HEADER TRANSCRIPTION/DNA/RNA 31-DEC-69 7EH1 TITLE Thermus thermophilus transcription initiation complex containing a TITLE 2 template-strand purine at position TSS-2, GpG RNA primer, and CMPcPP COMPND MOL_ID: 3; COMPND 2 MOLECULE: DNA-directed RNA polymerase subunit beta'; COMPND 3 CHAIN: D; COMPND 4 EC: 2.7.7.6; EXPDTA X-RAY DIFFRACTION REMARK 2 RESOLUTION. 2.90 ANGSTORMS DBREF 7EH1 D 1 1524 UNP Q8RQE8 RPOC_THET8 1 1524 SEQRES 1 D 61 ALA LYS ALA VAL ILE SER GLU ILE ASP GLY VAL VAL ARG SEQRES 2 D 61 ILE GLU GLU THR GLU GLU LYS LEU SER VAL PHE VAL GLU SEQRES 3 D 61 SER GLU GLY PHE SER LYS GLU TYR LYS LEU PRO LYS GLU SEQRES 4 D 61 ALA ARG LEU LEU VAL LYS ASP GLY ASP TYR VAL GLU ALA SEQRES 5 D 61 GLY GLN PRO LEU THR ARG GLY ALA ILE ATOM 1 N ALA D1270 160.360 -17.239 60.696 1.00 57.12 ATOM 2 CA ALA D1270 159.151 -17.983 61.048 1.00 56.05 ATOM 3 C ALA D1270 157.903 -17.118 60.846 1.00 55.75 ATOM 4 O ALA D1270 157.130 -16.841 61.772 1.00 52.62 ATOM 5 CB ALA D1270 159.259 -18.482 62.485 1.00 58.00 ATOM 6 N LYS D1271 157.704 -16.698 59.597 1.00 51.21 ATOM 7 CA LYS D1271 156.722 -15.660 59.325 1.00 45.75 ATOM 8 C LYS D1271 155.300 -16.215 59.388 1.00 46.11 ATOM 9 O LYS D1271 155.053 -17.409 59.199 1.00 51.22 ATOM 10 CB LYS D1271 156.999 -14.984 57.970 1.00 45.31 ATOM 11 CG LYS D1271 156.323 -15.590 56.735 1.00 46.64 ATOM 12 CD LYS D1271 156.267 -14.606 55.544 1.00 34.31 ATOM 13 CE LYS D1271 157.654 -14.132 55.108 1.00 45.51 ATOM 14 NZ LYS D1271 157.653 -13.387 53.785 1.00 45.44 ATOM 15 N ALA D1272 154.367 -15.330 59.714 1.00 50.78 ATOM 16 CA ALA D1272 152.952 -15.662 59.745 1.00 52.09 ATOM 17 C ALA D1272 152.360 -15.402 58.370 1.00 51.05 ATOM 18 O ALA D1272 152.570 -14.331 57.787 1.00 49.17 ATOM 19 CB ALA D1272 152.220 -14.835 60.805 1.00 42.73 ATOM 20 N VAL D1273 151.642 -16.384 57.844 1.00 53.42 ATOM 21 CA VAL D1273 150.913 -16.175 56.601 1.00 55.23 ATOM 22 C VAL D1273 149.685 -15.334 56.913 1.00 54.05 ATOM 23 O VAL D1273 148.949 -15.620 57.867 1.00 53.74 ATOM 24 CB VAL D1273 150.533 -17.512 55.947 1.00 46.50 ATOM 25 CG1 VAL D1273 150.351 -17.323 54.452 1.00 51.69 ATOM 26 CG2 VAL D1273 151.596 -18.559 56.215 1.00 55.30 ATOM 27 N ILE D1274 149.484 -14.271 56.137 1.00 45.67 ATOM 28 CA ILE D1274 148.363 -13.373 56.354 1.00 47.60 ATOM 29 C ILE D1274 147.524 -13.349 55.087 1.00 55.77 ATOM 30 O ILE D1274 148.008 -13.646 53.991 1.00 58.79 ATOM 31 CB ILE D1274 148.818 -11.950 56.741 1.00 55.20 ATOM 32 CG1 ILE D1274 149.564 -11.283 55.578 1.00 51.56 ATOM 33 CG2 ILE D1274 149.702 -11.989 57.980 1.00 48.52 ATOM 34 CD1 ILE D1274 149.671 -9.765 55.701 1.00 37.52 ATOM 35 N SER D1275 146.248 -12.992 55.248 1.00 56.36 ATOM 36 CA SER D1275 145.328 -12.911 54.117 1.00 60.61 ATOM 37 C SER D1275 145.604 -11.664 53.295 1.00 61.49 ATOM 38 O SER D1275 145.697 -10.560 53.843 1.00 57.32 ATOM 39 CB SER D1275 143.875 -12.886 54.590 1.00 66.05 ATOM 40 OG SER D1275 143.426 -14.174 54.961 1.00 75.75 ATOM 41 N GLU D1276 145.714 -11.840 51.975 1.00 63.32 ATOM 42 CA GLU D1276 145.869 -10.686 51.095 1.00 61.90 ATOM 43 