HEADER TRANSCRIPTION/DNA 31-DEC-69 6PB5 TITLE The E. coli class-II CAP-dependent transcription activation complex TITLE 2 at the state 1 architecture COMPND MOL_ID: 3; COMPND 2 MOLECULE: DNA-directed RNA polymerase subunit beta'; COMPND 3 CHAIN: D; COMPND 4 EC: 2.7.7.6; COMPND 5 ENGINEERED: YES; EXPDTA ELECTRON MICROSCOPY REMARK 465 MISSING RESIDUES REMARK 465 THE FOLLOWING RESIDUES WERE NOT LOCATED IN THE REMARK 465 EXPERIMENT. (M=MODEL NUMBER; RES=RESIDUE NAME; C=CHAIN REMARK 465 IDENTIFIER; SSSEQ=SEQUENCE NUMBER; I=INSERTION CODE.) REMARK 465 REMARK 465 M RES C SSSEQI REMARK 465 LYS D 1132 REMARK 465 ASP D 1133 REMARK 465 ILE D 1134 REMARK 465 THR D 1135 REMARK 465 GLY D 1136 DBREF 6PB5 D 1 1407 UNP P0A8T8 RPOC_ECO57 1 1407 SEQRES 1 D 84 LYS ASP ILE THR GLY GLY LEU PRO ARG VAL ALA ASP LEU SEQRES 2 D 84 PHE GLU ALA ARG ARG PRO LYS GLU PRO ALA ILE LEU ALA SEQRES 3 D 84 GLU ILE SER GLY ILE VAL SER PHE GLY LYS GLU THR LYS SEQRES 4 D 84 GLY LYS ARG ARG LEU VAL ILE THR PRO VAL ASP GLY SER SEQRES 5 D 84 ASP PRO TYR GLU GLU MET ILE PRO LYS TRP ARG GLN LEU SEQRES 6 D 84 ASN VAL PHE GLU GLY GLU ARG VAL GLU ARG GLY ASP VAL SEQRES 7 D 84 ILE SER ASP GLY PRO GLU ATOM 1 N GLY D1137 169.365 147.736 147.704 1.00 20.00 ATOM 2 CA GLY D1137 169.231 148.831 148.648 1.00 20.00 ATOM 3 C GLY D1137 169.687 150.181 148.113 1.00 20.00 ATOM 4 O GLY D1137 169.613 150.441 146.917 1.00 20.00 ATOM 5 HA2 GLY D1137 168.302 148.899 148.911 1.00 20.00 ATOM 6 HA3 GLY D1137 169.763 148.626 149.435 1.00 20.00 ATOM 7 N LEU D1138 170.094 151.061 149.032 1.00 20.00 ATOM 8 CA LEU D1138 170.904 152.247 148.764 1.00 20.00 ATOM 9 C LEU D1138 172.395 151.900 148.687 1.00 20.00 ATOM 10 O LEU D1138 173.156 152.638 148.043 1.00 20.00 ATOM 11 CB LEU D1138 170.661 153.308 149.839 1.00 20.00 ATOM 12 CG LEU D1138 171.227 154.716 149.611 1.00 20.00 ATOM 13 CD1 LEU D1138 170.632 155.366 148.372 1.00 20.00 ATOM 14 CD2 LEU D1138 170.948 155.597 150.819 1.00 20.00 ATOM 15 H LEU D1138 169.913 150.976 149.870 1.00 20.00 ATOM 16 HA LEU D1138 170.651 152.629 147.911 1.00 20.00 ATOM 17 HB2 LEU D1138 169.704 153.392 149.957 1.00 20.00 ATOM 18 HB3 LEU D1138 171.062 152.985 150.661 1.00 20.00 ATOM 19 HG LEU D1138 172.189 154.669 149.488 1.00 20.00 ATOM 20 HD11 LEU D1138 170.579 156.325 148.521 1.00 20.00 ATOM 21 HD12 LEU D1138 171.202 155.180 147.612 1.00 20.00 ATOM 22 HD13 LEU D1138 169.746 155.006 148.222 1.00 