HEADER TRANSCRIPTION 31-DEC-69 6PMI TITLE Sigm28-transcription initiation complex with specific promoter at the TITLE 2 state 1 COMPND MOL_ID: 3; COMPND 2 MOLECULE: DNA-directed RNA polymerase subunit beta'; COMPND 3 CHAIN: D; COMPND 4 EC: 2.7.7.6; COMPND 5 ENGINEERED: YES; EXPDTA ELECTRON MICROSCOPY REMARK 465 MISSING RESIDUES REMARK 465 THE FOLLOWING RESIDUES WERE NOT LOCATED IN THE REMARK 465 EXPERIMENT. (M=MODEL NUMBER; RES=RESIDUE NAME; C=CHAIN REMARK 465 IDENTIFIER; SSSEQ=SEQUENCE NUMBER; I=INSERTION CODE.) REMARK 465 REMARK 465 M RES C SSSEQI REMARK 465 GLU D 1127 REMARK 465 SER D 1128 REMARK 465 GLY D 1129 REMARK 465 GLY D 1130 REMARK 465 THR D 1131 DBREF 6PMI D 1 1407 UNP P0A8T8 RPOC_ECO57 1 1407 SEQRES 1 D 109 HIS THR MET PRO VAL ILE THR GLU VAL SER GLY PHE VAL SEQRES 2 D 109 ARG PHE THR ASP MET ILE ASP GLY GLN THR ILE THR ARG SEQRES 3 D 109 GLN THR ASP GLU LEU THR GLY LEU SER SER LEU VAL VAL SEQRES 4 D 109 LEU ASP SER ALA GLU ARG THR ALA GLY GLY LYS ASP LEU SEQRES 5 D 109 ARG PRO ALA LEU LYS ILE VAL ASP ALA GLN GLY ASN ASP SEQRES 6 D 109 VAL LEU ILE PRO GLY THR ASP MET PRO ALA GLN TYR PHE SEQRES 7 D 109 LEU PRO GLY LYS ALA ILE VAL GLN LEU GLU ASP GLY VAL SEQRES 8 D 109 GLN ILE SER SER GLY ASP THR LEU ALA ARG ILE PRO GLN SEQRES 9 D 109 GLU SER GLY GLY THR ATOM 1 N HIS D1023 145.496 115.984 188.461 1.00 20.00 ATOM 2 CA HIS D1023 144.263 116.718 188.704 1.00 20.00 ATOM 3 C HIS D1023 144.151 117.248 190.124 1.00 20.00 ATOM 4 O HIS D1023 143.679 118.371 190.325 1.00 20.00 ATOM 5 CB HIS D1023 143.082 115.810 188.375 1.00 20.00 ATOM 6 CG HIS D1023 143.099 115.328 186.963 1.00 20.00 ATOM 7 ND1 HIS D1023 142.779 116.141 185.898 1.00 20.00 ATOM 8 CD2 HIS D1023 143.446 114.132 186.434 1.00 20.00 ATOM 9 CE1 HIS D1023 142.906 115.459 184.775 1.00 20.00 ATOM 10 NE2 HIS D1023 143.309 114.237 185.072 1.00 20.00 ATOM 11 H HIS D1023 145.509 115.230 188.866 1.00 20.00 ATOM 12 HA HIS D1023 144.210 117.477 188.114 1.00 20.00 ATOM 13 HB2 HIS D1023 143.124 115.040 188.964 1.00 20.00 ATOM 14 HB3 HIS D1023 142.256 116.295 188.515 1.00 20.00 ATOM 15 HD2 HIS D1023 143.716 113.379 186.909 1.00 20.00 ATOM 16 HE1 HIS D1023 142.741 115.786 183.921 1.00 20.00 ATOM 17 HE2 HIS D1023 143.462 113.610 184.503 1.00 20.00 ATOM 18 N THR D1024 144.567 116.470 191.117 1.00 20.00 ATOM 19 CA THR D1024 144.437 116.899 192.502 1.00 20.00 ATOM 20 C THR D1024 145.286 118.129 192.795 