HEADER TRANSCRIPTION, TRANSFERASE/DNA/RNA 31-DEC-69 6UU6 TITLE E. coli sigma-S transcription initiation complex with a 4-nt RNA and TITLE 2 a UTP ("Old" crystal soaked with UTP, ddCTP, and dinucleotide ApG for TITLE 3 30 minutes) COMPND MOL_ID: 3; COMPND 2 MOLECULE: DNA-directed RNA polymerase subunit beta'; COMPND 3 CHAIN: DDD; COMPND 4 EC: 2.7.7.6; COMPND 5 ENGINEERED: YES; EXPDTA X-RAY DIFFRACTION REMARK 2 RESOLUTION. 4.20 ANGSTORMS DBREF 6UU6 D 1 1407 UNP P0A8T7 RPOC_ECOLI 1 1407 SEQRES 1 DDD 109 HIS THR MET PRO VAL ILE THR GLU VAL SER GLY PHE VAL SEQRES 2 DDD 109 ARG PHE THR ASP MET ILE ASP GLY GLN THR ILE THR ARG SEQRES 3 DDD 109 GLN THR ASP GLU LEU THR GLY LEU SER SER LEU VAL VAL SEQRES 4 DDD 109 LEU ASP SER ALA GLU ARG THR ALA GLY GLY LYS ASP LEU SEQRES 5 DDD 109 ARG PRO ALA LEU LYS ILE VAL ASP ALA GLN GLY ASN ASP SEQRES 6 DDD 109 VAL LEU ILE PRO GLY THR ASP MET PRO ALA GLN TYR PHE SEQRES 7 DDD 109 LEU PRO GLY LYS ALA ILE VAL GLN LEU GLU ASP GLY VAL SEQRES 8 DDD 109 GLN ILE SER SER GLY ASP THR LEU ALA ARG ILE PRO GLN SEQRES 9 DDD 109 GLU SER GLY GLY THR ATOM 1 N HIS D1023 29.291 -44.267 -21.111 1.00378.98 ATOM 2 CA HIS D1023 30.765 -44.363 -21.200 1.00376.25 ATOM 3 C HIS D1023 31.115 -45.706 -21.852 1.00363.92 ATOM 4 O HIS D1023 30.668 -46.758 -21.347 1.00364.25 ATOM 5 CB HIS D1023 31.353 -44.119 -19.806 1.00388.10 ATOM 6 CG HIS D1023 30.432 -43.432 -18.842 1.00399.10 ATOM 7 ND1 HIS D1023 30.174 -42.069 -18.881 1.00404.91 ATOM 8 CD2 HIS D1023 29.745 -43.909 -17.778 1.00406.15 ATOM 9 CE1 HIS D1023 29.353 -41.747 -17.900 1.00409.97 ATOM 10 NE2 HIS D1023 29.076 -42.858 -17.208 1.00410.29 ATOM 11 N THR D1024 31.843 -45.656 -22.968 1.00355.37 ATOM 12 CA THR D1024 32.153 -46.822 -23.836 1.00349.38 ATOM 13 C THR D1024 31.068 -47.007 -24.900 1.00332.86 ATOM 14 O THR D1024 29.923 -47.334 -24.540 1.00324.10 ATOM 15 CB THR D1024 32.248 -48.132 -23.045 1.00361.52 ATOM 16 OG1 THR D1024 33.480 -48.135 -22.324 1.00374.13 ATOM 17 CG2 THR D1024 32.163 -49.358 -23.929 1.00361.25 ATOM 18 N MET D1025 31.444 -46.864 -26.167 1.00320.23 ATOM 19 CA MET D1025 30.604 -47.351 -27.282 1.00310.59 ATOM 20 C MET D1025 31.170 -48.716 -27.662 1.00304.66 ATOM 21 O MET D1025 32.271 -48.790 -28.204 1.00298.90 ATOM 22 CB MET D1025 30.667 -46.355 -28.445 1.00306.03 ATOM 23 CG MET D1025 30.216 -46.924 -29.766 1.00301.48 ATOM 24 SD MET