HEADER TOXIN 31-DEC-69 6RW8 TITLE Cryo-EM structure of Xenorhabdus nematophila XptA1 COMPND MOL_ID: 1; COMPND 2 MOLECULE: A component of insecticidal toxin complex (Tc); COMPND 3 CHAIN: A, B, C, D, E; COMPND 4 ENGINEERED: YES; EXPDTA ELECTRON MICROSCOPY DBREF 6RW8 D 1 2523 UNP A0A0R4FN A0A0R4FN93_ 1 2523 SEQRES 1 D 180 ALA LEU GLU VAL THR ARG THR VAL SER LEU ALA GLU VAL SEQRES 2 D 180 TYR ALA GLY LEU THR GLU ASN SER PHE ILE LEU LYS ASP SEQRES 3 D 180 LYS VAL THR GLU LEU VAL ASN ALA GLY GLU GLY SER ALA SEQRES 4 D 180 GLY THR THR LEU ASN GLY LEU ASN VAL GLU GLY THR GLN SEQRES 5 D 180 LEU GLN ALA SER LEU LYS LEU SER ASP LEU ASN ILE ALA SEQRES 6 D 180 THR ASP TYR PRO ASP GLY LEU GLY ASN THR ARG ARG ILE SEQRES 7 D 180 LYS GLN ILE SER VAL THR LEU PRO ALA LEU LEU GLY PRO SEQRES 8 D 180 TYR GLN ASP VAL ARG ALA ILE LEU SER TYR GLY GLY SER SEQRES 9 D 180 THR MET MET PRO ARG GLY CYS LYS ALA ILE ALA ILE SER SEQRES 10 D 180 HIS GLY MET ASN ASP SER GLY GLN PHE GLN MET ASP PHE SEQRES 11 D 180 ASN ASP ALA LYS TYR LEU PRO PHE GLU GLY LEU PRO VAL SEQRES 12 D 180 ALA ASP THR GLY THR LEU THR LEU SER PHE PRO GLY ILE SEQRES 13 D 180 SER GLY LYS GLN LYS SER LEU LEU LEU SER LEU SER ASP SEQRES 14 D 180 ILE ILE LEU HIS ILE ARG TYR THR ILE ARG SER ATOM 1 N ALA D2344 246.210 215.231 323.190 1.00 47.49 ATOM 2 CA ALA D2344 246.819 216.060 324.231 1.00 47.49 ATOM 3 C ALA D2344 247.504 215.225 325.298 1.00 47.49 ATOM 4 O ALA D2344 247.439 213.994 325.277 1.00 47.49 ATOM 5 CB ALA D2344 245.799 216.933 324.960 1.00 47.49 ATOM 6 N LEU D2345 248.151 215.915 326.236 1.00 47.74 ATOM 7 CA LEU D2345 248.151 215.559 327.657 1.00 47.74 ATOM 8 C LEU D2345 248.196 216.885 328.404 1.00 47.74 ATOM 9 O LEU D2345 249.279 217.422 328.642 1.00 47.74 ATOM 10 CB LEU D2345 249.319 214.676 328.068 1.00 47.74 ATOM 11 CG LEU D2345 249.404 213.198 327.730 1.00 47.74 ATOM 12 CD1 LEU D2345 250.770 212.707 328.114 1.00 47.74 ATOM 13 CD2 LEU D2345 248.335 212.437 328.474 1.00 47.74 ATOM 14 N GLU D2346 247.033 217.415 328.765 1.00 50.54 ATOM 15 CA GLU D2346 247.003 218.689 329.468 1.00 50.54 ATOM 16 C GLU D2346 247.442 218.504 330.913 1.00 50.54 ATOM 17 O GLU D2346 246.866 217.697 331.647 1.00 50.54 ATOM 18 CB GLU D2346 245.617 219.318 329.423 1.00 50.54 ATOM 19 CG GLU D2346 245.171 219.903 328.105 1.00 50.54 ATOM 20 CD GLU D2346 244.280 218.973 327.335 1.00 50.54 ATOM 21 OE1 GLU D2346 243.985 217.880 327.856 1.00 50.54 ATOM 22 OE2 GLU D2346 243.858 219.338 326.218 1.00 50.54 ATOM 23 N VAL D2347 248.466 219.250 331.318 1.00 