Home/PDB

PDB 4WZD

X-RAY DIFFRACTION3.10 Å0 chains110 ECOD domains
View in RCSB PDB

3D Structure(domains colored, ligands/nucleic acids shown)

Loading viewer...

Domains by Chain

All Domains (110)

#ChainDomain IDRangeFamilyClassification
111e4wzd11111:127-273Ribosomal_L2_C4 → 4.1 → 4.1.1
211e4wzd11211:2-126Ribosomal_L22 → 2.1 → 2.1.1
312e4wzd12112:4-240Ribosomal_S22007 → 2007.6 → 2007.6.1
415e4wzd15115:1-138Ribosomal_L132490 → 2490.2 → 2490.2.1
519e4wzd19119:127-274Ribosomal_L2_C4 → 4.1 → 4.1.1
619e4wzd19219:2-126Ribosomal_L22 → 2.1 → 2.1.1
71Ae4wzd1A11A:3-101Ribosomal_S10304 → 304.44 → 304.44.1
81Ee4wzd1E11E:4-240Ribosomal_S22007 → 2007.6 → 2007.6.1
91Ie4wzd1I11I:3-101Ribosomal_S10304 → 304.44 → 304.44.1
1021e4wzd21121:1-205Ribosomal_L31 → 1.1 → 1.1.7
1122e4wzd22122:107-207Ribosomal_S3_C230 → 230.2 → 230.2.1
1222e4wzd22222:2-106KH_2327 → 327.11 → 327.11.1
1325e4wzd25125:1-122Ribosomal_L143174 → 3174.1 → 3174.1.1
1429e4wzd29129:1-205Ribosomal_L31 → 1.1 → 1.1.7
152Ae4wzd2A12A:11-126Ribosomal_S112484 → 2484.1 → 2484.1.1
162Ee4wzd2E12E:2-105KH_2327 → 327.11 → 327.11.1
172Ee4wzd2E22E:106-206Ribosomal_S3_C230 → 230.2 → 230.2.1
182Ie4wzd2I12I:11-126Ribosomal_S112484 → 2484.1 → 2484.1.1
1931e4wzd31131:6-207Ribosomal_L47559 → 7559.1 → 7559.1.1
2032e4wzd32132:2-209Ribosomal_S4,S4221 → 221.1 → 221.1.2
2135e4wzd35135:1-150Ribosomal_L27A, PF294712490 → 2490.3 → 2490.3.1
2239e4wzd39139:1-208Ribosomal_L47559 → 7559.1 → 7559.1.1
233Ae4wzd3A13A:5-129Ribosom_S12_S232 → 2.1 → 2.1.1
243Ee4wzd3E13E:2-209Ribosomal_S4,S4221 → 221.1 → 221.1.2
253Ie4wzd3I13I:5-129Ribosom_S12_S232 → 2.1 → 2.1.1
2641e4wzd41141:2-182Ribosomal_L5,Ribosomal_L5_C882 → 882.1 → 882.1.1
2742e4wzd42142:5-73Ribosomal_S5330 → 330.1 → 330.1.1
2842e4wzd42242:74-155Ribosomal_S5_C212 → 212.1 → 212.1.1
2945e4wzd45145:1-141Ribosomal_L16325 → 325.1 → 325.1.5
3049e4wzd49149:2-182Ribosomal_L5,Ribosomal_L5_C882 → 882.1 → 882.1.1
314Ae4wzd4A14A:2-118Ribosomal_S13102 → 102.2 → 102.2.1
324Ee4wzd4E14E:5-73Ribosomal_S5330 → 330.1 → 330.1.1
334Ee4wzd4E24E:74-155Ribosomal_S5_C212 → 212.1 → 212.1.1
344Ie4wzd4I14I:2-117Ribosomal_S13102 → 102.2 → 102.2.1
3551e4wzd51151:2-82Ribosomal_L6318 → 318.1 → 318.1.1
