HEADER TRANSCRIPTION, TRANSFERASE/DNA/RNA 31-DEC-69 6UU1 TITLE E. coli sigma-S transcription initiation complex with a 4-nt RNA and TITLE 2 a CTP ("Fresh" crystal soaked with CTP, GTP, and ddTTP for 30 COMPND MOL_ID: 3; COMPND 2 MOLECULE: DNA-directed RNA polymerase subunit beta'; COMPND 3 CHAIN: DDD; COMPND 4 EC: 2.7.7.6; COMPND 5 ENGINEERED: YES; EXPDTA X-RAY DIFFRACTION REMARK 2 RESOLUTION. 4.10 ANGSTORMS DBREF 6UU1 D 1 1407 UNP P0A8T7 RPOC_ECOLI 1 1407 SEQRES 1 DDD 109 HIS THR MET PRO VAL ILE THR GLU VAL SER GLY PHE VAL SEQRES 2 DDD 109 ARG PHE THR ASP MET ILE ASP GLY GLN THR ILE THR ARG SEQRES 3 DDD 109 GLN THR ASP GLU LEU THR GLY LEU SER SER LEU VAL VAL SEQRES 4 DDD 109 LEU ASP SER ALA GLU ARG THR ALA GLY GLY LYS ASP LEU SEQRES 5 DDD 109 ARG PRO ALA LEU LYS ILE VAL ASP ALA GLN GLY ASN ASP SEQRES 6 DDD 109 VAL LEU ILE PRO GLY THR ASP MET PRO ALA GLN TYR PHE SEQRES 7 DDD 109 LEU PRO GLY LYS ALA ILE VAL GLN LEU GLU ASP GLY VAL SEQRES 8 DDD 109 GLN ILE SER SER GLY ASP THR LEU ALA ARG ILE PRO GLN SEQRES 9 DDD 109 GLU SER GLY GLY THR ATOM 1 N HIS D1023 29.870 -44.747 -20.313 1.00320.50 ATOM 2 CA HIS D1023 31.344 -44.849 -20.429 1.00326.48 ATOM 3 C HIS D1023 31.680 -46.208 -21.057 1.00319.79 ATOM 4 O HIS D1023 31.236 -47.249 -20.526 1.00315.55 ATOM 5 CB HIS D1023 31.975 -44.573 -19.056 1.00339.92 ATOM 6 CG HIS D1023 31.074 -43.900 -18.065 1.00350.77 ATOM 7 ND1 HIS D1023 30.789 -42.543 -18.101 1.00358.33 ATOM 8 CD2 HIS D1023 30.427 -44.385 -16.981 1.00352.98 ATOM 9 CE1 HIS D1023 29.994 -42.231 -17.096 1.00357.86 ATOM 10 NE2 HIS D1023 29.759 -43.343 -16.392 1.00353.70 ATOM 11 N THR D1024 32.388 -46.187 -22.185 1.00321.45 ATOM 12 CA THR D1024 32.675 -47.377 -23.028 1.00324.04 ATOM 13 C THR D1024 31.575 -47.576 -24.075 1.00325.17 ATOM 14 O THR D1024 30.428 -47.874 -23.694 1.00328.52 ATOM 15 CB THR D1024 32.766 -48.672 -22.210 1.00329.81 ATOM 16 OG1 THR D1024 34.018 -48.681 -21.524 1.00331.99 ATOM 17 CG2 THR D1024 32.630 -49.915 -23.065 1.00332.23 ATOM 18 N MET D1025 31.938 -47.467 -25.351 1.00322.15 ATOM 19 CA MET D1025 31.086 -47.980 -26.448 1.00310.89 ATOM 20 C MET D1025 31.608 -49.377 -26.774 1.00296.79 ATOM 21 O MET D1025 32.712 -49.503 -27.303 1.00285.97 ATOM 22 CB MET D1025 31.183 -47.042 -27.657 1.00314.40 ATOM 23 CG MET D1025 30.731 -47.665 -28.961 1.00311.34 ATOM 24 SD MET D1025 32.024 -47.620 -30.231 1.00304.21 ATOM 25 CE MET D1025 31.172 -48.420 -31.585 1.00296.36 ATOM 26 N PRO D1026 30.902 -50.464 -26.373 1.00286.70 ATOM 27 CA PRO D1026 31.390 -51.822 -26.631 1.00281.87 ATOM 28 C PRO D1026 31.376 -52.207 -28.123 1.00270.35 ATOM 29 O PRO D1026 30.600 -51.662 -28.879 1.00268.51 ATOM 30 CB PRO D1026 30.437 -52.712 -25.810 1.00283.28 ATOM 31 CG PRO D1026 29.170 -51.885 -25.653 1.00278.39 ATOM 32 CD PRO D1026 29.631 -50.443 -25.627 1.00280.25 ATOM 33 N VAL D1027 32.257 -53.117 -28.531 1.00253.48 ATOM 34 CA VAL D1027 32.194 -53.714 -29.892 1.00245.89 ATOM 35 C VAL D1027 31.437 -55.031 -29.760 1.00238.26 ATOM 36 O VAL D1027 31.995 -55.961 -29.153 1.00233.04 ATOM 37 CB VAL D1027 