HEADER TRANSCRIPTION, TRANSFERASE/DNA/RNA 31-DEC-69 6UU5 TITLE E. coli sigma-S transcription initiation complex with a 6-nt RNA TITLE 2 ("Old" crystal soaked with GTP, UTP, CTP, and dinucleotide GpA for 30 TITLE 3 minutes) COMPND MOL_ID: 3; COMPND 2 MOLECULE: DNA-directed RNA polymerase subunit beta'; COMPND 3 CHAIN: DDD; COMPND 4 EC: 2.7.7.6; COMPND 5 ENGINEERED: YES; EXPDTA X-RAY DIFFRACTION REMARK 2 RESOLUTION. 5.40 ANGSTORMS DBREF 6UU5 D 1 1407 UNP P0A8T7 RPOC_ECOLI 1 1407 SEQRES 1 DDD 84 LYS ASP ILE THR GLY GLY LEU PRO ARG VAL ALA ASP LEU SEQRES 2 DDD 84 PHE GLU ALA ARG ARG PRO LYS GLU PRO ALA ILE LEU ALA SEQRES 3 DDD 84 GLU ILE SER GLY ILE VAL SER PHE GLY LYS GLU THR LYS SEQRES 4 DDD 84 GLY LYS ARG ARG LEU VAL ILE THR PRO VAL ASP GLY SER SEQRES 5 DDD 84 ASP PRO TYR GLU GLU MET ILE PRO LYS TRP ARG GLN LEU SEQRES 6 DDD 84 ASN VAL PHE GLU GLY GLU ARG VAL GLU ARG GLY ASP VAL SEQRES 7 DDD 84 ILE SER ASP GLY PRO GLU ATOM 1 N LYS D1132 29.797 -27.166 -21.281 1.00378.89 ATOM 2 CA LYS 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-27.059 1.00339.05 ATOM 21 O ILE D1134 31.394 -21.481 -28.292 1.00341.67 ATOM 22 CB ILE D1134 29.189 -20.002 -26.543 1.00322.81 ATOM 23 CG1 ILE D1134 27.660 -20.007 -26.438 1.00323.92 ATOM 24 CG2 ILE D1134 29.667 -19.191 -27.737 1.00316.36 ATOM 25 CD1 ILE D1134 26.958 -20.207 -27.761 1.00324.33 ATOM 26 N THR D1135 32.175 -21.633 -26.143 1.00348.48 ATOM 27 CA THR D1135 33.610 -21.814 -26.512 1.00350.63 ATOM 28 C THR D1135 33.748 -22.983 -27.495 1.00352.62 ATOM 29 O THR D1135 34.470 -22.830 -28.499 1.00359.92 ATOM 30 CB THR D1135 34.483 -22.046 -25.270 1.00357.65 ATOM 31 OG1 THR D1135 34.686 -20.784 -24.635 1.00361.60 ATOM 32 CG2 THR D1135 35.830 -22.662 -25.585 1.00357.96 ATOM 33 N GLY D1136 33.083 -24.105 -27.205 1.00346.50 ATOM 34 CA GLY D1136 33.177 -25.302 -28.063 1.00338.06 ATOM 35 C GLY D1136 32.152 -25.256 -29.181 1.00327.63 ATOM 36 O GLY D1136 32.392 -25.874 -30.245 1.00323.65 ATOM 37 N GLY D1137 31.053 -24.536 -28.934 1.00319.80 ATOM 38 CA GLY D1137 29.895 -24.503 -29.844 1.00312.45 ATOM 39 C GLY D1137 30.160 -23.636 -31.058 1.00303.27 ATOM 40 O GLY D1137 29.892 -24.107 -32.173 1.00298.39 ATOM 41 N LEU D1138 30.733 -22.446 -30.847 1.00298.97 ATOM 42 CA LEU D1138 30.883 -21.438 -31.934 1.00291.34 ATOM 43 C LEU D1138 31.784 -21.970 -33.047 1.00279.13 ATOM 44 O LEU D1138 31.493 -21.742 -34.220 1.00277.15 ATOM 45 CB LEU D1138 31.435 -20.124 -31.367 1.00298.37 ATOM 46 CG LEU D1138 30.401 -19.068 -30.962 1.00298.09 ATOM 47 CD1 LEU D1138 31.089 -17.829 -30.406 1.00297.67 ATOM 48 CD2 LEU D1138 29.495 -18.676 -32.122 1.00294.60 ATOM 49 N PRO D1139 32.927 -22.636 -32.763 1.00267.48 ATOM 50 CA PRO D1139 33.704 -23.240 -33.844 1.00266.23 ATOM 51 C PRO D1139 32.875 -24.183 -34.722 1.00266.77 ATOM 52 O PRO D1139 33.121 -24.224 -35.914 1.00260.27 ATOM 53 CB PRO D1139 34.785 -24.027 -33.106 1.00265.90 ATOM 54 CG PRO D1139 34.999 -23.214 -31.857 1.00266.35 ATOM 55 CD PRO D1139 33.613 -22.739 -31.463 1.00266.45 ATOM 56 N ARG D1140 31.927 -24.906 -34.117 1.00277.75 ATOM 57 CA ARG D1140 31.055 -25.819 -34.902 1.00284.24 ATOM 58 C ARG D1140 30.245 -24.985 -35.892 1.00277.04 ATOM 59 O ARG D1140 30.143 -25.377 -37.064 1.00283.95 ATOM 60 CB ARG D1140 30.072 -26.574 -34.004 1.00295.42 ATOM 61 CG ARG D1140 30.701 -27.672 -33.161 1.00305.68 ATOM 62 CD ARG D1140 29.636 -28.517 -32.489 1.00314.50 ATOM 63 NE ARG D1140 30.074 -29.885 -32.248 1.00325.15 ATOM 64 CZ ARG D1140 29.259 -30.924 -32.096 1.00335.70 ATOM 65 NH1 ARG D1140 27.948 -30.758 -32.165 1.00337.13 ATOM 66 NH2 ARG D1140 29.759 -32.128 -31.883 1.00344.88 ATOM 67 N VAL D1141 29.688 -23.888 -35.379 1.00263.53 ATOM 68 CA VAL D1141 28.835 -22.942 -36.144 1.00253.54 ATOM 69 C VAL D1141 29.681 -22.379 -37.286 1.00242.60 ATOM 70 O VAL D1141 29.220 -22.399 -38.435 1.00237.66 ATOM 71 CB VAL D1141 28.301 -21.830 -35.221 1.00252.49 ATOM 72 CG1 VAL D1141 27.694 -20.694 -36.025 1.00251.16 ATOM 73 CG2 VAL D1141 27.292 -22.355 -34.206 1.00253.97 ATOM 74 N ALA D1142 30.912 -21.973 -36.976 1.00235.83 ATOM 75 CA ALA D1142 31.765 -21.295 -37.977 1.00232.12 ATOM 76 C ALA D1142 32.192 -22.322 -39.030 1.00230.00 ATOM 77 O ALA D1142 32.280 -21.966 -40.224 1.00223.83 ATOM 78 CB ALA D1142 32.940 -20.639 -37.289 1.00232.25 ATOM 79 N ASP D1143 32.376 -23.570 -38.604 1.00234.70 ATOM 80 CA ASP D1143 32.747 -24.635 -39.564 1.00242.87 ATOM 81 C ASP D1143 31.580 -24.869 -40.513 1.00248.87 ATOM 82 O ASP D1143 31.846 -25.203 -41.656 1.00253.86 ATOM 83 CB ASP D1143 33.068 -25.948 -38.858 1.00245.13 ATOM 84 CG ASP D1143 34.431 -25.945 -38.190 1.00244.23 ATOM 85 OD1 ASP D1143 34.892 -24.850 -37.809 1.00240.30 ATOM 86 OD2 ASP D1143 35.042 -27.028 -38.099 1.00247.11 ATOM 87 N LEU D1144 30.359 -24.823 -39.982 1.00255.60 ATOM 88 CA LEU D1144 29.151 -25.054 -40.813 1.00258.92 ATOM 89 C LEU D1144 29.013 -23.910 -41.825 1.00249.27 ATOM 90 O LEU D1144 28.890 -24.208 -43.024 1.00253.22 ATOM 91 CB LEU D1144 27.935 -25.184 -39.889 1.00269.97 ATOM 92 CG LEU D1144 27.759 -26.582 -39.289 1.00277.55 ATOM 93 CD1 LEU D1144 27.004 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-20.264 -42.633 1.00273.49 ATOM 112 CD GLU D1146 34.309 -19.222 -43.631 1.00276.95 ATOM 113 OE1 GLU D1146 35.183 -19.556 -44.461 1.00280.37 ATOM 114 OE2 GLU D1146 33.855 -18.052 -43.558 1.00277.66 ATOM 115 N ALA D1147 31.385 -24.027 -44.604 1.00295.67 ATOM 116 CA ALA D1147 31.213 -25.139 -45.565 1.00311.02 ATOM 117 C ALA D1147 32.508 -25.944 -45.595 1.00320.47 ATOM 118 O ALA D1147 33.155 -26.046 -46.647 1.00320.10 ATOM 119 CB ALA D1147 30.863 -24.607 -46.929 1.00314.70 ATOM 120 N ARG D1148 32.889 -26.446 -44.430 1.00324.63 ATOM 121 CA ARG D1148 34.104 -27.282 -44.346 1.00325.43 ATOM 122 C ARG D1148 33.723 -28.759 -44.426 1.00330.49 ATOM 123 O ARG D1148 32.821 -29.221 -43.680 1.00336.25 ATOM 124 CB ARG D1148 34.863 -26.965 -43.063 1.00325.17 ATOM 125 CG ARG D1148 35.278 -25.509 -42.967 1.00324.90 ATOM 126 CD ARG D1148 36.055 -25.254 -41.698 1.00330.36 ATOM 127 NE ARG D1148 36.701 -23.954 -41.775 1.00334.80 ATOM 128 CZ ARG D1148 36.574 -22.973 -40.884 1.00336.61 ATOM 129 NH1 ARG D1148 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