HEADER TRANSCRIPTION 31-DEC-69 6L74 TITLE Thermus thermophilus initial transcription complex comprising sigma A TITLE 2 and 5'-triphosphate RNA of 2 nt COMPND MOL_ID: 3; COMPND 2 MOLECULE: DNA-directed RNA polymerase subunit beta'; COMPND 3 CHAIN: D; COMPND 4 EC: 2.7.7.6; EXPDTA X-RAY DIFFRACTION REMARK 2 RESOLUTION. 3.12 ANGSTORMS DBREF 6L74 D 1 1524 UNP Q8RQE8 RPOC_THET8 1 1524 SEQRES 1 D 91 ALA ASP CYS GLY THR THR ASN TYR ILE SER VAL PRO LEU SEQRES 2 D 91 PHE GLN PRO ASP GLU VAL THR ARG SER LEU ARG LEU ARG SEQRES 3 D 91 LYS ARG ALA ASP ILE GLU ALA GLY LEU TYR GLY ARG VAL SEQRES 4 D 91 LEU ALA ARG GLU VAL GLU VAL LEU GLY VAL ARG LEU GLU SEQRES 5 D 91 GLU GLY ARG TYR LEU SER MET ASP ASP VAL HIS LEU LEU SEQRES 6 D 91 ILE LYS ALA ALA GLU ALA GLY GLU ILE GLN GLU VAL PRO SEQRES 7 D 91 VAL ARG SER PRO LEU THR CYS GLN THR ARG TYR GLY VAL ATOM 1 N ALA D1110 -28.223 25.891 65.796 1.00 70.31 ATOM 2 CA ALA D1110 -29.145 25.668 66.906 1.00 62.21 ATOM 3 C ALA D1110 -30.328 24.803 66.494 1.00 60.61 ATOM 4 O ALA D1110 -30.802 23.981 67.286 1.00 63.17 ATOM 5 CB ALA D1110 -29.634 27.003 67.463 1.00 63.78 ATOM 6 N ASP D1111 -30.821 24.973 65.270 1.00 63.11 ATOM 7 CA ASP D1111 -31.928 24.157 64.780 1.00 58.10 ATOM 8 C ASP D1111 -31.867 24.119 63.262 1.00 60.70 ATOM 9 O ASP D1111 -31.894 25.170 62.614 1.00 66.88 ATOM 10 CB ASP D1111 -33.273 24.712 65.254 1.00 57.00 ATOM 11 CG ASP D1111 -34.450 23.873 64.787 1.00 66.18 ATOM 12 OD1 ASP D1111 -34.236 22.724 64.347 1.00 69.01 ATOM 13 OD2 ASP D1111 -35.595 24.365 64.855 1.00 72.40 ATOM 14 N CYS D1112 -31.782 22.912 62.702 1.00 62.29 ATOM 15 CA CYS D1112 -31.912 22.715 61.266 1.00 60.86 ATOM 16 C CYS D1112 -33.349 22.847 60.787 1.00 61.34 ATOM 17 O CYS D1112 -33.579 22.883 59.574 1.00 63.85 ATOM 18 CB CYS D1112 -31.372 21.340 60.882 1.00 60.18 ATOM 19 SG CYS D1112 -32.030 20.008 61.907 1.00 56.05 ATOM 20 N GLY D1113 -34.314 22.907 61.701 1.00 56.86 ATOM 21 CA GLY D1113 -35.700 23.083 61.330 1.00 66.36 ATOM 22 C GLY D1113 -36.389 21.852 60.791 1.00 67.88 ATOM 23 O GLY D1113 -37.515 21.963 60.292 1.00 68.32 ATOM 24 N THR D1114 -35.753 20.686 60.871 1.00 66.56 ATOM 25 CA THR D1114 -36.384 19.462 60.400 1.00 63.26 ATOM 26 C THR D1114 -37.687 19.212 61.149 1.00 55.73 ATOM 27 O THR D1114 -37.887 19.672 62.274 