HEADER TRANSCRIPTION 31-DEC-69 6M6B TITLE Cryo-EM structure of Thermus thermophilus Mfd in complex with RNA TITLE 2 polymerase and ATP-gamma-S COMPND MOL_ID: 3; COMPND 2 MOLECULE: DNA-directed RNA polymerase subunit beta'; COMPND 3 CHAIN: D; COMPND 4 EC: 2.7.7.6; EXPDTA ELECTRON MICROSCOPY DBREF 6M6B D 1 1524 UNP Q8RQE8 RPOC_THET8 1 1524 SEQRES 1 D 61 ALA LYS ALA VAL ILE SER GLU ILE ASP GLY VAL VAL ARG SEQRES 2 D 61 ILE GLU GLU THR GLU GLU LYS LEU SER VAL PHE VAL GLU SEQRES 3 D 61 SER GLU GLY PHE SER LYS GLU TYR LYS LEU PRO LYS GLU SEQRES 4 D 61 ALA ARG LEU LEU VAL LYS ASP GLY ASP TYR VAL GLU ALA SEQRES 5 D 61 GLY GLN PRO LEU THR ARG GLY ALA ILE ATOM 1 N ALA D1270 126.296 157.464 153.412 1.00163.33 ATOM 2 CA ALA D1270 125.778 158.233 154.539 1.00163.33 ATOM 3 C ALA D1270 126.772 158.161 155.696 1.00163.33 ATOM 4 O ALA D1270 126.583 157.451 156.683 1.00163.33 ATOM 5 CB ALA D1270 124.405 157.721 154.945 1.00163.33 ATOM 6 N LYS D1271 127.856 158.912 155.543 1.00154.27 ATOM 7 CA LYS D1271 128.977 158.847 156.472 1.00154.27 ATOM 8 C LYS D1271 128.569 159.503 157.778 1.00154.27 ATOM 9 O LYS D1271 128.678 160.719 157.939 1.00154.27 ATOM 10 CB LYS D1271 130.200 159.523 155.872 1.00154.27 ATOM 11 CG LYS D1271 130.565 159.002 154.504 1.00154.27 ATOM 12 CD LYS D1271 131.287 160.054 153.685 1.00154.27 ATOM 13 CE LYS D1271 130.338 160.761 152.735 1.00154.27 ATOM 14 NZ LYS D1271 130.037 159.934 151.532 1.00154.27 ATOM 15 N ALA D1272 128.082 158.693 158.712 1.00158.29 ATOM 16 CA ALA D1272 127.696 159.200 160.014 1.00158.29 ATOM 17 C ALA D1272 128.939 159.587 160.807 1.00158.29 ATOM 18 O ALA D1272 130.060 159.161 160.517 1.00158.29 ATOM 19 CB ALA D1272 126.871 158.161 160.767 1.00158.29 ATOM 20 N VAL D1273 128.740 160.424 161.814 1.00160.06 ATOM 21 CA VAL D1273 129.820 160.865 162.678 1.00160.06 ATOM 22 C VAL D1273 129.556 160.323 164.071 1.00160.06 ATOM 23 O VAL D1273 128.440 160.426 164.588 1.00160.06 ATOM 24 CB VAL D1273 129.945 162.399 162.694 1.00160.06 ATOM 25 CG1 VAL D1273 131.166 162.823 163.483 1.00160.06 ATOM 26 CG2 VAL D1273 130.025 162.923 161.275 1.00160.06 ATOM 27 N ILE D1274 130.583 159.727 164.666 1.00171.05 ATOM 28 CA ILE D1274 130.472 159.118 165.982 1.00171.05 ATOM 29 C ILE D1274 131.217 159.977 166.985 1.00171.05 ATOM 30 O ILE D1274 131.895 160.940 166.615 1.00171.05 ATOM 31 CB ILE D1274 131.033 157.691 165.979 1.00171.05 ATOM 32 CG1 ILE D1274 132.551 157.753 165.843 1.00171.05 ATOM 33 CG2 ILE D1274 130.445 156.902 164.838 1.00171.05 ATOM 34 CD1 ILE D1274 133.216 