HEADER TRANSCRIPTION 31-DEC-69 6M6B TITLE Cryo-EM structure of Thermus thermophilus Mfd in complex with RNA TITLE 2 polymerase and ATP-gamma-S COMPND MOL_ID: 3; COMPND 2 MOLECULE: DNA-directed RNA polymerase subunit beta'; COMPND 3 CHAIN: D; COMPND 4 EC: 2.7.7.6; EXPDTA ELECTRON MICROSCOPY DBREF 6M6B D 1 1524 UNP Q8RQE8 RPOC_THET8 1 1524 SEQRES 1 D 91 ALA ASP CYS GLY THR THR ASN TYR ILE SER VAL PRO LEU SEQRES 2 D 91 PHE GLN PRO ASP GLU VAL THR ARG SER LEU ARG LEU ARG SEQRES 3 D 91 LYS ARG ALA ASP ILE GLU ALA GLY LEU TYR GLY ARG VAL SEQRES 4 D 91 LEU ALA ARG GLU VAL GLU VAL LEU GLY VAL ARG LEU GLU SEQRES 5 D 91 GLU GLY ARG TYR LEU SER MET ASP ASP VAL HIS LEU LEU SEQRES 6 D 91 ILE LYS ALA ALA GLU ALA GLY GLU ILE GLN GLU VAL PRO SEQRES 7 D 91 VAL ARG SER PRO LEU THR CYS GLN THR ARG TYR GLY VAL ATOM 1 N ALA D1110 145.576 121.285 168.671 1.00138.44 ATOM 2 CA ALA D1110 144.466 121.121 169.595 1.00138.44 ATOM 3 C ALA D1110 144.140 122.448 170.261 1.00138.44 ATOM 4 O ALA D1110 143.053 123.000 170.073 1.00138.44 ATOM 5 CB ALA D1110 144.796 120.061 170.641 1.00138.44 ATOM 6 N ASP D1111 145.084 122.984 171.020 1.00138.57 ATOM 7 CA ASP D1111 144.910 124.274 171.658 1.00138.57 ATOM 8 C ASP D1111 146.111 125.149 171.360 1.00138.57 ATOM 9 O ASP D1111 147.236 124.667 171.223 1.00138.57 ATOM 10 CB ASP D1111 144.742 124.142 173.165 1.00138.57 ATOM 11 CG ASP D1111 144.021 125.325 173.776 1.00138.57 ATOM 12 OD1 ASP D1111 144.240 126.471 173.332 1.00138.57 ATOM 13 OD2 ASP D1111 143.226 125.109 174.712 1.00138.57 ATOM 14 N CYS D1112 145.858 126.445 171.266 1.00143.09 ATOM 15 CA CYS D1112 146.934 127.415 171.247 1.00143.09 ATOM 16 C CYS D1112 147.309 127.853 172.646 1.00143.09 ATOM 17 O CYS D1112 148.306 128.559 172.817 1.00143.09 ATOM 18 CB CYS D1112 146.542 128.634 170.416 1.00143.09 ATOM 19 SG CYS D1112 145.068 129.478 170.981 1.00143.09 ATOM 20 N GLY D1113 146.535 127.442 173.643 1.00137.27 ATOM 21 CA GLY D1113 146.814 127.824 175.010 1.00137.27 ATOM 22 C GLY D1113 146.580 129.286 175.291 1.00137.27 ATOM 23 O GLY D1113 147.243 129.853 176.162 1.00137.27 ATOM 24 N THR D1114 145.661 129.920 174.571 1.00134.74 ATOM 25 CA THR D1114 145.382 131.317 174.843 1.00134.74 ATOM 26 C THR D1114 144.497 131.453 176.071 1.00134.74 ATOM 27 O THR D1114 143.950 130.484 176.599 1.00134.74 ATOM 28 CB THR D1114 144.701 131.991 173.661 1.00134.74 ATOM 29 OG1 THR D1114 144.607 133.395 173.926 1.00134.74 ATOM 30 CG2 THR D1114 143.302 131.442 173.485 1.00134.74 ATOM 31 N THR D1115 144.361 132.685 176.531 1.00129.68 ATOM 32 CA THR D1115 143.410 133.013 177.567 1.00129.68 ATOM 33 C THR D1115 142.468 134.121 177.155 1.00129.68 ATOM 34 O THR D1115 141.529 134.416 177.900 1.00129.68 ATOM 35 CB THR D1115 144.134 133.432 178.850 1.00129.68 ATOM 36 OG1 THR D1115 145.100 134.438 178.531 1.00129.68 ATOM 37 CG2 THR D1115 144.834 132.245 179.476 1.00129.68 ATOM 38 N ASN D1116 142.690 134.747 176.005 1.00130.34 ATOM 39 CA ASN D1116 141.815 135.805 175.548 1.00130.34 ATOM 40 C ASN D1116 140.488 135.221 175.086 1.00130.34 ATOM 41 O