3651e4wzd51251:83-175Ribosomal_L6318 → 318.1 → 318.1.1
3752e4wzd52152:1-101Ribosomal_S6304 → 304.12 → 304.12.1
3855e4wzd55155:2-118Ribosomal_L17218 → 218.3 → 218.3.1
3958e4wzd58158:1-138Ribosomal_L132490 → 2490.2 → 2490.2.1
4059e4wzd59159:83-172Ribosomal_L6318 → 318.1 → 318.1.1
4159e4wzd59259:2-82Ribosomal_L6318 → 318.1 → 318.1.1
425Ae4wzd5A15A:2-61Ribosomal_S14377 → 377.1 → 377.1.1
435Ee4wzd5E15E:1-101Ribosomal_S6304 → 304.12 → 304.12.1
445Ie4wzd5I15I:2-61Ribosomal_S14377 → 377.1 → 377.1.1
4561e4wzd61161:54-146Ribosomal_L9_C523 → 523.1 → 523.1.1
4661e4wzd61261:1-53Ribosomal_L9_N4076 → 4076.1 → 4076.1.1
4762e4wzd62162:2-156Ribosomal_S7167 → 167.1 → 167.1.1
4865e4wzd65165:2-112Ribosomal_L18p2484 → 2484.1 → 2484.1.1
4968e4wzd68168:1-122Ribosomal_L143174 → 3174.1 → 3174.1.1
5069e4wzd69169:1-53Ribosomal_L9_N4076 → 4076.1 → 4076.1.1
5169e4wzd69269:54-146Ribosomal_L9_C523 → 523.1 → 523.1.1
526Ae4wzd6A16A:2-89Ribosomal_S15616 → 616.1 → 616.1.1
536Ee4wzd6E16E:2-156Ribosomal_S7167 → 167.1 → 167.1.1
546Ie4wzd6I16I:2-89Ribosomal_S15616 → 616.1 → 616.1.1
5571e4wzd71171:1-69,71:163-228Ribosomal_L1898 → 898.1 → 898.1.1
5672e4wzd72172:67-138Ribosomal_S84988 → 4988.1 → 4988.1.1
5772e4wzd72272:1-66Ribosomal_S8320 → 320.2 → 320.2.1
5875e4wzd75175:1-137Ribosomal_L194 → 4.1 → 4.1.1
5978e4wzd78178:1-150Ribosomal_L27A, PF294712490 → 2490.3 → 2490.3.1
6079e4wzd79179:1-69,79:163-228Ribosomal_L1898 → 898.1 → 898.1.1
617Ae4wzd7A17A:1-84Ribosomal_S16837 → 837.1 → 837.1.1
627Ee4wzd7E17E:1-66Ribosomal_S8320 → 320.2 → 320.2.1
637Ee4wzd7E27E:67-138Ribosomal_S84988 → 4988.1 → 4988.1.1
647Ie4wzd7I17I:1-84Ribosomal_S16837 → 837.1 → 837.1.1
6582e4wzd82182:2-128Ribosomal_S9212 → 212.1 → 212.1.1
6685e4wzd85185:2-118Ribosomal_L20143 → 143.2 → 143.2.1
6788e4wzd88188:1-141Ribosomal_L16325 → 325.1 → 325.1.5
688Ae4wzd8A18A:2-101Ribosomal_S172 → 2.1 → 2.1.1
698Ee4wzd8E18E:2-128Ribosomal_S9212 → 212.1 → 212.1.1
708Ie4wzd8I18I:2-101Ribosomal_S172 → 2.1 → 2.1.1
7195e4wzd95195:1-101Ribosomal_L21p4186 → 4186.1 → 4186.1.1
7298e4wzd98198:1-118Ribosomal_L17218 → 218.3 → 218.3.1
739Ae4wzd9A19A:17-88Ribosomal_S18101 → 101.1 → 101.1.1
