HEADER TRANSCRIPTION, TRANSFERASE/DNA/RNA 31-DEC-69 6UU6 TITLE E. coli sigma-S transcription initiation complex with a 4-nt RNA and TITLE 2 a UTP ("Old" crystal soaked with UTP, ddCTP, and dinucleotide ApG for TITLE 3 30 minutes) COMPND MOL_ID: 3; COMPND 2 MOLECULE: DNA-directed RNA polymerase subunit beta'; COMPND 3 CHAIN: DDD; COMPND 4 EC: 2.7.7.6; COMPND 5 ENGINEERED: YES; EXPDTA X-RAY DIFFRACTION REMARK 2 RESOLUTION. 4.20 ANGSTORMS DBREF 6UU6 D 1 1407 UNP P0A8T7 RPOC_ECOLI 1 1407 SEQRES 1 DDD 84 LYS ASP ILE THR GLY GLY LEU PRO ARG VAL ALA ASP LEU SEQRES 2 DDD 84 PHE GLU ALA ARG ARG PRO LYS GLU PRO ALA ILE LEU ALA SEQRES 3 DDD 84 GLU ILE SER GLY ILE VAL SER PHE GLY LYS GLU THR LYS SEQRES 4 DDD 84 GLY LYS ARG ARG LEU VAL ILE THR PRO VAL ASP GLY SER SEQRES 5 DDD 84 ASP PRO TYR GLU GLU MET ILE PRO LYS TRP ARG GLN LEU SEQRES 6 DDD 84 ASN VAL PHE GLU GLY GLU ARG VAL GLU ARG GLY ASP VAL SEQRES 7 DDD 84 ILE SER ASP GLY PRO GLU ATOM 1 N LYS D1132 29.927 -27.432 -21.388 1.00305.92 ATOM 2 CA LYS D1132 28.658 -27.223 -22.136 1.00289.07 ATOM 3 C LYS D1132 28.481 -25.734 -22.452 1.00269.17 ATOM 4 O LYS D1132 27.367 -25.217 -22.240 1.00262.01 ATOM 5 CB LYS D1132 27.474 -27.741 -21.314 1.00293.25 ATOM 6 CG LYS D1132 26.170 -27.890 -22.084 1.00289.67 ATOM 7 CD LYS D1132 24.954 -27.942 -21.191 1.00287.95 ATOM 8 CE LYS D1132 23.678 -28.216 -21.956 1.00284.53 ATOM 9 NZ LYS D1132 22.599 -28.678 -21.053 1.00289.12 ATOM 10 N ASP D1133 29.527 -25.063 -22.940 1.00253.34 ATOM 11 CA ASP D1133 29.447 -23.610 -23.235 1.00239.24 ATOM 12 C ASP D1133 29.603 -23.321 -24.728 1.00223.15 ATOM 13 O ASP D1133 29.885 -24.251 -25.513 1.00226.97 ATOM 14 CB ASP D1133 30.498 -22.792 -22.489 1.00243.45 ATOM 15 CG ASP D1133 30.280 -21.306 -22.700 1.00244.62 ATOM 16 OD1 ASP D1133 29.660 -20.681 -21.821 1.00253.34 ATOM 17 OD2 ASP D1133 30.689 -20.796 -23.765 1.00241.34 ATOM 18 N ILE D1134 29.447 -22.037 -25.058 1.00207.18 ATOM 19 CA ILE D1134 29.541 -21.477 -26.435 1.00201.66 ATOM 20 C ILE D1134 31.000 -21.536 -26.912 1.00207.95 ATOM 21 O ILE D1134 31.208 -21.504 -28.139 1.00215.98 ATOM 22 CB ILE D1134 28.957 -20.049 -26.438 1.00188.22 ATOM 23 CG1 ILE D1134 27.432 -20.073 -26.317 1.00185.13 ATOM 24 CG2 ILE D1134 29.399 -19.269 -27.664 1.00183.81 ATOM 25 CD1 ILE D1134 26.721 -20.258 -27.638 1.00183.89 ATOM 26 N THR D1135 31.969 -21.625 -25.989 1.00211.85 ATOM 27 CA THR D1135 33.406 -21.785 -26.360 1.00215.75 ATOM 28 C THR D1135 33.565 -22.957 -27.332 1.00224.94 ATOM 29 O THR D1135 34.293 -22.805 -28.329 1.00226.62 ATOM 30 CB THR D1135 34.296 -22.000 -25.129 1.00213.48 ATOM 31 OG1 THR D1135 34.481 -20.730 -24.509 1.00215.06 ATOM 32 CG2 THR D1135 35.652 -22.588 -25.457 1.00212.70 ATOM 33 N GLY D1136 32.907 -24.082 -27.049 1.00237.53 ATOM 34 CA GLY D1136 33.013 -25.299 -27.876 1.00245.40 ATOM 35 C GLY D1136 31.983 -25.291 -28.988 1.00251.37 ATOM 36 O GLY D1136 32.218 -25.939 -30.037 1.00255.27 ATOM 37 N GLY D1137 30.884 -24.570 -28.757 1.00253.99 ATOM 38 CA GLY D1137 29.707 -24.542 -29.640 1.00247.33 ATOM 39 