HEADER TRANSFERASE/DNA 31-DEC-69 6N60 TITLE Escherichia coli RNA polymerase sigma70-holoenzyme bound to upstream TITLE 2 fork promoter DNA and Microcin J25 (MccJ25) COMPND MOL_ID: 3; COMPND 2 MOLECULE: DNA-directed RNA polymerase subunit beta'; COMPND 3 CHAIN: D; COMPND 4 EC: 2.7.7.6; COMPND 5 ENGINEERED: YES; EXPDTA X-RAY DIFFRACTION REMARK 2 RESOLUTION. 3.68 ANGSTORMS DBREF 6N60 D 2 1407 UNP P0A8T7 RPOC_ECOLI 2 1407 SEQRES 1 D 79 GLY LEU PRO ARG VAL ALA ASP LEU PHE GLU ALA ARG ARG SEQRES 2 D 79 PRO LYS GLU PRO ALA ILE LEU ALA GLU ILE SER GLY ILE SEQRES 3 D 79 VAL SER PHE GLY LYS GLU THR LYS GLY LYS ARG ARG LEU SEQRES 4 D 79 VAL ILE THR PRO VAL ASP GLY SER ASP PRO TYR GLU GLU SEQRES 5 D 79 MET ILE PRO LYS TRP ARG GLN LEU ASN VAL PHE GLU GLY SEQRES 6 D 79 GLU ARG VAL GLU ARG GLY ASP VAL ILE SER ASP GLY PRO SEQRES 7 D 79 GLU ATOM 1 N GLY D1137 -25.004 -7.783 -49.688 1.00185.34 ATOM 2 CA GLY D1137 -25.604 -8.583 -50.737 1.00185.92 ATOM 3 C GLY D1137 -26.140 -7.794 -51.917 1.00173.38 ATOM 4 O GLY D1137 -25.660 -7.953 -53.043 1.00190.24 ATOM 5 N LEU D1138 -27.138 -6.947 -51.678 1.00177.84 ATOM 6 CA LEU D1138 -27.783 -6.202 -52.756 1.00184.78 ATOM 7 C LEU D1138 -27.012 -4.939 -53.147 1.00183.95 ATOM 8 O LEU D1138 -26.847 -4.685 -54.349 1.00147.96 ATOM 9 CB LEU D1138 -29.237 -5.878 -52.378 1.00172.68 ATOM 10 CG LEU D1138 -29.760 -4.483 -52.012 1.00169.84 ATOM 11 CD1 LEU D1138 -30.045 -3.631 -53.242 1.00155.33 ATOM 12 CD2 LEU D1138 -31.001 -4.596 -51.147 1.00190.04 ATOM 13 N PRO D1139 -26.520 -4.122 -52.201 1.00180.01 ATOM 14 CA PRO D1139 -25.787 -2.906 -52.600 1.00148.73 ATOM 15 C PRO D1139 -24.483 -3.194 -53.319 1.00162.81 ATOM 16 O PRO D1139 -23.831 -2.249 -53.794 1.00172.86 ATOM 17 CB PRO D1139 -25.529 -2.191 -51.266 1.00136.65 ATOM 18 CG PRO D1139 -26.491 -2.810 -50.299 1.00141.25 ATOM 19 CD PRO D1139 -26.593 -4.226 -50.732 1.00164.77 ATOM 20 N ARG D1140 -24.074 -4.464 -53.386 1.00161.64 ATOM 21 CA ARG D1140 -22.974 -4.860 -54.252 1.00181.40 ATOM 22 C ARG D1140 -23.253 -4.488 -55.699 1.00181.50 ATOM 23 O ARG D1140 -22.316 -4.383 -56.500 1.00202.41 ATOM 24 CB ARG D1140 -22.735 -6.365 -54.122 1.00190.25 ATOM 25 CG ARG D1140 -21.301 -6.774 -54.368 1.00196.94 ATOM 26 CD ARG D1140 -20.716 -7.455 -53.149 1.00199.39 ATOM 27 NE ARG D1140 -19.264 -7.325 -53.111 1.00200.76 ATOM 28 CZ ARG D1140 -18.626 -6.300 -52.558 1.00204.67 ATOM 29 NH1 ARG D1140 -19.313 -5.314 -51.996 1.00191.21 ATOM 30 NH2 ARG D1140 -17.301 -6.259 -52.565 1.00211.97 ATOM 31 N VAL D1141 -24.522 -4.280 -56.047 1.00146.55 ATOM 32 CA VAL D1141 -24.896 -3.800 -57.372 1.00161.05 ATOM 33 C VAL D1141 -24.932 -2.279 -57.418 1.00157.26 ATOM 