156.415 165.783 1.00171.05 ATOM 35 N SER D1275 131.093 159.637 168.260 1.00181.73 ATOM 36 CA SER D1275 131.884 160.291 169.283 1.00181.73 ATOM 37 C SER D1275 133.266 159.670 169.349 1.00181.73 ATOM 38 O SER D1275 133.459 158.501 169.007 1.00181.73 ATOM 39 CB SER D1275 131.205 160.184 170.643 1.00181.73 ATOM 40 OG SER D1275 132.153 160.302 171.689 1.00181.73 ATOM 41 N GLU D1276 134.230 160.467 169.793 1.00178.37 ATOM 42 CA GLU D1276 135.612 160.038 169.918 1.00178.37 ATOM 43 C GLU D1276 136.145 160.201 171.325 1.00178.37 ATOM 44 O GLU D1276 137.028 159.448 171.736 1.00178.37 ATOM 45 CB GLU D1276 136.501 160.831 168.953 1.00178.37 ATOM 46 CG GLU D1276 136.364 160.419 167.495 1.00178.37 ATOM 47 CD GLU D1276 135.091 160.937 166.849 1.00178.37 ATOM 48 OE1 GLU D1276 134.527 161.917 167.372 1.00178.37 ATOM 49 OE2 GLU D1276 134.643 160.356 165.838 1.00178.37 ATOM 50 N ILE D1277 135.629 161.178 172.056 1.00182.29 ATOM 51 CA ILE D1277 135.940 161.399 173.458 1.00182.29 ATOM 52 C ILE D1277 134.603 161.502 174.169 1.00182.29 ATOM 53 O ILE D1277 133.677 162.135 173.656 1.00182.29 ATOM 54 CB ILE D1277 136.791 162.674 173.658 1.00182.29 ATOM 55 CG1 ILE D1277 138.132 162.580 172.919 1.00182.29 ATOM 56 CG2 ILE D1277 137.043 162.949 175.129 1.00182.29 ATOM 57 CD1 ILE D1277 138.156 163.235 171.540 1.00182.29 ATOM 58 N ASP D1278 134.482 160.859 175.326 1.00195.80 ATOM 59 CA ASP D1278 133.204 160.826 176.016 1.00195.80 ATOM 60 C ASP D1278 132.870 162.186 176.623 1.00195.80 ATOM 61 O ASP D1278 133.730 163.053 176.796 1.00195.80 ATOM 62 CB ASP D1278 133.219 159.757 177.098 1.00195.80 ATOM 63 CG ASP D1278 133.718 158.439 176.581 1.00195.80 ATOM 64 OD1 ASP D1278 133.503 158.166 175.385 1.00195.80 ATOM 65 OD2 ASP D1278 134.335 157.684 177.359 1.00195.80 ATOM 66 N GLY D1279 131.597 162.359 176.943 1.00201.53 ATOM 67 CA GLY D1279 131.091 163.626 177.428 1.00201.53 ATOM 68 C GLY D1279 129.636 163.779 177.062 1.00201.53 ATOM 69 O GLY D1279 129.034 162.918 176.422 1.00201.53 ATOM 70 N VAL D1280 129.070 164.895 177.481 1.00203.90 ATOM 71 CA VAL D1280 127.647 165.127 177.287 1.00203.90 ATOM 72 C VAL D1280 127.419 165.697 175.893 1.00203.90 ATOM 73 O VAL D1280 128.338 166.211 175.254 1.00203.90 ATOM 74 CB VAL D1280 127.097 166.050 178.393 1.00203.90 ATOM 75 CG1 VAL D1280 127.356 167.514 178.070 1.00203.90 ATOM 76 CG2 VAL D1280 125.626 165.779 178.655 1.00203.90 ATOM 77 N VAL D1281 126.198 165.567 175.391 1.00210.21 ATOM 78 CA VAL D1281 125.832 166.164 174.114 1.00210.21 ATOM 79 C VAL D1281 125.146 