HEADER TRANSCRIPTION 31-DEC-69 6KQN TITLE Thermus thermophilus initial transcription complex comprising sigma A TITLE 2 and 5'-triphosphate RNA of 6 nt COMPND MOL_ID: 3; COMPND 2 MOLECULE: DNA-directed RNA polymerase subunit beta'; COMPND 3 CHAIN: D; COMPND 4 EC: 2.7.7.6; EXPDTA X-RAY DIFFRACTION REMARK 2 RESOLUTION. 3.49 ANGSTORMS DBREF 6KQN D 1 1524 UNP Q8RQE8 RPOC_THET8 1 1524 SEQRES 1 D 91 ALA ASP CYS GLY THR THR ASN TYR ILE SER VAL PRO LEU SEQRES 2 D 91 PHE GLN PRO ASP GLU VAL THR ARG SER LEU ARG LEU ARG SEQRES 3 D 91 LYS ARG ALA ASP ILE GLU ALA GLY LEU TYR GLY ARG VAL SEQRES 4 D 91 LEU ALA ARG GLU VAL GLU VAL LEU GLY VAL ARG LEU GLU SEQRES 5 D 91 GLU GLY ARG TYR LEU SER MET ASP ASP VAL HIS LEU LEU SEQRES 6 D 91 ILE LYS ALA ALA GLU ALA GLY GLU ILE GLN GLU VAL PRO SEQRES 7 D 91 VAL ARG SER PRO LEU THR CYS GLN THR ARG TYR GLY VAL ATOM 1 N ALA D1110 -28.447 25.180 66.567 1.00114.31 ATOM 2 CA ALA D1110 -29.461 24.945 67.590 1.00107.35 ATOM 3 C ALA D1110 -30.533 23.973 67.111 1.00105.62 ATOM 4 O ALA D1110 -30.822 22.980 67.778 1.00100.67 ATOM 5 CB ALA D1110 -30.094 26.258 68.016 1.00113.54 ATOM 6 N ASP D1111 -31.128 24.266 65.960 1.00105.16 ATOM 7 CA ASP D1111 -32.144 23.388 65.392 1.00107.09 ATOM 8 C ASP D1111 -32.040 23.293 63.874 1.00109.00 ATOM 9 O ASP D1111 -31.939 24.307 63.184 1.00111.70 ATOM 10 CB ASP D1111 -33.544 23.851 65.797 1.00106.20 ATOM 11 CG ASP D1111 -34.621 22.858 65.406 1.00107.21 ATOM 12 OD1 ASP D1111 -34.308 21.656 65.287 1.00108.38 ATOM 13 OD2 ASP D1111 -35.782 23.277 65.222 1.00110.04 ATOM 14 N CYS D1112 -32.074 22.067 63.361 1.00108.59 ATOM 15 CA CYS D1112 -32.058 21.832 61.923 1.00108.85 ATOM 16 C CYS D1112 -33.470 21.957 61.365 1.00107.84 ATOM 17 O CYS D1112 -33.670 22.013 60.151 1.00109.91 ATOM 18 CB CYS D1112 -31.493 20.446 61.610 1.00107.81 ATOM 19 SG CYS D1112 -32.458 19.076 62.286 1.00103.25 ATOM 20 N GLY D1113 -34.448 21.991 62.263 1.00104.82 ATOM 21 CA GLY D1113 -35.836 22.164 61.880 1.00108.99 ATOM 22 C GLY D1113 -36.432 20.951 61.195 1.00109.12 ATOM 23 O GLY D1113 -37.254 21.082 60.290 1.00117.48 ATOM 24 N THR D1114 -36.022 19.764 61.627 1.00102.95 ATOM 25 CA THR D1114 -36.559 18.535 61.060 1.00103.38 ATOM 26 C THR D1114 -37.901 18.159 61.685 1.00105.66 ATOM 27 O THR D1114 -38.145 18.408 62.865 1.00101.46 ATOM 28 CB THR D1114 -35.578 17.360 61.209 1.00102.55 ATOM 29 OG1 THR D1114 -36.130 16.197 60.582 1.00107.45 ATOM 30 CG2 THR D1114 -35.313 17.061 62.679 1.00101.15 ATOM 31 N THR D1115 -38.777 17.575 60.878 1.00108.86 ATOM 32 CA THR D1115 -40.062 17.088 61.363 1.00111.46 ATOM 33 C THR D1115 -39.981 15.602 61.709 1.00111.49 ATOM 34 O THR D1115 -40.978 14.982 62.082 1.00112.65 ATOM 35 CB THR D1115 -41.185 17.327 60.334 1.00123.92 ATOM 36 OG1 THR D1115 -40.828 16.730 59.082 1.00127.62 ATOM 37 CG2 THR D1115 -41.406 18.817 60.128 1.00130.55 ATOM 38 N ASN D1116 -38.782 15.042 61.587 1.00112.01 ATOM 39 CA ASN D1116 -38.574 13.608 61.754 1.00111.62 ATOM 40 C ASN D1116 -37.999 13.236 63.116 1.00105.13 ATOM 41 O ASN D1116 -37.228 13.990 63.709 