HEADER TRANSCRIPTION/DNA 31-DEC-69 7CHW TITLE Cryo-EM structure of an Escherichia coli RNAP-promoter open complex TITLE 2 (RPo) COMPND MOL_ID: 4; COMPND 2 MOLECULE: DNA-directed RNA polymerase subunit beta'; COMPND 3 CHAIN: D; COMPND 4 EC: 2.7.7.6; COMPND 5 ENGINEERED: YES; EXPDTA ELECTRON MICROSCOPY REMARK 465 MISSING RESIDUES REMARK 465 THE FOLLOWING RESIDUES WERE NOT LOCATED IN THE REMARK 465 EXPERIMENT. (M=MODEL NUMBER; RES=RESIDUE NAME; C=CHAIN REMARK 465 IDENTIFIER; SSSEQ=SEQUENCE NUMBER; I=INSERTION CODE.) REMARK 465 REMARK 465 M RES C SSSEQI REMARK 465 ASP D 1181 REMARK 465 GLY D 1182 REMARK 465 SER D 1183 REMARK 465 ASP D 1184 DBREF 7CHW D 1 1407 UNP D7Y6A2 D7Y6A2_ECOL 1 1407 SEQRES 1 D 84 LYS ASP ILE THR GLY GLY LEU PRO ARG VAL ALA ASP LEU SEQRES 2 D 84 PHE GLU ALA ARG ARG PRO LYS GLU PRO ALA ILE LEU ALA SEQRES 3 D 84 GLU ILE SER GLY ILE VAL SER PHE GLY LYS GLU THR LYS SEQRES 4 D 84 GLY LYS ARG ARG LEU VAL ILE THR PRO VAL ASP GLY SER SEQRES 5 D 84 ASP PRO TYR GLU GLU MET ILE PRO LYS TRP ARG GLN LEU SEQRES 6 D 84 ASN VAL PHE GLU GLY GLU ARG VAL GLU ARG GLY ASP VAL SEQRES 7 D 84 ILE SER ASP GLY PRO GLU ATOM 1 N LYS D1132 109.423 155.316 151.620 1.00 27.64 ATOM 2 CA LYS D1132 110.280 154.828 150.541 1.00 27.64 ATOM 3 C LYS D1132 111.367 155.854 150.228 1.00 27.64 ATOM 4 O LYS D1132 111.543 156.307 149.097 1.00 27.64 ATOM 5 CB LYS D1132 109.444 154.503 149.306 1.00 27.64 ATOM 6 N ASP D1133 112.089 156.227 151.279 1.00 25.07 ATOM 7 CA ASP D1133 113.234 157.125 151.189 1.00 25.07 ATOM 8 C ASP D1133 114.368 156.576 152.045 1.00 25.07 ATOM 9 O ASP D1133 115.023 157.298 152.797 1.00 25.07 ATOM 10 CB ASP D1133 112.852 158.542 151.612 1.00 25.07 ATOM 11 N ILE D1134 114.600 155.269 151.943 1.00 29.30 ATOM 12 CA ILE D1134 115.549 154.577 152.801 1.00 29.30 ATOM 13 C ILE D1134 116.603 153.889 151.943 1.00 29.30 ATOM 14 O ILE D1134 116.455 153.732 150.729 1.00 29.30 ATOM 15 CB ILE D1134 114.853 153.556 153.723 1.00 29.30 ATOM 16 N THR D1135 117.682 153.472 152.604 1.00 37.40 ATOM 17 CA THR D1135 118.783 152.763 151.975 1.00 37.40 ATOM 18 C THR D1135 118.939 151.378 152.600 1.00 37.40 ATOM 19 O THR D1135 118.384 151.075 153.659 1.00 37.40 ATOM 20 CB THR D1135 120.077 153.570 152.100 1.00 37.40 ATOM 21 OG1 THR D1135 120.505 153.578 153.468 1.00 37.40 ATOM 22 CG2 THR D1135 119.847 155.001 151.645 1.00 37.40 ATOM 23 N GLY D1136 119.717 150.534 151.939 1.00 15.29 ATOM 24 CA GLY D1136 119.950 149.178 152.380 1.00 15.29 ATOM 25 C GLY D1136 119.789 148.171 151.260 1.00 15.29 ATOM 26 O GLY D1136 119.474 148.505 150.115 1.00 15.29 ATOM 27 N GLY D1137 120.008 146.904 151.608 1.00 7.81 ATOM 28 CA GLY D1137 119.963 145.822 150.649 1.00 7.81 ATOM 29 C GLY D1137 121.284 145.078 150.593 1.00 7.81 ATOM 30 O GLY D1137 121.912 144.814 151.625 1.00 7.81 ATOM 31 N LEU D1138 121.687 144.724 149.387 1.00 9.35 ATOM 32 CA LEU D1138 122.992 144.107 