HEADER TRANSCRIPTION/DNA 31-DEC-69 6WRG TITLE Escherichia coli RNA polymerase and rrnBP1 promoter pre-open complex TITLE 2 with DksA/ppGpp COMPND MOL_ID: 3; COMPND 2 MOLECULE: DNA-directed RNA polymerase subunit beta'; COMPND 3 CHAIN: D; COMPND 4 EC: 2.7.7.6; COMPND 5 ENGINEERED: YES; EXPDTA ELECTRON MICROSCOPY DBREF 6WRG D 1 1407 UNP P0A8T7 RPOC_ECOLI 1 1407 SEQRES 1 D 85 THR LYS ASP ILE THR GLY GLY LEU PRO ARG VAL ALA ASP SEQRES 2 D 85 LEU PHE GLU ALA ARG ARG PRO LYS GLU PRO ALA ILE LEU SEQRES 3 D 85 ALA GLU ILE SER GLY ILE VAL SER PHE GLY LYS GLU THR SEQRES 4 D 85 LYS GLY LYS ARG ARG LEU VAL ILE THR PRO VAL ASP GLY SEQRES 5 D 85 SER ASP PRO TYR GLU GLU MET ILE PRO LYS TRP ARG GLN SEQRES 6 D 85 LEU ASN VAL PHE GLU GLY GLU ARG VAL GLU ARG GLY ASP SEQRES 7 D 85 VAL ILE SER ASP GLY PRO GLU ATOM 1 N THR D1131 188.105 148.995 215.501 1.00120.17 ATOM 2 CA THR D1131 188.365 150.402 215.781 1.00120.17 ATOM 3 C THR D1131 187.920 151.290 214.627 1.00120.17 ATOM 4 O THR D1131 188.084 150.939 213.457 1.00120.17 ATOM 5 CB THR D1131 189.849 150.628 216.061 1.00120.17 ATOM 6 OG1 THR D1131 190.623 149.870 215.126 1.00120.17 ATOM 7 CG2 THR D1131 190.192 150.185 217.471 1.00120.17 ATOM 8 N LYS D1132 187.352 152.442 214.978 1.00111.95 ATOM 9 CA LYS D1132 186.745 153.392 214.045 1.00111.95 ATOM 10 C LYS D1132 187.636 154.626 213.891 1.00111.95 ATOM 11 O LYS D1132 187.373 155.673 214.479 1.00111.95 ATOM 12 CB LYS D1132 185.350 153.765 214.529 1.00111.95 ATOM 13 CG LYS D1132 184.692 154.884 213.748 1.00111.95 ATOM 14 CD LYS D1132 184.714 154.611 212.262 1.00111.95 ATOM 15 CE LYS D1132 183.663 155.439 211.545 1.00111.95 ATOM 16 NZ LYS D1132 183.600 156.824 212.082 1.00111.95 ATOM 17 N ASP D1133 188.710 154.496 213.114 1.00105.98 ATOM 18 CA ASP D1133 189.628 155.613 212.892 1.00105.98 ATOM 19 C ASP D1133 188.906 156.936 212.634 1.00105.98 ATOM 20 O ASP D1133 188.233 157.099 211.613 1.00105.98 ATOM 21 CB ASP D1133 190.560 155.299 211.726 1.00105.98 ATOM 22 CG ASP D1133 189.817 155.151 210.425 1.00105.98 ATOM 23 OD1 ASP D1133 190.357 155.551 209.373 1.00105.98 ATOM 24 OD2 ASP D1133 188.677 154.647 210.462 1.00105.98 ATOM 25 N ILE D1134 189.052 157.885 213.559 1.00 93.87 ATOM 26 CA ILE D1134 188.505 159.230 213.407 1.00 93.87 ATOM 27 C ILE D1134 189.183 159.974 212.268 1.00 93.87 ATOM 28 O ILE D1134 190.412 159.954 212.135 1.00 93.87 ATOM 29 CB ILE D1134 188.657 160.015 214.712 1.00 93.87 ATOM 30 CG1 ILE D1134 187.846 159.369 215.822 1.00 93.87 ATOM 31 CG2 ILE D1134 188.207 161.427 214.508 1.00 93.87 ATOM 32 CD1 ILE D1134 187.721 160.241 217.040 1.00 93.87 ATOM 33 N THR D1135 188.382 160.636 211.439 1.00 88.58 ATOM 34 CA THR D1135 188.863 161.513 210.380 1.00 