D1025 31.416 -46.591 -31.073 1.00297.05 ATOM 25 CE MET D1025 30.654 -47.471 -32.432 1.00296.17 ATOM 26 N PRO D1026 30.509 -49.837 -27.286 1.00304.46 ATOM 27 CA PRO D1026 31.040 -51.171 -27.582 1.00302.52 ATOM 28 C PRO D1026 31.038 -51.512 -29.083 1.00297.28 ATOM 29 O PRO D1026 30.256 -50.964 -29.829 1.00296.25 ATOM 30 CB PRO D1026 30.116 -52.117 -26.791 1.00305.82 ATOM 31 CG PRO D1026 28.825 -51.337 -26.607 1.00307.46 ATOM 32 CD PRO D1026 29.235 -49.880 -26.547 1.00307.12 ATOM 33 N VAL D1027 31.940 -52.392 -29.512 1.00294.91 ATOM 34 CA VAL D1027 31.906 -52.956 -30.889 1.00295.52 ATOM 35 C VAL D1027 31.175 -54.293 -30.797 1.00295.32 ATOM 36 O VAL D1027 31.740 -55.236 -30.208 1.00296.62 ATOM 37 CB VAL D1027 33.320 -53.118 -31.464 1.00298.10 ATOM 38 CG1 VAL D1027 33.284 -53.643 -32.889 1.00300.56 ATOM 39 CG2 VAL D1027 34.118 -51.827 -31.380 1.00296.65 ATOM 40 N ILE D1028 29.941 -54.350 -31.299 1.00293.61 ATOM 41 CA ILE D1028 29.043 -55.525 -31.082 1.00292.58 ATOM 42 C ILE D1028 29.026 -56.367 -32.364 1.00286.49 ATOM 43 O ILE D1028 28.761 -55.828 -33.459 1.00279.50 ATOM 44 CB ILE D1028 27.654 -55.114 -30.530 1.00296.50 ATOM 45 CG1 ILE D1028 27.718 -55.064 -28.999 1.00300.46 ATOM 46 CG2 ILE D1028 26.535 -56.036 -31.010 1.00297.43 ATOM 47 CD1 ILE D1028 26.490 -54.530 -28.314 1.00301.99 ATOM 48 N THR D1029 29.405 -57.635 -32.219 1.00286.92 ATOM 49 CA THR D1029 29.509 -58.580 -33.360 1.00290.49 ATOM 50 C THR D1029 28.157 -59.179 -33.745 1.00296.54 ATOM 51 O THR D1029 27.440 -59.675 -32.868 1.00302.22 ATOM 52 CB THR D1029 30.395 -59.774 -33.009 1.00289.47 ATOM 53 OG1 THR D1029 29.661 -60.596 -32.101 1.00288.84 ATOM 54 CG2 THR D1029 31.707 -59.358 -32.393 1.00289.62 ATOM 55 N GLU D1030 27.884 -59.259 -35.039 1.00300.36 ATOM 56 CA GLU D1030 26.626 -59.889 -35.498 1.00303.33 ATOM 57 C GLU D1030 26.743 -61.416 -35.404 1.00307.71 ATOM 58 O GLU D1030 25.811 -62.046 -34.890 1.00309.75 ATOM 59 CB GLU D1030 26.348 -59.375 -36.903 1.00302.65 ATOM 60 CG GLU D1030 26.216 -57.863 -36.933 1.00297.38 ATOM 61 CD GLU D1030 26.189 -57.226 -38.311 1.00294.06 ATOM 62 OE1 GLU D1030 26.887 -57.731 -39.210 1.00295.02 ATOM 63 OE2 GLU D1030 25.473 -56.220 -38.480 1.00286.97 ATOM 64 N VAL D1031 27.856 -61.990 -35.863 1.00307.94 ATOM 65 CA VAL D1031 27.925 -63.473 -36.020 1.00308.15 ATOM 66 C VAL D1031 28.496 -64.117 -34.755 1.00305.06 