HEADER TRANSCRIPTION, TRANSFERASE/DNA 31-DEC-69 6XLN TITLE Cryo-EM structure of E. coli RNAP-DNA elongation complex 2 (RDe2) in TITLE 2 EcmrR-dependent transcription COMPND MOL_ID: 3; COMPND 2 MOLECULE: DNA-directed RNA polymerase subunit beta'; COMPND 3 CHAIN: D; COMPND 4 EC: 2.7.7.6; COMPND 5 ENGINEERED: YES; EXPDTA ELECTRON MICROSCOPY REMARK 465 MISSING RESIDUES REMARK 465 THE FOLLOWING RESIDUES WERE NOT LOCATED IN THE REMARK 465 EXPERIMENT. (M=MODEL NUMBER; RES=RESIDUE NAME; C=CHAIN REMARK 465 IDENTIFIER; SSSEQ=SEQUENCE NUMBER; I=INSERTION CODE.) REMARK 465 REMARK 465 M RES C SSSEQI REMARK 465 LYS D 1132 REMARK 465 ASP D 1133 REMARK 465 ILE D 1134 REMARK 465 THR D 1135 DBREF 6XLN D 1 1407 UNP P0A8T8 RPOC_ECO57 1 1407 SEQRES 1 D 84 LYS ASP ILE THR GLY GLY LEU PRO ARG VAL ALA ASP LEU SEQRES 2 D 84 PHE GLU ALA ARG ARG PRO LYS GLU PRO ALA ILE LEU ALA SEQRES 3 D 84 GLU ILE SER GLY ILE VAL SER PHE GLY LYS GLU THR LYS SEQRES 4 D 84 GLY LYS ARG ARG LEU VAL ILE THR PRO VAL ASP GLY SER SEQRES 5 D 84 ASP PRO TYR GLU GLU MET ILE PRO LYS TRP ARG GLN LEU SEQRES 6 D 84 ASN VAL PHE GLU GLY GLU ARG VAL GLU ARG GLY ASP VAL SEQRES 7 D 84 ILE SER ASP GLY PRO GLU ATOM 1 N GLY D1136 163.317 194.237 160.311 1.00 81.98 ATOM 2 CA GLY D1136 163.958 194.260 161.613 1.00 81.98 ATOM 3 C GLY D1136 164.158 192.871 162.175 1.00 81.98 ATOM 4 O GLY D1136 163.770 191.888 161.552 1.00 81.98 ATOM 5 N GLY D1137 164.762 192.785 163.352 1.00 80.82 ATOM 6 CA GLY D1137 164.946 191.510 164.003 1.00 80.82 ATOM 7 C GLY D1137 166.353 190.977 163.855 1.00 80.82 ATOM 8 O GLY D1137 167.314 191.709 163.672 1.00 80.82 ATOM 9 N LEU D1138 166.462 189.662 163.954 1.00 80.98 ATOM 10 CA LEU D1138 167.752 189.026 163.714 1.00 80.98 ATOM 11 C LEU D1138 168.138 188.989 162.239 1.00 80.98 ATOM 12 O LEU D1138 169.323 189.221 161.941 1.00 80.98 ATOM 13 CB LEU D1138 167.753 187.618 164.313 1.00 80.98 ATOM 14 CG LEU D1138 169.114 186.985 164.510 1.00 80.98 ATOM 15 CD1 LEU D1138 169.993 187.939 165.260 1.00 80.98 ATOM 16 CD2 LEU D1138 168.925 185.725 165.292 1.00 80.98 ATOM 17 N PRO D1139 167.247 188.693 161.287 1.00 82.11 ATOM 18 CA PRO D1139 167.659 188.791 159.884 1.00 82.11 ATOM 19 C PRO D1139 168.083 190.178 159.456 1.00 82.11 ATOM 20 O PRO D1139 168.865 190.296 158.511 1.00 82.11 ATOM 21 CB PRO D1139 166.412 188.327 159.133 1.00 82.11 ATOM 22 CG PRO D1139 165.792 187.390 160.042 1.00 82.11 ATOM 23 CD PRO D1139 165.960 187.985 161.391 1.00 82.11 ATOM 24 N ARG D1140 167.631 191.236 160.118 1.00 80.89 ATOM 25 CA ARG D1140 168.142 192.550 159.759 