C GLU D1276 144.618 -9.809 51.120 1.00 62.77 ATOM 44 O GLU D1276 144.715 -8.576 51.075 1.00 57.45 ATOM 45 CB GLU D1276 146.190 -11.151 49.669 1.00 59.55 ATOM 46 CG GLU D1276 147.438 -12.036 49.575 1.00 60.01 ATOM 47 CD GLU D1276 148.086 -12.022 48.200 1.00 73.10 ATOM 48 OE1 GLU D1276 147.361 -11.789 47.208 1.00 85.32 ATOM 49 OE2 GLU D1276 149.321 -12.234 48.109 1.00 61.83 ATOM 50 N ILE D1277 143.439 -10.431 51.237 1.00 68.41 ATOM 51 CA ILE D1277 142.138 -9.781 51.096 1.00 72.33 ATOM 52 C ILE D1277 141.269 -10.126 52.305 1.00 73.13 ATOM 53 O ILE D1277 141.710 -10.785 53.248 1.00 67.79 ATOM 54 CB ILE D1277 141.414 -10.188 49.789 1.00 73.52 ATOM 55 CG1 ILE D1277 141.500 -11.708 49.584 1.00 75.07 ATOM 56 CG2 ILE D1277 141.954 -9.421 48.584 1.00 68.36 ATOM 57 CD1 ILE D1277 140.813 -12.204 48.342 1.00 79.85 ATOM 58 N ASP D1278 140.019 -9.653 52.260 1.00 79.71 ATOM 59 CA ASP D1278 138.949 -10.120 53.135 1.00 82.18 ATOM 60 C ASP D1278 138.499 -11.521 52.697 1.00 91.93 ATOM 61 O ASP D1278 139.031 -12.111 51.750 1.00 92.80 ATOM 62 CB ASP D1278 137.763 -9.151 53.099 1.00 82.63 ATOM 63 CG ASP D1278 138.169 -7.694 53.298 1.00 76.45 ATOM 64 OD1 ASP D1278 138.816 -7.379 54.317 1.00 79.22 ATOM 65 OD2 ASP D1278 137.829 -6.856 52.437 1.00 69.17 ATOM 66 N GLY D1279 137.501 -12.066 53.381 1.00 94.81 ATOM 67 CA GLY D1279 136.894 -13.302 52.924 1.00100.26 ATOM 68 C GLY D1279 136.444 -14.169 54.085 1.00104.94 ATOM 69 O GLY D1279 136.225 -13.684 55.197 1.00101.64 ATOM 70 N VAL D1280 136.300 -15.464 53.787 1.00 98.36 ATOM 71 CA VAL D1280 135.832 -16.445 54.760 1.00 94.43 ATOM 72 C VAL D1280 136.648 -17.725 54.615 1.00 93.85 ATOM 73 O VAL D1280 137.190 -18.023 53.545 1.00 90.60 ATOM 74 CB VAL D1280 134.320 -16.722 54.608 1.00 93.15 ATOM 75 CG1 VAL D1280 134.042 -17.567 53.363 1.00 95.99 ATOM 76 CG2 VAL D1280 133.769 -17.367 55.876 1.00 94.53 ATOM 77 N VAL D1281 136.719 -18.489 55.708 1.00 97.12 ATOM 78 CA VAL D1281 137.679 -19.578 55.868 1.00 99.80 ATOM 79 C VAL D1281 137.037 -20.906 55.485 1.00101.58 ATOM 80 O VAL D1281 135.938 -21.236 55.951 1.00102.79 ATOM 81 CB VAL D1281 138.208 -19.635 57.313 1.00 93.94 ATOM 82 CG1 VAL D1281 139.617 -20.223 57.346 1.00 94.00 ATOM 83 CG2 VAL D1281 138.165 -18.259 57.955 1.00 85.92 ATOM 84 N ARG D1282 137.733 -21.677 54.653 1.00 96.35 ATOM 85 CA ARG D1282 137.368 -23.055 54.335 1.00 98.28 ATOM 86 C ARG D1282 138.604 -23.905 54.578 1.00 96.88 ATOM 87 O ARG D1282 139.566 -23.835 53.806 1.00 98.30 ATOM 88 CB ARG D1282 136.884 -23.186 52.885 1.00104.12 ATOM 89 CG ARG D1282 136.311 -24.560 52.490 1.00102.46 ATOM 90 CD ARG D1282 137.306 -25.434 51.708 1.00100.73 ATOM 91 NE ARG D1282 137.836 -24.799 50.498 1.00 93.09 ATOM 92 CZ ARG D1282 137.284 -24.885 49.291 1.00 90.90 ATOM 93 NH1 ARG D1282 136.165 -25.573 49.114 1.00 89.13 ATOM 94 NH2 ARG D1282 137.851 -24.278 48.256 1.00 90.08 ATOM 95 N ILE D1283 138.598 -24.686 55.648 1.00 94.97 ATOM 96 CA ILE D1283 139.724 -25.573 55.913 1.00101.69 ATOM 97 C ILE D1283 139.579 -26.837 55.070 1.00106.79 ATOM 98 O ILE D1283 138.467 -27.327 