HEADER TRANSCRIPTION, Transferase/DNA 31-DEC-69 6OMF TITLE CryoEM structure of SigmaS-transcription initiation complex with TITLE 2 activator Crl COMPND MOL_ID: 3; COMPND 2 MOLECULE: DNA-directed RNA polymerase subunit beta'; COMPND 3 CHAIN: D; COMPND 4 EC: 2.7.7.6; COMPND 5 ENGINEERED: YES; EXPDTA ELECTRON MICROSCOPY REMARK 465 MISSING RESIDUES REMARK 465 THE FOLLOWING RESIDUES WERE NOT LOCATED IN THE REMARK 465 EXPERIMENT. (M=MODEL NUMBER; RES=RESIDUE NAME; C=CHAIN REMARK 465 IDENTIFIER; SSSEQ=SEQUENCE NUMBER; I=INSERTION CODE.) REMARK 465 REMARK 465 M RES C SSSEQI REMARK 465 LYS D 1132 REMARK 465 ASP D 1133 REMARK 465 ILE D 1134 DBREF 6OMF D 1 1407 UNP P0A8T7 RPOC_ECOLI 1 1407 SEQRES 1 D 84 LYS ASP ILE THR GLY GLY LEU PRO ARG VAL ALA ASP LEU SEQRES 2 D 84 PHE GLU ALA ARG ARG PRO LYS GLU PRO ALA ILE LEU ALA SEQRES 3 D 84 GLU ILE SER GLY ILE VAL SER PHE GLY LYS GLU THR LYS SEQRES 4 D 84 GLY LYS ARG ARG LEU VAL ILE THR PRO VAL ASP GLY SER SEQRES 5 D 84 ASP PRO TYR GLU GLU MET ILE PRO LYS TRP ARG GLN LEU SEQRES 6 D 84 ASN VAL PHE GLU GLY GLU ARG VAL GLU ARG GLY ASP VAL SEQRES 7 D 84 ILE SER ASP GLY PRO GLU ATOM 1 N THR D1135 171.838 196.021 167.465 1.00135.98 ATOM 2 CA THR D1135 172.387 195.519 166.212 1.00135.98 ATOM 3 C THR D1135 172.211 194.020 166.114 1.00135.98 ATOM 4 O THR D1135 171.763 193.499 165.098 1.00135.98 ATOM 5 CB THR D1135 173.887 195.827 166.070 1.00135.98 ATOM 6 OG1 THR D1135 174.649 194.683 166.474 1.00135.98 ATOM 7 CG2 THR D1135 174.275 197.018 166.932 1.00135.98 ATOM 8 N GLY D1136 172.567 193.340 167.189 1.00129.14 ATOM 9 CA GLY D1136 172.738 191.907 167.177 1.00129.14 ATOM 10 C GLY D1136 174.173 191.531 166.856 1.00129.14 ATOM 11 O GLY D1136 174.917 192.271 166.211 1.00129.14 ATOM 12 N GLY D1137 174.578 190.376 167.359 1.00125.79 ATOM 13 CA GLY D1137 175.905 189.906 167.042 1.00125.79 ATOM 14 C GLY D1137 175.882 188.994 165.844 1.00125.79 ATOM 15 O GLY D1137 176.556 189.233 164.845 1.00125.79 ATOM 16 N LEU D1138 175.092 187.962 165.926 1.00124.54 ATOM 17 CA LEU D1138 174.970 187.046 164.807 1.00124.54 ATOM 18 C LEU D1138 174.137 187.584 163.642 1.00124.54 ATOM 19 O LEU D1138 174.580 187.421 162.497 1.00124.54 ATOM 20 CB LEU D1138 174.418 185.703 165.280 1.00124.54 ATOM 21 CG LEU D1138 174.488 184.562 164.284 1.00124.54 ATOM 22 CD1 LEU D1138 175.867 184.487 163.710 1.00124.54 ATOM 23 CD2 LEU D1138 174.172 183.289 165.006 1.00124.54 ATOM 24 N PRO D1139 172.964 188.209 163.822 1.00124.75 ATOM 25 CA PRO D1139 172.249 188.698 162.641 1.00124.75 ATOM 26 C PRO D1139 