ATOM 67 O VAL D1031 29.136 -63.419 -33.955 1.00302.68 ATOM 68 CB VAL D1031 28.758 -63.844 -37.257 1.00312.41 ATOM 69 CG1 VAL D1031 28.025 -63.458 -38.522 1.00313.79 ATOM 70 CG2 VAL D1031 30.126 -63.191 -37.218 1.00311.52 ATOM 71 N SER D1032 28.286 -65.427 -34.617 1.00302.49 ATOM 72 CA SER D1032 28.787 -66.235 -33.475 1.00301.27 ATOM 73 C SER D1032 29.943 -67.140 -33.930 1.00299.94 ATOM 74 O SER D1032 29.915 -67.649 -35.073 1.00297.67 ATOM 75 CB SER D1032 27.666 -67.043 -32.856 1.00302.85 ATOM 76 OG SER D1032 26.383 -66.634 -33.323 1.00304.01 ATOM 77 N GLY D1033 30.939 -67.355 -33.076 1.00301.70 ATOM 78 CA GLY D1033 31.974 -68.348 -33.411 1.00307.81 ATOM 79 C GLY D1033 33.180 -68.247 -32.507 1.00311.54 ATOM 80 O GLY D1033 32.980 -68.279 -31.296 1.00317.25 ATOM 81 N PHE D1034 34.388 -68.217 -33.090 1.00313.28 ATOM 82 CA PHE D1034 35.658 -67.963 -32.354 1.00312.28 ATOM 83 C PHE D1034 36.214 -66.601 -32.792 1.00301.91 ATOM 84 O PHE D1034 35.816 -66.128 -33.864 1.00295.11 ATOM 85 CB PHE D1034 36.634 -69.129 -32.557 1.00322.32 ATOM 86 CG PHE D1034 36.263 -70.349 -31.753 1.00331.53 ATOM 87 CD1 PHE D1034 35.195 -71.151 -32.129 1.00334.32 ATOM 88 CD2 PHE D1034 36.939 -70.660 -30.584 1.00338.11 ATOM 89 CE1 PHE D1034 34.838 -72.257 -31.373 1.00338.99 ATOM 90 CE2 PHE D1034 36.571 -71.757 -29.821 1.00342.48 ATOM 91 CZ PHE D1034 35.526 -72.558 -30.221 1.00342.53 ATOM 92 N VAL D1035 37.094 -65.985 -31.993 1.00299.70 ATOM 93 CA VAL D1035 37.653 -64.628 -32.288 1.00299.71 ATOM 94 C VAL D1035 39.115 -64.738 -32.732 1.00303.24 ATOM 95 O VAL D1035 39.925 -65.351 -32.019 1.00304.11 ATOM 96 CB VAL D1035 37.514 -63.682 -31.085 1.00296.65 ATOM 97 CG1 VAL D1035 38.157 -62.332 -31.361 1.00294.10 ATOM 98 CG2 VAL D1035 36.055 -63.524 -30.705 1.00296.43 ATOM 99 N ARG D1036 39.451 -64.126 -33.866 1.00308.51 ATOM 100 CA ARG D1036 40.811 -64.228 -34.450 1.00313.79 ATOM 101 C ARG D1036 41.463 -62.847 -34.423 1.00314.96 ATOM 102 O ARG D1036 40.794 -61.860 -34.741 1.00314.80 ATOM 103 CB ARG D1036 40.762 -64.800 -35.871 1.00316.66 ATOM 104 CG ARG D1036 42.115 -64.921 -36.560 1.00316.48 ATOM 105 CD ARG D1036 42.093 -65.963 -37.663 1.00317.21 ATOM 106 NE ARG D1036 42.024 -67.308 -37.109 1.00319.46 ATOM 107 CZ ARG D1036 42.009 -68.426 -37.825 1.00323.16 ATOM 108 NH1 ARG D1036 42.062 -68.370 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