C GLY D1137 29.972 -23.692 -30.866 1.00241.85 ATOM 40 O GLY D1137 29.706 -24.174 -31.967 1.00242.28 ATOM 41 N LEU D1138 30.562 -22.508 -30.676 1.00231.12 ATOM 42 CA LEU D1138 30.714 -21.505 -31.765 1.00216.45 ATOM 43 C LEU D1138 31.599 -22.052 -32.880 1.00205.22 ATOM 44 O LEU D1138 31.305 -21.830 -34.051 1.00194.16 ATOM 45 CB LEU D1138 31.295 -20.204 -31.207 1.00216.47 ATOM 46 CG LEU D1138 30.279 -19.139 -30.797 1.00219.10 ATOM 47 CD1 LEU D1138 30.996 -17.940 -30.200 1.00221.38 ATOM 48 CD2 LEU D1138 29.408 -18.705 -31.967 1.00219.20 ATOM 49 N PRO D1139 32.736 -22.726 -32.596 1.00205.33 ATOM 50 CA PRO D1139 33.500 -23.334 -33.679 1.00208.00 ATOM 51 C PRO D1139 32.673 -24.292 -34.537 1.00207.41 ATOM 52 O PRO D1139 32.915 -24.353 -35.725 1.00198.63 ATOM 53 CB PRO D1139 34.593 -24.115 -32.958 1.00212.27 ATOM 54 CG PRO D1139 34.820 -23.300 -31.716 1.00212.21 ATOM 55 CD PRO D1139 33.437 -22.829 -31.304 1.00209.29 ATOM 56 N ARG D1140 31.712 -24.994 -33.940 1.00218.76 ATOM 57 CA ARG D1140 30.839 -25.910 -34.715 1.00226.42 ATOM 58 C ARG D1140 30.037 -25.081 -35.711 1.00217.49 ATOM 59 O ARG D1140 29.933 -25.478 -36.881 1.00219.70 ATOM 60 CB ARG D1140 29.870 -26.663 -33.807 1.00242.31 ATOM 61 CG ARG D1140 30.526 -27.777 -33.009 1.00256.51 ATOM 62 CD ARG D1140 29.530 -28.597 -32.210 1.00273.90 ATOM 63 NE ARG D1140 29.897 -30.007 -32.129 1.00292.12 ATOM 64 CZ ARG D1140 29.046 -30.998 -31.877 1.00309.91 ATOM 65 NH1 ARG D1140 27.763 -30.741 -31.682 1.00317.81 ATOM 66 NH2 ARG D1140 29.478 -32.246 -31.826 1.00319.23 ATOM 67 N VAL D1141 29.490 -23.977 -35.208 1.00207.03 ATOM 68 CA VAL D1141 28.643 -23.019 -35.961 1.00200.46 ATOM 69 C VAL D1141 29.503 -22.460 -37.091 1.00190.40 ATOM 70 O VAL D1141 29.051 -22.457 -38.239 1.00180.65 ATOM 71 CB VAL D1141 28.130 -21.904 -35.034 1.00202.11 ATOM 72 CG1 VAL D1141 27.531 -20.765 -35.828 1.00206.03 ATOM 73 CG2 VAL D1141 27.125 -22.408 -34.010 1.00201.52 ATOM 74 N ALA D1142 30.738 -22.078 -36.779 1.00188.49 ATOM 75 CA ALA D1142 31.593 -21.396 -37.771 1.00188.90 ATOM 76 C ALA D1142 32.025 -22.423 -38.820 1.00186.10 ATOM 77 O ALA D1142 32.131 -22.060 -40.006 1.00174.21 ATOM 78 CB ALA D1142 32.760 -20.734 -37.080 1.00194.58 ATOM 79 N ASP D1143 32.183 -23.679 -38.405 1.00194.11 ATOM 80 CA ASP D1143 32.541 -24.740 -39.375 1.00204.88 ATOM 81 C ASP D1143 31.370 -24.940 -40.326 1.00206.84 ATOM 82 O ASP D1143 31.615 -25.239 -41.476 1.00205.04 ATOM 83 CB ASP D1143 32.820 -26.072 -38.686 1.00211.70 ATOM 84 CG ASP D1143 34.167 -26.122 -37.992 1.00213.43 ATOM 85 OD1 ASP D1143 34.661 -25.046 -37.602 1.00211.41 ATOM 86 OD2 ASP D1143 34.726 -27.231 -37.877 1.00218.09 ATOM 87 N LEU D1144 30.154 -24.893 -39.792 1.00212.18 ATOM 88 CA LEU D1144 28.952 -25.088 -40.638 1.00214.07 ATOM 89 C LEU D1144 28.846 -23.936 -41.643 1.00203.51 ATOM 90 O LEU D1144 28.737 -24.218 -42.847 1.00204.85 ATOM 91 CB LEU D1144 27.731 -25.199 -39.720 1.00223.73 ATOM 92 CG LEU D1144 27.544 -26.603 -39.139 1.00229.00 ATOM 93 CD1 LEU 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