33.599 -53.922 -30.477 1.00248.27 ATOM 38 CG1 VAL D1027 33.533 -54.462 -31.895 1.00254.26 ATOM 39 CG2 VAL D1027 34.429 -52.650 -30.424 1.00252.58 ATOM 40 N ILE D1028 30.200 -55.087 -30.259 1.00238.20 ATOM 41 CA ILE D1028 29.291 -56.251 -30.020 1.00243.58 ATOM 42 C ILE D1028 29.253 -57.118 -31.286 1.00244.99 ATOM 43 O ILE D1028 28.982 -56.592 -32.383 1.00250.76 ATOM 44 CB ILE D1028 27.908 -55.811 -29.474 1.00247.10 ATOM 45 CG1 ILE D1028 27.964 -55.775 -27.943 1.00259.90 ATOM 46 CG2 ILE D1028 26.764 -56.696 -29.960 1.00242.05 ATOM 47 CD1 ILE D1028 26.785 -55.125 -27.273 1.00268.80 ATOM 48 N THR D1029 29.602 -58.396 -31.128 1.00244.49 ATOM 49 CA THR D1029 29.681 -59.352 -32.266 1.00243.87 ATOM 50 C THR D1029 28.317 -59.937 -32.634 1.00251.95 ATOM 51 O THR D1029 27.595 -60.400 -31.744 1.00255.79 ATOM 52 CB THR D1029 30.554 -60.554 -31.915 1.00234.07 ATOM 53 OG1 THR D1029 29.824 -61.333 -30.967 1.00228.19 ATOM 54 CG2 THR D1029 31.888 -60.149 -31.343 1.00233.05 ATOM 55 N GLU D1030 28.028 -60.032 -33.923 1.00265.83 ATOM 56 CA GLU D1030 26.732 -60.623 -34.330 1.00282.19 ATOM 57 C GLU D1030 26.818 -62.152 -34.243 1.00297.47 ATOM 58 O GLU D1030 25.887 -62.765 -33.707 1.00302.27 ATOM 59 CB GLU D1030 26.393 -60.109 -35.723 1.00290.02 ATOM 60 CG GLU D1030 26.377 -58.592 -35.785 1.00288.63 ATOM 61 CD GLU D1030 26.389 -57.981 -37.177 1.00293.93 ATOM 62 OE1 GLU D1030 27.023 -58.565 -38.076 1.00303.44 ATOM 63 OE2 GLU D1030 25.772 -56.912 -37.356 1.00294.47 ATOM 64 N VAL D1031 27.915 -62.743 -34.717 1.00307.51 ATOM 65 CA VAL D1031 27.979 -64.230 -34.848 1.00305.80 ATOM 66 C VAL D1031 28.563 -64.849 -33.577 1.00303.94 ATOM 67 O VAL D1031 29.226 -64.136 -32.804 1.00304.89 ATOM 68 CB VAL D1031 28.798 -64.626 -36.086 1.00308.33 ATOM 69 CG1 VAL D1031 28.050 -64.268 -37.351 1.00305.20 ATOM 70 CG2 VAL D1031 30.169 -63.976 -36.078 1.00307.31 ATOM 71 N SER D1032 28.334 -66.154 -33.402 1.00292.33 ATOM 72 CA SER D1032 28.830 -66.924 -32.229 1.00283.82 ATOM 73 C SER D1032 29.973 -67.864 -32.653 1.00277.96 ATOM 74 O SER D1032 29.923 -68.416 -33.775 1.00277.97 ATOM 75 CB SER D1032 27.695 -67.693 -31.579 1.00282.62 ATOM 76 OG SER D1032 26.415 -67.249 -32.027 1.00280.32 ATOM 77 N GLY D1033 30.987 -68.053 -31.810 1.00271.20 ATOM 78 CA GLY D1033 32.007 -69.064 -32.147 1.00270.62 ATOM 79 C GLY D1033 33.226 -68.995 -31.253 1.00269.95 ATOM 80 O GLY D1033 33.041 -69.004 -30.037 1.00275.83 ATOM 81 N PHE D1034 34.429 -69.041 -31.847 1.00271.53 ATOM 82 CA PHE D1034 35.718 -68.793 -31.138 1.00273.90 ATOM 83 C PHE D1034 36.278 -67.445 -31.610 1.00270.16 ATOM 84 O PHE D1034 35.868 -66.990 -32.686 1.00268.63 ATOM 85 CB PHE D1034 36.679 -69.974 -31.336 1.00279.35 ATOM 86 CG PHE D1034 36.288 -71.172 -30.509 1.00286.71 ATOM 87 CD1 PHE D1034 35.215 -71.966 -30.881 1.00287.87 ATOM 88 CD2 PHE D1034 36.934 -71.452 -29.315 1.00294.87 ATOM 89 CE1 PHE D1034 34.828 -73.045 -30.101 1.00292.86 ATOM 90 CE2 PHE D1034 36.534 -72.520 -28.527 1.00301.45 ATOM 91 CZ PHE D1034 35.490 -73.321 -28.927 1.00299.84 ATOM 92 N VAL D1035 37.168 -66.819 -30.829 1.00269.14 ATOM 93 CA VAL D1035 37.726 -65.471 -31.162 1.00269.27 ATOM 94 C VAL D1035 39.185 -65.595 -31.612 1.00278.90 ATOM 95 O VAL D1035 39.997 -66.190 -30.887 1.00283.27 ATOM 96 CB VAL D1035 37.602 -64.496 -29.983 1.00262.00 ATOM 97 CG1 VAL D1035 38.241 -63.155 -30.309 1.00258.86 ATOM 98 CG2 VAL D1035 36.150 -64.329 -29.584 1.00262.50 ATOM 99 N ARG D1036 39.516 -65.013 -32.762 1.00295.08 ATOM 100 CA ARG D1036 40.867 -65.157 -33.357 1.00306.34 ATOM 101 C ARG D1036 41.546 -63.790 -33.376 1.00294.14 ATOM 102 O ARG D1036 40.890 -62.798 -33.712 1.00283.83 ATOM 103 CB ARG D1036 40.797 -65.765 -34.761 1.00331.09 ATOM 104 CG ARG D1036 42.149 -65.934 -35.441 1.00340.98 ATOM 105 CD ARG D1036 42.129 -67.014 -36.507 1.00345.16 ATOM 106 NE ARG D1036 42.030 -68.340 -35.915 1.00346.99 ATOM 107 CZ ARG D1036 41.972 -69.472 -36.603 1.00355.18 ATOM 108 NH1 ARG D1036 42.006 -69.448 -37.926 1.00357.49 ATOM 109 NH2 ARG D1036 41.883 -70.626 -35.965 1.00363.58 ATOM 110 N PHE D1037 42.838 -63.765 -33.079 1.00291.36 ATOM 111 CA PHE D1037 43.604 -62.497 -33.143 1.00296.76 ATOM 112 C PHE D1037 44.287 -62.317 -34.502 1.00298.82 ATOM 113 O PHE D1037 45.425 -62.801 -34.683 1.00294.77 ATOM 114 CB PHE D1037 44.704 -62.520 -32.092 1.00295.65 ATOM 115 CG PHE D1037 44.309 -62.156 -30.686 1.00295.62 ATOM 116 CD1 PHE D1037 42.988 -62.139 -30.257 1.00295.16 ATOM 117 CD2 PHE D1037 45.304 -61.879 -29.766 1.00293.82 ATOM 118 CE1 PHE D1037 42.681 -61.811 -28.944 1.00291.81 ATOM 119 CE2 PHE D1037 44.995 -61.559 -28.457 1.00291.31 ATOM 120 CZ PHE D1037 43.683 -61.525 -28.049 1.00290.33 ATOM 121 N THR D1038 43.664 -61.565 -35.408 1.00307.21 ATOM 122 CA THR D1038 44.314 -61.189 -36.691 1.00315.37 ATOM 123 C THR D1038 45.232 -59.979 -36.472 1.00323.31 ATOM 124 O THR D1038 44.814 -58.997 -35.824 1.00320.90 ATOM 125 CB THR D1038 43.319 -60.933 -37.833 1.00318.41 ATOM 126 OG1 THR D1038 42.121 -60.316 -37.353 1.00318.72 ATOM 127 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145 CA ILE D1041 51.196 -58.450 -32.991 1.00286.37 ATOM 146 C ILE D1041 51.464 -57.519 -31.805 1.00287.53 ATOM 147 O ILE D1041 51.288 -56.284 -31.938 1.00289.16 ATOM 148 CB ILE D1041 52.244 -58.256 -34.107 1.00285.06 ATOM 149 CG1 ILE D1041 51.895 -59.038 -35.379 1.00285.82 ATOM 150 CG2 ILE D1041 53.623 -58.625 -33.580 1.00283.46 ATOM 151 CD1 ILE D1041 52.743 -58.684 -36.586 1.00285.15 ATOM 152 N ASP D1042 51.901 -58.093 -30.685 1.00290.56 ATOM 153 CA ASP D1042 52.267 -57.277 -29.499 1.00295.60 ATOM 154 C ASP D1042 53.416 -56.320 -29.840 1.00295.33 ATOM 155 O ASP D1042 54.376 -56.713 -30.539 1.00292.49 ATOM 156 CB ASP D1042 52.639 -58.134 -28.292 1.00304.31 ATOM 157 CG ASP D1042 53.078 -57.288 -27.108 1.00308.64 ATOM 158 OD1 ASP D1042 52.906 -56.048 -27.169 1.00307.25 ATOM 159 OD2 ASP D1042 53.585 -57.870 -26.130 1.00313.09 ATOM 160 N GLY D1043 53.312 -55.092 -29.338 1.00296.15 ATOM 161 CA GLY D1043 54.387 -54.099 -29.521 1.00295.01 ATOM 162 C GLY D1043 54.281 -53.422 -30.876 1.00290.03 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