1.00 54.21 ATOM 28 CB THR D1114 -35.444 18.268 60.580 1.00 58.65 ATOM 29 OG1 THR D1114 -36.089 17.076 60.118 1.00 60.92 ATOM 30 CG2 THR D1114 -35.079 18.089 62.041 1.00 58.72 ATOM 31 N THR D1115 -38.592 18.495 60.495 1.00 61.27 ATOM 32 CA THR D1115 -39.807 18.015 61.129 1.00 59.49 ATOM 33 C THR D1115 -39.789 16.508 61.328 1.00 62.85 ATOM 34 O THR D1115 -40.772 15.949 61.828 1.00 69.11 ATOM 35 CB THR D1115 -41.035 18.424 60.306 1.00 63.29 ATOM 36 OG1 THR D1115 -40.820 18.099 58.926 1.00 71.76 ATOM 37 CG2 THR D1115 -41.285 19.917 60.438 1.00 56.18 ATOM 38 N ASN D1116 -38.703 15.841 60.948 1.00 62.09 ATOM 39 CA ASN D1116 -38.559 14.404 61.115 1.00 60.61 ATOM 40 C ASN D1116 -37.982 14.093 62.489 1.00 59.46 ATOM 41 O ASN D1116 -37.337 14.930 63.124 1.00 63.65 ATOM 42 CB ASN D1116 -37.657 13.811 60.031 1.00 60.65 ATOM 43 CG ASN D1116 -37.965 14.354 58.652 1.00 72.51 ATOM 44 OD1 ASN D1116 -39.127 14.564 58.294 1.00 74.48 ATOM 45 ND2 ASN D1116 -36.918 14.591 57.868 1.00 71.55 ATOM 46 N TYR D1117 -38.213 12.865 62.938 1.00 53.35 ATOM 47 CA TYR D1117 -37.806 12.442 64.270 1.00 55.64 ATOM 48 C TYR D1117 -37.820 10.921 64.312 1.00 54.29 ATOM 49 O TYR D1117 -38.092 10.256 63.309 1.00 58.66 ATOM 50 CB TYR D1117 -38.719 13.048 65.342 1.00 56.76 ATOM 51 CG TYR D1117 -40.199 12.846 65.086 1.00 58.07 ATOM 52 CD1 TYR D1117 -40.895 11.808 65.694 1.00 56.58 ATOM 53 CD2 TYR D1117 -40.901 13.695 64.236 1.00 60.24 ATOM 54 CE1 TYR D1117 -42.249 11.618 65.461 1.00 56.82 ATOM 55 CE2 TYR D1117 -42.252 13.511 63.994 1.00 68.24 ATOM 56 CZ TYR D1117 -42.921 12.472 64.612 1.00 66.74 ATOM 57 OH TYR D1117 -44.263 12.287 64.373 1.00 65.24 ATOM 58 N ILE D1118 -37.512 10.372 65.485 1.00 47.93 ATOM 59 CA ILE D1118 -37.619 8.942 65.730 1.00 49.86 ATOM 60 C ILE D1118 -38.556 8.735 66.914 1.00 55.16 ATOM 61 O ILE D1118 -38.867 9.664 67.663 1.00 56.12 ATOM 62 CB ILE D1118 -36.249 8.277 65.987 1.00 43.84 ATOM 63 CG1 ILE D1118 -35.679 8.712 67.334 1.00 49.83 ATOM 64 CG2 ILE D1118 -35.266 8.632 64.894 1.00 42.74 ATOM 65 CD1 ILE D1118 -34.400 8.003 67.699 1.00 51.71 ATOM 66 N SER D1119 -39.016 7.498 67.075 1.00 54.67 ATOM 67 CA SER D1119 -39.936 7.140 68.155 1.00 56.53 ATOM 68 C SER D1119 -39.294 6.055 69.010 1.00 51.93 ATOM 69 O SER D1119 -39.277 4.881 68.629 1.00 58.00 ATOM 70 