34 O VAL D1141 -24.514 -1.675 -58.407 1.00158.68 ATOM 35 CB VAL D1141 -26.255 -4.401 -57.789 1.00163.00 ATOM 36 CG1 VAL D1141 -26.613 -3.994 -59.215 1.00156.54 ATOM 37 CG2 VAL D1141 -26.236 -5.902 -57.650 1.00195.85 ATOM 38 N ALA D1142 -25.449 -1.637 -56.367 1.00151.51 ATOM 39 CA ALA D1142 -25.585 -0.182 -56.374 1.00155.31 ATOM 40 C ALA D1142 -24.225 0.507 -56.405 1.00165.75 ATOM 41 O ALA D1142 -24.016 1.463 -57.163 1.00168.67 ATOM 42 CB ALA D1142 -26.390 0.275 -55.157 1.00186.49 ATOM 43 N ASP D1143 -23.289 0.045 -55.571 1.00168.06 ATOM 44 CA ASP D1143 -21.946 0.620 -55.579 1.00161.41 ATOM 45 C ASP D1143 -21.274 0.421 -56.932 1.00143.27 ATOM 46 O ASP D1143 -20.524 1.287 -57.399 1.00169.66 ATOM 47 CB ASP D1143 -21.108 -0.001 -54.462 1.00172.62 ATOM 48 CG ASP D1143 -21.766 0.128 -53.102 1.00195.21 ATOM 49 OD1 ASP D1143 -22.848 0.745 -53.020 1.00183.83 ATOM 50 OD2 ASP D1143 -21.200 -0.389 -52.116 1.00193.98 ATOM 51 N LEU D1144 -21.535 -0.717 -57.576 1.00144.57 ATOM 52 CA LEU D1144 -20.978 -0.981 -58.897 1.00161.96 ATOM 53 C LEU D1144 -21.556 -0.025 -59.934 1.00147.07 ATOM 54 O LEU D1144 -20.821 0.557 -60.740 1.00149.57 ATOM 55 CB LEU D1144 -21.261 -2.433 -59.282 1.00141.74 ATOM 56 CG LEU D1144 -20.307 -3.228 -60.173 1.00168.96 ATOM 57 CD1 LEU D1144 -20.832 -4.645 -60.294 1.00180.31 ATOM 58 CD2 LEU D1144 -20.150 -2.601 -61.544 1.00167.94 ATOM 59 N PHE D1145 -22.879 0.144 -59.926 1.00153.47 ATOM 60 CA PHE D1145 -23.539 0.982 -60.921 1.00150.33 ATOM 61 C PHE D1145 -23.171 2.450 -60.748 1.00180.82 ATOM 62 O PHE D1145 -23.065 3.189 -61.734 1.00175.03 ATOM 63 CB PHE D1145 -25.056 0.800 -60.835 1.00145.16 ATOM 64 CG PHE D1145 -25.619 -0.112 -61.886 1.00128.19 ATOM 65 CD1 PHE D1145 -25.289 0.068 -63.217 1.00142.33 ATOM 66 CD2 PHE D1145 -26.470 -1.154 -61.546 1.00121.65 ATOM 67 CE1 PHE D1145 -25.797 -0.765 -64.193 1.00143.44 ATOM 68 CE2 PHE D1145 -26.983 -1.995 -62.523 1.00124.89 ATOM 69 CZ PHE D1145 -26.645 -1.797 -63.848 1.00140.33 ATOM 70 N GLU D1146 -22.983 2.893 -59.503 1.00188.82 ATOM 71 CA GLU D1146 -22.722 4.301 -59.221 1.00166.77 ATOM 72 C GLU D1146 -21.322 4.700 -59.674 1.00177.55 ATOM 73 O GLU D1146 -20.905 5.853 -59.501 1.00199.52 ATOM 74 CB GLU D1146 -22.905 4.589 -57.729 1.00170.59 ATOM 75 CG GLU D1146 -23.208 6.045 -57.435 1.00230.14 ATOM 76 CD GLU D1146 -24.424 6.525 -58.193 1.00198.24 ATOM 77 OE1 GLU D1146 -25.549 6.170 -57.788 1.00192.62 ATOM 78 OE2 GLU D1146 -24.258 7.235 -59.207 1.00191.05 ATOM 79 N ALA D1147 -20.594 3.742 -60.249 1.00160.95 ATOM 80 CA ALA D1147 -19.193 3.888 -60.629 1.00168.43 ATOM 81 C ALA D1147 -18.313 4.240 -59.437 1.00190.80 ATOM 82 O ALA D1147 -17.195 4.734 -59.613 1.00211.07 ATOM 83 CB ALA D1147 -19.012 4.914 -61.754 1.00165.63 ATOM 84 N ARG D1148 -18.801 3.996 -58.224 1.00184.53 ATOM 85 CA ARG D1148 -18.021 4.269 -57.026 1.00197.70 ATOM 86 C ARG D1148 -16.821 3.334 -56.951 1.00216.60 ATOM 87 O ARG D1148 -16.950 2.120 -57.138 1.00225.04 ATOM 88 CB ARG D1148 -18.892 4.109 -55.781 1.00184.29 ATOM 89 CG ARG D1148 -18.113 4.182 -54.483 1.00190.75 ATOM 90 CD ARG D1148 -18.979 3.840 -53.289 1.00192.77 ATOM 91 NE ARG D1148 -18.519 2.633 -52.608 1.00199.70 ATOM 92 CZ ARG D1148 -18.685 2.398 -51.311 1.00201.46 ATOM 93 NH1 ARG D1148 -19.291 3.294 -50.544 1.00201.83 ATOM 94 NH2 ARG D1148 -18.236 1.270 -50.776 1.00178.78 ATOM 95 N ARG D1149 -15.651 3.902 -56.677 1.00234.53 ATOM 96 CA ARG D1149 -14.446 3.105 -56.557 1.00221.32 ATOM 97 C ARG D1149 -14.489 2.282 -55.272 1.00213.63 ATOM 98 O ARG D1149 -15.257 2.583 -54.355 1.00226.18 ATOM 99 CB ARG D1149 -13.216 4.007 -56.562 1.00199.12 ATOM 100 CG ARG D1149 -13.005 4.773 -55.270 1.00175.81 ATOM 101 CD ARG D1149 -11.857 5.761 -55.393 1.00190.65 ATOM 102 NE ARG D1149 -12.123 6.777 -56.408 1.00245.37 ATOM 103 CZ ARG D1149 -11.592 6.777 -57.627 1.00242.20 ATOM 104 NH1 ARG D1149 -10.755 5.815 -57.989 1.00226.31 ATOM 105 NH2 ARG D1149 -11.896 7.742 -58.484 1.00220.69 ATOM 106 N PRO D1150 -13.683 1.227 -55.186 1.00196.87 ATOM 107 CA PRO D1150 -13.569 0.497 -53.922 1.00208.53 ATOM 108 C PRO D1150 -12.935 1.362 -52.844 1.00232.92 ATOM 109 O PRO D1150 -12.324 2.398 -53.113 1.00239.29 ATOM 110 CB PRO D1150 -12.672 -0.694 -54.274 1.00221.47 ATOM 111 CG PRO D1150 -11.929 -0.257 -55.492 1.00223.12 ATOM 112 CD PRO D1150 -12.896 0.590 -56.256 1.00199.61 ATOM 113 N LYS D1151 -13.095 0.912 -51.597 1.00233.76 ATOM 114 CA LYS D1151 -12.527 1.649 -50.473 1.00236.45 ATOM 115 C LYS D1151 -11.007 1.715 -50.568 1.00241.70 ATOM 116 O LYS D1151 -10.407 2.771 -50.334 1.00246.91 ATOM 117 CB LYS D1151 -12.964 1.010 -49.155 1.00210.27 ATOM 118 CG LYS D1151 -13.682 1.968 -48.219 1.00195.39 ATOM 119 CD LYS D1151 -14.270 1.239 -47.021 1.00194.52 ATOM 120 CE LYS D1151 -14.880 2.213 -46.023 1.00184.03 ATOM 121 NZ LYS D1151 -15.926 3.073 -46.641 1.00149.38 ATOM 122 N GLU D1152 -10.368 0.600 -50.910 1.00223.39 ATOM 123 CA GLU D1152 -8.923 0.565 -51.133 1.00213.71 ATOM 124 C GLU D1152 -8.668 0.080 -52.551 1.00207.53 ATOM 125 O GLU D1152 -8.719 -1.135 -52.814 1.00186.74 ATOM 126 CB GLU D1152 -8.225 -0.335 -50.116 1.00212.74 ATOM 127 CG GLU D1152 -6.707 -0.260 -50.168 1.00200.51 ATOM 128 CD GLU D1152 -6.059 -0.608 -48.842 1.00204.98 ATOM 129 OE1 GLU D1152 -6.784 -1.034 -47.919 1.00196.99 ATOM 130 OE2 GLU D1152 -4.826 -0.448 -48.719 1.00199.43 ATOM 131 