3WOD - ECOD Domain Classification

#	Chain	Domain ID	Range	Family	Classification
1	A	e3wodA1	A:6-49,A:173-230	RNA_pol_L	305 → 305.1 → 305.1.1
2	A	e3wodA2	A:50-172	RNA_pol_A_bac	240 → 240.2 → 240.2.1
3	B	e3wodB1	B:4-49,B:173-235	RNA_pol_L	305 → 305.1 → 305.1.1
4	B	e3wodB2	B:50-172	RNA_pol_A_bac	240 → 240.2 → 240.2.1
5	C	e3wodC8	C:1-142,C:332-457	RNA_pol_Rpb2_1,RNA_pol_Rpb2_3	4010 → 4010.1 → 4010.1.1
6	C	e3wodC9	C:592-662	325.1.7.0	325 → 325.1 → 325.1.7
7	C	e3wodC10	C:143-331	RNA_pol_Rpb2_2	4041 → 4041.1 → 4041.1.1
8	C	e3wodC13	C:1000-1118	RNA_pol_Rpb2_6,RNA_pol_Rpb2_7	4043 → 4043.1 → 4043.1.1
9	C	e3wodC14	C:458-591	RNA_pol_Rpb2_45	4042 → 4042.1 → 4042.1.1
10	C	e3wodC6	C:699-832	RNA_pol_Rpb2_6	325 → 325.1 → 325.1.7
11	C	e3wodC7	C:664-700,C:827-999	RNA_pol_Rpb2_6	1 → 1.1 → 1.1.2
12	D	e3wodD1	D:396-447	325.1.7.0	325 → 325.1 → 325.1.7
13	D	e3wodD2	D:217-340	RPOC_hybrid	325 → 325.1 → 325.1.6
14	D	e3wodD3	D:209-216,D:341-388	325.1.7.0	325 → 325.1 → 325.1.7
15	D	e3wodD4	D:166-208,D:389-395	325.1.7.0	325 → 325.1 → 325.1.7
16	D	e3wodD5	D:2-165,D:448-621	RNA_pol_Rpb1_1	4246 → 4246.1 → 4246.1.1
17	D	e3wodD6	D:622-653,D:697-777	RNA_pol_Rpb1_2	1 → 1.1 → 1.1.2
18	D	e3wodD7	D:654-696	4951.1.1.0	4951 → 4951.1 → 4951.1.1
19	D	e3wodD8	D:778-948	RNA_pol_Rpb1_3	4959 → 4959.1 → 4959.1.1
20	D	e3wodD9	D:949-1109	RNA_pol_Rpb1_5,RNA_pol_Rpb1_4	4958 → 4958.1 → 4958.1.1
21	D	e3wodD10	D:1110-1200	275.1.1.0	275 → 275.1 → 275.1.1
22	D	e3wodD11	D:1201-1269,D:1331-1505	RNA_pol_Rpb1_5	4954 → 4954.1 → 4954.1.1
23	D	e3wodD12	D:1270-1330	325.1.7.0	325 → 325.1 → 325.1.7
24	E	e3wodE1	E:2-96	RNA_pol_Rpb6	152 → 152.1 → 152.1.2
25	F	e3wodF1	F:74-255	Sigma70_r1_2,Sigma70_r2	142 → 142.1 → 142.1.1
26	F	e3wodF2	F:312-412	Sigma70_r3,Sigma70_r4	101 → 101.1 → 101.1.1
27	G	e3wodG1	G:4-138	P23-45_gp39_N	243 → 243.15 → 243.15.1
28	H	e3wodH1	H:5-107	P23-45_gp39_N	243 → 243.15 → 243.15.1

PDB 3WOD

3D Structure(domains colored, ligands/nucleic acids shown)

Domains by Chain

All Domains (28)

Visualization Legend