HEADER TRANSCRIPTION, TRANSFERASE/DNA 31-DEC-69 6UUB TITLE E. coli sigma-S transcription initiation complex with a mismatching TITLE 2 UTP ("Fresh" crystal soaked with UTP for 2 hours) COMPND MOL_ID: 3; COMPND 2 MOLECULE: DNA-directed RNA polymerase subunit beta'; COMPND 3 CHAIN: DDD; COMPND 4 EC: 2.7.7.6; COMPND 5 ENGINEERED: YES; EXPDTA X-RAY DIFFRACTION REMARK 2 RESOLUTION. 3.96 ANGSTORMS DBREF 6UUB D 1 1407 UNP P0A8T7 RPOC_ECOLI 1 1407 SEQRES 1 DDD 84 LYS ASP ILE THR GLY GLY LEU PRO ARG VAL ALA ASP LEU SEQRES 2 DDD 84 PHE GLU ALA ARG ARG PRO LYS GLU PRO ALA ILE LEU ALA SEQRES 3 DDD 84 GLU ILE SER GLY ILE VAL SER PHE GLY LYS GLU THR LYS SEQRES 4 DDD 84 GLY LYS ARG ARG LEU VAL ILE THR PRO VAL ASP GLY SER SEQRES 5 DDD 84 ASP PRO TYR GLU GLU MET ILE PRO LYS TRP ARG GLN LEU SEQRES 6 DDD 84 ASN VAL PHE GLU GLY GLU ARG VAL GLU ARG GLY ASP VAL SEQRES 7 DDD 84 ILE SER ASP GLY PRO GLU ATOM 1 N LYS D1132 30.479 -27.774 -23.212 1.00332.85 ATOM 2 CA LYS D1132 30.648 -27.134 -24.546 1.00323.18 ATOM 3 C LYS D1132 30.360 -25.633 -24.424 1.00326.08 ATOM 4 O LYS D1132 31.170 -24.848 -24.953 1.00331.05 ATOM 5 CB LYS D1132 29.751 -27.791 -25.604 1.00315.88 ATOM 6 CG LYS D1132 30.355 -28.997 -26.315 1.00315.13 ATOM 7 CD LYS D1132 30.061 -30.318 -25.636 1.00318.25 ATOM 8 CE LYS D1132 31.114 -31.375 -25.895 1.00316.15 ATOM 9 NZ LYS D1132 30.893 -32.586 -25.069 1.00318.44 ATOM 10 N ASP D1133 29.266 -25.263 -23.742 1.00322.82 ATOM 11 CA ASP D1133 28.876 -23.839 -23.541 1.00312.16 ATOM 12 C ASP D1133 28.811 -23.151 -24.908 1.00292.59 ATOM 13 O ASP D1133 28.085 -23.657 -25.780 1.00315.69 ATOM 14 CB ASP D1133 29.853 -23.138 -22.592 1.00321.52 ATOM 15 CG ASP D1133 29.313 -21.874 -21.946 1.00330.88 ATOM 16 OD1 ASP D1133 28.246 -21.391 -22.383 1.00325.17 ATOM 17 OD2 ASP D1133 29.970 -21.379 -21.009 1.00359.11 ATOM 18 N ILE D1134 29.552 -22.053 -25.083 1.00260.87 ATOM 19 CA ILE D1134 29.621 -21.341 -26.392 1.00254.61 ATOM 20 C ILE D1134 31.079 -21.379 -26.864 1.00247.24 ATOM 21 O ILE D1134 31.299 -21.303 -28.093 1.00253.31 ATOM 22 CB ILE D1134 29.068 -19.906 -26.259 1.00246.82 ATOM 23 CG1 ILE D1134 27.570 -19.909 -25.952 1.00246.51 ATOM 24 CG2 ILE D1134 29.369 -19.080 -27.497 1.00242.86 ATOM 25 CD1 ILE D1134 26.681 -19.850 -27.177 1.00246.20 ATOM 26 N THR D1135 32.019 -21.518 -25.916 1.00236.58 ATOM 27 CA THR D1135 33.475 -21.506 -26.229 1.00244.73 ATOM 28 C THR D1135 33.773 -22.596 -27.262 1.00267.65 ATOM 29 O THR D1135 34.374 -22.268 -28.311 1.00258.54 ATOM 30 CB THR D1135 34.333 -21.687 -24.966 1.00232.50 ATOM 31 OG1 THR D1135 34.260 -20.510 -24.160 1.00232.34 ATOM 32 CG2 THR D1135 35.790 -21.957 -25.277 1.00228.89 ATOM 33 N GLY D1136 33.339 -23.832 -26.972 