1.00 20.00 ATOM 21 O THR D1024 146.484 118.165 192.498 1.00 20.00 ATOM 22 CB THR D1024 144.822 115.772 193.449 1.00 20.00 ATOM 23 OG1 THR D1024 143.866 114.718 193.330 1.00 20.00 ATOM 24 CG2 THR D1024 144.891 116.283 194.896 1.00 20.00 ATOM 25 H THR D1024 144.917 115.693 191.015 1.00 20.00 ATOM 26 HA THR D1024 143.519 117.103 192.694 1.00 20.00 ATOM 27 HB THR D1024 145.697 115.432 193.214 1.00 20.00 ATOM 28 HG1 THR D1024 143.800 114.324 194.058 1.00 20.00 ATOM 29 HG21 THR D1024 144.809 115.566 195.524 1.00 20.00 ATOM 30 HG22 THR D1024 145.748 116.692 195.057 1.00 20.00 ATOM 31 HG23 THR D1024 144.183 116.923 195.069 1.00 20.00 ATOM 32 N MET D1025 144.645 119.142 193.378 1.00 20.00 ATOM 33 CA MET D1025 145.321 120.146 194.184 1.00 20.00 ATOM 34 C MET D1025 145.185 119.670 195.628 1.00 20.00 ATOM 35 O MET D1025 144.137 119.904 196.252 1.00 20.00 ATOM 36 CB MET D1025 144.682 121.528 193.998 1.00 20.00 ATOM 37 CG MET D1025 145.340 122.689 194.768 1.00 20.00 ATOM 38 SD MET D1025 144.476 124.249 194.476 1.00 20.00 ATOM 39 CE MET D1025 145.316 125.355 195.613 1.00 20.00 ATOM 40 H MET D1025 143.795 119.259 193.318 1.00 20.00 ATOM 41 HA MET D1025 146.245 120.222 193.908 1.00 20.00 ATOM 42 HB2 MET D1025 144.733 121.754 193.056 1.00 20.00 ATOM 43 HB3 MET D1025 143.753 121.484 194.265 1.00 20.00 ATOM 44 HG2 MET D1025 145.321 122.522 195.722 1.00 20.00 ATOM 45 HG3 MET D1025 146.255 122.793 194.465 1.00 20.00 ATOM 46 HE1 MET D1025 144.767 126.138 195.760 1.00 20.00 ATOM 47 HE2 MET D1025 145.491 124.894 196.454 1.00 20.00 ATOM 48 HE3 MET D1025 146.136 125.649 195.207 1.00 20.00 ATOM 49 N PRO D1026 146.169 118.973 196.197 1.00 20.00 ATOM 50 CA PRO D1026 145.942 118.313 197.486 1.00 20.00 ATOM 51 C PRO D1026 145.860 119.310 198.635 1.00 20.00 ATOM 52 O PRO D1026 146.228 120.480 198.513 1.00 20.00 ATOM 53 CB PRO D1026 147.158 117.394 197.632 1.00 20.00 ATOM 54 CG PRO D1026 148.225 118.080 196.855 1.00 20.00 ATOM 55 CD PRO D1026 147.537 118.722 195.695 1.00 20.00 ATOM 56 HA PRO D1026 145.133 117.773 197.454 1.00 20.00 ATOM 57 HB2 PRO D1026 147.394 117.321 198.568 1.00 20.00 ATOM 58 HB3 PRO D1026 146.951 116.522 197.258 1.00 20.00 ATOM 59 HG2 PRO D1026 148.644 118.757 197.408 1.00 20.00 ATOM 60 HG3 PRO D1026 148.878 117.435 196.546 1.00 20.00 ATOM 61 HD2 PRO D1026 147.976 119.553 195.461 1.00 20.00 ATOM 62 HD3 PRO D1026 147.525 118.114 194.941 1.00 20.00 ATOM 63 N VAL