6JNX - ECOD Domain Classification

#	Chain	Domain ID	Range	Family	Classification
1	A	e6jnxA1	A:53-173	RNA_pol_A_bac	240 → 240.2 → 240.2.1
2	A	e6jnxA2	A:8-52,A:174-232	RNA_pol_L	305 → 305.1 → 305.1.1
3	B	e6jnxB1	B:5-52,B:174-233	RNA_pol_L	305 → 305.1 → 305.1.1
4	B	e6jnxB2	B:53-173	RNA_pol_A_bac	240 → 240.2 → 240.2.1
5	C	e6jnxC1	C:235-288	275.1.1.0	275 → 275.1 → 275.1.1
6	C	e6jnxC2	C:939-1044	3681.1.1.0	3681 → 3681.1 → 3681.1.1
7	C	e6jnxC3	C:791-827,C:1063-1239	RNA_pol_Rpb2_6	1 → 1.1 → 1.1.2
8	C	e6jnxC4	C:226-234,C:289-342	275.1.1.0	275 → 275.1 → 275.1.1
9	C	e6jnxC5	C:828-938,C:1045-1062	RNA_pol_Rpb2_6	325 → 325.1 → 325.1.7
10	C	e6jnxC6	C:578-712	RNA_pol_Rpb2_45	4042 → 4042.1 → 4042.1.1
11	C	e6jnxC7	C:152-225,C:343-451	RNA_pol_Rpb2_2	4041 → 4041.1 → 4041.1.1
12	C	e6jnxC8	C:2-151,C:452-577	RNA_pol_Rpb2_1,RNA_pol_Rpb2_3	4010 → 4010.1 → 4010.1.1
13	C	e6jnxC9	C:713-790	RNA_pol_Rpb2_6	325 → 325.1 → 325.1.7
14	C	e6jnxC10	C:1240-1341	RNA_pol_Rpb2_6,RNA_pol_Rpb2_7	4043 → 4043.1 → 4043.1.1
15	D	e6jnxD1	D:1134-1215	325.1.7.0	325 → 325.1 → 325.1.7
16	D	e6jnxD2	D:334-498	RNA_pol_Rpb1_2	1 → 1.1 → 1.1.2
17	D	e6jnxD3	D:895-931,D:1214-1373	RNA_pol_Rpb1_5	4954 → 4954.1 → 4954.1.1
18	D	e6jnxD4	D:811-894	275.1.1.0	275 → 275.1 → 275.1.1
19	D	e6jnxD5	D:16-341	4246.1.1.0	4246 → 4246.1 → 4246.1.1
20	D	e6jnxD6	D:932-1022	325.1.7.0	325 → 325.1 → 325.1.7
21	D	e6jnxD7	D:639-810	RNA_pol_Rpb1_5,RNA_pol_Rpb1_4	4958 → 4958.1 → 4958.1.1
22	D	e6jnxD8	D:1023-1131	325.1.7.0	325 → 325.1 → 325.1.7
23	D	e6jnxD9	D:499-638	RNA_pol_Rpb1_3	4959 → 4959.1 → 4959.1.1
24	E	e6jnxE1	E:2-80	RNA_pol_Rpb6	152 → 152.1 → 152.1.2
25	F	e6jnxF1	F:114-167,F:213-447	Sigma70_r2,Sigma70_ner	142 → 142.1 → 142.1.1
26	P	e6jnxP1	P:7-153	Phage_antitermQ	101 → 101.1 → 101.1.1
27	Q	e6jnxQ1	Q:7-144	Phage_antitermQ	101 → 101.1 → 101.1.1

PDB 6JNX

3D Structure(domains colored, ligands/nucleic acids shown)

Domains by Chain

All Domains (27)

Visualization Legend