1.00303.53 ATOM 34 CA GLY D1136 33.644 -25.021 -27.795 1.00310.20 ATOM 35 C GLY D1136 32.491 -25.413 -28.708 1.00313.31 ATOM 36 O GLY D1136 32.414 -26.613 -29.075 1.00299.06 ATOM 37 N GLY D1137 31.643 -24.438 -29.074 1.00304.92 ATOM 38 CA GLY D1137 30.459 -24.644 -29.935 1.00286.99 ATOM 39 C GLY D1137 30.392 -23.612 -31.049 1.00273.90 ATOM 40 O GLY D1137 29.846 -23.937 -32.119 1.00264.84 ATOM 41 N LEU D1138 30.974 -22.425 -30.835 1.00269.93 ATOM 42 CA LEU D1138 31.026 -21.404 -31.919 1.00259.73 ATOM 43 C LEU D1138 31.933 -21.878 -33.050 1.00243.74 ATOM 44 O LEU D1138 31.613 -21.671 -34.217 1.00241.10 ATOM 45 CB LEU D1138 31.519 -20.063 -31.366 1.00268.97 ATOM 46 CG LEU D1138 30.445 -19.125 -30.818 1.00282.03 ATOM 47 CD1 LEU D1138 30.795 -17.684 -31.147 1.00295.16 ATOM 48 CD2 LEU D1138 29.058 -19.464 -31.352 1.00276.30 ATOM 49 N PRO D1139 33.113 -22.475 -32.770 1.00228.25 ATOM 50 CA PRO D1139 33.987 -22.942 -33.851 1.00224.42 ATOM 51 C PRO D1139 33.262 -23.850 -34.860 1.00218.06 ATOM 52 O PRO D1139 33.444 -23.702 -36.069 1.00195.67 ATOM 53 CB PRO D1139 35.094 -23.680 -33.081 1.00221.91 ATOM 54 CG PRO D1139 35.163 -22.947 -31.758 1.00220.56 ATOM 55 CD PRO D1139 33.715 -22.643 -31.436 1.00224.28 ATOM 56 N ARG D1140 32.434 -24.756 -34.342 1.00237.11 ATOM 57 CA ARG D1140 31.644 -25.713 -35.160 1.00253.45 ATOM 58 C ARG D1140 30.689 -24.918 -36.053 1.00253.34 ATOM 59 O ARG D1140 30.428 -25.349 -37.186 1.00275.89 ATOM 60 CB ARG D1140 30.899 -26.684 -34.237 1.00263.27 ATOM 61 CG ARG D1140 29.668 -27.339 -34.846 1.00263.58 ATOM 62 CD ARG D1140 29.926 -28.693 -35.492 1.00264.10 ATOM 63 NE ARG D1140 28.750 -29.554 -35.400 1.00267.50 ATOM 64 CZ ARG D1140 27.551 -29.252 -35.893 1.00264.23 ATOM 65 NH1 ARG D1140 27.369 -28.101 -36.518 1.00264.57 ATOM 66 NH2 ARG D1140 26.543 -30.097 -35.754 1.00257.73 ATOM 67 N VAL D1141 30.181 -23.801 -35.552 1.00231.57 ATOM 68 CA VAL D1141 29.260 -22.970 -36.370 1.00225.04 ATOM 69 C VAL D1141 30.085 -22.376 -37.510 1.00209.20 ATOM 70 O VAL D1141 29.654 -22.398 -38.679 1.00197.19 ATOM 71 CB VAL D1141 28.628 -21.891 -35.480 1.00227.92 ATOM 72 CG1 VAL D1141 27.920 -20.833 -36.302 1.00227.57 ATOM 73 CG2 VAL D1141 27.697 -22.518 -34.454 1.00237.96 ATOM 74 N ALA D1142 31.267 -21.899 -37.154 1.00207.18 ATOM 75 CA ALA D1142 32.083 -21.172 -38.139 1.00219.87 ATOM 76 C ALA D1142 32.399 -22.151 -39.256 1.00216.42 ATOM 77 O ALA D1142 32.199 -21.808 -40.416 1.00203.41 ATOM 78 CB ALA D1142 33.336 -20.652 -37.489 1.00229.96 ATOM 79 N ASP D1143 32.850 -23.338 -38.866 1.00224.68 ATOM 80 CA ASP D1143 33.340 -24.336 -39.842 1.00243.51 ATOM 81 C ASP D1143 32.195 -24.667 -40.799 1.00267.24 ATOM 82 O ASP D1143 32.456 -24.855 -42.001 