D1027 145.361 118.812 199.769 1.00 20.00 ATOM 64 CA VAL D1027 144.988 119.647 200.910 1.00 20.00 ATOM 65 C VAL D1027 145.692 119.133 202.167 1.00 20.00 ATOM 66 O VAL D1027 145.100 119.102 203.252 1.00 20.00 ATOM 67 CB VAL D1027 143.458 119.677 201.092 1.00 20.00 ATOM 68 CG1 VAL D1027 143.042 120.749 202.125 1.00 20.00 ATOM 69 CG2 VAL D1027 142.752 119.885 199.744 1.00 20.00 ATOM 70 H VAL D1027 145.218 117.972 199.898 1.00 20.00 ATOM 71 HA VAL D1027 145.279 120.559 200.754 1.00 20.00 ATOM 72 HB VAL D1027 143.189 118.814 201.440 1.00 20.00 ATOM 73 HG11 VAL D1027 142.425 121.375 201.713 1.00 20.00 ATOM 74 HG12 VAL D1027 142.615 120.313 202.880 1.00 20.00 ATOM 75 HG13 VAL D1027 143.835 121.224 202.424 1.00 20.00 ATOM 76 HG21 VAL D1027 141.820 120.105 199.902 1.00 20.00 ATOM 77 HG22 VAL D1027 143.189 120.606 199.266 1.00 20.00 ATOM 78 HG23 VAL D1027 142.807 119.072 199.219 1.00 20.00 ATOM 79 N ILE D1028 146.939 118.674 202.012 1.00 20.00 ATOM 80 CA ILE D1028 147.653 117.958 203.069 1.00 20.00 ATOM 81 C ILE D1028 147.694 118.754 204.369 1.00 20.00 ATOM 82 O ILE D1028 147.758 119.990 204.373 1.00 20.00 ATOM 83 CB ILE D1028 149.083 117.614 202.605 1.00 20.00 ATOM 84 CG1 ILE D1028 149.896 118.883 202.264 1.00 20.00 ATOM 85 CG2 ILE D1028 149.026 116.664 201.410 1.00 20.00 ATOM 86 CD1 ILE D1028 151.368 118.639 202.093 1.00 20.00 ATOM 87 H ILE D1028 147.392 118.761 201.288 1.00 20.00 ATOM 88 HA ILE D1028 147.187 117.129 203.256 1.00 20.00 ATOM 89 HB ILE D1028 149.532 117.159 203.334 1.00 20.00 ATOM 90 HG12 ILE D1028 149.564 119.267 201.437 1.00 20.00 ATOM 91 HG13 ILE D1028 149.838 119.543 202.970 1.00 20.00 ATOM 92 HG21 ILE D1028 149.917 116.338 201.210 1.00 20.00 ATOM 93 HG22 ILE D1028 148.447 115.920 201.641 1.00 20.00 ATOM 94 HG23 ILE D1028 148.667 117.136 200.642 1.00 20.00 ATOM 95 HD11 ILE D1028 151.775 119.461 201.790 1.00 20.00 ATOM 96 HD12 ILE D1028 151.742 118.383 202.945 1.00 20.00 ATOM 97 HD13 ILE D1028 151.522 117.935 201.449 1.00 20.00 ATOM 98 N THR D1029 147.665 118.024 205.484 1.00 20.00 ATOM 99 CA THR D1029 147.801 118.577 206.828 1.00 20.00 ATOM 100 C THR D1029 149.170 118.206 207.387 1.00 20.00 ATOM 101 O THR D1029 149.507 117.019 207.471 1.00 20.00 ATOM 102 CB THR D1029 146.706 118.043 207.754 1.00 20.00 ATOM 103 OG1 THR D1029 146.773 116.610 207.798 1.00 20.00 ATOM 104 CG2 THR D1029 145.330 118.483 207.294 1.00 20.00 ATOM 105 H THR D1029 147.546 