HEADER TRANSCRIPTION 31-DEC-69 6RH3 TITLE Cryo-EM structure of E. coli RNA polymerase elongation complex bound TITLE 2 to CTP substrate COMPND MOL_ID: 5; COMPND 2 MOLECULE: DNA-directed RNA polymerase subunit beta'; COMPND 3 CHAIN: D; COMPND 4 EC: 2.7.7.6; COMPND 5 ENGINEERED: YES; EXPDTA ELECTRON MICROSCOPY DBREF 6RH3 D 1 1407 UNP P0A8T7 RPOC_ECOLI 1 1407 SEQRES 1 D 110 HIS THR MET PRO VAL ILE THR GLU VAL SER GLY PHE VAL SEQRES 2 D 110 ARG PHE THR ASP MET ILE ASP GLY GLN THR ILE THR ARG SEQRES 3 D 110 GLN THR ASP GLU LEU THR GLY LEU SER SER LEU VAL VAL SEQRES 4 D 110 LEU ASP SER ALA GLU ARG THR ALA GLY GLY LYS ASP LEU SEQRES 5 D 110 ARG PRO ALA LEU LYS ILE VAL ASP ALA GLN GLY ASN ASP SEQRES 6 D 110 VAL LEU ILE PRO GLY THR ASP MET PRO ALA GLN TYR PHE SEQRES 7 D 110 LEU PRO GLY LYS ALA ILE VAL GLN LEU GLU ASP GLY VAL SEQRES 8 D 110 GLN ILE SER SER GLY ASP THR LEU ALA ARG ILE PRO GLN SEQRES 9 D 110 GLU SER GLY GLY THR LYS ATOM 1 N HIS D1023 132.110 183.262 134.271 1.00105.54 ATOM 2 CA HIS D1023 131.842 182.032 133.542 1.00105.54 ATOM 3 C HIS D1023 131.722 182.291 132.052 1.00105.54 ATOM 4 O HIS D1023 130.947 181.629 131.362 1.00105.54 ATOM 5 CB HIS D1023 130.581 181.360 134.066 1.00105.54 ATOM 6 CG HIS D1023 130.666 180.990 135.506 1.00105.54 ATOM 7 ND1 HIS D1023 131.490 179.987 135.961 1.00105.54 ATOM 8 CD2 HIS D1023 130.030 181.480 136.593 1.00105.54 ATOM 9 CE1 HIS D1023 131.365 179.879 137.271 1.00105.54 ATOM 10 NE2 HIS D1023 130.481 180.771 137.679 1.00105.54 ATOM 11 N THR D1024 132.480 183.252 131.538 1.00108.69 ATOM 12 CA THR D1024 132.368 183.609 130.134 1.00108.69 ATOM 13 C THR D1024 133.564 184.450 129.730 1.00108.69 ATOM 14 O THR D1024 133.889 185.430 130.402 1.00108.69 ATOM 15 CB THR D1024 131.074 184.372 129.873 1.00108.69 ATOM 16 OG1 THR D1024 129.954 183.530 130.164 1.00108.69 ATOM 17 CG2 THR D1024 131.012 184.803 128.438 1.00108.69 ATOM 18 N MET D1025 134.213 184.062 128.648 1.00110.89 ATOM 19 CA MET D1025 135.264 184.855 128.033 1.00110.89 ATOM 20 C MET D1025 134.696 185.574 126.822 1.00110.89 ATOM 21 O MET D1025 134.676 185.012 125.723 1.00110.89 ATOM 22 CB MET D1025 136.434 183.968 127.620 1.00110.89 ATOM 23 CG MET D1025 137.524 184.684 126.861 1.00110.89 ATOM 24 SD MET D1025 138.830 183.548 126.387 1.00110.89 ATOM 25 CE MET D1025 139.776 184.569 125.268 1.00110.89 ATOM 26 N PRO D1026 134.224 186.800 126.973 1.00109.56 ATOM 27 CA PRO D1026 133.593 187.492 125.848 1.00109.56 ATOM 28 C PRO D1026 134.614 187.870 124.788 1.00109.56 ATOM 29 O PRO D1026 135.820 187.709 124.956 1.00109.56 ATOM 30 CB PRO D1026 132.970 188.721 126.500 1.00109.56 ATOM 31 CG PRO D1026 133.784 188.947 127.699 1.00109.56 ATOM 32 CD PRO D1026 134.203 187.607 128.197 1.00109.56 ATOM 33 N VAL D1027 134.099 188.374 123.667 1.00111.75 ATOM 34 CA VAL D1027 134.888 188.629 122.467 1.00111.75 ATOM 35 C VAL D1027 134.738 190.099 122.093 1.00111.75 ATOM 36 O VAL D1027 134.531 190.438 120.925 1.00111.75 ATOM 37 CB VAL D1027 134.463 187.700 121.316 1.00111.75 ATOM 38 CG1 VAL D1027 135.422 187.798 