88.58 ATOM 35 C THR D1135 188.295 162.911 210.584 1.00 88.58 ATOM 36 O THR D1135 187.228 163.075 211.175 1.00 88.58 ATOM 37 CB THR D1135 188.475 160.998 209.002 1.00 88.58 ATOM 38 OG1 THR D1135 189.042 159.699 208.805 1.00 88.58 ATOM 39 CG2 THR D1135 188.996 161.932 207.930 1.00 88.58 ATOM 40 N GLY D1136 189.007 163.917 210.099 1.00 81.56 ATOM 41 CA GLY D1136 188.572 165.282 210.289 1.00 81.56 ATOM 42 C GLY D1136 189.229 166.285 209.361 1.00 81.56 ATOM 43 O GLY D1136 189.726 165.943 208.288 1.00 81.56 ATOM 44 N GLY D1137 189.210 167.539 209.795 1.00 76.39 ATOM 45 CA GLY D1137 189.702 168.665 209.021 1.00 76.39 ATOM 46 C GLY D1137 188.805 169.068 207.866 1.00 76.39 ATOM 47 O GLY D1137 187.745 168.506 207.628 1.00 76.39 ATOM 48 N LEU D1138 189.283 170.067 207.108 1.00 71.59 ATOM 49 CA LEU D1138 188.409 170.727 206.137 1.00 71.59 ATOM 50 C LEU D1138 188.095 169.850 204.944 1.00 71.59 ATOM 51 O LEU D1138 186.911 169.567 204.697 1.00 71.59 ATOM 52 CB LEU D1138 189.015 172.054 205.695 1.00 71.59 ATOM 53 CG LEU D1138 187.894 172.951 205.200 1.00 71.59 ATOM 54 CD1 LEU D1138 186.782 172.887 206.196 1.00 71.59 ATOM 55 CD2 LEU D1138 188.372 174.367 205.037 1.00 71.59 ATOM 56 N PRO D1139 189.069 169.388 204.173 1.00 73.52 ATOM 57 CA PRO D1139 188.730 168.722 202.919 1.00 73.52 ATOM 58 C PRO D1139 187.765 167.589 203.132 1.00 73.52 ATOM 59 O PRO D1139 186.987 167.275 202.229 1.00 73.52 ATOM 60 CB PRO D1139 190.090 168.245 202.407 1.00 73.52 ATOM 61 CG PRO D1139 191.017 169.247 202.952 1.00 73.52 ATOM 62 CD PRO D1139 190.518 169.529 204.332 1.00 73.52 ATOM 63 N ARG D1140 187.785 166.957 204.300 1.00 74.63 ATOM 64 CA ARG D1140 186.809 165.912 204.551 1.00 74.63 ATOM 65 C ARG D1140 185.404 166.478 204.441 1.00 74.63 ATOM 66 O ARG D1140 184.503 165.823 203.913 1.00 74.63 ATOM 67 CB ARG D1140 187.042 165.317 205.933 1.00 74.63 ATOM 68 CG ARG D1140 186.447 163.945 206.194 1.00 74.63 ATOM 69 CD ARG D1140 186.697 162.993 205.045 1.00 74.63 ATOM 70 NE ARG D1140 185.874 161.791 205.137 1.00 74.63 ATOM 71 CZ ARG D1140 184.552 161.788 205.201 1.00 74.63 ATOM 72 NH1 ARG D1140 183.883 162.927 205.180 1.00 74.63 ATOM 73 NH2 ARG D1140 183.897 160.643 205.281 1.00 74.63 ATOM 74 N VAL D1141 185.206 167.715 204.895 1.00 73.94 ATOM 75 CA VAL D1141 183.903 168.359 204.760 1.00 73.94 ATOM 76 C VAL D1141 183.561 168.609 203.299 1.00 73.94 ATOM 77 O VAL D1141 182.449 168.317 202.853 1.00 73.94 ATOM 78 CB VAL D1141 183.849 169.663 205.562 1.00 73.94 ATOM 79 CG1 VAL D1141 182.739 170.519 205.027 1.00 73.94 ATOM 80 CG2 VAL D1141 183.602 169.353 207.004 1.00 73.94 ATOM 81 N ALA D1142 184.467 169.245 202.559 1.00 78.43 ATOM 82 CA ALA D1142 184.204 169.477 201.143 1.00 78.43 