117.172 205.480 1.00 20.00 ATOM 106 HA THR D1029 147.732 119.543 206.807 1.00 20.00 ATOM 107 HB THR D1029 146.843 118.390 208.649 1.00 20.00 ATOM 108 HG1 THR D1029 146.004 116.282 207.747 1.00 20.00 ATOM 109 HG21 THR D1029 144.679 117.908 207.711 1.00 20.00 ATOM 110 HG22 THR D1029 145.157 119.395 207.568 1.00 20.00 ATOM 111 HG23 THR D1029 145.228 118.413 206.332 1.00 20.00 ATOM 112 N GLU D1030 149.954 119.220 207.768 1.00 20.00 ATOM 113 CA GLU D1030 151.215 118.970 208.462 1.00 20.00 ATOM 114 C GLU D1030 150.985 118.428 209.870 1.00 20.00 ATOM 115 O GLU D1030 151.828 117.691 210.395 1.00 20.00 ATOM 116 CB GLU D1030 152.046 120.255 208.499 1.00 20.00 ATOM 117 CG GLU D1030 153.403 120.138 209.195 1.00 20.00 ATOM 118 CD GLU D1030 154.276 121.364 208.991 1.00 20.00 ATOM 119 OE1 GLU D1030 153.822 122.316 208.321 1.00 20.00 ATOM 120 OE2 GLU D1030 155.423 121.370 209.490 1.00 20.00 ATOM 121 H GLU D1030 149.780 120.052 207.635 1.00 20.00 ATOM 122 HA GLU D1030 151.721 118.310 207.964 1.00 20.00 ATOM 123 HB2 GLU D1030 152.209 120.537 207.586 1.00 20.00 ATOM 124 HB3 GLU D1030 151.536 120.934 208.967 1.00 20.00 ATOM 125 HG2 GLU D1030 153.261 120.035 210.149 1.00 20.00 ATOM 126 HG3 GLU D1030 153.883 119.377 208.850 1.00 20.00 ATOM 127 N VAL D1031 149.868 118.785 210.494 1.00 20.00 ATOM 128 CA VAL D1031 149.502 118.258 211.807 1.00 20.00 ATOM 129 C VAL D1031 148.945 116.848 211.657 1.00 20.00 ATOM 130 O VAL D1031 148.288 116.528 210.657 1.00 20.00 ATOM 131 CB VAL D1031 148.487 119.191 212.498 1.00 20.00 ATOM 132 CG1 VAL D1031 149.105 120.558 212.726 1.00 20.00 ATOM 133 CG2 VAL D1031 147.185 119.329 211.684 1.00 20.00 ATOM 134 H VAL D1031 149.311 119.353 210.175 1.00 20.00 ATOM 135 HA VAL D1031 150.295 118.215 212.366 1.00 20.00 ATOM 136 HB VAL D1031 148.258 118.819 213.366 1.00 20.00 ATOM 137 HG11 VAL D1031 148.496 121.092 213.260 1.00 20.00 ATOM 138 HG12 VAL D1031 149.947 120.446 213.191 1.00 20.00 ATOM 139 HG13 VAL D1031 149.255 120.987 211.869 1.00 20.00 ATOM 140 HG21 VAL D1031 146.563 119.861 212.204 1.00 20.00 ATOM 141 HG22 VAL D1031 147.361 119.779 210.844 1.00 20.00 ATOM 142 HG23 VAL D1031 146.791 118.461 211.512 1.00 20.00 ATOM 143 N SER D1032 149.208 115.998 212.655 1.00 20.00 ATOM 144 CA SER D1032 148.609 114.661 212.748 1.00 20.00 ATOM 145 C SER D1032 147.550 114.692 213.849 1.00 20.00 ATOM 146 O 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