120.147 1.00111.75 ATOM 39 CG2 VAL D1027 134.381 186.280 121.797 1.00111.75 ATOM 40 N ILE D1028 134.755 190.975 123.093 1.00113.32 ATOM 41 CA ILE D1028 134.465 192.394 122.915 1.00113.32 ATOM 42 C ILE D1028 135.283 193.002 121.788 1.00113.32 ATOM 43 O ILE D1028 136.427 192.606 121.550 1.00113.32 ATOM 44 CB ILE D1028 134.713 193.164 124.216 1.00113.32 ATOM 45 CG1 ILE D1028 136.183 193.090 124.592 1.00113.32 ATOM 46 CG2 ILE D1028 133.875 192.597 125.334 1.00113.32 ATOM 47 CD1 ILE D1028 136.509 193.954 125.765 1.00113.32 ATOM 48 N THR D1029 134.694 193.980 121.103 1.00119.45 ATOM 49 CA THR D1029 135.266 194.603 119.920 1.00119.45 ATOM 50 C THR D1029 136.139 195.788 120.309 1.00119.45 ATOM 51 O THR D1029 136.509 195.972 121.469 1.00119.45 ATOM 52 CB THR D1029 134.171 195.098 118.986 1.00119.45 ATOM 53 OG1 THR D1029 133.479 196.177 119.620 1.00119.45 ATOM 54 CG2 THR D1029 133.188 194.022 118.726 1.00119.45 ATOM 55 N GLU D1030 136.474 196.611 119.323 1.00124.81 ATOM 56 CA GLU D1030 137.031 197.927 119.585 1.00124.81 ATOM 57 C GLU D1030 136.450 198.995 118.670 1.00124.81 ATOM 58 O GLU D1030 136.643 200.182 118.937 1.00124.81 ATOM 59 CB GLU D1030 138.562 197.887 119.454 1.00124.81 ATOM 60 CG GLU D1030 139.285 199.163 119.864 1.00124.81 ATOM 61 CD GLU D1030 140.795 199.010 119.868 1.00124.81 ATOM 62 OE1 GLU D1030 141.278 197.895 119.585 1.00124.81 ATOM 63 OE2 GLU D1030 141.498 200.005 120.150 1.00124.81 ATOM 64 N VAL D1031 135.706 198.623 117.637 1.00125.20 ATOM 65 CA VAL D1031 135.156 199.574 116.684 1.00125.20 ATOM 66 C VAL D1031 133.639 199.524 116.775 1.00125.20 ATOM 67 O VAL D1031 133.085 198.753 117.562 1.00125.20 ATOM 68 CB VAL D1031 135.640 199.255 115.266 1.00125.20 ATOM 69 CG1 VAL D1031 137.144 199.316 115.220 1.00125.20 ATOM 70 CG2 VAL D1031 135.157 197.889 114.855 1.00125.20 ATOM 71 N SER D1032 132.952 200.342 115.981 1.00125.79 ATOM 72 CA SER D1032 131.501 200.433 116.061 1.00125.79 ATOM 73 C SER D1032 130.909 200.503 114.668 1.00125.79 ATOM 74 O SER D1032 131.337 201.318 113.849 1.00125.79 ATOM 75 CB SER D1032 131.080 201.657 116.866 1.00125.79 ATOM 76 OG SER D1032 131.562 201.554 118.191 1.00125.79 ATOM 77 N GLY D1033 129.912 199.664 114.416 1.00127.00 ATOM 78 CA GLY D1033 129.316 199.588 113.092 1.00127.00 ATOM 79 C GLY D1033 128.411 198.384 112.980 1.00127.00 ATOM 80 O GLY D1033 127.896 197.881 113.983 1.00127.00 ATOM 81 N PHE D1034 128.229 197.923 111.754 1.00126.49 ATOM 82 CA PHE D1034 127.342 196.801 111.515 1.00126.49 ATOM 83 C PHE D1034 128.156 195.515 111.462 1.00126.49 ATOM 84 O PHE D1034 129.385 195.535 111.410 1.00126.49 ATOM 85 CB PHE D1034 126.560 197.013 110.226 1.00126.49 ATOM 86 CG PHE D1034 125.720 198.254 110.233 1.00126.49 ATOM 87 CD1 PHE D1034 125.503 198.958 111.404 1.00126.49 ATOM 88 CD2 PHE D1034 125.146 198.719 109.070 1.00126.49 ATOM 89 CE1 PHE D1034 124.740 200.101 111.412 1.00126.49 ATOM 90 CE2 PHE D1034 124.376 199.859 109.076 1.00126.49 ATOM 91 CZ PHE D1034 124.172 200.550 110.253 1.00126.49 ATOM 92 N VAL D1035 127.462 194.380 111.456 