N PRO D1153 -8.396 0.976 -53.494 1.00228.25 ATOM 132 CA PRO D1153 -8.289 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ATOM 151 N LEU D1156 -3.226 0.577 -61.827 1.00198.45 ATOM 152 CA LEU D1156 -2.879 -0.003 -63.117 1.00218.70 ATOM 153 C LEU D1156 -1.894 0.916 -63.821 1.00214.63 ATOM 154 O LEU D1156 -2.132 2.125 -63.919 1.00200.64 ATOM 155 CB LEU D1156 -4.120 -0.214 -63.995 1.00219.00 ATOM 156 CG LEU D1156 -5.051 -1.393 -63.692 1.00227.64 ATOM 157 CD1 LEU D1156 -4.259 -2.683 -63.539 1.00199.41 ATOM 158 CD2 LEU D1156 -5.911 -1.131 -62.464 1.00195.61 ATOM 159 N ALA D1157 -0.796 0.344 -64.311 1.00213.03 ATOM 160 CA ALA D1157 0.208 1.128 -65.012 1.00199.69 ATOM 161 C ALA D1157 -0.376 1.728 -66.290 1.00199.97 ATOM 162 O ALA D1157 -1.409 1.290 -66.804 1.00216.79 ATOM 163 CB ALA D1157 1.429 0.269 -65.339 1.00212.01 ATOM 164 N GLU D1158 0.313 2.743 -66.808 1.00175.69 ATOM 165 CA GLU D1158 -0.217 3.553 -67.898 1.00176.24 ATOM 166 C GLU D1158 0.084 2.983 -69.280 1.00194.51 ATOM 167 O GLU D1158 -0.812 2.929 -70.129 1.00189.62 ATOM 168 CB GLU D1158 0.327 4.980 -67.795 1.00189.30 ATOM 169 CG GLU D1158 -0.327 5.796 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-55.716 1.00242.41 ATOM 598 C ASP D1212 -5.052 -5.099 -55.064 1.00247.30 ATOM 599 O ASP D1212 -4.860 -3.921 -54.753 1.00267.58 ATOM 600 CB ASP D1212 -3.718 -7.237 -54.931 1.00233.00 ATOM 601 CG ASP D1212 -2.817 -8.201 -55.673 1.00242.84 ATOM 602 OD1 ASP D1212 -3.107 -8.497 -56.852 1.00270.76 ATOM 603 OD2 ASP D1212 -1.810 -8.648 -55.086 1.00217.78 ATOM 604 N GLY D1213 -6.208 -5.726 -54.859 1.00241.80 ATOM 605 CA GLY D1213 -7.387 -5.040 -54.388 1.00235.21 ATOM 606 C GLY D1213 -8.338 -4.744 -55.530 1.00241.71 ATOM 607 O GLY D1213 -7.967 -4.815 -56.706 1.00244.42 ATOM 608 N PRO D1214 -9.591 -4.417 -55.210 1.00233.55 ATOM 609 CA PRO D1214 -10.552 -4.073 -56.265 1.00230.75 ATOM 610 C PRO D1214 -10.142 -2.795 -56.984 1.00223.11 ATOM 611 O PRO D1214 -9.320 -2.014 -56.502 1.00229.95 ATOM 612 CB PRO D1214 -11.874 -3.895 -55.504 1.00222.57 ATOM 613 CG PRO D1214 -11.668 -4.595 -54.194 1.00179.77 ATOM 614 CD PRO D1214 -10.214 -4.439 -53.877 1.00195.17 ATOM 615 N GLU D1215 -10.720 -2.590 -58.164 1.00202.73 ATOM 616 CA GLU D1215 -10.310 -1.504 -59.043 1.00236.88 ATOM 617 C GLU D1215 -11.472 -0.557 -59.309 1.00241.75 ATOM 618 O GLU D1215 -12.638 -0.906 -59.113 1.00216.82 ATOM 619 CB GLU D1215 -9.765 -2.046 -60.372 1.00212.58 ATOM 620 CG GLU D1215 -10.682 -3.047 -61.045 1.00213.39 ATOM 621 CD GLU D1215 -10.184 -4.465 -60.891 1.00217.57 ATOM 622 OE1 GLU D1215 -9.147 -4.799 -61.502 1.00216.69 ATOM 623 OE2 GLU D1215 -10.815 -5.239 -60.144 1.00212.55 TER