1.00 80.89 ATOM 26 C ARG D1140 169.609 192.691 160.120 1.00 80.89 ATOM 27 O ARG D1140 170.378 193.267 159.351 1.00 80.89 ATOM 28 CB ARG D1140 167.336 193.648 160.431 1.00 80.89 ATOM 29 CG ARG D1140 167.885 195.028 160.187 1.00 80.89 ATOM 30 CD ARG D1140 167.809 195.386 158.733 1.00 80.89 ATOM 31 NE ARG D1140 167.958 196.817 158.528 1.00 80.89 ATOM 32 CZ ARG D1140 168.383 197.360 157.397 1.00 80.89 ATOM 33 NH1 ARG D1140 168.707 196.589 156.373 1.00 80.89 ATOM 34 NH2 ARG D1140 168.492 198.673 157.293 1.00 80.89 ATOM 35 N VAL D1141 170.024 192.161 161.268 1.00 79.44 ATOM 36 CA VAL D1141 171.439 192.195 161.617 1.00 79.44 ATOM 37 C VAL D1141 172.228 191.262 160.713 1.00 79.44 ATOM 38 O VAL D1141 173.329 191.595 160.261 1.00 79.44 ATOM 39 CB VAL D1141 171.625 191.846 163.099 1.00 79.44 ATOM 40 CG1 VAL D1141 173.049 191.945 163.473 1.00 79.44 ATOM 41 CG2 VAL D1141 170.829 192.780 163.945 1.00 79.44 ATOM 42 N ALA D1142 171.669 190.096 160.406 1.00 80.50 ATOM 43 CA ALA D1142 172.365 189.161 159.535 1.00 80.50 ATOM 44 C ALA D1142 172.466 189.686 158.110 1.00 80.50 ATOM 45 O ALA D1142 173.299 189.217 157.334 1.00 80.50 ATOM 46 CB ALA D1142 171.665 187.810 159.550 1.00 80.50 ATOM 47 N ASP D1143 171.616 190.637 157.738 1.00 85.08 ATOM 48 CA ASP D1143 171.657 191.238 156.415 1.00 85.08 ATOM 49 C ASP D1143 172.413 192.549 156.379 1.00 85.08 ATOM 50 O ASP D1143 172.783 193.002 155.297 1.00 85.08 ATOM 51 CB ASP D1143 170.242 191.470 155.906 1.00 85.08 ATOM 52 CG ASP D1143 169.599 190.204 155.400 1.00 85.08 ATOM 53 OD1 ASP D1143 168.712 190.294 154.523 1.00 85.08 ATOM 54 OD2 ASP D1143 169.985 189.115 155.873 1.00 85.08 ATOM 55 N LEU D1144 172.617 193.186 157.524 1.00 80.74 ATOM 56 CA LEU D1144 173.521 194.324 157.580 1.00 80.74 ATOM 57 C LEU D1144 174.964 193.862 157.615 1.00 80.74 ATOM 58 O LEU D1144 175.841 194.489 157.017 1.00 80.74 ATOM 59 CB LEU D1144 173.222 195.169 158.804 1.00 80.74 ATOM 60 CG LEU D1144 172.083 196.141 158.628 1.00 80.74 ATOM 61 CD1 LEU D1144 171.624 196.540 159.981 1.00 80.74 ATOM 62 CD2 LEU D1144 172.588 197.331 157.874 1.00 80.74 ATOM 63 N PHE D1145 175.238 192.781 158.339 1.00 76.70 ATOM 64 CA PHE D1145 176.609 192.306 158.387 1.00 76.70 ATOM 65 C PHE D1145 176.972 191.558 157.124 1.00 76.70 ATOM 66 O PHE D1145 178.121 191.610 156.689 1.00 76.70 ATOM 67 CB PHE D1145 176.823 191.446 159.620 1.00 76.70 ATOM 68 CG PHE D1145 176.991 192.243 160.858 1.00 76.70 ATOM 69 CD1 PHE D1145 177.838 193.319 160.875 1.00 76.70 ATOM 70 CD2 PHE D1145 176.279 191.953 161.988 1.00 76.70 ATOM 71 CE1 