149.200 1.00 9.35 ATOM 33 C LEU D1138 124.103 145.151 149.192 1.00 9.35 ATOM 34 O LEU D1138 125.156 144.924 149.798 1.00 9.35 ATOM 35 CB LEU D1138 123.035 143.287 147.913 1.00 9.35 ATOM 36 CG LEU D1138 124.312 142.467 147.745 1.00 9.35 ATOM 37 CD1 LEU D1138 124.603 141.677 149.000 1.00 9.35 ATOM 38 CD2 LEU D1138 124.182 141.542 146.561 1.00 9.35 ATOM 39 N PRO D1139 123.937 146.286 148.510 1.00 9.69 ATOM 40 CA PRO D1139 124.959 147.337 148.598 1.00 9.69 ATOM 41 C PRO D1139 125.198 147.852 150.001 1.00 9.69 ATOM 42 O PRO D1139 126.276 148.392 150.265 1.00 9.69 ATOM 43 CB PRO D1139 124.400 148.434 147.689 1.00 9.69 ATOM 44 CG PRO D1139 123.641 147.694 146.679 1.00 9.69 ATOM 45 CD PRO D1139 123.004 146.547 147.402 1.00 9.69 ATOM 46 N ARG D1140 124.233 147.725 150.909 1.00 4.80 ATOM 47 CA ARG D1140 124.466 148.162 152.277 1.00 4.80 ATOM 48 C ARG D1140 125.345 147.192 153.046 1.00 4.80 ATOM 49 O ARG D1140 125.996 147.597 154.012 1.00 4.80 ATOM 50 CB ARG D1140 123.141 148.337 153.005 1.00 4.80 ATOM 51 CG ARG D1140 123.273 148.702 154.467 1.00 4.80 ATOM 52 CD ARG D1140 123.661 150.150 154.636 1.00 4.80 ATOM 53 NE ARG D1140 123.305 150.645 155.958 1.00 4.80 ATOM 54 CZ ARG D1140 124.165 150.775 156.957 1.00 4.80 ATOM 55 NH1 ARG D1140 125.434 150.451 156.780 1.00 4.80 ATOM 56 NH2 ARG D1140 123.761 151.235 158.129 1.00 4.80 ATOM 57 N VAL D1141 125.379 145.923 152.645 1.00 4.80 ATOM 58 CA VAL D1141 126.134 144.934 153.402 1.00 4.80 ATOM 59 C VAL D1141 127.559 144.822 152.889 1.00 4.80 ATOM 60 O VAL D1141 128.466 144.475 153.649 1.00 4.80 ATOM 61 CB VAL D1141 125.421 143.577 153.368 1.00 4.80 ATOM 62 CG1 VAL D1141 126.215 142.554 154.131 1.00 4.80 ATOM 63 CG2 VAL D1141 124.038 143.707 153.957 1.00 4.80 ATOM 64 N ALA D1142 127.790 145.091 151.609 1.00 11.92 ATOM 65 CA ALA D1142 129.161 145.142 151.123 1.00 11.92 ATOM 66 C ALA D1142 129.851 146.420 151.569 1.00 11.92 ATOM 67 O ALA D1142 131.039 146.403 151.904 1.00 11.92 ATOM 68 CB ALA D1142 129.192 145.031 149.604 1.00 11.92 ATOM 69 N ASP D1143 129.128 147.538 151.575 1.00 11.75 ATOM 70 CA ASP D1143 129.704 148.795 152.030 1.00 11.75 ATOM 71 C ASP D1143 129.890 148.833 153.537 1.00 11.75 ATOM 72 O ASP D1143 130.807 149.498 154.022 1.00 11.75 ATOM 73 CB ASP D1143 128.829 149.961 151.583 1.00 11.75 ATOM 74 CG ASP D1143 129.009 151.183 152.447 1.00 11.75 ATOM 75 OD1 ASP D1143 130.158 151.658 152.572 1.00 11.75 ATOM 76 OD2 ASP D1143 128.003 151.672 153.003 1.00 11.75 ATOM 77 N LEU D1144 129.062 148.122 154.288 1.00 4.80 ATOM 78 CA LEU D1144 129.239 148.099 155.732 1.00 4.80 ATOM 79 C LEU D1144 130.443 147.255 156.124 1.00 4.80 ATOM 80 O LEU D1144 130.997 147.421 157.214 1.00 4.80 ATOM 81 CB LEU D1144 127.973 147.579 156.398 1.00 4.80 ATOM 82 CG LEU D1144 127.981 147.691 157.908 1.00 4.80 ATOM 83 CD1 LEU D1144 128.644 148.979 158.291 1.00 4.80 ATOM 84 CD2 LEU D1144 126.563 147.677 