54.830 1.00105.04 ATOM 99 CB ILE D1283 139.836 -25.888 57.419 1.00 99.66 ATOM 100 CG1 ILE D1283 138.452 -26.073 58.063 1.00102.00 ATOM 101 CG2 ILE D1283 140.635 -24.796 58.134 1.00 77.11 ATOM 102 CD1 ILE D1283 137.884 -27.499 58.051 1.00 89.66 ATOM 103 N GLU D1284 140.714 -27.349 54.587 1.00100.93 ATOM 104 CA GLU D1284 140.741 -28.550 53.751 1.00101.11 ATOM 105 C GLU D1284 142.050 -29.265 54.072 1.00105.79 ATOM 106 O GLU D1284 143.104 -28.895 53.543 1.00102.35 ATOM 107 CB GLU D1284 140.629 -28.198 52.271 1.00103.75 ATOM 108 CG GLU D1284 140.881 -29.355 51.303 1.00111.04 ATOM 109 CD GLU D1284 142.237 -29.263 50.606 1.00114.12 ATOM 110 OE1 GLU D1284 142.959 -28.263 50.826 1.00105.68 ATOM 111 OE2 GLU D1284 142.579 -30.190 49.836 1.00119.10 ATOM 112 N GLU D1285 141.979 -30.271 54.947 1.00108.29 ATOM 113 CA GLU D1285 143.168 -30.943 55.474 1.00101.25 ATOM 114 C GLU D1285 143.099 -32.441 55.169 1.00 98.74 ATOM 115 O GLU D1285 142.426 -33.198 55.874 1.00 98.55 ATOM 116 CB GLU D1285 143.318 -30.679 56.975 1.00 89.17 ATOM 117 CG GLU D1285 144.622 -31.207 57.563 1.00 95.78 ATOM 118 CD GLU D1285 144.911 -30.673 58.958 1.00 98.33 ATOM 119 OE1 GLU D1285 146.108 -30.583 59.325 1.00 96.33 ATOM 120 OE2 GLU D1285 143.944 -30.346 59.685 1.00 87.51 ATOM 121 N THR D1286 143.800 -32.859 54.113 1.00 94.15 ATOM 122 CA THR D1286 144.126 -34.260 53.869 1.00 95.98 ATOM 123 C THR D1286 144.814 -34.860 55.094 1.00 99.59 ATOM 124 O THR D1286 145.353 -34.125 55.931 1.00 97.42 ATOM 125 CB THR D1286 145.039 -34.370 52.638 1.00 95.25 ATOM 126 OG1 THR D1286 144.489 -33.596 51.566 1.00 89.14 ATOM 127 CG2 THR D1286 145.230 -35.827 52.183 1.00 93.56 ATOM 128 N GLU D1287 144.807 -36.189 55.221 1.00 96.06 ATOM 129 CA GLU D1287 145.665 -36.813 56.221 1.00101.70 ATOM 130 C GLU D1287 147.134 -36.448 56.012 1.00106.05 ATOM 131 O GLU D1287 147.929 -36.563 56.952 1.00110.50 ATOM 132 CB GLU D1287 145.498 -38.342 56.204 1.00104.93 ATOM 133 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ATOM 151 N LEU D1290 147.768 -29.961 53.896 1.00 95.60 ATOM 152 CA LEU D1290 146.890 -28.989 54.548 1.00 92.72 ATOM 153 C LEU D1290 146.911 -27.658 53.808 1.00 88.99 ATOM 154 O LEU D1290 147.957 -27.235 53.308 1.00 80.82 ATOM 155 CB LEU D1290 147.295 -28.770 56.021 1.00 95.81 ATOM 156 CG LEU D1290 146.932 -27.470 56.762 1.00 90.94 ATOM 157 CD1 LEU D1290 145.427 -27.211 56.851 1.00 82.07 ATOM 158 CD2 LEU D1290 147.551 -27.483 58.162 1.00 93.43 ATOM 159 N SER D1291 145.747 -27.003 53.747 1.00 89.04 ATOM 160 CA SER D1291 145.599 -25.711 53.083 1.00 92.01 ATOM 161 C SER D1291 144.384 -24.977 53.641 1.00 94.79 ATOM 162 O SER D1291 143.439 -25.592 54.144 1.00 95.65 ATOM 163 CB SER D1291 145.473 -25.863 51.561 1.00 93.06 ATOM 164 OG SER D1291 146.734 -26.117 50.964 1.00 89.87 ATOM 165 N VAL D1292 144.426 -23.644 53.529 1.00 97.63 ATOM 166 CA VAL D1292 143.394 -22.729 54.024 1.00 89.59 ATOM 167 C VAL D1292 142.981 -21.814 52.880 1.00 88.37 ATOM 168 O VAL D1292 143.823 -21.098 52.321 1.00 87.33 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