167.491 174.388 1.00210.21 ATOM 80 O VAL D1281 124.135 167.545 175.097 1.00210.21 ATOM 81 CB VAL D1281 124.922 165.238 173.297 1.00210.21 ATOM 82 CG1 VAL D1281 124.335 165.993 172.122 1.00210.21 ATOM 83 CG2 VAL D1281 125.699 164.035 172.807 1.00210.21 ATOM 84 N ARG D1282 125.689 168.559 173.827 1.00216.04 ATOM 85 CA ARG D1282 125.078 169.876 173.900 1.00216.04 ATOM 86 C ARG D1282 124.818 170.274 172.454 1.00216.04 ATOM 87 O ARG D1282 125.741 170.688 171.746 1.00216.04 ATOM 88 CB ARG D1282 125.990 170.862 174.625 1.00216.04 ATOM 89 CG ARG D1282 125.304 172.118 175.140 1.00216.04 ATOM 90 CD ARG D1282 125.261 173.232 174.118 1.00216.04 ATOM 91 NE ARG D1282 126.577 173.550 173.583 1.00216.04 ATOM 92 CZ ARG D1282 127.438 174.371 174.171 1.00216.04 ATOM 93 NH1 ARG D1282 127.118 174.953 175.317 1.00216.04 ATOM 94 NH2 ARG D1282 128.618 174.610 173.617 1.00216.04 ATOM 95 N ILE D1283 123.578 170.116 172.002 1.00218.52 ATOM 96 CA ILE D1283 123.261 170.507 170.639 1.00218.52 ATOM 97 C ILE D1283 123.115 172.021 170.574 1.00218.52 ATOM 98 O ILE D1283 122.877 172.700 171.575 1.00218.52 ATOM 99 CB ILE D1283 121.995 169.809 170.108 1.00218.52 ATOM 100 CG1 ILE D1283 120.738 170.364 170.767 1.00218.52 ATOM 101 CG2 ILE D1283 122.062 168.326 170.353 1.00218.52 ATOM 102 CD1 ILE D1283 119.468 169.880 170.143 1.00218.52 ATOM 103 N GLU D1284 123.278 172.550 169.369 1.00235.62 ATOM 104 CA GLU D1284 123.091 173.966 169.087 1.00235.62 ATOM 105 C GLU D1284 122.406 174.052 167.736 1.00235.62 ATOM 106 O GLU D1284 122.998 173.702 166.705 1.00235.62 ATOM 107 CB GLU D1284 124.415 174.725 169.092 1.00235.62 ATOM 108 CG GLU D1284 124.920 175.029 170.480 1.00235.62 ATOM 109 CD GLU D1284 123.908 175.824 171.271 1.00235.62 ATOM 110 OE1 GLU D1284 123.406 176.835 170.738 1.00235.62 ATOM 111 OE2 GLU D1284 123.594 175.436 172.413 1.00235.62 ATOM 112 N GLU D1285 121.153 174.487 167.755 1.00241.34 ATOM 113 CA GLU D1285 120.322 174.555 166.562 1.00241.34 ATOM 114 C GLU D1285 120.147 176.021 166.201 1.00241.34 ATOM 115 O GLU D1285 119.251 176.702 166.700 1.00241.34 ATOM 116 CB GLU D1285 118.979 173.874 166.790 1.00241.34 ATOM 117 CG GLU D1285 118.224 173.546 165.510 1.00241.34 ATOM 118 CD GLU D1285 117.362 174.686 165.020 1.00241.34 ATOM 119 OE1 GLU D1285 116.780 175.398 165.861 1.00241.34 ATOM 120 OE2 GLU D1285 117.273 174.874 163.791 1.00241.34 ATOM 121 N THR D1286 121.019 176.516 165.335 1.00254.22 ATOM 122 CA THR D1286 120.667 177.678 164.543 1.00254.22 ATOM 123 C THR D1286 119.847 177.181 163.366 1.00254.22 