HEADER TRANSCRIPTION 31-DEC-69 6RI9 TITLE Cryo-EM structure of E. coli RNA polymerase backtracked elongation TITLE 2 complex in non-swiveled state COMPND MOL_ID: 5; COMPND 2 MOLECULE: DNA-directed RNA polymerase subunit beta'; COMPND 3 CHAIN: D; COMPND 4 EC: 2.7.7.6; COMPND 5 ENGINEERED: YES; EXPDTA ELECTRON MICROSCOPY REMARK 465 MISSING RESIDUES REMARK 465 THE FOLLOWING RESIDUES WERE NOT LOCATED IN THE REMARK 465 EXPERIMENT. (M=MODEL NUMBER; RES=RESIDUE NAME; C=CHAIN REMARK 465 IDENTIFIER; SSSEQ=SEQUENCE NUMBER; I=INSERTION CODE.) REMARK 465 REMARK 465 M RES C SSSEQI REMARK 465 ILE D 1134 DBREF 6RI9 D 1 1407 UNP P0A8T7 RPOC_ECOLI 1 1407 SEQRES 1 D 82 ILE THR GLY GLY LEU PRO ARG VAL ALA ASP LEU PHE GLU SEQRES 2 D 82 ALA ARG ARG PRO LYS GLU PRO ALA ILE LEU ALA GLU ILE SEQRES 3 D 82 SER GLY ILE VAL SER PHE GLY LYS GLU THR LYS GLY LYS SEQRES 4 D 82 ARG ARG LEU VAL ILE THR PRO VAL ASP GLY SER ASP PRO SEQRES 5 D 82 TYR GLU GLU MET ILE PRO LYS TRP ARG GLN LEU ASN VAL SEQRES 6 D 82 PHE GLU GLY GLU ARG VAL GLU ARG GLY ASP VAL ILE SER SEQRES 7 D 82 ASP GLY PRO GLU ATOM 1 N THR D1135 142.320 177.664 138.791 1.00106.35 ATOM 2 CA THR D1135 142.993 176.527 139.410 1.00106.35 ATOM 3 C THR D1135 143.481 176.863 140.806 1.00106.35 ATOM 4 O THR D1135 143.276 177.969 141.295 1.00106.35 ATOM 5 CB THR D1135 144.196 176.062 138.584 1.00106.35 ATOM 6 OG1 THR D1135 145.135 177.135 138.477 1.00106.35 ATOM 7 CG2 THR D1135 143.767 175.648 137.199 1.00106.35 ATOM 8 N GLY D1136 144.124 175.892 141.446 1.00101.66 ATOM 9 CA GLY D1136 144.761 176.123 142.724 1.00101.66 ATOM 10 C GLY D1136 145.209 174.846 143.396 1.00101.66 ATOM 11 O GLY D1136 144.479 173.854 143.389 1.00101.66 ATOM 12 N GLY D1137 146.400 174.848 143.970 1.00 91.41 ATOM 13 CA GLY D1137 146.851 173.756 144.803 1.00 91.41 ATOM 14 C GLY D1137 148.258 173.304 144.475 1.00 91.41 ATOM 15 O GLY D1137 148.988 173.915 143.682 1.00 91.41 ATOM 16 N LEU D1138 148.644 172.214 145.124 1.00 89.16 ATOM 17 CA LEU D1138 149.967 171.653 144.903 1.00 89.16 ATOM 18 C LEU D1138 150.347 171.587 143.439 1.00 89.16 ATOM 19 O LEU D1138 151.490 171.943 143.112 1.00 89.16 ATOM 20 CB LEU D1138 150.046 170.258 145.518 1.00 89.16 ATOM 21 CG LEU D1138 151.448 169.724 145.326 1.00 89.16 ATOM 22 CD1 LEU D1138 152.364 170.621 146.106 1.00 89.16 ATOM 23 CD2 LEU D1138 151.561 168.298 145.792 1.00 89.16 ATOM 24 N PRO D1139 149.482 171.163 142.526 1.00 88.59 ATOM 25 CA PRO D1139 149.863 171.226 141.118 1.00 88.59 ATOM 26 C PRO D1139 150.148 172.632 140.657 1.00 88.59 ATOM 27 O PRO D1139 151.016 172.825 139.804 1.00 88.59 ATOM 28 CB PRO D1139 148.652 170.626 140.409 1.00 88.59 ATOM 29 CG PRO D1139 148.050 169.766 141.403 1.00 88.59 ATOM 30 CD PRO D1139 148.203 170.470 142.694 1.00 88.59 ATOM 31 N ARG D1140 149.434 173.626 141.175 1.00 87.92 ATOM 32 CA ARG D1140 149.773 174.998 140.826 1.00 87.92 ATOM 33 C ARG D1140 151.206 175.305 