172.918 189.864 161.947 1.00124.75 ATOM 27 O PRO D1139 172.641 190.080 160.767 1.00124.75 ATOM 28 CB PRO D1139 170.892 189.119 163.208 1.00124.75 ATOM 29 CG PRO D1139 170.749 188.356 164.408 1.00124.75 ATOM 30 CD PRO D1139 172.090 188.386 164.997 1.00124.75 ATOM 31 N ARG D1140 173.808 190.589 162.616 1.00125.14 ATOM 32 CA ARG D1140 174.584 191.601 161.920 1.00125.14 ATOM 33 C ARG D1140 175.491 190.971 160.883 1.00125.14 ATOM 34 O ARG D1140 175.565 191.450 159.749 1.00125.14 ATOM 35 CB ARG D1140 175.408 192.412 162.909 1.00125.14 ATOM 36 CG ARG D1140 176.234 193.493 162.273 1.00125.14 ATOM 37 CD ARG D1140 175.363 194.404 161.457 1.00125.14 ATOM 38 NE ARG D1140 176.108 195.510 160.891 1.00125.14 ATOM 39 CZ ARG D1140 175.588 196.382 160.039 1.00125.14 ATOM 40 NH1 ARG D1140 174.323 196.263 159.666 1.00125.14 ATOM 41 NH2 ARG D1140 176.328 197.370 159.561 1.00125.14 ATOM 42 N VAL D1141 176.138 189.866 161.235 1.00122.67 ATOM 43 CA VAL D1141 176.957 189.151 160.270 1.00122.67 ATOM 44 C VAL D1141 176.085 188.522 159.200 1.00122.67 ATOM 45 O VAL D1141 176.404 188.574 158.004 1.00122.67 ATOM 46 CB VAL D1141 177.803 188.101 160.996 1.00122.67 ATOM 47 CG1 VAL D1141 178.702 187.397 160.029 1.00122.67 ATOM 48 CG2 VAL D1141 178.593 188.749 162.075 1.00122.67 ATOM 49 N ALA D1142 174.951 187.959 159.604 1.00130.11 ATOM 50 CA ALA D1142 174.067 187.293 158.659 1.00130.11 ATOM 51 C ALA D1142 173.356 188.252 157.719 1.00130.11 ATOM 52 O ALA D1142 172.790 187.800 156.725 1.00130.11 ATOM 53 CB ALA D1142 173.027 186.462 159.406 1.00130.11 ATOM 54 N ASP D1143 173.343 189.548 158.011 1.00135.19 ATOM 55 CA ASP D1143 172.814 190.527 157.078 1.00135.19 ATOM 56 C ASP D1143 173.908 191.288 156.357 1.00135.19 ATOM 57 O ASP D1143 173.639 191.907 155.327 1.00135.19 ATOM 58 CB ASP D1143 171.889 191.503 157.794 1.00135.19 ATOM 59 CG ASP D1143 170.740 190.810 158.464 1.00135.19 ATOM 60 OD1 ASP D1143 170.475 189.643 158.111 1.00135.19 ATOM 61 OD2 ASP D1143 170.113 191.420 159.352 1.00135.19 ATOM 62 N LEU D1144 175.128 191.277 156.874 1.00127.63 ATOM 63 CA LEU D1144 176.206 191.867 156.103 1.00127.63 ATOM 64 C LEU D1144 176.630 190.954 154.971 1.00127.63 ATOM 65 O LEU D1144 176.868 191.416 153.855 1.00127.63 ATOM 66 CB LEU D1144 177.390 192.170 157.004 1.00127.63 ATOM 67 CG LEU D1144 177.192 193.481 157.721 1.00127.63 ATOM 68 CD1 LEU D1144 178.296 193.640 158.717 1.00127.63 ATOM 69 CD2 LEU D1144 177.200 194.592 156.711 1.00127.63 ATOM 70 N PHE D1145 176.715 189.654 155.242 1.00126.79 ATOM 71 CA PHE D1145 177.048 