48.91 ATOM 24 CA VAL D2347 248.988 219.220 332.677 1.00 48.91 ATOM 25 C VAL D2347 249.031 220.648 333.191 1.00 48.91 ATOM 26 O VAL D2347 249.610 221.523 332.539 1.00 48.91 ATOM 27 CB VAL D2347 250.397 218.612 332.748 1.00 48.91 ATOM 28 CG1 VAL D2347 250.886 218.613 334.183 1.00 48.91 ATOM 29 CG2 VAL D2347 250.444 217.224 332.142 1.00 48.91 ATOM 30 N THR D2348 248.440 220.889 334.355 1.00 52.12 ATOM 31 CA THR D2348 248.726 222.115 335.079 1.00 52.12 ATOM 32 C THR D2348 249.840 221.858 336.085 1.00 52.12 ATOM 33 O THR D2348 249.915 220.788 336.696 1.00 52.12 ATOM 34 CB THR D2348 247.473 222.683 335.764 1.00 52.12 ATOM 35 OG1 THR D2348 247.807 223.894 336.453 1.00 52.12 ATOM 36 CG2 THR D2348 246.824 221.708 336.724 1.00 52.12 ATOM 37 N ARG D2349 250.750 222.818 336.201 1.00 56.49 ATOM 38 CA ARG D2349 251.828 222.751 337.175 1.00 56.49 ATOM 39 C ARG D2349 251.851 224.033 337.987 1.00 56.49 ATOM 40 O ARG D2349 251.999 225.124 337.429 1.00 56.49 ATOM 41 CB ARG D2349 253.186 222.524 336.518 1.00 56.49 ATOM 42 CG ARG D2349 254.291 222.477 337.553 1.00 56.49 ATOM 43 CD ARG D2349 255.632 222.143 336.965 1.00 56.49 ATOM 44 NE ARG D2349 256.690 222.277 337.960 1.00 56.49 ATOM 45 CZ ARG D2349 257.059 221.317 338.796 1.00 56.49 ATOM 46 NH1 ARG D2349 256.459 220.136 338.763 1.00 56.49 ATOM 47 NH2 ARG D2349 258.032 221.538 339.666 1.00 56.49 ATOM 48 N THR D2350 251.717 223.894 339.298 1.00 59.99 ATOM 49 CA THR D2350 251.756 225.021 340.214 1.00 59.99 ATOM 50 C THR D2350 253.197 225.292 340.622 1.00 59.99 ATOM 51 O THR D2350 253.867 224.415 341.177 1.00 59.99 ATOM 52 CB THR D2350 250.897 224.741 341.442 1.00 59.99 ATOM 53 OG1 THR D2350 249.528 224.601 341.047 1.00 59.99 ATOM 54 CG2 THR D2350 251.024 225.861 342.436 1.00 59.99 ATOM 55 N VAL D2351 253.668 226.502 340.347 1.00 58.11 ATOM 56 CA VAL D2351 255.003 226.939 340.724 1.00 58.11 ATOM 57 C VAL D2351 254.854 228.090 341.703 1.00 58.11 ATOM 58 O VAL D2351 254.273 229.127 341.364 1.00 58.11 ATOM 59 CB VAL D2351 255.830 227.369 339.504 1.00 58.11 ATOM 60 CG1 VAL D2351 257.176 227.898 339.947 1.00 58.11 ATOM 61 CG2 VAL D2351 255.997 226.213 338.546 1.00 58.11 ATOM 62 N SER D2352 255.369 227.910 342.912 1.00 62.41 ATOM 63 CA SER D2352 255.434 228.976 343.899 1.00 62.41 ATOM 64 C SER D2352 256.849 229.529 343.919 1.00 62.41 ATOM 65 O SER D2352 257.814 228.763 343.992 1.00 62.41 ATOM 66 CB SER D2352 255.042 228.469 345.285 1.00 62.41 ATOM 67 OG SER D2352 255.991 227.537 345.765 1.00 62.41 ATOM 68 N LEU D2353 256.972 230.855 343.851 