158.392 1.00 4.80 ATOM 85 N PHE D1145 130.852 146.333 155.248 1.00 4.80 ATOM 86 CA PHE D1145 132.014 145.500 155.533 1.00 4.80 ATOM 87 C PHE D1145 133.297 146.157 155.049 1.00 4.80 ATOM 88 O PHE D1145 134.372 145.905 155.598 1.00 4.80 ATOM 89 CB PHE D1145 131.854 144.126 154.893 1.00 4.80 ATOM 90 CG PHE D1145 131.157 143.128 155.762 1.00 4.80 ATOM 91 CD1 PHE D1145 131.633 142.839 157.022 1.00 4.80 ATOM 92 CD2 PHE D1145 130.044 142.462 155.310 1.00 4.80 ATOM 93 CE1 PHE D1145 131.001 141.920 157.816 1.00 4.80 ATOM 94 CE2 PHE D1145 129.412 141.540 156.101 1.00 4.80 ATOM 95 CZ PHE D1145 129.891 141.270 157.355 1.00 4.80 ATOM 96 N GLU D1146 133.212 146.995 154.016 1.00 1.52 ATOM 97 CA GLU D1146 134.404 147.689 153.541 1.00 1.52 ATOM 98 C GLU D1146 134.844 148.781 154.504 1.00 1.52 ATOM 99 O GLU D1146 135.974 149.270 154.407 1.00 1.52 ATOM 100 CB GLU D1146 134.154 148.292 152.164 1.00 1.52 ATOM 101 CG GLU D1146 133.764 147.295 151.110 1.00 1.52 ATOM 102 CD GLU D1146 134.957 146.624 150.491 1.00 1.52 ATOM 103 OE1 GLU D1146 136.091 147.046 150.788 1.00 1.52 ATOM 104 OE2 GLU D1146 134.766 145.678 149.703 1.00 1.52 ATOM 105 N ALA D1147 133.979 149.174 155.438 1.00 8.75 ATOM 106 CA ALA D1147 134.269 150.244 156.389 1.00 8.75 ATOM 107 C ALA D1147 134.550 151.557 155.655 1.00 8.75 ATOM 108 O ALA D1147 135.644 152.114 155.705 1.00 8.75 ATOM 109 CB ALA D1147 135.438 149.862 157.298 1.00 8.75 ATOM 110 N ARG D1148 133.518 152.031 154.967 1.00 14.26 ATOM 111 CA ARG D1148 133.603 153.249 154.177 1.00 14.26 ATOM 112 C ARG D1148 133.027 154.439 154.935 1.00 14.26 ATOM 113 O ARG D1148 132.090 154.312 155.724 1.00 14.26 ATOM 114 CB ARG D1148 132.869 153.068 152.854 1.00 14.26 ATOM 115 CG ARG D1148 133.324 151.848 152.103 1.00 14.26 ATOM 116 CD ARG D1148 132.776 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134 C PRO D1150 129.072 159.043 154.330 1.00 19.02 ATOM 135 O PRO D1150 127.935 159.489 154.505 1.00 19.02 ATOM 136 CB PRO D1150 128.451 157.147 155.856 1.00 19.02 ATOM 137 CG PRO D1150 129.166 157.500 157.117 1.00 19.02 ATOM 138 CD PRO D1150 130.634 157.350 156.846 1.00 19.02 ATOM 139 N LYS D1151 130.040 159.762 153.762 1.00 20.15 ATOM 140 CA LYS D1151 129.807 161.045 153.096 1.00 20.15 ATOM 141 C LYS D1151 129.374 162.187 154.012 1.00 20.15 ATOM 142 O LYS D1151 129.268 163.330 153.559 1.00 20.15 ATOM 143 CB LYS D1151 128.760 160.878 151.996 1.00 20.15 ATOM 144 CG LYS D1151 129.336 160.543 150.636 1.00 20.15 ATOM 145 CD LYS D1151 128.246 160.541 149.582 1.00 20.15 ATOM 146 CE LYS D1151 127.406 161.810 149.656 1.00 20.15 ATOM 147 NZ LYS D1151 128.197 163.038 149.372 1.00 20.15 ATOM 148 N GLU D1152 129.130 161.911 155.286 1.00 24.37 ATOM 149 CA GLU D1152 128.633 162.930 156.203 1.00 24.37 ATOM 150 C GLU D1152 128.849 162.482 157.638 1.00 24.37 ATOM 151 O GLU D1152 127.897 162.067 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