HEADER TRANSCRIPTION, TRANSFERASE/DNA/RNA 31-DEC-69 6UTZ TITLE E. coli sigma-S transcription initiation complex with a 6-nt RNA TITLE 2 ("Fresh" crystal soaked with CTP and UTP for 30 minutes) COMPND MOL_ID: 3; COMPND 2 MOLECULE: DNA-directed RNA polymerase subunit beta'; COMPND 3 CHAIN: DDD; COMPND 4 EC: 2.7.7.6; COMPND 5 ENGINEERED: YES; EXPDTA X-RAY DIFFRACTION REMARK 2 RESOLUTION. 3.80 ANGSTORMS DBREF 6UTZ D 1 1407 UNP P0A8T7 RPOC_ECOLI 1 1407 SEQRES 1 DDD 84 LYS ASP ILE THR GLY GLY LEU PRO ARG VAL ALA ASP LEU SEQRES 2 DDD 84 PHE GLU ALA ARG ARG PRO LYS GLU PRO ALA ILE LEU ALA SEQRES 3 DDD 84 GLU ILE SER GLY ILE VAL SER PHE GLY LYS GLU THR LYS SEQRES 4 DDD 84 GLY LYS ARG ARG LEU VAL ILE THR PRO VAL ASP GLY SER SEQRES 5 DDD 84 ASP PRO TYR GLU GLU MET ILE PRO LYS TRP ARG GLN LEU SEQRES 6 DDD 84 ASN VAL PHE GLU GLY GLU ARG VAL GLU ARG GLY ASP VAL SEQRES 7 DDD 84 ILE SER ASP GLY PRO GLU ATOM 1 N LYS D1132 30.256 -27.975 -22.210 1.00231.32 ATOM 2 CA LYS D1132 30.108 -27.314 -23.532 1.00220.08 ATOM 3 C LYS D1132 29.416 -25.965 -23.333 1.00208.30 ATOM 4 O LYS D1132 28.189 -25.959 -23.116 1.00206.87 ATOM 5 CB LYS D1132 29.346 -28.234 -24.488 1.00227.19 ATOM 6 CG LYS D1132 30.115 -29.479 -24.905 1.00230.06 ATOM 7 CD LYS D1132 29.251 -30.575 -25.473 1.00234.10 ATOM 8 CE LYS D1132 29.982 -31.896 -25.578 1.00236.42 ATOM 9 NZ LYS D1132 29.368 -32.781 -26.596 1.00240.69 ATOM 10 N ASP D1133 30.204 -24.887 -23.371 1.00198.28 ATOM 11 CA ASP D1133 29.698 -23.491 -23.325 1.00199.86 ATOM 12 C ASP D1133 29.700 -22.963 -24.762 1.00193.57 ATOM 13 O ASP D1133 29.931 -23.784 -25.664 1.00187.37 ATOM 14 CB ASP D1133 30.546 -22.635 -22.381 1.00204.39 ATOM 15 CG ASP D1133 29.821 -21.414 -21.835 1.00218.77 ATOM 16 OD1 ASP D1133 28.959 -20.878 -22.558 1.00224.98 ATOM 17 OD2 ASP D1133 30.115 -21.015 -20.682 1.00241.66 ATOM 18 N ILE D1134 29.469 -21.659 -24.964 1.00189.28 ATOM 19 CA ILE D1134 29.484 -21.086 -26.346 1.00188.25 ATOM 20 C ILE D1134 30.853 -21.407 -26.961 1.00192.66 ATOM 21 O ILE D1134 30.908 -21.674 -28.174 1.00199.79 ATOM 22 CB ILE D1134 29.182 -19.567 -26.359 1.00181.51 ATOM 23 CG1 ILE D1134 28.326 -19.114 -25.172 1.00182.07 ATOM 24 CG2 ILE D1134 28.551 -19.149 -27.679 1.00176.17 ATOM 25 CD1 ILE D1134 27.012 -19.856 -25.026 1.00180.98 ATOM 26 N THR D1135 31.902 -21.430 -26.133 1.00202.00 ATOM 27 CA THR D1135 33.308 -21.484 -26.617 1.00200.32 ATOM 28 C THR D1135 33.575 -22.802 -27.362 1.00214.83 ATOM 29 O THR D1135 34.259 -22.749 -28.402 1.00212.10 ATOM 30 CB THR D1135 34.270 -21.225 -25.453 1.00186.66 ATOM 31 OG1 THR D1135 33.952 -22.075 -24.352 1.00185.76 ATOM 32 CG2 THR D1135 34.205 -19.786 -24.996 1.00185.99 ATOM 33 N GLY D1136 33.007 -23.918 -26.885 1.00229.46 ATOM 34 CA GLY D1136 33.257 -25.256 -27.461 1.00230.83 ATOM 35 C GLY D1136 32.381 -25.555 -28.674 1.00234.68 ATOM 36 O GLY D1136 32.736 -26.477 -29.437 1.00244.23 ATOM 37 N GLY D1137 31.276 -24.821 -28.850 1.00227.56 ATOM 38 CA GLY D1137 30.315 -25.087 -29.939 1.00217.58 ATOM 39 C GLY D1137 30.449 -24.080 -31.068 1.00209.84 ATOM 