ATOM 83 C ALA D1142 183.839 168.187 200.433 1.00 78.43 ATOM 84 O ALA D1142 182.908 168.152 199.620 1.00 78.43 ATOM 85 CB ALA D1142 185.418 170.117 200.479 1.00 78.43 ATOM 86 N ASP D1143 184.537 167.104 200.753 1.00 82.75 ATOM 87 CA ASP D1143 184.269 165.843 200.080 1.00 82.75 ATOM 88 C ASP D1143 182.934 165.274 200.519 1.00 82.75 ATOM 89 O ASP D1143 182.205 164.685 199.715 1.00 82.75 ATOM 90 CB ASP D1143 185.398 164.859 200.358 1.00 82.75 ATOM 91 CG ASP D1143 186.540 165.009 199.382 1.00 82.75 ATOM 92 OD1 ASP D1143 187.313 164.046 199.209 1.00 82.75 ATOM 93 OD2 ASP D1143 186.657 166.092 198.776 1.00 82.75 ATOM 94 N LEU D1144 182.595 165.451 201.789 1.00 74.19 ATOM 95 CA LEU D1144 181.315 164.977 202.281 1.00 74.19 ATOM 96 C LEU D1144 180.160 165.712 201.619 1.00 74.19 ATOM 97 O LEU D1144 179.128 165.110 201.309 1.00 74.19 ATOM 98 CB LEU D1144 181.275 165.134 203.790 1.00 74.19 ATOM 99 CG LEU D1144 180.153 164.317 204.367 1.00 74.19 ATOM 100 CD1 LEU D1144 180.106 163.047 203.584 1.00 74.19 ATOM 101 CD2 LEU D1144 180.472 164.036 205.804 1.00 74.19 ATOM 102 N PHE D1145 180.305 167.018 201.409 1.00 75.56 ATOM 103 CA PHE D1145 179.262 167.779 200.734 1.00 75.56 ATOM 104 C PHE D1145 179.235 167.582 199.236 1.00 75.56 ATOM 105 O PHE D1145 178.196 167.829 198.623 1.00 75.56 ATOM 106 CB PHE D1145 179.385 169.272 201.013 1.00 75.56 ATOM 107 CG PHE D1145 178.699 169.707 202.258 1.00 75.56 ATOM 108 CD1 PHE D1145 177.735 168.919 202.830 1.00 75.56 ATOM 109 CD2 PHE D1145 179.010 170.902 202.853 1.00 75.56 ATOM 110 CE1 PHE D1145 177.101 169.314 203.966 1.00 75.56 ATOM 111 CE2 PHE D1145 178.376 171.293 203.991 1.00 75.56 ATOM 112 CZ PHE D1145 177.423 170.499 204.545 1.00 75.56 ATOM 113 N GLU D1146 180.327 167.171 198.616 1.00 88.13 ATOM 114 CA GLU D1146 180.228 166.907 197.192 1.00 88.13 ATOM 115 C GLU D1146 179.881 165.462 196.893 1.00 88.13 ATOM 116 O GLU D1146 179.836 165.079 195.722 1.00 88.13 ATOM 117 CB GLU D1146 181.514 167.298 196.485 1.00 88.13 ATOM 118 CG GLU D1146 181.618 168.780 196.311 1.00 88.13 ATOM 119 CD GLU D1146 182.769 169.170 195.434 1.00 88.13 ATOM 120 OE1 GLU D1146 183.523 168.270 195.015 1.00 88.13 ATOM 121 OE2 GLU D1146 182.923 170.379 195.166 1.00 88.13 ATOM 122 N ALA D1147 179.626 164.661 197.920 1.00 90.72 ATOM 123 CA ALA D1147 179.054 163.336 197.747 1.00 90.72 ATOM 124 C ALA D1147 179.884 162.523 196.769 1.00 90.72 ATOM 125 O ALA D1147 179.375 161.954 195.804 1.00 90.72 ATOM 126 CB ALA D1147 177.602 163.422 197.289 1.00 90.72 ATOM 127 N ARG D1148 181.183 162.468 197.022 1.00104.00 ATOM 128 CA ARG D1148 182.052 161.710 196.143 1.00104.00 ATOM 129 C ARG D1148 181.982 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