20.00 ATOM 23 HD21 LEU D1138 171.518 156.375 150.766 1.00 20.00 ATOM 24 HD22 LEU D1138 170.020 155.876 150.808 1.00 20.00 ATOM 25 HD23 LEU D1138 171.140 155.101 151.630 1.00 20.00 ATOM 26 N PRO D1139 172.885 150.840 149.355 1.00 20.00 ATOM 27 CA PRO D1139 174.260 150.412 149.059 1.00 20.00 ATOM 28 C PRO D1139 174.498 150.079 147.588 1.00 20.00 ATOM 29 O PRO D1139 175.532 150.470 147.027 1.00 20.00 ATOM 30 CB PRO D1139 174.436 149.181 149.963 1.00 20.00 ATOM 31 CG PRO D1139 173.578 149.440 151.097 1.00 20.00 ATOM 32 CD PRO D1139 172.389 150.141 150.562 1.00 20.00 ATOM 33 HA PRO D1139 174.870 151.108 149.350 1.00 20.00 ATOM 34 HB2 PRO D1139 174.139 148.383 149.500 1.00 20.00 ATOM 35 HB3 PRO D1139 175.356 149.090 150.253 1.00 20.00 ATOM 36 HG2 PRO D1139 173.315 148.594 151.496 1.00 20.00 ATOM 37 HG3 PRO D1139 174.036 149.993 151.743 1.00 20.00 ATOM 38 HD2 PRO D1139 171.720 149.482 150.336 1.00 20.00 ATOM 39 HD3 PRO D1139 172.056 150.782 151.204 1.00 20.00 ATOM 40 N ARG D1140 173.565 149.384 146.933 1.00 20.00 ATOM 41 CA ARG D1140 173.741 149.101 145.512 1.00 20.00 ATOM 42 C ARG D1140 173.657 150.378 144.695 1.00 20.00 ATOM 43 O ARG D1140 174.206 150.452 143.594 1.00 20.00 ATOM 44 CB ARG D1140 172.721 148.070 145.025 1.00 20.00 ATOM 45 CG ARG D1140 171.286 148.480 145.130 1.00 20.00 ATOM 46 CD ARG D1140 170.382 147.334 144.714 1.00 20.00 ATOM 47 NE ARG D1140 170.489 147.038 143.291 1.00 20.00 ATOM 48 CZ ARG D1140 169.996 145.957 142.693 1.00 20.00 ATOM 49 NH1 ARG D1140 169.345 145.026 143.378 1.00 20.00 ATOM 50 NH2 ARG D1140 170.142 145.825 141.383 1.00 20.00 ATOM 51 H ARG D1140 172.826 149.108 147.269 1.00 20.00 ATOM 52 HA ARG D1140 174.626 148.728 145.363 1.00 20.00 ATOM 53 HB2 ARG D1140 172.874 147.912 144.082 1.00 20.00 ATOM 54 HB3 ARG D1140 172.842 147.248 145.522 1.00 20.00 ATOM 55 HG2 ARG D1140 171.100 148.727 146.040 1.00 20.00 ATOM 56 HG3 ARG D1140 171.110 149.224 144.536 1.00 20.00 ATOM 57 HD2 ARG D1140 170.632 146.534 145.203 1.00 20.00 ATOM 58 HD3 ARG D1140 169.461 147.575 144.896 1.00 20.00 ATOM 59 HE ARG D1140 170.995 147.550 142.820 1.00 20.00 ATOM 60 HH11 ARG D1140 169.236 145.100 144.224 1.00 20.00 ATOM 61 HH12 ARG D1140 169.034 144.336 142.971 1.00 20.00 ATOM 62 HH21 ARG D1140 170.558 146.432 140.936 1.00 20.00 ATOM 63 HH22 ARG D1140 169.829 145.133 140.980 1.00 20.00 ATOM 64 N VAL D1141 172.961 151.388 145.212 1.00 20.00 ATOM 65 CA VAL