40 O GLY D1137 29.995 -24.402 -32.176 1.00200.37 ATOM 41 N LEU D1138 31.042 -22.907 -30.797 1.00206.89 ATOM 42 CA LEU D1138 31.066 -21.794 -31.790 1.00209.53 ATOM 43 C LEU D1138 31.931 -22.183 -32.976 1.00203.63 ATOM 44 O LEU D1138 31.584 -21.874 -34.110 1.00203.69 ATOM 45 CB LEU D1138 31.598 -20.506 -31.158 1.00208.74 ATOM 46 CG LEU D1138 30.539 -19.483 -30.741 1.00219.83 ATOM 47 CD1 LEU D1138 31.190 -18.300 -30.051 1.00230.25 ATOM 48 CD2 LEU D1138 29.718 -18.991 -31.925 1.00221.33 ATOM 49 N PRO D1139 33.078 -22.861 -32.754 1.00201.48 ATOM 50 CA PRO D1139 33.909 -23.324 -33.864 1.00208.32 ATOM 51 C PRO D1139 33.089 -24.199 -34.828 1.00209.69 ATOM 52 O PRO D1139 33.304 -24.136 -36.048 1.00204.21 ATOM 53 CB PRO D1139 35.031 -24.104 -33.159 1.00209.98 ATOM 54 CG PRO D1139 35.083 -23.502 -31.765 1.00204.63 ATOM 55 CD PRO D1139 33.636 -23.211 -31.440 1.00198.41 ATOM 56 N ARG D1140 32.175 -24.998 -34.273 1.00213.89 ATOM 57 CA ARG D1140 31.292 -25.852 -35.105 1.00218.85 ATOM 58 C ARG D1140 30.464 -24.953 -36.026 1.00210.66 ATOM 59 O ARG D1140 30.322 -25.281 -37.205 1.00210.07 ATOM 60 CB ARG D1140 30.372 -26.689 -34.213 1.00227.61 ATOM 61 CG ARG D1140 29.314 -27.478 -34.972 1.00239.62 ATOM 62 CD ARG D1140 29.932 -28.415 -35.984 1.00248.37 ATOM 63 NE ARG D1140 28.993 -29.378 -36.547 1.00252.86 ATOM 64 CZ ARG D1140 29.257 -30.126 -37.613 1.00264.25 ATOM 65 NH1 ARG D1140 30.425 -30.012 -38.224 1.00278.12 ATOM 66 NH2 ARG D1140 28.366 -30.988 -38.070 1.00265.83 ATOM 67 N VAL D1141 29.934 -23.866 -35.471 1.00198.69 ATOM 68 CA VAL D1141 29.081 -22.910 -36.228 1.00194.74 ATOM 69 C VAL D1141 29.916 -22.322 -37.366 1.00197.88 ATOM 70 O VAL D1141 29.436 -22.307 -38.520 1.00202.75 ATOM 71 CB VAL D1141 28.551 -21.815 -35.287 1.00187.21 ATOM 72 CG1 VAL D1141 27.653 -20.835 -36.019 1.00185.25 ATOM 73 CG2 VAL D1141 27.831 -22.422 -34.091 1.00189.07 ATOM 74 N ALA D1142 31.130 -21.886 -37.028 1.00193.49 ATOM 75 CA ALA D1142 32.038 -21.248 -38.003 1.00188.87 ATOM 76 C ALA D1142 32.317 -22.246 -39.117 1.00193.28 ATOM 77 O ALA D1142 32.317 -21.845 -40.295 1.00204.17 ATOM 78 CB ALA D1142 33.321 -20.835 -37.331 1.00191.63 ATOM 79 N ASP D1143 32.528 -23.502 -38.737 1.00194.37 ATOM 80 CA ASP D1143 32.929 -24.511 -39.746 1.00203.61 ATOM 81 C ASP D1143 31.745 -24.748 -40.681 1.00208.23 ATOM 82 O ASP D1143 31.956 -24.875 -41.909 1.00209.64 ATOM 83 CB ASP D1143 33.390 -25.800 -39.073 1.00206.49 ATOM 84 CG ASP D1143 34.662 -25.617 -38.280 1.00211.50 ATOM 85 OD1 ASP D1143 35.193 -24.480 -38.267 1.00211.32 ATOM 86 OD2 ASP D1143 35.069 -26.599 -37.639 1.00219.42 ATOM 87 N LEU D1144 30.545 -24.783 -40.102 1.00217.50 ATOM 88 CA LEU D1144 29.321 -25.022 -40.901 1.00225.22 ATOM 89 C LEU D1144 29.138 -23.874 -41.892 1.00216.54 ATOM 90 O LEU D1144 28.974 -24.182 -43.083 1.00209.62 ATOM 91 CB LEU D1144 28.119 -25.153 -39.964 1.00229.87 ATOM 92 CG LEU D1144 28.028 -26.485 -39.214 1.00229.81 ATOM 93 CD1 LEU D1144 26.999 -26.423 -38.097 1.00225.98 ATOM 94 CD2 LEU D1144 27.718 -27.641 -40.155 1.00227.48 ATOM 95 N PHE D1145 