141.214 1.00 87.92 ATOM 34 O ARG D1140 151.973 175.871 140.424 1.00 87.92 ATOM 35 CB ARG D1140 148.819 175.970 141.497 1.00 87.92 ATOM 36 CG ARG D1140 149.206 177.404 141.330 1.00 87.92 ATOM 37 CD ARG D1140 149.150 177.837 139.903 1.00 87.92 ATOM 38 NE ARG D1140 149.286 179.282 139.811 1.00 87.92 ATOM 39 CZ ARG D1140 149.404 179.949 138.672 1.00 87.92 ATOM 40 NH1 ARG D1140 149.412 179.301 137.520 1.00 87.92 ATOM 41 NH2 ARG D1140 149.511 181.264 138.682 1.00 87.92 ATOM 42 N VAL D1141 151.592 174.928 142.429 1.00 88.94 ATOM 43 CA VAL D1141 152.970 175.180 142.834 1.00 88.94 ATOM 44 C VAL D1141 153.928 174.465 141.909 1.00 88.94 ATOM 45 O VAL D1141 154.968 175.010 141.511 1.00 88.94 ATOM 46 CB VAL D1141 153.204 174.746 144.282 1.00 88.94 ATOM 47 CG1 VAL D1141 154.658 174.902 144.616 1.00 88.94 ATOM 48 CG2 VAL D1141 152.375 175.570 145.190 1.00 88.94 ATOM 49 N ALA D1142 153.618 173.215 141.594 1.00 93.25 ATOM 50 CA ALA D1142 154.482 172.452 140.712 1.00 93.25 ATOM 51 C ALA D1142 154.665 173.173 139.393 1.00 93.25 ATOM 52 O ALA D1142 155.791 173.364 138.932 1.00 93.25 ATOM 53 CB ALA D1142 153.900 171.064 140.482 1.00 93.25 ATOM 54 N ASP D1143 153.568 173.611 138.789 1.00 99.68 ATOM 55 CA ASP D1143 153.663 174.270 137.497 1.00 99.68 ATOM 56 C ASP D1143 154.465 175.552 137.589 1.00 99.68 ATOM 57 O ASP D1143 155.163 175.918 136.644 1.00 99.68 ATOM 58 CB ASP D1143 152.276 174.552 136.940 1.00 99.68 ATOM 59 CG ASP D1143 151.620 173.316 136.384 1.00 99.68 ATOM 60 OD1 ASP D1143 152.356 172.420 135.927 1.00 99.68 ATOM 61 OD2 ASP D1143 150.375 173.239 136.387 1.00 99.68 ATOM 62 N LEU D1144 154.382 176.253 138.709 1.00 89.52 ATOM 63 CA LEU D1144 155.140 177.487 138.804 1.00 89.52 ATOM 64 C LEU D1144 156.626 177.200 138.865 1.00 89.52 ATOM 65 O LEU D1144 157.390 177.647 138.007 1.00 89.52 ATOM 66 CB LEU D1144 154.681 178.276 140.006 1.00 89.52 ATOM 67 CG LEU D1144 153.276 178.686 139.627 1.00 89.52 ATOM 68 CD1 LEU D1144 152.543 179.259 140.793 1.00 89.52 ATOM 69 CD2 LEU D1144 153.378 179.696 138.524 1.00 89.52 ATOM 70 N PHE D1145 157.053 176.409 139.845 1.00 92.83 ATOM 71 CA PHE D1145 158.478 176.101 139.902 1.00 92.83 ATOM 72 C PHE D1145 158.890 175.301 138.685 1.00 92.83 ATOM 73 O PHE D1145 160.070 174.999 138.505 1.00 92.83 ATOM 74 CB PHE D1145 158.860 175.330 141.154 1.00 92.83 ATOM 75 CG PHE D1145 158.851 176.149 142.384 1.00 92.83 ATOM 76 CD1 PHE D1145 159.865 177.029 142.643 1.00 92.83 ATOM 77 CD2 PHE D1145 157.842 176.019 143.296 1.00 92.83 ATOM 78 CE1 PHE D1145 159.857 177.774 143.774 1.00 92.83 ATOM 79 CE2 PHE D1145 157.838 176.761 144.426 1.00 92.83 ATOM 80 CZ PHE D1145 158.847 177.639 144.666 1.00 92.83 ATOM 81 N GLU D1146 157.926 174.932 137.861 1.00101.01 ATOM 82 CA GLU D1146 158.237 174.308 136.597 1.00101.01 ATOM 83 C GLU D1146 158.319 175.310 135.466 1.00101.01 ATOM 84 O GLU D1146 158.932 175.019 134.434 1.00101.01 ATOM 