D1141 172.950 152.693 144.566 1.00 20.00 ATOM 66 C VAL D1141 174.348 153.286 144.586 1.00 20.00 ATOM 67 O VAL D1141 174.854 153.791 143.571 1.00 20.00 ATOM 68 CB VAL D1141 171.948 153.626 145.264 1.00 20.00 ATOM 69 CG1 VAL D1141 171.980 155.005 144.644 1.00 20.00 ATOM 70 CG2 VAL D1141 170.560 153.069 145.179 1.00 20.00 ATOM 71 H VAL D1141 172.507 151.349 145.939 1.00 20.00 ATOM 72 HA VAL D1141 172.669 152.590 143.649 1.00 20.00 ATOM 73 HB VAL D1141 172.188 153.707 146.187 1.00 20.00 ATOM 74 HG11 VAL D1141 171.071 155.347 144.641 1.00 20.00 ATOM 75 HG12 VAL D1141 172.564 155.589 145.166 1.00 20.00 ATOM 76 HG13 VAL D1141 172.302 154.907 143.736 1.00 20.00 ATOM 77 HG21 VAL D1141 169.963 153.633 145.698 1.00 20.00 ATOM 78 HG22 VAL D1141 170.297 153.058 144.251 1.00 20.00 ATOM 79 HG23 VAL D1141 170.554 152.174 145.533 1.00 20.00 ATOM 80 N ALA D1142 174.984 153.238 145.759 1.00 20.00 ATOM 81 CA ALA D1142 176.378 153.641 145.880 1.00 20.00 ATOM 82 C ALA D1142 177.249 152.892 144.894 1.00 20.00 ATOM 83 O ALA D1142 178.168 153.463 144.297 1.00 20.00 ATOM 84 CB ALA D1142 176.864 153.352 147.291 1.00 20.00 ATOM 85 H ALA D1142 174.633 152.966 146.495 1.00 20.00 ATOM 86 HA ALA D1142 176.460 154.587 145.691 1.00 20.00 ATOM 87 HB1 ALA D1142 177.707 153.794 147.451 1.00 20.00 ATOM 88 HB2 ALA D1142 176.191 153.644 147.917 1.00 20.00 ATOM 89 HB3 ALA D1142 176.968 152.394 147.364 1.00 20.00 ATOM 90 N ASP D1143 177.005 151.592 144.758 1.00 20.00 ATOM 91 CA ASP D1143 177.832 150.777 143.884 1.00 20.00 ATOM 92 C ASP D1143 177.611 151.145 142.421 1.00 20.00 ATOM 93 O ASP D1143 178.569 151.223 141.645 1.00 20.00 ATOM 94 CB ASP D1143 177.539 149.299 144.120 1.00 20.00 ATOM 95 CG ASP D1143 177.710 148.898 145.571 1.00 20.00 ATOM 96 OD1 ASP D1143 178.384 149.643 146.308 1.00 20.00 ATOM 97 OD2 ASP D1143 177.200 147.829 145.972 1.00 20.00 ATOM 98 H ASP D1143 176.390 151.156 145.171 1.00 20.00 ATOM 99 HA ASP D1143 178.766 150.932 144.093 1.00 20.00 ATOM 100 HB2 ASP D1143 176.632 149.103 143.851 1.00 20.00 ATOM 101 HB3 ASP D1143 178.160 148.778 143.594 1.00 20.00 ATOM 102 N LEU D1144 176.357 151.397 142.027 1.00 20.00 ATOM 103 CA LEU D1144 176.088 151.717 140.629 1.00 20.00 ATOM 104 C LEU D1144 176.674 153.060 140.258 1.00 20.00 ATOM 105 O LEU D1144 177.183 153.225 139.144 1.00 20.00 ATOM 106 CB LEU D1144 174.587 151.729 140.322 1.00 20.00 ATOM 107 CG LEU D1144 173.832 150.400 140.229 