1.00100.36 ATOM 42 CB ASN D1116 -37.678 13.062 60.640 1.00114.85 ATOM 43 CG ASN D1116 -38.237 13.335 59.259 1.00124.18 ATOM 44 OD1 ASN D1116 -39.444 13.508 59.090 1.00133.19 ATOM 45 ND2 ASN D1116 -37.360 13.375 58.261 1.00119.54 ATOM 46 N TYR D1117 -38.400 12.072 63.613 1.00103.66 ATOM 47 CA TYR D1117 -37.946 11.599 64.912 1.00103.28 ATOM 48 C TYR D1117 -37.954 10.076 64.980 1.00105.62 ATOM 49 O TYR D1117 -38.341 9.403 64.025 1.00110.82 ATOM 50 CB TYR D1117 -38.843 12.166 66.010 1.00107.71 ATOM 51 CG TYR D1117 -40.316 11.859 65.818 1.00108.83 ATOM 52 CD1 TYR D1117 -40.891 10.728 66.386 1.00109.10 ATOM 53 CD2 TYR D1117 -41.131 12.702 65.070 1.00105.63 ATOM 54 CE1 TYR D1117 -42.233 10.443 66.214 1.00113.16 ATOM 55 CE2 TYR D1117 -42.475 12.425 64.892 1.00107.55 ATOM 56 CZ TYR D1117 -43.021 11.294 65.467 1.00116.86 ATOM 57 OH TYR D1117 -44.357 11.013 65.293 1.00127.14 ATOM 58 N ILE D1118 -37.534 9.540 66.121 1.00102.06 ATOM 59 CA ILE D1118 -37.594 8.102 66.353 1.00100.36 ATOM 60 C ILE D1118 -38.504 7.787 67.539 1.00106.34 ATOM 61 O ILE D1118 -38.689 8.616 68.432 1.00103.23 ATOM 62 CB ILE D1118 -36.194 7.493 66.588 1.00 90.76 ATOM 63 CG1 ILE D1118 -35.643 7.895 67.957 1.00100.15 ATOM 64 CG2 ILE D1118 -35.239 7.911 65.487 1.00 93.11 ATOM 65 CD1 ILE D1118 -34.375 7.159 68.337 1.00 95.84 ATOM 66 N SER D1119 -39.079 6.589 67.536 1.00111.57 ATOM 67 CA SER D1119 -39.965 6.166 68.612 1.00108.40 ATOM 68 C SER D1119 -39.250 5.177 69.518 1.00100.57 ATOM 69 O SER D1119 -38.994 4.041 69.124 1.00105.75 ATOM 70 CB SER D1119 -41.224 5.514 68.038 1.00115.36 ATOM 71 OG SER D1119 -41.849 6.353 67.084 1.00122.15 ATOM 72 N VAL D1120 -38.939 5.605 70.736 1.00 94.04 ATOM 73 CA VAL D1120 -38.236 4.746 71.680 1.00102.30 ATOM 74 C VAL D1120 -39.218 3.857 72.433 1.00107.12 ATOM 75 O VAL D1120 -40.018 4.346 73.230 1.00112.05 ATOM 76 CB VAL D1120 -37.422 5.571 72.690 1.00 98.82 ATOM 77 CG1 VAL D1120 -36.739 4.654 73.689 1.00 95.93 ATOM 78 CG2 VAL D1120 -36.405 6.435 71.966 1.00 98.29 ATOM 79 N PRO D1121 -39.156 2.540 72.185 1.00104.33 ATOM 80 CA PRO D1121 -40.098 1.602 72.802 1.00103.76 ATOM 81 C PRO D1121 -39.838 1.426 74.291 1.00107.34 ATOM 82 O PRO D1121 -38.682 1.352 74.707 1.00 98.45 ATOM 83 CB PRO D1121 -39.813 0.294 72.063 1.00100.76 ATOM 84 CG PRO D1121 -38.386 0.401 71.665 1.00109.52 ATOM 85 CD PRO D1121 -38.164 1.851 71.341 1.00114.06 ATOM 86 N LEU D1122 -40.904 1.379 75.083 1.00113.34 ATOM 87 CA LEU D1122 -40.791 1.054 76.499 1.00106.03 ATOM 88 C LEU D1122 -41.080 -0.425 76.735 1.00103.67 ATOM 89 O LEU D1122 -40.971 -0.918 77.857 1.00106.12 ATOM 90 CB LEU D1122 -41.741 1.920 77.325 1.00 95.44 ATOM 91 CG LEU D1122 -41.610 3.425 77.096 1.00 94.03 ATOM 92 CD1 LEU D1122 -42.543 4.190 78.015 1.00109.59 ATOM 93 CD2 LEU D1122 -40.173 3.869 77.297 1.00 93.06 ATOM 94 N PHE D1123 -41.438 -1.128 75.665 1.00101.78 ATOM 95 CA PHE D1123 -41.818 -2.534 75.759 1.00113.30 ATOM 96 C PHE D1123 -41.105 -3.393 74.721 1.00118.97 ATOM 97 O PHE D1123 -40.977 -3.005 73.560 1.00117.25 ATOM 98 CB PHE D1123 -43.333 -2.689 