85 CB GLU D1146 157.188 173.249 136.283 1.00101.01 ATOM 86 CG GLU D1146 157.478 172.515 135.028 1.00101.01 ATOM 87 CD GLU D1146 158.822 171.857 135.089 1.00101.01 ATOM 88 OE1 GLU D1146 159.251 171.465 136.194 1.00101.01 ATOM 89 OE2 GLU D1146 159.467 171.765 134.031 1.00101.01 ATOM 90 N ALA D1147 157.748 176.488 135.657 1.00102.70 ATOM 91 CA ALA D1147 157.693 177.512 134.627 1.00102.70 ATOM 92 C ALA D1147 157.017 176.994 133.365 1.00102.70 ATOM 93 O ALA D1147 157.456 177.271 132.251 1.00102.70 ATOM 94 CB ALA D1147 159.084 178.050 134.309 1.00102.70 ATOM 95 N ARG D1148 155.944 176.231 133.528 1.00110.96 ATOM 96 CA ARG D1148 155.245 175.775 132.344 1.00110.96 ATOM 97 C ARG D1148 154.583 176.935 131.627 1.00110.96 ATOM 98 O ARG D1148 154.374 178.013 132.180 1.00110.96 ATOM 99 CB ARG D1148 154.203 174.719 132.676 1.00110.96 ATOM 100 CG ARG D1148 154.811 173.375 132.913 1.00110.96 ATOM 101 CD ARG D1148 153.761 172.308 133.035 1.00110.96 ATOM 102 NE ARG D1148 154.377 170.997 133.175 1.00110.96 ATOM 103 CZ ARG D1148 154.685 170.451 134.342 1.00110.96 ATOM 104 NH1 ARG D1148 154.429 171.107 135.462 1.00110.96 ATOM 105 NH2 ARG D1148 155.244 169.255 134.394 1.00110.96 ATOM 106 N ARG D1149 154.267 176.692 130.366 1.00112.02 ATOM 107 CA ARG D1149 153.604 177.669 129.539 1.00112.02 ATOM 108 C ARG D1149 152.113 177.426 129.613 1.00112.02 ATOM 109 O ARG D1149 151.654 176.348 129.212 1.00112.02 ATOM 110 CB ARG D1149 154.089 177.549 128.108 1.00112.02 ATOM 111 CG ARG D1149 155.573 177.785 127.977 1.00112.02 ATOM 112 CD ARG D1149 156.023 177.575 126.558 1.00112.02 ATOM 113 NE ARG D1149 155.357 178.520 125.678 1.00112.02 ATOM 114 CZ ARG D1149 155.782 179.758 125.465 1.00112.02 ATOM 115 NH1 ARG D1149 156.876 180.199 126.069 1.00112.02 ATOM 116 NH2 ARG D1149 155.110 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GLU D1152 146.191 180.075 126.617 1.00123.39 ATOM 135 C GLU D1152 146.866 181.389 126.957 1.00123.39 ATOM 136 O GLU D1152 146.398 182.132 127.824 1.00123.39 ATOM 137 CB GLU D1152 144.709 180.095 126.959 1.00123.39 ATOM 138 CG GLU D1152 143.906 181.066 126.148 1.00123.39 ATOM 139 CD GLU D1152 142.431 180.946 126.437 1.00123.39 ATOM 140 OE1 GLU D1152 142.057 180.072 127.245 1.00123.39 ATOM 141 OE2 GLU D1152 141.646 181.733 125.871 1.00123.39 ATOM 142 N PRO D1153 147.968 181.704 126.297 1.00119.63 ATOM 143 CA PRO D1153 148.836 182.773 126.787 1.00119.63 ATOM 144 C PRO D1153 148.175 184.125 126.656 1.00119.63 ATOM 145 O PRO D1153 147.329 184.342 125.788 1.00119.63 ATOM 146 CB PRO D1153 150.059 182.678 125.871 1.00119.63 ATOM 147 CG PRO D1153 149.987 181.320 125.270 1.00119.63 ATOM 148 CD PRO D1153 148.535 181.031 125.125 1.00119.63 ATOM 149 N ALA D1154 148.554 185.028 127.543 1.00119.45 ATOM 150 CA ALA D1154 148.331 186.441 127.303 1.00119.45 ATOM 151 C ALA D1154 149.563 187.011 126.622 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