29.188 -22.622 -41.418 1.00211.02 ATOM 96 CA PHE D1145 28.961 -21.439 -42.293 1.00216.77 ATOM 97 C PHE D1145 30.074 -21.353 -43.338 1.00221.88 ATOM 98 O PHE D1145 29.865 -20.798 -44.433 1.00217.64 ATOM 99 CB PHE D1145 28.889 -20.154 -41.466 1.00204.51 ATOM 100 CG PHE D1145 27.531 -19.900 -40.869 1.00194.01 ATOM 101 CD1 PHE D1145 26.423 -19.675 -41.674 1.00199.17 ATOM 102 CD2 PHE D1145 27.368 -19.895 -39.498 1.00189.87 ATOM 103 CE1 PHE D1145 25.173 -19.475 -41.109 1.00201.04 ATOM 104 CE2 PHE D1145 26.122 -19.682 -38.938 1.00195.65 ATOM 105 CZ PHE D1145 25.025 -19.487 -39.743 1.00198.72 ATOM 106 N GLU D1146 31.237 -21.910 -43.004 1.00236.13 ATOM 107 CA GLU D1146 32.393 -21.839 -43.928 1.00252.15 ATOM 108 C GLU D1146 32.435 -23.086 -44.808 1.00255.36 ATOM 109 O GLU D1146 33.376 -23.197 -45.606 1.00277.12 ATOM 110 CB GLU D1146 33.701 -21.748 -43.152 1.00271.87 ATOM 111 CG GLU D1146 33.868 -20.447 -42.389 1.00278.21 ATOM 112 CD GLU D1146 34.166 -19.213 -43.227 1.00281.34 ATOM 113 OE1 GLU D1146 34.508 -19.370 -44.421 1.00294.38 ATOM 114 OE2 GLU D1146 34.037 -18.092 -42.687 1.00278.04 ATOM 115 N ALA D1147 31.500 -24.014 -44.594 1.00250.84 ATOM 116 CA ALA D1147 31.262 -25.174 -45.482 1.00256.47 ATOM 117 C ALA D1147 32.556 -25.983 -45.605 1.00252.71 ATOM 118 O ALA D1147 33.058 -26.154 -46.730 1.00268.67 ATOM 119 CB ALA D1147 30.740 -24.698 -46.819 1.00263.95 ATOM 120 N ARG D1148 33.078 -26.434 -44.462 1.00235.99 ATOM 121 CA ARG D1148 34.247 -27.348 -44.446 1.00236.02 ATOM 122 C ARG D1148 33.786 -28.796 -44.455 1.00235.28 ATOM 123 O ARG D1148 32.946 -29.183 -43.612 1.00225.84 ATOM 124 CB ARG D1148 35.103 -27.111 -43.210 1.00232.94 ATOM 125 CG ARG D1148 35.497 -25.656 -43.101 1.00235.81 ATOM 126 CD ARG D1148 36.528 -25.396 -42.042 1.00247.96 ATOM 127 NE ARG D1148 36.872 -23.996 -42.201 1.00258.27 ATOM 128 CZ ARG D1148 37.422 -23.233 -41.272 1.00272.71 ATOM 129 NH1 ARG D1148 37.716 -23.741 -40.087 1.00283.36 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1.00261.24 ATOM 148 CD PRO D1150 33.242 -33.194 -43.639 1.00260.77 ATOM 149 N LYS D1151 37.047 -34.403 -41.517 1.00287.59 ATOM 150 CA LYS D1151 38.203 -35.286 -41.834 1.00291.90 ATOM 151 C LYS D1151 37.692 -36.599 -42.456 1.00289.85 ATOM 152 O LYS D1151 38.395 -37.146 -43.326 1.00289.58 ATOM 153 CB LYS D1151 39.079 -35.506 -40.593 1.00301.79 ATOM 154 CG LYS D1151 40.334 -34.638 -40.526 1.00302.21 ATOM 155 CD LYS D1151 41.499 -35.299 -39.814 1.00301.23 ATOM 156 CE LYS D1151 42.844 -34.781 -40.276 1.00293.92 ATOM 157 NZ LYS D1151 43.944 -35.692 -39.883 1.00291.28 ATOM 158 N GLU D1152 36.501 -37.073 -42.073 1.00280.76 ATOM 159 CA GLU D1152 36.015 -38.371 -42.611 1.00279.11 ATOM 160 C GLU D1152 34.610 -38.225 -43.180 1.00277.84 ATOM 161 O GLU D1152 33.651 -38.670 -42.558 1.00277.52 ATOM 162 CB GLU D1152 35.995 -39.406 -41.491 1.00275.80 ATOM 163 CG GLU D1152 35.354 -38.889 -40.215 1.00271.79 ATOM 164 CD GLU D1152 34.780 -39.963 -39.308 1.00279.00 ATOM 165 OE1 GLU D1152 34.484 -41.067 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