1.00126.17 ATOM 93 CA VAL D1035 128.105 193.079 111.586 1.00126.17 ATOM 94 C VAL D1035 127.708 192.189 110.419 1.00126.17 ATOM 95 O VAL D1035 126.519 192.050 110.122 1.00126.17 ATOM 96 CB VAL D1035 127.725 192.406 112.913 1.00126.17 ATOM 97 CG1 VAL D1035 128.307 191.020 112.972 1.00126.17 ATOM 98 CG2 VAL D1035 128.196 193.249 114.069 1.00126.17 ATOM 99 N ARG D1036 128.698 191.583 109.763 1.00124.41 ATOM 100 CA ARG D1036 128.458 190.523 108.793 1.00124.41 ATOM 101 C ARG D1036 129.200 189.267 109.200 1.00124.41 ATOM 102 O ARG D1036 130.397 189.310 109.490 1.00124.41 ATOM 103 CB ARG D1036 128.881 190.882 107.368 1.00124.41 ATOM 104 CG ARG D1036 127.956 191.826 106.654 1.00124.41 ATOM 105 CD ARG D1036 128.175 191.739 105.157 1.00124.41 ATOM 106 NE ARG D1036 129.494 192.198 104.740 1.00124.41 ATOM 107 CZ ARG D1036 130.428 191.405 104.228 1.00124.41 ATOM 108 NH1 ARG D1036 130.188 190.113 104.085 1.00124.41 ATOM 109 NH2 ARG D1036 131.604 191.897 103.865 1.00124.41 ATOM 110 N PHE D1037 128.488 188.154 109.188 1.00125.57 ATOM 111 CA PHE D1037 129.103 186.850 109.337 1.00125.57 ATOM 112 C PHE D1037 129.970 186.573 108.121 1.00125.57 ATOM 113 O PHE D1037 129.488 186.632 106.987 1.00125.57 ATOM 114 CB PHE D1037 128.014 185.795 109.461 1.00125.57 ATOM 115 CG PHE D1037 127.154 185.964 110.663 1.00125.57 ATOM 116 CD1 PHE D1037 127.624 186.629 111.767 1.00125.57 ATOM 117 CD2 PHE D1037 125.853 185.514 110.665 1.00125.57 ATOM 118 CE1 PHE D1037 126.832 186.802 112.873 1.00125.57 ATOM 119 CE2 PHE D1037 125.051 185.691 111.768 1.00125.57 ATOM 120 CZ PHE D1037 125.541 186.337 112.874 1.00125.57 ATOM 121 N THR D1038 131.242 186.280 108.344 1.00128.09 ATOM 122 CA THR D1038 132.134 185.857 107.275 1.00128.09 ATOM 123 C THR D1038 132.448 184.380 107.431 1.00128.09 ATOM 124 O THR D1038 132.787 183.929 108.529 1.00128.09 ATOM 125 CB THR D1038 133.431 186.657 107.285 1.00128.09 ATOM 126 OG1 THR D1038 134.070 186.502 108.557 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129.141 178.814 107.279 1.00135.66 ATOM 145 CA ILE D1041 128.231 177.926 106.570 1.00135.66 ATOM 146 C ILE D1041 127.594 176.980 107.576 1.00135.66 ATOM 147 O ILE D1041 128.283 176.427 108.441 1.00135.66 ATOM 148 CB ILE D1041 128.964 177.146 105.467 1.00135.66 ATOM 149 CG1 ILE D1041 129.379 178.079 104.331 1.00135.66 ATOM 150 CG2 ILE D1041 128.109 176.013 104.947 1.00135.66 ATOM 151 CD1 ILE D1041 130.758 178.655 104.482 1.00135.66 ATOM 152 N ASP D1042 126.279 176.802 107.469 1.00133.83 ATOM 153 CA ASP D1042 125.562 175.886 108.345 1.00133.83 ATOM 154 C ASP D1042 126.091 174.464 108.196 1.00133.83 ATOM 155 O ASP D1042 126.678 174.098 107.176 1.00133.83 ATOM 156 CB ASP D1042 124.068 175.924 108.025 1.00133.83 ATOM 157 CG ASP D1042 123.236 175.099 108.986 1.00133.83 ATOM 158 OD1 ASP D1042 123.808 174.465 109.894 1.00133.83 ATOM 159 OD2 ASP D1042 122.000 175.080 108.826 1.00133.83 ATOM 160 N GLY D1043 125.912 173.668 109.247 1.00129.88 ATOM 161 CA GLY D1043 126.152 172.243 109.152 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