HEADER TRANSCRIPTION, TRANSFERASE/DNA/RNA 31-DEC-69 6UTZ TITLE E. coli sigma-S transcription initiation complex with a 6-nt RNA TITLE 2 ("Fresh" crystal soaked with CTP and UTP for 30 minutes) COMPND MOL_ID: 3; COMPND 2 MOLECULE: DNA-directed RNA polymerase subunit beta'; COMPND 3 CHAIN: DDD; COMPND 4 EC: 2.7.7.6; COMPND 5 ENGINEERED: YES; EXPDTA X-RAY DIFFRACTION REMARK 2 RESOLUTION. 3.80 ANGSTORMS DBREF 6UTZ D 1 1407 UNP P0A8T7 RPOC_ECOLI 1 1407 SEQRES 1 DDD 109 HIS THR MET PRO VAL ILE THR GLU VAL SER GLY PHE VAL SEQRES 2 DDD 109 ARG PHE THR ASP MET ILE ASP GLY GLN THR ILE THR ARG SEQRES 3 DDD 109 GLN THR ASP GLU LEU THR GLY LEU SER SER LEU VAL VAL SEQRES 4 DDD 109 LEU ASP SER ALA GLU ARG THR ALA GLY GLY LYS ASP LEU SEQRES 5 DDD 109 ARG PRO ALA LEU LYS ILE VAL ASP ALA GLN GLY ASN ASP SEQRES 6 DDD 109 VAL LEU ILE PRO GLY THR ASP MET PRO ALA GLN TYR PHE SEQRES 7 DDD 109 LEU PRO GLY LYS ALA ILE VAL GLN LEU GLU ASP GLY VAL SEQRES 8 DDD 109 GLN ILE SER SER GLY ASP THR LEU ALA ARG ILE PRO GLN SEQRES 9 DDD 109 GLU SER GLY GLY THR ATOM 1 N HIS D1023 30.081 -44.497 -20.504 1.00275.49 ATOM 2 CA HIS D1023 31.523 -44.151 -20.579 1.00281.28 ATOM 3 C HIS D1023 32.272 -45.279 -21.291 1.00280.87 ATOM 4 O HIS D1023 33.301 -45.737 -20.761 1.00285.99 ATOM 5 CB HIS D1023 32.071 -43.871 -19.176 1.00288.11 ATOM 6 CG HIS D1023 31.078 -43.295 -18.218 1.00293.56 ATOM 7 ND1 HIS D1023 30.414 -42.101 -18.446 1.00299.94 ATOM 8 CD2 HIS D1023 30.653 -43.736 -17.014 1.00296.41 ATOM 9 CE1 HIS D1023 29.618 -41.842 -17.429 1.00301.88 ATOM 10 NE2 HIS D1023 29.746 -42.831 -16.538 1.00300.45 ATOM 11 N THR D1024 31.762 -45.704 -22.446 1.00276.33 ATOM 12 CA THR D1024 32.340 -46.803 -23.261 1.00271.64 ATOM 13 C THR D1024 31.499 -46.995 -24.521 1.00271.23 ATOM 14 O THR D1024 30.256 -46.988 -24.406 1.00278.77 ATOM 15 CB THR D1024 32.385 -48.129 -22.490 1.00269.27 ATOM 16 OG1 THR D1024 33.498 -48.115 -21.596 1.00267.03 ATOM 17 CG2 THR D1024 32.496 -49.333 -23.400 1.00266.54 ATOM 18 N MET D1025 32.171 -47.191 -25.659 1.00267.13 ATOM 19 CA MET D1025 31.504 -47.461 -26.961 1.00266.38 ATOM 20 C MET D1025 31.905 -48.856 -27.437 1.00262.47 ATOM 21 O MET D1025 32.932 -49.034 -28.099 1.00280.14 ATOM 22 CB MET D1025 31.890 -46.422 -28.017 1.00273.19 ATOM 23 CG MET D1025 31.142 -46.608 -29.326 1.00274.10 ATOM 24 SD MET D1025 31.528 -45.350 -30.566 1.00285.44 ATOM 25 CE MET D1025 29.948 -45.252 -31.409 1.00285.56 ATOM 26 N PRO D1026 31.107 -49.880 -27.059 1.00251.45 ATOM 27 CA PRO D1026 31.429 -51.281 -27.330 1.00249.07 ATOM 28 C PRO D1026 31.481 -51.586 -28.836 1.00244.89 ATOM 29 O PRO D1026 30.934 -50.829 -29.614 1.00235.62 ATOM 30 CB PRO D1026 30.298 -52.048 -26.615 1.00248.08 ATOM 31 CG PRO D1026 29.163 -51.053 -26.527 1.00249.75 ATOM 32 CD PRO D1026 29.843 -49.717 -26.327 1.00250.45 ATOM 33 N VAL D1027 32.190 -52.654 -29.207 1.00248.13 ATOM 34 CA VAL D1027 32.123 -53.194 -30.594 1.00249.00 ATOM 35 C VAL D1027 31.445 -54.561 -30.505 1.00253.13 ATOM 36 O VAL D1027 32.034 -55.475 -29.919 1.00251.47 ATOM 37 CB VAL D1027 33.518 -53.272 -31.236 1.00243.61 ATOM 38 CG1 VAL D1027 33.460 -53.833 -32.649 1.00240.34 ATOM 39 CG2 VAL D1027 34.200 -51.915 -31.217 1.00240.67 ATOM 40 N ILE D1028 30.228 -54.666 -31.040 1.00255.66 ATOM 41 CA ILE D1028 29.355 -55.871 -30.849 1.00258.05 ATOM 42 C ILE D1028 29.295 -56.722 -32.128 1.00261.35 ATOM 43 O ILE D1028 29.250 -56.146 -33.239 1.00261.22 ATOM 44 CB ILE D1028 27.955 -55.437 -30.380 1.00257.32 ATOM 45 CG1 ILE D1028 28.064 -54.706 -29.040 1.00267.59 ATOM 46 CG2 ILE D1028 27.005 -56.624 -30.325 1.00257.43 ATOM 47 CD1 ILE D1028 26.789 -54.665 -28.231 1.00274.18 ATOM 48 N THR D1029 29.250 -58.049 -31.969 1.00270.69 ATOM 49 CA THR D1029 29.341 -58.966 -33.136 1.00278.48 ATOM 50 C THR D1029 27.946 -59.242 -33.693 1.00281.61 ATOM 51 O THR D1029 26.958 -58.939 -33.002 1.00281.18 ATOM 52 CB THR D1029 30.035 -60.287 -32.785 1.00280.20 ATOM 53 OG1 THR D1029 29.287 -60.937 -31.759 1.00279.63 ATOM 54 CG2 THR D1029 31.465 -60.087 -32.343 1.00278.70 ATOM 55 N GLU D1030 27.915 -59.781 -34.913 1.00283.34 ATOM 56 CA GLU D1030 26.682 -60.076 -35.683 1.00283.75 ATOM 57 C GLU D1030 26.662 -61.585 -35.950 1.00284.87 ATOM 58 O GLU D1030 25.728 -62.054 -36.621 1.00298.82 ATOM 59 CB GLU D1030 26.654 -59.272 -36.990 1.00289.99 ATOM 60 CG GLU D1030 26.743 -57.763 -36.796 1.00286.75 ATOM 61 CD GLU D1030 26.575 -56.928 -38.059 1.00285.66 ATOM 62 OE1 GLU D1030 27.026 -57.378 -39.129 1.00296.91 ATOM 63 OE2 GLU D1030 25.986 -55.828 -37.977 1.00271.98 ATOM 64 N VAL D1031 27.655 -62.313 -35.423 1.00272.53 ATOM 65 CA VAL D1031 27.807 -63.773 -35.705 1.00264.40 ATOM 66 C VAL D1031 28.466 -64.454 -34.504 1.00254.05 ATOM 67 O VAL D1031 29.126 -63.759 -33.710 1.00246.42 ATOM 68 CB VAL D1031 28.633 -64.017 -36.980 1.00266.24 ATOM 69 CG1 VAL D1031 27.807 -63.877 -38.250 1.00265.86 ATOM 70 CG2 VAL D1031 29.845 -63.108 -37.018 1.00267.21 ATOM 71 N SER D1032 28.284 -65.772 -34.402 1.00250.95 ATOM 72 CA SER D1032 28.719 -66.563 -33.222 1.00255.37 ATOM 73 C SER D1032 29.841 -67.515 -33.628 1.00260.58 ATOM 74 O SER D1032 29.902 -67.877 -34.816 1.00255.97 ATOM 75 CB SER D1032 27.576 -67.335 -32.634 1.00251.47 ATOM 76 OG SER D1032 26.533 -66.464 -32.230 1.00248.88 ATOM 77 N GLY D1033 30.658 -67.932 -32.663 1.00273.04 ATOM 78 CA GLY D1033 31.833 -68.769 -32.975 1.00279.30 ATOM 79 C GLY D1033 33.016 -68.424 -32.084 1.00287.76 ATOM 80 O GLY D1033 32.779 -68.220 -30.902 1.00306.55 ATOM 81 N PHE D1034 34.242 -68.360 -32.629 1.00276.10 ATOM 82 CA PHE D1034 35.478 -68.153 -31.819 1.00265.58 ATOM 83 C PHE D1034 36.186 -66.877 -32.296 1.00255.77 ATOM 84 O PHE D1034 35.841 -66.398 -33.383 1.00244.03 ATOM 85 CB PHE D1034 36.347 -69.410 -31.909 1.00265.58 ATOM 86 CG PHE D1034 35.668 -70.654 -31.390 1.00266.18 ATOM 87 CD1 PHE D1034 34.696 -71.301 -32.140 1.00261.97 ATOM 88 CD2 PHE D1034 35.996 -71.174 -30.147 1.00266.33 ATOM 89 CE1 PHE D1034 34.053 -72.425 -31.646 1.00260.84 ATOM 90 CE2 PHE D1034 35.369 -72.313 -29.668 1.00266.58 ATOM 91 CZ PHE D1034 34.403 -72.939 -30.421 1.00263.28 ATOM 92 N VAL D1035 37.153 -66.355 -31.533 1.00258.72 ATOM 93 CA VAL D1035 37.770 -65.035 -31.880 1.00265.57 ATOM 94 C VAL D1035 39.183 -65.234 -32.439 1.00273.96 ATOM 95 O VAL D1035 39.991 -65.914 -31.792 1.00276.01 ATOM 96 CB VAL D1035 37.799 -64.094 -30.664 1.00262.68 ATOM 97 CG1 VAL D1035 38.485 -62.776 -30.990 1.00260.69 ATOM 98 CG2 VAL D1035 36.398 -63.861 -30.134 1.00261.44 ATOM 99 N ARG D1036 39.486 -64.613 -33.583 1.00279.94 ATOM 100 CA ARG D1036 40.829 -64.753 -34.205 1.00285.66 ATOM 101 C ARG D1036 41.538 -63.398 -34.148 1.00294.17 ATOM 102 O ARG D1036 40.882 -62.358 -34.370 1.00295.11 ATOM 103 CB ARG D1036 40.706 -65.292 -35.635 1.00283.50 ATOM 104 CG ARG D1036 42.029 -65.575 -36.334 1.00278.81 ATOM 105 CD ARG D1036 41.953 -66.807 -37.218 1.00273.94 ATOM 106 NE ARG D1036 41.723 -67.999 -36.414 1.00273.49 ATOM 107 CZ ARG D1036 41.830 -69.251 -36.850 1.00272.49 ATOM 108 NH1 ARG D1036 42.169 -69.497 -38.105 1.00270.40 ATOM 109 NH2 ARG D1036 41.599 -70.255 -36.022 1.00273.51 ATOM 110 N PHE D1037 42.836 -63.433 -33.874 1.00302.19 ATOM 111 CA PHE D1037 43.659 -62.205 -33.826 1.00302.88 ATOM 112 C PHE D1037 44.359 -61.991 -35.167 1.00311.65 ATOM 113 O PHE D1037 45.262 -62.779 -35.510 1.00320.96 ATOM 114 CB PHE D1037 44.643 -62.336 -32.671 1.00300.03 ATOM 115 CG PHE D1037 44.095 -61.782 -31.387 1.00294.66 ATOM 116 CD1 PHE D1037 42.962 -62.318 -30.794 1.00293.36 ATOM 117 CD2 PHE D1037 44.712 -60.702 -30.784 1.00291.27 ATOM 118 CE1 PHE D1037 42.457 -61.768 -29.625 1.00293.73 ATOM 119 CE2 PHE D1037 44.212 -60.163 -29.612 1.00288.57 ATOM 120 CZ PHE D1037 43.090 -60.700 -29.031 1.00290.97 ATOM 121 N THR D1038 43.966 -60.941 -35.891 1.00314.77 ATOM 122 CA THR D1038 44.564 -60.644 -37.223 1.00329.47 ATOM 123 C THR D1038 45.258 -59.276 -37.216 1.00351.93 ATOM 124 O THR D1038 44.598 -58.271 -36.874 1.00354.91 ATOM 125 CB THR D1038 43.529 -60.722 -38.350 1.00317.31 ATOM 126 OG1 THR D1038 42.498 -59.765 -38.109 1.00303.36 ATOM 127 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145 CA ILE D1041 51.426 -58.327 -33.448 1.00295.51 ATOM 146 C ILE D1041 51.762 -57.474 -32.218 1.00296.12 ATOM 147 O ILE D1041 51.519 -56.255 -32.251 1.00295.76 ATOM 148 CB ILE D1041 52.376 -58.012 -34.622 1.00295.90 ATOM 149 CG1 ILE D1041 52.024 -58.818 -35.877 1.00292.47 ATOM 150 CG2 ILE D1041 53.825 -58.212 -34.206 1.00301.05 ATOM 151 CD1 ILE D1041 52.695 -58.324 -37.139 1.00291.44 ATOM 152 N ASP D1042 52.322 -58.093 -31.177 1.00294.52 ATOM 153 CA ASP D1042 52.565 -57.368 -29.903 1.00296.28 ATOM 154 C ASP D1042 53.760 -56.425 -30.070 1.00301.28 ATOM 155 O ASP D1042 54.818 -56.885 -30.525 1.00307.68 ATOM 156 CB ASP D1042 52.785 -58.348 -28.753 1.00298.88 ATOM 157 CG ASP D1042 52.863 -57.660 -27.407 1.00299.38 ATOM 158 OD1 ASP D1042 52.352 -56.528 -27.294 1.00299.06 ATOM 159 OD2 ASP D1042 53.439 -58.261 -26.491 1.00301.77 ATOM 160 N GLY D1043 53.590 -55.148 -29.718 1.00295.29 ATOM 161 CA GLY D1043 54.690 -54.170 -29.840 1.00293.86 ATOM 162 C GLY D1043 54.503 -53.254 -31.040 1.00290.17 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