1.00286.01 ATOM 83 CB ASP D1143 33.886 -25.557 -39.105 1.00247.22 ATOM 84 CG ASP D1143 35.238 -25.294 -38.465 1.00241.19 ATOM 85 OD1 ASP D1143 35.639 -24.112 -38.401 1.00214.47 ATOM 86 OD2 ASP D1143 35.887 -26.271 -38.047 1.00256.05 ATOM 87 N LEU D1144 30.971 -24.726 -40.271 1.00277.65 ATOM 88 CA LEU D1144 29.788 -25.014 -41.121 1.00279.27 ATOM 89 C LEU D1144 29.644 -23.891 -42.142 1.00274.13 ATOM 90 O LEU D1144 29.515 -24.192 -43.344 1.00271.14 ATOM 91 CB LEU D1144 28.518 -25.069 -40.269 1.00288.47 ATOM 92 CG LEU D1144 28.151 -26.415 -39.646 1.00293.92 ATOM 93 CD1 LEU D1144 27.033 -26.217 -38.635 1.00296.30 ATOM 94 CD2 LEU D1144 27.740 -27.428 -40.709 1.00296.44 ATOM 95 N PHE D1145 29.635 -22.653 -41.646 1.00252.38 ATOM 96 CA PHE D1145 29.417 -21.491 -42.540 1.00246.58 ATOM 97 C PHE D1145 30.567 -21.433 -43.546 1.00258.49 ATOM 98 O PHE D1145 30.353 -21.219 -44.767 1.00263.66 ATOM 99 CB PHE D1145 29.312 -20.215 -41.708 1.00222.45 ATOM 100 CG PHE D1145 27.935 -19.968 -41.155 1.00215.01 ATOM 101 CD1 PHE D1145 26.865 -19.695 -41.994 1.00218.84 ATOM 102 CD2 PHE D1145 27.707 -20.014 -39.794 1.00202.14 ATOM 103 CE1 PHE D1145 25.594 -19.480 -41.480 1.00212.52 ATOM 104 CE2 PHE D1145 26.441 -19.782 -39.282 1.00202.39 ATOM 105 CZ PHE D1145 25.387 -19.511 -40.124 1.00204.59 ATOM 106 N GLU D1146 31.771 -21.688 -43.037 1.00268.64 ATOM 107 CA GLU D1146 32.979 -21.533 -43.886 1.00278.86 ATOM 108 C GLU D1146 33.085 -22.729 -44.830 1.00298.36 ATOM 109 O GLU D1146 33.982 -22.717 -45.695 1.00322.58 ATOM 110 CB GLU D1146 34.233 -21.427 -43.027 1.00272.51 ATOM 111 CG GLU D1146 34.292 -20.158 -42.220 1.00265.61 ATOM 112 CD GLU D1146 34.674 -18.923 -43.010 1.00260.90 ATOM 113 OE1 GLU D1146 35.388 -19.055 -44.024 1.00251.29 ATOM 114 OE2 GLU D1146 34.277 -17.838 -42.579 1.00265.17 ATOM 115 N ALA D1147 32.210 -23.721 -44.647 1.00293.42 ATOM 116 CA ALA D1147 32.154 -24.896 -45.539 1.00294.68 ATOM 117 C ALA D1147 33.545 -25.536 -45.590 1.00294.87 ATOM 118 O ALA D1147 34.183 -25.527 -46.656 1.00308.55 ATOM 119 CB ALA D1147 31.655 -24.457 -46.891 1.00300.07 ATOM 120 N ARG D1148 34.016 -26.023 -44.443 1.00282.80 ATOM 121 CA ARG D1148 35.292 -26.776 -44.396 1.00285.35 ATOM 122 C ARG D1148 34.966 -28.249 -44.201 1.00289.48 ATOM 123 O ARG D1148 34.443 -28.607 -43.125 1.00270.65 ATOM 124 CB ARG D1148 36.177 -26.300 -43.250 1.00284.42 ATOM 125 CG ARG D1148 36.581 -24.841 -43.348 1.00293.62 ATOM 126 CD ARG D1148 37.027 -24.325 -41.997 1.00307.97 ATOM 127 NE ARG D1148 37.371 -22.917 -42.085 1.00323.46 ATOM 128 CZ ARG D1148 37.753 -22.167 -41.059 1.00336.76 ATOM 129 NH1 ARG D1148 37.845 -22.701 -39.853 1.00337.28 ATOM 130 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