ASN D1116 140.375 134.039 174.760 1.00130.34 ATOM 42 CB ASN D1116 142.473 136.583 174.419 1.00130.34 ATOM 43 CG ASN D1116 143.739 137.257 174.854 1.00130.34 ATOM 44 OD1 ASN D1116 143.816 137.797 175.954 1.00130.34 ATOM 45 ND2 ASN D1116 144.745 137.237 173.995 1.00130.34 ATOM 46 N TYR D1117 139.477 136.077 175.046 1.00124.19 ATOM 47 CA TYR D1117 138.118 135.628 174.815 1.00124.19 ATOM 48 C TYR D1117 137.283 136.834 174.440 1.00124.19 ATOM 49 O TYR D1117 137.595 137.963 174.825 1.00124.19 ATOM 50 CB TYR D1117 137.532 134.961 176.049 1.00124.19 ATOM 51 CG TYR D1117 137.111 135.926 177.122 1.00124.19 ATOM 52 CD1 TYR D1117 135.770 136.159 177.378 1.00124.19 ATOM 53 CD2 TYR D1117 138.052 136.603 177.884 1.00124.19 ATOM 54 CE1 TYR D1117 135.376 137.042 178.358 1.00124.19 ATOM 55 CE2 TYR D1117 137.667 137.486 178.868 1.00124.19 ATOM 56 CZ TYR D1117 136.326 137.698 179.100 1.00124.19 ATOM 57 OH TYR D1117 135.926 138.574 180.078 1.00124.19 ATOM 58 N ILE D1118 136.209 136.586 173.698 1.00122.01 ATOM 59 CA ILE D1118 135.233 137.629 173.429 1.00122.01 ATOM 60 C ILE D1118 133.923 137.191 174.047 1.00122.01 ATOM 61 O ILE D1118 133.753 136.038 174.438 1.00122.01 ATOM 62 CB ILE D1118 135.045 137.922 171.931 1.00122.01 ATOM 63 CG1 ILE D1118 134.221 136.828 171.268 1.00122.01 ATOM 64 CG2 ILE D1118 136.382 138.047 171.242 1.00122.01 ATOM 65 CD1 ILE D1118 133.679 137.234 169.931 1.00122.01 ATOM 66 N SER D1119 132.986 138.122 174.127 1.00128.79 ATOM 67 CA SER D1119 131.690 137.821 174.704 1.00128.79 ATOM 68 C SER D1119 130.596 138.158 173.712 1.00128.79 ATOM 69 O SER D1119 130.543 139.273 173.187 1.00128.79 ATOM 70 CB SER D1119 131.457 138.582 175.995 1.00128.79 ATOM 71 OG SER D1119 130.089 138.500 176.323 1.00128.79 ATOM 72 N VAL D1120 129.728 137.196 173.473 1.00125.43 ATOM 73 CA VAL D1120 128.570 137.445 172.615 1.00125.43 ATOM 74 C VAL D1120 127.481 138.135 173.428 1.00125.43 ATOM 75 O VAL D1120 127.209 137.730 174.573 1.00125.43 ATOM 76 CB VAL D1120 128.086 136.133 171.990 1.00125.43 ATOM 77 CG1 VAL D1120 127.930 135.043 173.030 1.00125.43 ATOM 78 CG2 VAL D1120 126.787 136.336 171.245 1.00125.43 ATOM 79 N PRO D1121 126.899 139.217 172.931 1.00123.26 ATOM 80 CA PRO D1121 125.811 139.874 173.654 1.00123.26 ATOM 81 C PRO D1121 124.491 139.168 173.394 1.00123.26 ATOM 82 O PRO D1121 124.385 138.278 172.554 1.00123.26 ATOM 83 CB PRO D1121 125.809 141.280 173.063 1.00123.26 ATOM 84 CG PRO D1121 126.272 141.071 171.673 1.00123.26 ATOM 85 CD PRO D1121 127.279 139.961 171.721 1.00123.26 ATOM 86 N LEU D1122 123.477 139.580 174.144 1.00133.93 ATOM 87 CA LEU D1122 122.155 138.992 173.980 1.00133.93 ATOM 88 C LEU D1122 121.091 140.069 173.874 1.00133.93 ATOM 89 O LEU D1122 120.028 139.855 173.284 1.00133.93 ATOM 90 CB LEU D1122 121.829 138.064 175.142 1.00133.93 ATOM 91 CG LEU D1122 122.437 136.669 175.073 1.00133.93 ATOM 92 CD1 LEU D1122 123.817 136.618 175.696 1.00133.93 ATOM 93 CD2 LEU D1122 121.513 135.677 175.730 1.00133.93 ATOM 94 N PHE D1123 121.371 141.226 174.450 1.00151.77 ATOM 95 CA PHE D1123 120.413 