1.00 62.76 ATOM 69 CA LEU D2353 258.298 231.459 343.807 1.00 62.76 ATOM 70 C LEU D2353 259.027 231.389 345.137 1.00 62.76 ATOM 71 O LEU D2353 260.250 231.545 345.155 1.00 62.76 ATOM 72 CB LEU D2353 258.220 232.912 343.346 1.00 62.76 ATOM 73 CG LEU D2353 257.953 233.095 341.859 1.00 62.76 ATOM 74 CD1 LEU D2353 257.902 234.562 341.493 1.00 62.76 ATOM 75 CD2 LEU D2353 259.049 232.405 341.099 1.00 62.76 ATOM 76 N ALA D2354 258.317 231.164 346.242 1.00 62.77 ATOM 77 CA ALA D2354 258.993 230.979 347.520 1.00 62.77 ATOM 78 C ALA D2354 259.803 229.689 347.529 1.00 62.77 ATOM 79 O ALA D2354 260.932 229.662 348.032 1.00 62.77 ATOM 80 CB ALA D2354 257.975 230.989 348.656 1.00 62.77 ATOM 81 N GLU D2355 259.258 228.623 346.939 1.00 63.59 ATOM 82 CA GLU D2355 259.978 227.356 346.864 1.00 63.59 ATOM 83 C GLU D2355 261.146 227.438 345.890 1.00 63.59 ATOM 84 O GLU D2355 262.205 226.846 346.130 1.00 63.59 ATOM 85 CB GLU D2355 259.016 226.242 346.457 1.00 63.59 ATOM 86 CG GLU D2355 259.627 224.853 346.426 1.00 63.59 ATOM 87 CD GLU D2355 258.620 223.786 346.054 1.00 63.59 ATOM 88 OE1 GLU D2355 257.445 224.133 345.814 1.00 63.59 ATOM 89 OE2 GLU D2355 259.004 222.599 345.995 1.00 63.59 ATOM 90 N VAL D2356 260.974 228.171 344.791 1.00 61.45 ATOM 91 CA VAL D2356 262.034 228.292 343.797 1.00 61.45 ATOM 92 C VAL D2356 263.169 229.157 344.328 1.00 61.45 ATOM 93 O VAL D2356 264.349 228.810 344.198 1.00 61.45 ATOM 94 CB VAL D2356 261.456 228.850 342.486 1.00 61.45 ATOM 95 CG1 VAL D2356 262.550 229.068 341.460 1.00 61.45 ATOM 96 CG2 VAL D2356 260.399 227.913 341.950 1.00 61.45 ATOM 97 N TYR D2357 262.829 230.281 344.956 1.00 62.88 ATOM 98 CA TYR D2357 263.843 231.180 345.489 1.00 62.88 ATOM 99 C TYR D2357 264.496 230.613 346.740 1.00 62.88 ATOM 100 O TYR D2357 265.645 230.948 347.043 1.00 62.88 ATOM 101 CB TYR D2357 263.212 232.539 345.779 1.00 62.88 ATOM 102 CG TYR D2357 262.802 233.305 344.542 1.00 62.88 ATOM 103 CD1 TYR D2357 263.387 233.045 343.310 1.00 62.88 ATOM 104 CD2 TYR D2357 261.806 234.269 344.602 1.00 62.88 ATOM 105 CE1 TYR D2357 263.007 233.740 342.182 1.00 62.88 ATOM 106 CE2 TYR D2357 261.417 234.963 343.480 1.00 62.88 ATOM 107 CZ TYR D2357 262.021 234.696 342.275 1.00 62.88 ATOM 108 OH TYR D2357 261.631 235.393 341.159 1.00 62.88 ATOM 109 N ALA D2358 263.787 229.756 347.476 1.00 63.00 ATOM 110 CA ALA D2358 264.370 229.151 348.664 1.00 63.00 ATOM 111 C ALA D2358 265.290 227.990 348.322 1.00 63.00 ATOM 112 O ALA D2358 266.237 227.715 349.066 1.00 63.00 ATOM 113 CB ALA D2358 263.266 