ATOM 124 O THR D1286 119.866 175.989 163.048 1.00254.22 ATOM 125 CB THR D1286 121.906 178.424 164.056 1.00254.22 ATOM 126 OG1 THR D1286 122.612 177.608 163.121 1.00254.22 ATOM 127 CG2 THR D1286 122.825 178.729 165.221 1.00254.22 ATOM 128 N GLU D1287 119.119 178.093 162.723 1.00272.05 ATOM 129 CA GLU D1287 118.179 177.680 161.689 1.00272.05 ATOM 130 C GLU D1287 118.893 177.206 160.427 1.00272.05 ATOM 131 O GLU D1287 118.315 176.445 159.643 1.00272.05 ATOM 132 CB GLU D1287 117.219 178.837 161.388 1.00272.05 ATOM 133 CG GLU D1287 115.920 178.450 160.685 1.00272.05 ATOM 134 CD GLU D1287 116.023 178.479 159.176 1.00272.05 ATOM 135 OE1 GLU D1287 116.837 179.268 158.655 1.00272.05 ATOM 136 OE2 GLU D1287 115.292 177.713 158.513 1.00272.05 ATOM 137 N GLU D1288 120.152 177.590 160.239 1.00266.18 ATOM 138 CA GLU D1288 120.916 177.174 159.078 1.00266.18 ATOM 139 C GLU D1288 122.052 176.215 159.396 1.00266.18 ATOM 140 O GLU D1288 122.616 175.628 158.466 1.00266.18 ATOM 141 CB GLU D1288 121.484 178.405 158.358 1.00266.18 ATOM 142 CG GLU D1288 122.103 179.414 159.302 1.00266.18 ATOM 143 CD GLU D1288 123.580 179.191 159.498 1.00266.18 ATOM 144 OE1 GLU D1288 124.182 178.464 158.680 1.00266.18 ATOM 145 OE2 GLU D1288 124.140 179.743 160.467 1.00266.18 ATOM 146 N LYS D1289 122.407 176.037 160.664 1.00254.80 ATOM 147 CA LYS D1289 123.534 175.200 161.052 1.00254.80 ATOM 148 C LYS D1289 123.167 174.411 162.297 1.00254.80 ATOM 149 O LYS D1289 122.619 174.969 163.252 1.00254.80 ATOM 150 CB LYS D1289 124.786 176.056 161.291 1.00254.80 ATOM 151 CG LYS D1289 125.980 175.362 161.929 1.00254.80 ATOM 152 CD LYS D1289 126.101 175.763 163.398 1.00254.80 ATOM 153 CE LYS D1289 126.256 177.266 163.539 1.00254.80 ATOM 154 NZ LYS D1289 126.236 177.694 164.961 1.00254.80 ATOM 155 N LEU D1290 123.475 173.121 162.281 1.00244.46 ATOM 156 CA LEU D1290 123.317 172.242 163.432 1.00244.46 ATOM 157 C LEU D1290 124.699 171.853 163.929 1.00244.46 ATOM 158 O LEU D1290 125.409 171.092 163.266 1.00244.46 ATOM 159 CB LEU D1290 122.508 171.006 163.059 1.00244.46 ATOM 160 CG LEU D1290 121.018 171.112 163.332 1.00244.46 ATOM 161 CD1 LEU D1290 120.265 169.990 162.642 1.00244.46 ATOM 162 CD2 LEU D1290 120.828 171.051 164.825 1.00244.46 ATOM 163 N SER D1291 125.087 172.366 165.086 1.00229.77 ATOM 164 CA SER D1291 126.336 171.928 165.677 1.00229.77 ATOM 165 C SER D1291 126.044 171.156 166.951 1.00229.77 ATOM 166 O SER D1291 124.953 171.233 167.514 1.00229.77 ATOM 167 CB SER 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