75.603 1.00121.77 ATOM 99 CG PHE D1123 -44.125 -2.106 76.739 1.00120.87 ATOM 100 CD1 PHE D1123 -44.313 -2.823 77.909 1.00110.92 ATOM 101 CD2 PHE D1123 -44.689 -0.845 76.633 1.00117.33 ATOM 102 CE1 PHE D1123 -45.041 -2.293 78.955 1.00100.41 ATOM 103 CE2 PHE D1123 -45.421 -0.309 77.678 1.00109.49 ATOM 104 CZ PHE D1123 -45.596 -1.035 78.840 1.00101.67 ATOM 105 N GLN D1124 -40.647 -4.566 75.147 1.00128.09 ATOM 106 CA GLN D1124 -39.987 -5.507 74.249 1.00134.73 ATOM 107 C GLN D1124 -40.679 -6.867 74.295 1.00138.00 ATOM 108 O GLN D1124 -41.134 -7.298 75.355 1.00136.82 ATOM 109 CB GLN D1124 -38.504 -5.647 74.612 1.00138.75 ATOM 110 CG GLN D1124 -38.245 -6.109 76.042 1.00136.76 ATOM 111 CD GLN D1124 -36.772 -6.078 76.411 1.00131.04 ATOM 112 OE1 GLN D1124 -36.396 -6.408 77.536 1.00117.35 ATOM 113 NE2 GLN D1124 -35.931 -5.676 75.464 1.00131.68 ATOM 114 N PRO D1125 -40.765 -7.543 73.137 1.00143.93 ATOM 115 CA PRO D1125 -41.401 -8.861 73.047 1.00151.60 ATOM 116 C PRO D1125 -40.710 -9.880 73.944 1.00160.98 ATOM 117 O PRO D1125 -39.482 -9.972 73.937 1.00167.20 ATOM 118 CB PRO D1125 -41.209 -9.240 71.575 1.00153.48 ATOM 119 CG PRO D1125 -41.063 -7.940 70.866 1.00146.99 ATOM 120 CD PRO D1125 -40.321 -7.056 71.820 1.00146.89 ATOM 121 N ASP D1126 -41.494 -10.631 74.710 1.00167.66 ATOM 122 CA ASP D1126 -40.944 -11.635 75.611 1.00178.09 ATOM 123 C ASP D1126 -40.387 -12.809 74.811 1.00191.15 ATOM 124 O ASP D1126 -40.779 -13.027 73.664 1.00192.91 ATOM 125 CB ASP D1126 -42.018 -12.116 76.589 1.00177.43 ATOM 126 CG ASP D1126 -41.432 -12.775 77.821 1.00178.83 ATOM 127 OD1 ASP D1126 -41.163 -12.058 78.808 1.00174.70 ATOM 128 OD2 ASP D1126 -41.239 -14.008 77.806 1.00182.95 ATOM 129 N GLU D1127 -39.468 -13.559 75.414 1.00195.12 ATOM 130 CA GLU D1127 -38.860 -14.707 74.745 1.00200.02 ATOM 131 C GLU D1127 -39.861 -15.846 74.565 1.00204.68 ATOM 132 O GLU D1127 -39.728 -16.667 73.655 1.00203.92 ATOM 133 CB GLU D1127 -37.628 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-43.662 -14.134 70.260 1.00182.93 ATOM 152 N ARG D1130 -45.269 -14.610 74.490 1.00189.97 ATOM 153 CA ARG D1130 -46.615 -14.648 75.041 1.00183.86 ATOM 154 C ARG D1130 -47.255 -13.269 74.959 1.00184.47 ATOM 155 O ARG D1130 -48.387 -13.123 74.499 1.00184.74 ATOM 156 CB ARG D1130 -46.576 -15.113 76.496 1.00179.05 ATOM 157 CG ARG D1130 -47.940 -15.432 77.077 1.00174.76 ATOM 158 CD ARG D1130 -47.891 -15.490 78.592 1.00170.89 ATOM 159 NE ARG D1130 -47.653 -14.173 79.174 1.00168.01 ATOM 160 CZ ARG D1130 -47.609 -13.930 80.480 1.00167.70 ATOM 161 NH1 ARG D1130 -47.388 -12.699 80.920 1.00166.75 ATOM 162 NH2 ARG D1130 -47.786 -14.918 81.346 1.00164.44 ATOM 163 N SER D1131 -46.517 -12.260 75.411 1.00184.46 ATOM 164 CA SER D1131 -46.997 -10.885 75.391 1.00179.03 ATOM 165 C SER D1131 -45.832 -9.903 75.407 1.00165.11 ATOM 166 O SER D1131 -44.671 -10.296 75.287 1.00165.18 ATOM 167 CB SER D1131 -47.918 -10.618 76.585 1.00176.39 ATOM 168 OG SER D1131 -47.212 -10.711 77.810 1.00168.01 ATOM 169 N LEU 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