1.00 20.00 ATOM 108 CD1 LEU D1144 172.381 150.695 140.090 1.00 20.00 ATOM 109 CD2 LEU D1144 174.274 149.561 139.021 1.00 20.00 ATOM 110 H LEU D1144 175.669 151.402 142.546 1.00 20.00 ATOM 111 HA LEU D1144 176.505 151.050 140.071 1.00 20.00 ATOM 112 HB2 LEU D1144 174.148 152.275 140.993 1.00 20.00 ATOM 113 HB3 LEU D1144 174.467 152.168 139.463 1.00 20.00 ATOM 114 HG LEU D1144 173.965 149.885 141.039 1.00 20.00 ATOM 115 HD11 LEU D1144 171.869 149.871 140.094 1.00 20.00 ATOM 116 HD12 LEU D1144 172.081 151.288 140.795 1.00 20.00 ATOM 117 HD13 LEU D1144 172.286 151.132 139.237 1.00 20.00 ATOM 118 HD21 LEU D1144 173.913 148.668 139.122 1.00 20.00 ATOM 119 HD22 LEU D1144 173.935 149.954 138.198 1.00 20.00 ATOM 120 HD23 LEU D1144 175.239 149.518 138.985 1.00 20.00 ATOM 121 N PHE D1145 176.636 154.021 141.174 1.00 20.00 ATOM 122 CA PHE D1145 177.117 155.348 140.824 1.00 20.00 ATOM 123 C PHE D1145 178.634 155.467 140.932 1.00 20.00 ATOM 124 O PHE D1145 179.259 156.100 140.074 1.00 20.00 ATOM 125 CB PHE D1145 176.382 156.368 141.692 1.00 20.00 ATOM 126 CG PHE D1145 174.929 156.586 141.294 1.00 20.00 ATOM 127 CD1 PHE D1145 174.511 156.526 139.967 1.00 20.00 ATOM 128 CD2 PHE D1145 173.970 156.776 142.264 1.00 20.00 ATOM 129 CE1 PHE D1145 173.200 156.712 139.624 1.00 20.00 ATOM 130 CE2 PHE D1145 172.646 156.965 141.924 1.00 20.00 ATOM 131 CZ PHE D1145 172.259 156.921 140.603 1.00 20.00 ATOM 132 H PHE D1145 176.325 153.940 141.975 1.00 20.00 ATOM 133 HA PHE D1145 176.973 155.515 139.888 1.00 20.00 ATOM 134 HB2 PHE D1145 176.396 156.062 142.611 1.00 20.00 ATOM 135 HB3 PHE D1145 176.840 157.216 141.633 1.00 20.00 ATOM 136 HD1 PHE D1145 175.134 156.393 139.292 1.00 20.00 ATOM 137 HD2 PHE D1145 174.230 156.805 143.154 1.00 20.00 ATOM 138 HE1 PHE D1145 172.949 156.681 138.728 1.00 20.00 ATOM 139 HE2 PHE D1145 172.014 157.101 142.592 1.00 20.00 ATOM 140 HZ PHE D1145 171.366 157.041 140.371 1.00 20.00 ATOM 141 N GLU D1146 179.258 154.848 141.932 1.00 20.00 ATOM 142 CA GLU D1146 180.694 155.051 142.099 1.00 20.00 ATOM 143 C GLU D1146 181.538 154.273 141.088 1.00 20.00 ATOM 144 O GLU D1146 182.754 154.484 141.033 1.00 20.00 ATOM 145 CB GLU D1146 181.089 154.715 143.543 1.00 20.00 ATOM 146 CG GLU D1146 182.586 154.828 143.893 1.00 20.00 ATOM 147 CD GLU D1146 183.244 156.152 143.483 1.00 20.00 ATOM 148 OE1 GLU D1146 182.539 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