.713 51.115 1.00119.00 ATOM 110 OE1 GLU D1284 -40.053 -29.050 51.281 1.00114.18 ATOM 111 OE2 GLU D1284 -41.093 -30.896 50.716 1.00125.97 ATOM 112 N GLU D1285 -41.428 -29.978 54.950 1.00129.61 ATOM 113 CA GLU D1285 -40.338 -30.738 55.549 1.00127.04 ATOM 114 C GLU D1285 -40.364 -32.221 55.184 1.00121.74 ATOM 115 O GLU D1285 -41.286 -32.949 55.553 1.00112.92 ATOM 116 CB GLU D1285 -40.342 -30.562 57.073 1.00119.00 ATOM 117 CG GLU D1285 -39.072 -31.037 57.762 1.00118.47 ATOM 118 CD GLU D1285 -39.030 -30.667 59.234 1.00121.37 ATOM 119 OE1 GLU D1285 -37.976 -30.878 59.872 1.00117.90 ATOM 120 OE2 GLU D1285 -40.050 -30.165 59.752 1.00112.61 ATOM 121 N THR D1286 -39.341 -32.657 54.458 1.00123.79 ATOM 122 CA THR D1286 -39.096 -34.076 54.254 1.00117.03 ATOM 123 C THR D1286 -38.243 -34.500 55.441 1.00115.98 ATOM 124 O THR D1286 -37.927 -33.679 56.300 1.00119.82 ATOM 125 CB THR D1286 -38.332 -34.336 52.937 1.00114.85 ATOM 126 OG1 THR D1286 -38.747 -33.388 51.946 1.00122.49 ATOM 127 CG2 THR D1286 -38.591 -35.748 52.420 1.00105.09 ATOM 128 N GLU D1287 -37.867 -35.770 55.504 1.00119.47 ATOM 129 CA GLU D1287 -36.998 -36.218 56.582 1.00126.44 ATOM 130 C GLU D1287 -35.546 -35.814 56.319 1.00120.27 ATOM 131 O GLU D1287 -34.807 -35.488 57.248 1.00113.39 ATOM 132 CB GLU D1287 -37.140 -37.727 56.810 1.00132.63 ATOM 133 CG GLU D1287 -38.534 -38.136 57.288 1.00128.54 ATOM 134 CD GLU D1287 -38.617 -39.590 57.717 1.00121.25 ATOM 135 OE1 GLU D1287 -38.590 -40.476 56.836 1.00114.45 ATOM 136 OE2 GLU D1287 -38.713 -39.846 58.936 1.00115.09 ATOM 137 N GLU D1288 -35.142 -35.835 55.052 1.00112.37 ATOM 138 CA GLU D1288 -33.792 -35.419 54.679 1.00111.45 ATOM 139 C GLU D1288 -33.682 -33.969 54.192 1.00118.47 ATOM 140 O GLU D1288 -32.580 -33.492 53.916 1.00114.23 ATOM 141 CB GLU D1288 -33.218 -36.360 53.616 1.00102.81 ATOM 142 CG GLU D1288 -33.926 -36.279 52.274 1.00106.00 ATOM 143 CD GLU D1288 -33.171 -37.001 51.176 1.00106.96 ATOM 144 OE1 GLU D1288 -32.109 -37.587 51.471 1.00108.47 ATOM 145 OE2 GLU D1288 -33.638 -36.981 50.017 1.00100.98 ATOM 146 N LYS D1289 -34.810 -33.267 54.090 1.00122.60 ATOM 147 CA LYS D1289 -34.817 -31.910 53.529 1.00118.28 ATOM 148 C LYS D1289 -35.819 -30.971 54.208 1.00118.03 ATOM 149 O LYS D1289 -36.833 -31.413 54.746 1.00118.60 ATOM 150 CB LYS D1289 -35.078 -31.950 52.017 1.00102.50 ATOM 151 CG LYS D1289 -33.913 -32.485 51.194 1.00 95.03 ATOM 152 CD LYS D1289 -34.285 -32.665 49.732 1.00 87.23 ATOM 153 CE LYS D1289 -33.128 -33.271 48.948 1.00 75.90 ATOM 154 NZ LYS D1289 -33.466 -33.508 47.517 1.00 49.64 ATOM 155 N LEU D1290 -35.526 -29.673 54.171 1.00115.54 ATOM 156 CA LEU D1290 -36.372 -28.669 54.814 1.00111.11 ATOM 157 C LEU D1290 -36.449 -27.385 53.985 1.00106.01 ATOM 158 O LEU D1290 -35.439 -26.914 53.460 1.00100.31 ATOM 159 CB LEU D1290 -35.842 -28.357 56.217 1.00107.63 ATOM 160 CG LEU D1290 -36.840 -28.097 57.350 1.00108.92 ATOM 161 CD1 LEU D1290 -36.107 -28.008 58.681 1.00112.21 ATOM 162 CD2 LEU D1290 -37.663 -26.839 57.111 1.00 94.91 ATOM 163 N SER D1291 -37.652 -26.829 53.868 1.00104.54 ATOM 164 CA SER D1291 -37.858 -25.559 53.173 1.00105.02 ATOM 165 C SER D1291 -39.019 -24.763 53.770 1.00109.02 ATOM 166 O SER D1291 -40.019 -25.336 54.214 1.00105.63 ATOM 167 CB SER D1291 -38.092 -25.785 51.677 1.00 96.92 ATOM 168 OG SER D1291 -36.914 -26.243 51.036 1.00 89.30 ATOM 169 N VAL D1292 -38.878 -23.440 53.774 1.00112.74 ATOM 170 CA VAL D1292 -39.923 -22.550 54.274 1.00109.33 ATOM 171 C VAL D1292 -40.488 -21.699 53.141 1.00103.56 ATOM 172 O VAL D1292 -39.746 -21.009 52.440 1.00 96.54 ATOM 173 CB VAL D1292 -39.400 -21.621 55.390 1.00 96.86 ATOM 174 CG1 VAL D1292 -40.523 -20.734 55.915 1.00 78.55 ATOM 175 CG2 VAL D1292 -38.789 -22.437 56.517 1.00100.63 ATOM 176 N PHE D1293 -41.805 -21.753 52.966 1.00102.51 ATOM 177 CA PHE D1293 -42.464 -21.027 51.887 1.00 97.85 ATOM 178 C PHE D1293 -43.269 -19.840 52.403 1.00 95.70 ATOM 179 O PHE D1293 -44.217 -20.008 53.168 1.00 93.21 ATOM 180 CB PHE D1293 -43.383 -21.960 51.093 1.00102.10 ATOM 181 CG PHE D1293 -42.652 -22.909 50.185 1.00100.45 ATOM 182 CD1 PHE D1293 -42.024 -24.034 50.695 1.00103.01 ATOM 183 CD2 PHE D1293 -42.606 -22.683 48.819 1.00 91.79 ATOM 184 CE1 PHE D1293 -41.355 -24.908 49.861 1.00104.39 ATOM 185 CE2 PHE D1293 -41.941 -23.554 47.980 1.00 90.97 ATOM 186 CZ PHE D1293 -41.315 -24.669 48.501 1.00101.32 ATOM 187 N VAL D1294 -42.884 -18.640 51.982 1.00101.16 ATOM 188 CA VAL D1294 -43.672 -17.449 52.271 1.00111.71 ATOM 189 C VAL D1294 -44.592 -17.177 51.087 1.00114.88 ATOM 190 O VAL D1294 -44.130 -16.841 49.995 1.00111.20 ATOM 191 CB VAL D1294 -42.778 -16.219 52.529 1.00103.63 ATOM 192 CG1 VAL D1294 -43.630 -14.981 52.776 1.00 94.15 ATOM 193 CG2 VAL D1294 -41.849 -16.476 53.706 1.00 96.05 ATOM 194 N GLU D1295 -45.896 -17.325 51.305 1.00112.02 ATOM 195 CA GLU D1295 -46.860 -17.195 50.218 1.00106.34 ATOM 196 C GLU D1295 -47.672 -15.908 50.324 1.00105.12 ATOM 197 O GLU D1295 -48.443 -15.724 51.266 1.00105.06 ATOM 198 CB GLU D1295 -47.794 -18.408 50.175 1.00108.52 ATOM 199 CG GLU D1295 -47.780 -19.164 48.849 1.00113.40 ATOM 200 CD GLU D1295 -46.582 -20.087 48.704 1.00109.60 ATOM 201 OE1 GLU D1295 -46.505 -21.085 49.452 1.00107.89 ATOM 202 OE2 GLU D1295 -45.719 -19.818 47.840 1.00 89.74 ATOM 203 N SER D1296 -47.491 -15.023 49.350 1.00110.20 ATOM 204 CA SER D1296 -48.235 -13.770 49.293 1.00111.91 ATOM 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ATOM 474 CD1 ILE D1330 -33.000 -9.512 62.029 1.00 19.01 TER