CB SER D1119 -41.284 6.682 67.603 1.00 61.04 ATOM 71 OG SER D1119 -42.061 7.789 67.176 1.00 66.40 ATOM 72 N VAL D1120 -38.778 6.445 70.170 1.00 48.48 ATOM 73 CA VAL D1120 -38.176 5.494 71.099 1.00 47.05 ATOM 74 C VAL D1120 -39.283 4.636 71.699 1.00 58.42 ATOM 75 O VAL D1120 -40.211 5.172 72.324 1.00 55.39 ATOM 76 CB VAL D1120 -37.380 6.212 72.197 1.00 44.26 ATOM 77 CG1 VAL D1120 -36.677 5.196 73.078 1.00 45.54 ATOM 78 CG2 VAL D1120 -36.391 7.196 71.587 1.00 43.01 ATOM 79 N PRO D1121 -39.238 3.317 71.531 1.00 60.69 ATOM 80 CA PRO D1121 -40.264 2.465 72.137 1.00 54.57 ATOM 81 C PRO D1121 -40.023 2.287 73.625 1.00 61.23 ATOM 82 O PRO D1121 -38.883 2.169 74.082 1.00 56.35 ATOM 83 CB PRO D1121 -40.105 1.137 71.389 1.00 53.62 ATOM 84 CG PRO D1121 -38.674 1.105 71.018 1.00 59.16 ATOM 85 CD PRO D1121 -38.281 2.537 70.728 1.00 62.22 ATOM 86 N LEU D1122 -41.118 2.282 74.384 1.00 64.52 ATOM 87 CA LEU D1122 -41.072 1.972 75.805 1.00 64.81 ATOM 88 C LEU D1122 -41.417 0.517 76.094 1.00 67.55 ATOM 89 O LEU D1122 -41.246 0.069 77.232 1.00 69.82 ATOM 90 CB LEU D1122 -42.024 2.895 76.581 1.00 63.32 ATOM 91 CG LEU D1122 -41.839 4.401 76.369 1.00 58.45 ATOM 92 CD1 LEU D1122 -42.966 5.192 77.002 1.00 57.85 ATOM 93 CD2 LEU D1122 -40.509 4.856 76.923 1.00 55.70 ATOM 94 N PHE D1123 -41.893 -0.222 75.093 1.00 67.76 ATOM 95 CA PHE D1123 -42.225 -1.631 75.225 1.00 71.35 ATOM 96 C PHE D1123 -41.514 -2.409 74.129 1.00 70.47 ATOM 97 O PHE D1123 -41.097 -1.848 73.114 1.00 76.76 ATOM 98 CB PHE D1123 -43.743 -1.867 75.140 1.00 77.88 ATOM 99 CG PHE D1123 -44.522 -1.215 76.245 1.00 66.66 ATOM 100 CD1 PHE D1123 -44.753 -1.885 77.435 1.00 70.69 ATOM 101 CD2 PHE D1123 -45.019 0.068 76.096 1.00 65.84 ATOM 102 CE1 PHE D1123 -45.462 -1.288 78.457 1.00 63.21 ATOM 103 CE2 PHE D1123 -45.730 0.672 77.117 1.00 70.42 ATOM 104 CZ PHE D1123 -45.951 -0.008 78.300 1.00 65.59 ATOM 105 N GLN D1124 -41.382 -3.715 74.337 1.00 82.41 ATOM 106 CA GLN D1124 -40.703 -4.561 73.367 1.00 98.48 ATOM 107 C GLN D1124 -41.348 -5.935 73.364 1.00102.04 ATOM 108 O GLN D1124 -41.836 -6.391 74.405 1.00 96.33 ATOM 109 CB GLN D1124 -39.205 -4.684 73.678 1.00102.75 ATOM 110 CG GLN D1124 -38.901 -5.313 75.021 1.00 99.96 ATOM 111 CD GLN D1124 -37.417 -5.435 75.266 1.00109.35 ATOM 112 OE1 GLN D1124 -36.614 -5.323 74.337 1.00106.30 ATOM 113 NE2 GLN D1124 -37.038 -5.658 76.521 1.00113.84 ATOM 114 N PRO D1125 -41.367 -6.616 72.217 1.00106.95 ATOM 115 CA PRO D1125 -41.975 -7.951 72.160 1.00114.61 ATOM 116 C PRO D1125 -41.265 -8.925 73.087 1.00122.85 ATOM 117 O PRO D1125 -40.038 -9.039 73.077 1.00127.68 ATOM 118 CB PRO D1125 -41.814 -8.350 70.688 1.00110.91 ATOM 119 CG PRO D1125 -41.672 -7.057 69.956 1.00101.50 ATOM 120 CD PRO D1125 -40.925 -6.155 70.890 1.00 99.65 ATOM 121 N ASP D1126 -42.052 -9.617 73.906 1.00132.32 ATOM 122 CA ASP D1126 -41.514 -10.667 74.756 1.00146.29 ATOM 123 C ASP D1126 -40.991 -11.813 73.896 1.00158.91 ATOM 124 O ASP D1126 -41.493 -12.075 72.799 1.00161.10 ATOM 125 CB ASP D1126 -42.593 -11.171 75.717 1.00150.01 ATOM 126 CG ASP D1126 -42.016 -11.796 76.971 1.00146.76 ATOM 127 OD1 ASP D1126 -41.469 -11.051 77.810 1.00139.74 ATOM 128 OD2 ASP D1126 -42.116 -13.029 77.123 1.00149.70 ATOM 129 N GLU D1127 -39.956 -12.495 74.395 1.00162.39 ATOM 130 CA GLU D1127 -39.400 -13.616 73.646 1.00167.96 ATOM 131 C GLU D1127 -40.359 -14.797 73.583 1.00171.48 ATOM 132 O GLU D1127 -40.240 -15.628 72.676 1.00173.63 ATOM 133 CB GLU D1127 -38.062 -14.049 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-13.529 69.211 1.00153.83 ATOM 152 N ARG D1130 -45.655 -13.544 73.597 1.00162.94 ATOM 153 CA ARG D1130 -46.958 -13.600 74.246 1.00161.72 ATOM 154 C ARG D1130 -47.617 -12.227 74.305 1.00159.31 ATOM 155 O ARG D1130 -48.829 -12.109 74.089 1.00156.77 ATOM 156 CB ARG D1130 -46.812 -14.182 75.652 1.00158.99 ATOM 157 CG ARG D1130 -48.073 -14.826 76.193 1.00157.25 ATOM 158 CD ARG D1130 -48.104 -14.753 77.706 1.00158.03 ATOM 159 NE ARG D1130 -48.198 -13.372 78.167 1.00155.86 ATOM 160 CZ ARG D1130 -48.234 -13.009 79.444 1.00158.48 ATOM 161 NH1 ARG D1130 -48.323 -11.726 79.768 1.00157.60 ATOM 162 NH2 ARG D1130 -48.180 -13.928 80.399 1.00158.98 ATOM 163 N SER D1131 -46.844 -11.187 74.600 1.00155.81 ATOM 164 CA SER D1131 -47.370 -9.832 74.715 1.00145.40 ATOM 165 C SER D1131 -46.217 -8.852 74.524 1.00129.33 ATOM 166 O SER D1131 -45.136 -9.221 74.054 1.00126.71 ATOM 167 CB SER D1131 -48.074 -9.632 76.063 1.00137.39 ATOM 168 OG SER D1131 -47.180 -9.832 77.144 1.00127.51 ATOM 169 N LEU D1132 -46.462 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