749Ie4wzd9I19I:17-88Ribosomal_S18101 → 101.1 → 101.1.1
75A5e4wzdA51A5:1-113Ribosomal_L22218 → 218.2 → 218.2.1
76A8e4wzdA81A8:2-112Ribosomal_L18p2484 → 2484.1 → 2484.1.1
77AAe4wzdAA1AA:6-84Ribosomal_S19838 → 838.1 → 838.1.1
78AIe4wzdAI1AI:2-84Ribosomal_S19838 → 838.1 → 838.1.1
79B5e4wzdB51B5:2-94Ribosomal_L23304 → 304.109 → 304.109.1
80B8e4wzdB81B8:1-137Ribosomal_L194 → 4.1 → 4.1.1
81BAe4wzdBA1BA:8-106Ribosomal_S20p604 → 604.9 → 604.9.1
82BIe4wzdBI1BI:8-106Ribosomal_S20p604 → 604.9 → 604.9.1
83C5e4wzdC51C5:2-105KOW,ribosomal_L244 → 4.1 → 4.1.1
84C8e4wzdC81C8:2-118Ribosomal_L20143 → 143.2 → 143.2.1
85D5e4wzdD51D5:1-92Ribosomal_L25p239 → 239.1 → 239.1.1
86D5e4wzdD52D5:93-179Ribosomal_TL5_C240 → 240.1 → 240.1.1
87D8e4wzdD81D8:1-101Ribosomal_L21p4186 → 4186.1 → 4186.1.1
88E5e4wzdE51E5:9-85Ribosomal_L27325 → 325.1 → 325.1.8
89E8e4wzdE81E8:1-113Ribosomal_L22218 → 218.2 → 218.2.1
90F5e4wzdF51F5:2-98Ribosomal_L284232 → 4232.1 → 4232.1.1
91F8e4wzdF81F8:3-94Ribosomal_L23304 → 304.109 → 304.109.1
92G5e4wzdG51G5:4-72Ribosomal_L29192 → 192.4 → 192.4.1
93G8e4wzdG81G8:3-106KOW,ribosomal_L244 → 4.1 → 4.1.1
94H5e4wzdH51H5:2-60Ribosomal_L30887 → 887.1 → 887.1.1
95H8e4wzdH81H8:93-175Ribosomal_TL5_C240 → 240.1 → 240.1.1
96H8e4wzdH82H8:1-92Ribosomal_L25p239 → 239.1 → 239.1.1
97I5e4wzdI51I5:1-63Ribosomal_L314987 → 4987.1 → 4987.1.1
98I8e4wzdI81I8:3-85Ribosomal_L27325 → 325.1 → 325.1.8
99J5e4wzdJ51J5:2-60Ribosomal_L32p375 → 375.1 → 375.1.1
100J8e4wzdJ81J8:2-98Ribosomal_L284232 → 4232.1 → 4232.1.1
101K5e4wzdK51K5:9-53Ribosomal_L33375 → 375.1 → 375.1.1
102K8e4wzdK81K8:4-69Ribosomal_L29192 → 192.4 → 192.4.1
103L5e4wzdL51L5:1-49Ribosomal_L343074 → 3074.1 → 3074.1.1
104L8e4wzdL81L8:2-60Ribosomal_L30887 → 887.1 → 887.1.1
105M5e4wzdM51M5:2-63Ribosomal_L35p4281 → 4281.1 → 4281.1.1
106M8e4wzdM81M8:1-66Ribosomal_L314987 → 4987.1 → 4987.1.1
107N8e4wzdN81N8:2-60Ribosomal_L32p375 → 375.1 → 375.1.1
108O8e4wzdO81O8:9-53Ribosomal_L33375 → 375.1 → 375.1.1
109P8e4wzdP81P8:1-47Ribosomal_L343074 → 3074.1 → 3074.1.1
110Q8e4wzdQ81Q8:2-63Ribosomal_L35p4281 → 4281.1 → 4281.1.1

Visualization Legend

ECOD domains (colored by index)Unclassified protein regionsNucleic acids (RNA/DNA)Ligands/cofactors