228.682 349.609 1.00 63.00 ATOM 114 N GLY D2359 265.035 227.303 347.214 1.00 64.11 ATOM 115 CA GLY D2359 265.823 226.143 346.854 1.00 64.11 ATOM 116 C GLY D2359 266.677 226.364 345.626 1.00 64.11 ATOM 117 O GLY D2359 266.779 225.485 344.767 1.00 64.11 ATOM 118 N LEU D2360 267.303 227.534 345.534 1.00 65.08 ATOM 119 CA LEU D2360 268.002 227.933 344.324 1.00 65.08 ATOM 120 C LEU D2360 269.506 227.700 344.407 1.00 65.08 ATOM 121 O LEU D2360 270.175 227.702 343.367 1.00 65.08 ATOM 122 CB LEU D2360 267.689 229.406 344.029 1.00 65.08 ATOM 123 CG LEU D2360 267.822 229.998 342.627 1.00 65.08 ATOM 124 CD1 LEU D2360 266.739 231.038 342.484 1.00 65.08 ATOM 125 CD2 LEU D2360 269.166 230.636 342.378 1.00 65.08 ATOM 126 N THR D2361 270.044 227.489 345.616 1.00 69.33 ATOM 127 CA THR D2361 271.420 227.080 345.929 1.00 69.33 ATOM 128 C THR D2361 272.497 228.066 345.480 1.00 69.33 ATOM 129 O THR D2361 273.687 227.733 345.501 1.00 69.33 ATOM 130 CB THR D2361 271.751 225.695 345.346 1.00 69.33 ATOM 131 OG1 THR D2361 271.795 225.756 343.914 1.00 69.33 ATOM 132 CG2 THR D2361 270.714 224.662 345.784 1.00 69.33 ATOM 133 N GLU D2362 272.107 229.275 345.088 1.00 72.22 ATOM 134 CA GLU D2362 273.071 230.300 344.701 1.00 72.22 ATOM 135 C GLU D2362 272.397 231.644 344.920 1.00 72.22 ATOM 136 O GLU D2362 271.553 232.040 344.111 1.00 72.22 ATOM 137 CB GLU D2362 273.509 230.124 343.253 1.00 72.22 ATOM 138 CG GLU D2362 274.559 231.119 342.802 1.00 72.22 ATOM 139 CD GLU D2362 275.014 230.875 341.379 1.00 72.22 ATOM 140 OE1 GLU D2362 274.515 229.917 340.753 1.00 72.22 ATOM 141 OE2 GLU D2362 275.863 231.643 340.882 1.00 72.22 ATOM 142 N ASN D2363 272.785 232.331 346.000 1.00 69.64 ATOM 143 CA ASN D2363 272.086 233.509 346.526 1.00 69.64 ATOM 144 C ASN D2363 270.609 233.216 346.773 1.00 69.64 ATOM 145 O ASN D2363 269.735 234.028 346.470 1.00 69.64 ATOM 146 CB ASN D2363 272.254 234.731 345.618 1.00 69.64 ATOM 147 CG ASN D2363 273.646 235.304 345.664 1.00 69.64 ATOM 148 OD1 ASN D2363 274.248 235.417 346.729 1.00 69.64 ATOM 149 ND2 ASN D2363 274.170 235.674 344.502 1.00 69.64 ATOM 150 N SER D2364 270.329 232.040 347.327 1.00 67.99 ATOM 151 CA SER D2364 268.961 231.680 347.655 1.00 67.99 ATOM 152 C SER D2364 268.469 232.504 348.840 1.00 67.99 ATOM 153 O SER D2364 269.243 232.947 349.690 1.00 67.99 ATOM 154 CB SER D2364 268.858 230.191 347.970 1.00 67.99 ATOM 155 OG SER D2364 269.576 229.875 349.148 1.00 67.99 ATOM 156 N PHE D2365 267.159 232.710 348.887 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