142.320 174.525 1.00151.77 ATOM 96 C PHE D1123 120.977 143.484 173.731 1.00151.77 ATOM 97 O PHE D1123 121.775 144.274 174.241 1.00151.77 ATOM 98 CB PHE D1123 120.143 142.709 175.967 1.00151.77 ATOM 99 CG PHE D1123 119.330 141.710 176.707 1.00151.77 ATOM 100 CD1 PHE D1123 117.970 141.877 176.833 1.00151.77 ATOM 101 CD2 PHE D1123 119.925 140.600 177.273 1.00151.77 ATOM 102 CE1 PHE D1123 117.218 140.966 177.511 1.00151.77 ATOM 103 CE2 PHE D1123 119.175 139.679 177.952 1.00151.77 ATOM 104 CZ PHE D1123 117.817 139.861 178.071 1.00151.77 ATOM 105 N GLN D1124 120.546 143.592 172.490 1.00162.53 ATOM 106 CA GLN D1124 120.974 144.693 171.670 1.00162.53 ATOM 107 C GLN D1124 120.195 145.948 172.046 1.00162.53 ATOM 108 O GLN D1124 119.116 145.868 172.643 1.00162.53 ATOM 109 CB GLN D1124 120.771 144.355 170.201 1.00162.53 ATOM 110 CG GLN D1124 119.331 144.235 169.816 1.00162.53 ATOM 111 CD GLN D1124 119.095 144.724 168.421 1.00162.53 ATOM 112 OE1 GLN D1124 119.997 145.265 167.786 1.00162.53 ATOM 113 NE2 GLN D1124 117.881 144.544 167.929 1.00162.53 ATOM 114 N PRO D1125 120.746 147.125 171.756 1.00176.35 ATOM 115 CA PRO D1125 119.977 148.355 171.961 1.00176.35 ATOM 116 C PRO D1125 118.976 148.603 170.850 1.00176.35 ATOM 117 O PRO D1125 119.348 148.929 169.720 1.00176.35 ATOM 118 CB PRO D1125 121.054 149.444 172.000 1.00176.35 ATOM 119 CG PRO D1125 122.207 148.866 171.282 1.00176.35 ATOM 120 CD PRO D1125 122.178 147.403 171.551 1.00176.35 ATOM 121 N ASP D1126 117.698 148.435 171.159 1.00198.72 ATOM 122 CA ASP D1126 116.644 148.863 170.256 1.00198.72 ATOM 123 C ASP D1126 116.556 150.382 170.278 1.00198.72 ATOM 124 O ASP D1126 116.357 150.986 171.339 1.00198.72 ATOM 125 CB ASP D1126 115.316 148.238 170.660 1.00198.72 ATOM 126 CG ASP D1126 114.421 147.974 169.476 1.00198.72 ATOM 127 OD1 ASP D1126 114.681 148.550 168.400 1.00198.72 ATOM 128 OD2 ASP D1126 113.462 147.186 169.617 1.00198.72 ATOM 129 N GLU D1127 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1.00206.42 ATOM 147 C THR D1129 114.051 152.727 173.094 1.00206.42 ATOM 148 O THR D1129 113.847 153.250 174.195 1.00206.42 ATOM 149 CB THR D1129 112.814 150.596 172.952 1.00206.42 ATOM 150 OG1 THR D1129 114.136 150.073 173.137 1.00206.42 ATOM 151 CG2 THR D1129 112.054 149.696 171.991 1.00206.42 ATOM 152 N ARG D1130 115.222 152.773 172.451 1.00198.83 ATOM 153 CA ARG D1130 116.493 153.161 173.062 1.00198.83 ATOM 154 C ARG D1130 116.735 152.391 174.355 1.00198.83 ATOM 155 O ARG D1130 117.012 152.965 175.408 1.00198.83 ATOM 156 CB ARG D1130 116.568 154.668 173.301 1.00198.83 ATOM 157 CG ARG D1130 117.005 155.457 172.097 1.00198.83 ATOM 158 CD ARG D1130 118.343 154.978 171.588 1.00198.83 ATOM 159 NE ARG D1130 119.412 155.287 172.527 1.00198.83 ATOM 160 CZ ARG D1130 120.702 155.238 172.224 1.00198.83 ATOM 161 NH1 ARG D1130 121.085 154.892 171.005 1.00198.83 ATOM 162 NH2 ARG D1130 121.607 155.537 173.140 1.00198.83 ATOM 163 N SER D1131 116.610 151.070 174.274 1.00185.10 ATOM 164 CA SER D1131 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