PHE D1145 177.987 194.067 161.992 1.00 76.70 ATOM 72 CE2 PHE D1145 176.433 192.704 163.103 1.00 76.70 ATOM 73 CZ PHE D1145 177.288 193.758 163.103 1.00 76.70 ATOM 74 N GLU D1146 176.022 190.902 156.506 1.00 83.23 ATOM 75 CA GLU D1146 176.382 190.316 155.232 1.00 83.23 ATOM 76 C GLU D1146 176.290 191.283 154.101 1.00 83.23 ATOM 77 O GLU D1146 176.478 190.832 152.975 1.00 83.23 ATOM 78 CB GLU D1146 175.513 189.102 154.956 1.00 83.23 ATOM 79 CG GLU D1146 175.805 187.970 155.887 1.00 83.23 ATOM 80 CD GLU D1146 176.706 186.938 155.271 1.00 83.23 ATOM 81 OE1 GLU D1146 177.193 187.166 154.147 1.00 83.23 ATOM 82 OE2 GLU D1146 176.927 185.891 155.910 1.00 83.23 ATOM 83 N ALA D1147 176.015 192.553 154.400 1.00 89.57 ATOM 84 CA ALA D1147 176.031 193.634 153.420 1.00 89.57 ATOM 85 C ALA D1147 175.259 193.256 152.169 1.00 89.57 ATOM 86 O ALA D1147 175.782 193.286 151.057 1.00 89.57 ATOM 87 CB ALA D1147 177.458 194.041 153.077 1.00 89.57 ATOM 88 N ARG D1148 174.007 192.862 152.361 1.00 99.74 ATOM 89 CA ARG D1148 173.187 192.426 151.247 1.00 99.74 ATOM 90 C ARG D1148 172.469 193.610 150.629 1.00 99.74 ATOM 91 O ARG D1148 171.957 194.481 151.332 1.00 99.74 ATOM 92 CB ARG D1148 172.189 191.380 151.712 1.00 99.74 ATOM 93 CG ARG D1148 172.859 190.073 151.963 1.00 99.74 ATOM 94 CD ARG D1148 171.958 189.089 152.617 1.00 99.74 ATOM 95 NE ARG D1148 172.685 187.857 152.860 1.00 99.74 ATOM 96 CZ ARG D1148 172.124 186.729 153.268 1.00 99.74 ATOM 97 NH1 ARG D1148 170.817 186.677 153.470 1.00 99.74 ATOM 98 NH2 ARG D1148 172.869 185.652 153.461 1.00 99.74 ATOM 99 N ARG D1149 172.446 193.641 149.310 1.00110.22 ATOM 100 CA ARG D1149 171.831 194.752 148.606 1.00110.22 ATOM 101 C ARG D1149 170.321 194.697 148.780 1.00110.22 ATOM 102 O ARG D1149 169.718 193.638 148.584 1.00110.22 ATOM 103 CB ARG D1149 172.195 194.706 147.132 1.00110.22 ATOM 104 CG ARG D1149 173.659 194.445 146.889 1.00110.22 ATOM 105 CD ARG D1149 173.972 194.384 145.412 1.00110.22 ATOM 106 NE ARG D1149 175.380 194.093 145.174 1.00110.22 ATOM 107 CZ ARG D1149 176.343 195.007 145.194 1.00110.22 ATOM 108 NH1 ARG D1149 176.051 196.276 145.440 1.00110.22 ATOM 109 NH2 ARG D1149 177.599 194.654 144.968 1.00110.22 ATOM 110 N PRO D1150 169.679 195.801 149.140 1.00117.83 ATOM 111 CA PRO D1150 168.231 195.782 149.340 1.00117.83 ATOM 112 C PRO D1150 167.495 195.543 148.033 1.00117.83 ATOM 113 O PRO D1150 168.051 195.665 146.941 1.00117.83 ATOM 114 CB PRO D1150 167.937 197.173 149.903 1.00117.83 ATOM 115 CG PRO D1150 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