HEADER TRANSCRIPTION, TRANSFERASE/RNA 31-DEC-69 6UU7 TITLE E. coli sigma-S transcription initiation complex with a 6-nt RNA and TITLE 2 an NTP ("Old" crystal soaked with UTP, CTP, ddGTP, and dinucleotide TITLE 3 ApG for 30 minutes) COMPND MOL_ID: 3; COMPND 2 MOLECULE: DNA-directed RNA polymerase subunit beta'; COMPND 3 CHAIN: DDD; COMPND 4 EC: 2.7.7.6; COMPND 5 ENGINEERED: YES; EXPDTA X-RAY DIFFRACTION REMARK 2 RESOLUTION. 4.40 ANGSTORMS DBREF 6UU7 D 1 1407 UNP P0A8T7 RPOC_ECOLI 1 1407 SEQRES 1 CCC 78 GLY VAL THR ALA VAL ALA LYS ARG GLY GLY VAL VAL GLN SEQRES 2 CCC 78 TYR VAL ASP ALA SER ARG ILE VAL ILE LYS VAL ASN GLU SEQRES 3 CCC 78 ASP GLU MET TYR PRO GLY GLU ALA GLY ILE ASP ILE TYR SEQRES 4 CCC 78 ASN LEU THR LYS TYR THR ARG SER ASN GLN ASN THR CYS SEQRES 5 CCC 78 ILE ASN GLN MET PRO CYS VAL SER LEU GLY GLU PRO VAL SEQRES 6 CCC 78 GLU ARG GLY ASP VAL LEU ALA ASP GLY PRO SER THR ASP ATOM 1 N LYS D1132 29.871 -27.244 -21.427 1.00338.43 ATOM 2 CA LYS D1132 28.625 -26.989 -22.200 1.00328.46 ATOM 3 C LYS D1132 28.634 -25.576 -22.800 1.00317.37 ATOM 4 O LYS D1132 27.537 -25.042 -23.034 1.00318.89 ATOM 5 CB LYS D1132 27.415 -27.170 -21.275 1.00329.83 ATOM 6 CG LYS D1132 26.075 -27.393 -21.968 1.00326.74 ATOM 7 CD LYS D1132 24.955 -27.757 -21.012 1.00324.46 ATOM 8 CE LYS D1132 23.660 -28.112 -21.713 1.00317.89 ATOM 9 NZ LYS D1132 22.641 -28.592 -20.751 1.00317.93 ATOM 10 N ASP D1133 29.802 -24.985 -23.066 1.00308.62 ATOM 11 CA ASP D1133 29.763 -23.536 -23.397 1.00297.38 ATOM 12 C ASP D1133 29.897 -23.275 -24.902 1.00285.30 ATOM 13 O ASP D1133 30.155 -24.218 -25.687 1.00284.64 ATOM 14 CB ASP D1133 30.826 -22.728 -22.656 1.00302.75 ATOM 15 CG ASP D1133 30.609 -21.240 -22.856 1.00302.68 ATOM 16 OD1 ASP D1133 30.012 -20.619 -21.962 1.00301.88 ATOM 17 OD2 ASP D1133 30.995 -20.730 -23.928 1.00309.44 ATOM 18 N ILE D1134 29.720 -21.997 -25.247 1.00273.43 ATOM 19 CA ILE D1134 29.815 -21.432 -26.623 1.00267.87 ATOM 20 C ILE D1134 31.267 -21.527 -27.123 1.00277.79 ATOM 21 O ILE D1134 31.448 -21.498 -28.354 1.00280.57 ATOM 22 CB ILE D1134 29.268 -19.988 -26.598 1.00253.89 ATOM 23 CG1 ILE D1134 27.744 -19.981 -26.481 1.00247.61 ATOM 24 CG2 ILE D1134 29.725 -19.182 -27.800 1.00250.13 ATOM 25 CD1 ILE D1134 27.045 -20.144 -27.805 1.00246.11 ATOM 26 N THR D1135 32.250 -21.642 -26.213 1.00287.20 ATOM 27 CA THR D1135 33.691 -21.840 -26.565 1.00288.16 ATOM 28 C THR D1135 33.842 -23.014 -27.541 1.00289.78 ATOM 29 O THR D1135 34.593 -22.877 -28.527 1.00288.15 ATOM 30 CB THR D1135 34.552 -22.093 -25.318 1.00294.35 ATOM 31 OG1 THR D1135 34.755 -20.845 -24.657 1.00297.06 ATOM 32 CG2 THR D1135 35.900 -22.712 -25.625 1.00296.21 ATOM 33 N GLY D1136 33.156 -24.125 -27.264 1.00288.68 ATOM 34 CA GLY D1136 33.231 -25.330 -28.111 1.00285.70 ATOM 35 C GLY D1136 32.209 -25.264 -29.230 1.00278.07 ATOM 36 O GLY D1136 32.442 -25.883 -30.294 1.00277.91 ATOM 37 N GLY D1137 31.122 -24.525 -28.985 1.00268.22 ATOM 38 CA GLY D1137 29.939 -24.475 -29.862 1.00260.15 ATOM 39 C GLY D1137 30.196 -23.624 -31.089 1.00251.90 ATOM 40 O GLY D1137 29.937 -24.109 -32.200 1.00249.34 ATOM 41 N LEU D1138 30.755 -22.427 -30.891 1.00247.20 ATOM 42 CA LEU D1138 30.911 -21.430 -31.987 1.00244.28 ATOM 43 C LEU D1138 31.810 -21.973 -33.094 1.00246.87 ATOM 44 O LEU D1138 31.520 -21.754 -34.268 1.00240.52 ATOM 45 CB LEU D1138 31.475 -20.118 -31.430 1.00242.99 ATOM 46 CG LEU D1138 30.454 -19.054 -31.025 1.00240.04 ATOM 47 CD1 LEU D1138 31.157 -17.812 -30.500 1.00240.25 ATOM 48 CD2 LEU D1138 29.537 -18.678 -32.178 1.00237.63 ATOM 49 N PRO D1139 32.955 -22.635 -32.809 1.00256.48 ATOM 50 CA PRO D1139 33.727 -23.242 -33.890 1.00259.27 ATOM 51 C PRO D1139 32.905 -24.208 -34.747 1.00258.16 ATOM 52 O PRO D1139 33.145 -24.273 -35.936 1.00256.28 ATOM 53 CB PRO D1139 34.829 -24.009 -33.160 1.00266.44 ATOM 54 CG PRO D1139 35.040 -23.197 -31.909 1.00265.68 ATOM 55 CD PRO D1139 33.652 -22.727 -31.512 1.00261.67 ATOM 56 N ARG D1140 31.954 -24.917 -34.139 1.00258.00 ATOM 57 CA ARG D1140 31.094 -25.847 -34.912 1.00259.21 ATOM 58 C ARG D1140 30.276 -25.028 -35.902 1.00247.17 ATOM 59 O ARG D1140 30.165 -25.433 -37.065 1.00243.93 ATOM 60 CB ARG D1140 30.130 -26.605 -33.999 1.00268.44 ATOM 61 CG ARG D1140 30.788 -27.705 -33.182 1.00281.41 ATOM 62 CD ARG D1140 29.774 -28.482 -32.361 1.00290.81 ATOM 63 NE ARG D1140 30.163 -29.873 -32.155 1.00303.09 ATOM 64 CZ ARG D1140 29.333 -30.850 -31.795 1.00310.50 ATOM 65 NH1 ARG D1140 28.048 -30.600 -31.599 1.00309.61 ATOM 66 NH2 ARG D1140 29.791 -32.080 -31.639 1.00317.87 ATOM 67 N VAL D1141 29.729 -23.923 -35.405 1.00241.06 ATOM 68 CA VAL D1141 28.873 -22.982 -36.170 1.00238.71 ATOM 69 C VAL D1141 29.720 -22.432 -37.315 1.00234.33 ATOM 70 O VAL D1141 29.257 -22.457 -38.460 1.00231.81 ATOM 71 CB VAL D1141 28.351 -21.859 -35.256 1.00239.65 ATOM 72 CG1 VAL D1141 27.758 -20.718 -36.060 1.00239.09 ATOM 73 CG2 VAL D1141 27.339 -22.368 -34.237 1.00242.09 ATOM 74 N ALA D1142 30.952 -22.028 -37.010 1.00233.58 ATOM 75 CA ALA D1142 31.802 -21.358 -38.016 1.00234.78 ATOM 76 C ALA D1142 32.223 -22.398 -39.058 1.00240.13 ATOM 77 O ALA D1142 32.312 -22.053 -40.256 1.00241.72 ATOM 78 CB ALA D1142 32.976 -20.693 -37.335 1.00234.23 ATOM 79 N ASP D1143 32.395 -23.647 -38.624 1.00244.92 ATOM 80 CA ASP D1143 32.753 -24.724 -39.578 1.00250.72 ATOM 81 C ASP D1143 31.585 -24.956 -40.524 1.00249.44 ATOM 82 O ASP D1143 31.837 -25.299 -41.664 1.00253.48 ATOM 83 CB ASP D1143 33.046 -26.040 -38.867 1.00257.20 ATOM 84 CG ASP D1143 34.399 -26.061 -38.184 1.00261.76 ATOM 85 OD1 ASP D1143 34.882 -24.970 -37.813 1.00259.55 ATOM 86 OD2 ASP D1143 34.976 -27.160 -38.071 1.00269.49 ATOM 87 N LEU D1144 30.368 -24.898 -39.990 1.00245.36 ATOM 88 CA LEU D1144 29.162 -25.123 -40.822 1.00243.75 ATOM 89 C LEU D1144 29.024 -23.983 -41.837 1.00236.81 ATOM 90 O LEU D1144 28.896 -24.283 -43.034 1.00237.82 ATOM 91 CB LEU D1144 27.953 -25.248 -39.891 1.00244.06 ATOM 92 CG LEU D1144 27.791 -26.644 -39.282 1.00248.52 ATOM 93 CD1 LEU D1144 27.028 -26.616 -37.958 1.00248.15 ATOM 94 CD2 LEU D1144 27.121 -27.583 -40.276 1.00250.70 ATOM 95 N PHE D1145 29.088 -22.732 -41.381 1.00229.43 ATOM 96 CA PHE D1145 28.884 -21.569 -42.280 1.00228.12 ATOM 97 C PHE D1145 30.011 -21.487 -43.304 1.00232.36 ATOM 98 O PHE D1145 29.812 -20.895 -44.386 1.00229.47 ATOM 99 CB PHE D1145 28.827 -20.288 -41.455 1.00222.43 ATOM 100 CG PHE D1145 27.453 -19.995 -40.926 1.00221.42 ATOM 101 CD1 PHE D1145 26.389 -19.804 -41.793 1.00221.30 ATOM 102 CD2 PHE D1145 27.222 -19.931 -39.564 1.00221.78 ATOM 103 CE1 PHE D1145 25.117 -19.554 -41.304 1.00220.14 ATOM 104 CE2 PHE D1145 25.950 -19.670 -39.079 1.00220.15 ATOM 105 CZ PHE D1145 24.901 -19.485 -39.948 1.00219.35 ATOM 106 N GLU D1146 31.169 -22.055 -42.963 1.00242.57 ATOM 107 CA GLU D1146 32.320 -21.971 -43.898 1.00250.99 ATOM 108 C GLU D1146 32.370 -23.219 -44.778 1.00262.36 ATOM 109 O GLU D1146 33.284 -23.295 -45.623 1.00268.19 ATOM 110 CB GLU D1146 33.644 -21.776 -43.166 1.00250.98 ATOM 111 CG GLU D1146 33.829 -20.348 -42.677 1.00245.25 ATOM 112 CD GLU D1146 34.324 -19.312 -43.683 1.00243.17 ATOM 113 OE1 GLU D1146 35.183 -19.657 -44.525 1.00244.56 ATOM 114 OE2 GLU D1146 33.874 -18.141 -43.610 1.00237.77 ATOM 115 N ALA D1147 31.392 -24.114 -44.620 1.00266.43 ATOM 116 CA ALA D1147 31.206 -25.230 -45.573 1.00270.30 ATOM 117 C ALA D1147 32.490 -26.051 -45.595 1.00273.29 ATOM 118 O ALA D1147 33.140 -26.166 -46.643 1.00275.57 ATOM 119 CB ALA D1147 30.874 -24.696 -46.940 1.00272.20 ATOM 120 N ARG D1148 32.866 -26.553 -44.433 1.00270.15 ATOM 121 CA ARG D1148 34.078 -27.387 -44.336 1.00272.93 ATOM 122 C ARG D1148 33.689 -28.859 -44.394 1.00274.52 ATOM 123 O ARG D1148 32.805 -29.308 -43.626 1.00271.25 ATOM 124 CB ARG D1148 34.847 -27.063 -43.062 1.00272.50 ATOM 125 CG ARG D1148 35.272 -25.608 -42.976 1.00269.81 ATOM 126 CD ARG D1148 36.042 -25.359 -41.701 1.00271.26 ATOM 127 NE ARG D1148 36.676 -24.053 -41.778 1.00269.73 ATOM 128 CZ ARG D1148 36.560 -23.079 -40.878 1.00266.39 ATOM 129 NH1 ARG D1148 35.850 -23.247 -39.775 1.00263.56 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