188.730 154.171 1.00126.79 ATOM 72 C PHE D1145 175.891 188.555 153.213 1.00126.79 ATOM 73 O PHE D1145 176.106 188.308 152.025 1.00126.79 ATOM 74 CB PHE D1145 177.480 187.397 154.747 1.00126.79 ATOM 75 CG PHE D1145 178.895 187.385 155.174 1.00126.79 ATOM 76 CD1 PHE D1145 179.878 187.812 154.314 1.00126.79 ATOM 77 CD2 PHE D1145 179.244 186.999 156.443 1.00126.79 ATOM 78 CE1 PHE D1145 181.187 187.820 154.700 1.00126.79 ATOM 79 CE2 PHE D1145 180.556 187.006 156.836 1.00126.79 ATOM 80 CZ PHE D1145 181.527 187.413 155.962 1.00126.79 ATOM 81 N GLU D1146 174.664 188.708 153.695 1.00137.29 ATOM 82 CA GLU D1146 173.526 188.684 152.796 1.00137.29 ATOM 83 C GLU D1146 173.377 189.980 152.025 1.00137.29 ATOM 84 O GLU D1146 172.697 189.986 150.996 1.00137.29 ATOM 85 CB GLU D1146 172.252 188.405 153.570 1.00137.29 ATOM 86 CG GLU D1146 171.617 187.127 153.155 1.00137.29 ATOM 87 CD GLU D1146 171.502 187.048 151.660 1.00137.29 ATOM 88 OE1 GLU D1146 170.745 187.853 151.086 1.00137.29 ATOM 89 OE2 GLU D1146 172.186 186.202 151.052 1.00137.29 ATOM 90 N ALA D1147 174.003 191.056 152.505 1.00139.06 ATOM 91 CA ALA D1147 173.959 192.391 151.911 1.00139.06 ATOM 92 C ALA D1147 172.529 192.879 151.717 1.00139.06 ATOM 93 O ALA D1147 172.116 193.251 150.620 1.00139.06 ATOM 94 CB ALA D1147 174.731 192.440 150.598 1.00139.06 ATOM 95 N ARG D1148 171.762 192.860 152.796 1.00151.54 ATOM 96 CA ARG D1148 170.409 193.374 152.738 1.00151.54 ATOM 97 C ARG D1148 170.417 194.890 152.722 1.00151.54 ATOM 98 O ARG D1148 171.345 195.535 153.212 1.00151.54 ATOM 99 CB ARG D1148 169.591 192.877 153.920 1.00151.54 ATOM 100 CG ARG D1148 169.102 191.477 153.737 1.00151.54 ATOM 101 CD ARG D1148 168.158 191.065 154.840 1.00151.54 ATOM 102 NE ARG D1148 167.657 189.718 154.605 1.00151.54 ATOM 103 CZ ARG D1148 168.294 188.617 154.980 1.00151.54 ATOM 104 NH1 ARG D1148 169.449 188.705 155.617 1.00151.54 ATOM 105 NH2 ARG D1148 167.778 187.426 154.725 1.00151.54 ATOM 106 N ARG D1149 169.374 195.451 152.148 1.00154.11 ATOM 107 CA ARG D1149 169.189 196.887 152.151 1.00154.11 ATOM 108 C ARG D1149 168.767 197.344 153.537 1.00154.11 ATOM 109 O ARG D1149 167.714 196.914 154.021 1.00154.11 ATOM 110 CB ARG D1149 168.132 197.269 151.135 1.00154.11 ATOM 111 CG ARG D1149 168.467 196.853 149.726 1.00154.11 ATOM 112 CD ARG D1149 169.344 197.895 149.091 1.00154.11 ATOM 113 NE ARG D1149 168.859 199.230 149.419 1.00154.11 ATOM 114 CZ ARG D1149 169.412 200.356 148.989 1.00154.11 ATOM 115 NH1 ARG D1149 170.476 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